Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition.
The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure, to pre-computed structural neighbours in the Dali Database,
and to the PDB format coordinate file where the neighbour
is superimposed onto the query structure.
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Summary
No: Chain Z rmsd lali nres %id PDB Description
1: 3fg8-A 12.9 1.8 94 106 16 PDB MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN RHA05790;
2: 3a0r-A 11.6 2.2 96 334 16 PDB MOLECULE: SENSOR PROTEIN;
3: 3fc7-A 11.5 2.6 95 100 18 PDB MOLECULE: HTR-LIKE PROTEIN;
4: 1f98-A 11.0 3.0 96 125 15 PDB MOLECULE: PHOTOACTIVE YELLOW PROTEIN;
5: 1mzu-B 10.9 2.2 90 114 11 PDB MOLECULE: PPR;
6: 2qkp-A 10.4 2.8 92 138 14 PDB MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN;
7: 3b33-A 10.4 2.7 91 109 14 PDB MOLECULE: SENSOR PROTEIN;
8: 2gj3-A 10.3 2.7 93 119 16 PDB MOLECULE: NITROGEN FIXATION REGULATORY PROTEIN;
9: 3bwl-A 10.1 8.1 105 125 12 PDB MOLECULE: SENSOR PROTEIN;
10: 3cax-A 10.0 7.8 101 355 10 PDB MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN PF0695;
11: 1n9l-A 10.0 2.7 95 109 18 PDB MOLECULE: PUTATIVE BLUE LIGHT RECEPTOR;
12: 3eeh-A 9.7 3.7 104 116 13 PDB MOLECULE: PUTATIVE LIGHT AND REDOX SENSING HISTIDINE
13: 3h82-A 9.6 3.2 103 115 11 PDB MOLECULE: ARYL HYDROCARBON RECEPTOR NUCLEAR TRANSLOCATOR;
14: 3ewk-A 9.5 2.4 83 227 12 PDB MOLECULE: SENSOR PROTEIN;
15: 1x0o-A 9.4 2.6 92 119 12 PDB MOLECULE: ARYL HYDROCARBON RECEPTOR NUCLEAR TRANSLOCATOR;
16: 2z6d-A 9.4 3.0 96 118 15 PDB MOLECULE: PHOTOTROPIN-2;
17: 1g28-A 9.3 2.5 88 104 13 PDB MOLECULE: PHY3 PROTEIN;
18: 2r78-C 9.2 2.4 88 116 9 PDB MOLECULE: SENSOR PROTEIN;
19: 1byw-A 9.2 2.7 91 110 14 PDB MOLECULE: PROTEIN (HUMAN ERG POTASSIUM CHANNEL);
20: 1drm-A 9.2 3.1 94 119 12 PDB MOLECULE: SENSOR PROTEIN FIXL;
21: 2jhe-A 9.2 8.1 92 189 8 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTION REGULATOR TYRR;
22: 2z6c-A 9.0 5.3 104 121 16 PDB MOLECULE: PHOTOTROPIN-1;
23: 1d06-A 9.0 7.9 104 130 17 PDB MOLECULE: NITROGEN FIXATION REGULATORY PROTEIN FIXL;
24: 1s66-L 8.8 2.6 94 119 14 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YDDU;
25: 2wkp-A 8.3 2.6 90 320 17 PDB MOLECULE: NPH1-1, RAS-RELATED C3 BOTULINUM TOXIN SUBSTRATE
26: 1wa9-B 7.9 7.8 106 318 14 PDB MOLECULE: PERIOD CIRCADIAN PROTEIN;
27: 3h9w-A 7.9 4.0 96 109 7 PDB MOLECULE: DIGUANYLATE CYCLASE WITH PAS/PAC SENSOR;
28: 2pr6-A 7.8 3.1 96 128 22 PDB MOLECULE: BLUE-LIGHT PHOTORECEPTOR;
29: 3hjk-A 7.4 2.6 87 150 17 PDB MOLECULE: VIVID PAS PROTEIN VVD;
30: 2o9c-A 7.2 7.4 98 319 10 PDB MOLECULE: BACTERIOPHYTOCHROME;
31: 3g6o-A 7.1 6.3 95 457 16 PDB MOLECULE: BACTERIOPHYTOCHROME;
32: 2vlg-C 7.1 2.6 83 102 7 PDB MOLECULE: SPORULATION KINASE A;
33: 3c2w-C 6.8 6.6 94 482 15 PDB MOLECULE: BACTERIOPHYTOCHROME;
34: 2bas-A 6.7 11.0 88 402 9 PDB MOLECULE: YKUI PROTEIN;
35: 3fos-A 6.7 8.0 89 207 8 PDB MOLECULE: SENSOR PROTEIN;
36: 3ibj-B 6.4 6.9 81 643 11 PDB MOLECULE: CGMP-DEPENDENT 3',5'-CYCLIC PHOSPHODIESTERASE;
37: 3eea-A 6.3 3.5 89 153 6 PDB MOLECULE: GAF DOMAIN/HD DOMAIN PROTEIN;
38: 1p0z-A 6.2 2.7 80 131 15 PDB MOLECULE: SENSOR KINASE CITA;
39: 3k2n-A 6.1 3.1 85 177 11 PDB MOLECULE: SIGMA-54-DEPENDENT TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
40: 3b42-B 6.0 4.6 85 129 9 PDB MOLECULE: METHYL-ACCEPTING CHEMOTAXIS PROTEIN, PUTATIVE;
41: 2w1t-A 5.8 3.0 79 175 18 PDB MOLECULE: STAGE V SPORULATION PROTEIN T;
42: 1ll8-A 5.8 3.6 92 114 8 PDB MOLECULE: PAS KINASE;
43: 1f5m-B 5.1 5.9 87 177 14 PDB MOLECULE: GAF;
44: 3gdi-A 5.1 3.3 85 269 7 PDB MOLECULE: PERIOD CIRCADIAN PROTEIN HOMOLOG 2;
45: 2qhk-A 4.9 2.8 81 148 9 PDB MOLECULE: METHYL-ACCEPTING CHEMOTAXIS PROTEIN;
46: 2vjw-A 4.9 2.7 73 138 15 PDB MOLECULE: GAF FAMILY PROTEIN;
47: 1oj5-A 4.9 3.7 77 105 6 PDB MOLECULE: STEROID RECEPTOR COACTIVATOR 1A;
48: 3e0y-A 4.8 2.1 68 155 13 PDB MOLECULE: CONSERVED DOMAIN PROTEIN;
49: 3dte-A 4.8 5.5 84 247 8 PDB MOLECULE: IRRE PROTEIN;
50: 2gx5-C 4.5 5.4 82 161 9 PDB MOLECULE: GTP-SENSING TRANSCRIPTIONAL PLEIOTROPIC
51: 2vzw-B 4.5 3.4 74 149 1 PDB MOLECULE: PROBABLE HISTIDINE KINASE RESPONSE REGULATOR;
52: 3c8c-A 4.5 7.9 81 241 7 PDB MOLECULE: METHYL-ACCEPTING CHEMOTAXIS PROTEIN;
53: 2h28-A 4.5 3.2 73 109 11 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YEEU;
54: 1ysq-A 4.4 2.5 76 181 7 PDB MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YIAJ;
55: 2gnx-A 4.4 2.6 70 288 3 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;
56: 2hf6-A 4.4 4.3 73 149 14 PDB MOLECULE: COATOMER SUBUNIT ZETA-1;
57: 1k0k-A 4.3 2.9 67 125 7 PDB MOLECULE: PROFILIN;
58: 1cqa-A 4.3 2.7 64 123 9 PDB MOLECULE: PROFILIN;
59: 2ool-A 4.2 5.0 85 304 6 PDB MOLECULE: SENSOR PROTEIN;
60: 2va0-E 4.2 3.8 69 120 9 PDB MOLECULE: ABFS ARABINOFURANOSIDASE TWO COMPONENT SYSTEM
61: 2g7u-A 4.1 2.9 78 251 19 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
62: 1mkm-B 4.1 9.9 81 247 10 PDB MOLECULE: ICLR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
63: 1w63-Q 4.1 3.0 70 148 7 PDB MOLECULE: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1
64: 1a0k-A 4.1 3.0 67 130 9 PDB MOLECULE: PROFILIN;
65: 2hj9-C 4.1 7.9 83 210 8 PDB MOLECULE: AUTOINDUCER 2-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN LUXP;
66: 2grg-A 4.1 3.9 66 98 6 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN; YNR034W-AP;
67: 3bjn-A 4.0 2.9 77 162 10 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, PUTATIVE;
68: 2q0o-A 4.0 3.7 81 235 10 PDB MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR PROTEIN TRAR;
69: 2o0y-C 3.9 3.1 77 255 10 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
70: 1g5u-A 3.9 3.2 69 130 12 PDB MOLECULE: PROFILIN;
71: 1yax-A 3.9 4.1 72 153 7 PDB MOLECULE: VIRULENCE SENSOR PROTEIN PHOQ, SENSOR DOMAIN;
72: 1f2k-A 3.9 3.0 66 125 9 PDB MOLECULE: PROFILIN II;
73: 3cwf-A 3.9 2.4 59 108 10 PDB MOLECULE: ALKALINE PHOSPHATASE SYNTHESIS SENSOR PROTEIN
74: 3clo-A 3.8 3.4 92 258 7 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
75: 2o99-C 3.8 2.8 75 182 12 PDB MOLECULE: ACETATE OPERON REPRESSOR;
76: 3c30-A 3.7 3.6 74 219 7 PDB MOLECULE: AUTOINDUCER 2 SENSOR KINASE/PHOSPHATASE LUXQ;
77: 1tf1-A 3.7 2.9 72 184 11 PDB MOLECULE: NEGATIVE REGULATOR OF ALLANTOIN AND GLYOXYLATE
78: 1stz-A 3.7 5.7 75 323 7 PDB MOLECULE: HEAT-INDUCIBLE TRANSCRIPTION REPRESSOR HRCA
79: 2k2n-A 3.7 3.6 82 172 10 PDB MOLECULE: SENSOR PROTEIN;
80: 2w3g-A 3.7 3.8 79 150 5 PDB MOLECULE: TWO COMPONENT SENSOR HISTIDINE KINASE DEVS (GAF
81: 3d9y-A 3.7 3.3 68 126 9 PDB MOLECULE: PROFILIN;
82: 3ibj-A 3.6 6.6 84 661 13 PDB MOLECULE: CGMP-DEPENDENT 3',5'-CYCLIC PHOSPHODIESTERASE;
83: 3bqa-A 3.6 4.1 76 146 16 PDB MOLECULE: SENSOR PROTEIN PHOQ;
84: 3hcy-A 3.6 3.1 73 145 12 PDB MOLECULE: PUTATIVE TWO-COMPONENT SENSOR HISTIDINE KINASE
85: 1j3w-B 3.5 2.9 67 135 7 PDB MOLECULE: GIDING PROTEIN-MGLB;
86: 3by9-A 3.4 3.1 67 259 7 PDB MOLECULE: SENSOR PROTEIN;
87: 2j3t-D 3.3 3.2 64 210 6 PDB MOLECULE: TRAFFICKING PROTEIN PARTICLE COMPLEX SUBUNIT 3;
88: 3ix4-C 3.3 3.3 85 168 8 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR PROTEIN LASR;
89: 1gw5-S 3.3 2.9 63 142 10 PDB MOLECULE: ADAPTOR-RELATED PROTEIN COMPLEX 2 ALPHA 2
90: 1vet-A 3.3 2.7 65 122 11 PDB MOLECULE: MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE KINASE 1
91: 1rp5-A 3.2 3.1 71 687 6 PDB MOLECULE: PENICILLIN-BINDING PROTEIN 2X;
92: 2v1z-A 3.1 3.7 73 270 5 PDB MOLECULE: BETA-LACTAMASE TEM;
93: 3cit-A 3.1 6.3 72 155 10 PDB MOLECULE: SENSOR HISTIDINE KINASE;
94: 1hlu-P 3.0 3.0 67 139 9 PDB MOLECULE: BETA-ACTIN;
95: 2jkf-A 3.0 3.3 68 170 6 PDB MOLECULE: PROFILIN;
96: 1nrj-A 3.0 3.9 64 147 5 PDB MOLECULE: SIGNAL RECOGNITION PARTICLE RECEPTOR ALPHA
97: 2dmw-A 3.0 3.8 66 131 15 PDB MOLECULE: SYNAPTOBREVIN-LIKE 1 VARIANT;
98: 2vk3-A 3.0 3.5 66 142 8 PDB MOLECULE: PROFILIN-2;
99: 2inw-A 3.0 6.5 75 117 11 PDB MOLECULE: PUTATIVE STRUCTURAL PROTEIN;
100: 1l3l-A 2.9 3.6 81 233 7 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR PROTEIN TRAR;
101: 1pyy-A 2.9 3.2 69 607 7 PDB MOLECULE: PENICILLIN-BINDING PROTEIN 2X;
102: 3itb-D 2.9 3.6 67 351 4 PDB MOLECULE: D-ALANYL-D-ALANINE CARBOXYPEPTIDASE DACC;
103: 2j3w-A 2.9 3.4 69 142 14 PDB MOLECULE: TRAFFICKING PROTEIN PARTICLE COMPLEX PROTEIN 2;
104: 1tvf-A 2.8 5.1 80 369 5 PDB MOLECULE: PENICILLIN BINDING PROTEIN 4;
105: 1is7-K 2.8 3.0 58 84 9 PDB MOLECULE: GTP CYCLOHYDROLASE I;
106: 2vea-A 2.7 6.4 80 500 18 PDB MOLECULE: PHYTOCHROME-LIKE PROTEIN CPH1;
107: 2fz0-A 2.7 3.3 71 149 11 PDB MOLECULE: V-SNARE COMPONENT OF THE VACUOLAR SNARE COMPLEX
108: 1mfo-A 2.7 4.9 77 262 6 PDB MOLECULE: BETA-LACTAMASE;
109: 3a3j-A 2.7 3.5 65 344 3 PDB MOLECULE: PBP5;
110: 2k31-A 2.5 3.7 74 149 5 PDB MOLECULE: PHOSPHODIESTERASE 5A, CGMP-SPECIFIC;
111: 3b47-A 2.5 4.2 63 121 5 PDB MOLECULE: METHYL-ACCEPTING CHEMOTAXIS PROTEIN;
112: 1ykd-A 2.4 3.6 77 383 5 PDB MOLECULE: ADENYLATE CYCLASE;
113: 2nup-C 2.4 2.5 54 137 9 PDB MOLECULE: PROTEIN TRANSPORT PROTEIN SEC23A;
114: 3dba-A 2.4 5.7 83 171 12 PDB MOLECULE: CONE CGMP-SPECIFIC 3',5'-CYCLIC
115: 3fwl-A 2.4 4.7 71 707 11 PDB MOLECULE: PENICILLIN-BINDING PROTEIN 1B;
116: 1rpy-B 2.4 2.1 40 86 5 PDB MOLECULE: ADAPTOR PROTEIN APS;
117: 1m6k-A 2.3 3.8 75 250 7 PDB MOLECULE: BETA-LACTAMASE OXA-1;
118: 1y4o-A 2.3 1.9 49 103 8 PDB MOLECULE: DYNEIN LIGHT CHAIN 2A, CYTOPLASMIC;
119: 3csw-C 2.3 3.9 53 275 8 PDB MOLECULE: PUTATIVE BRANCHED-CHAIN-AMINO-ACID
120: 1r1p-B 2.3 9.1 49 100 2 PDB MOLECULE: GRB2-RELATED ADAPTOR PROTEIN 2;
121: 2jc7-A 2.2 3.5 70 244 7 PDB MOLECULE: BETA-LACTAMASE OXA-24;
122: 1mwt-A 2.2 6.2 83 635 2 PDB MOLECULE: PENICILLIN-BINDING PROTEIN 2A;
123: 3fwm-A 2.2 4.7 74 666 11 PDB MOLECULE: PENICILLIN-BINDING PROTEIN 1B;
124: 1z8k-A 2.2 4.2 69 174 7 PDB MOLECULE: AT3G25770 PROTEIN;
125: 2vx8-B 2.2 4.3 76 138 11 PDB MOLECULE: NUCLEOPORIN-LIKE PROTEIN RIP, VESICLE-ASSOCIATED
126: 3l5z-A 2.2 4.7 62 143 5 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, GNTR FAMILY;
127: 3cue-A 2.2 3.6 71 159 13 PDB MOLECULE: TRANSPORT PROTEIN PARTICLE 23 KDA SUBUNIT;
128: 2go5-1 2.2 3.6 59 125 10 PDB MOLECULE: SRP RNA;
129: 2gza-C 2.2 4.6 64 336 6 PDB MOLECULE: TYPE IV SECRETION SYSTEM PROTEIN VIRB11;
130: 2v3s-A 2.2 3.1 54 96 2 PDB MOLECULE: SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE OSR1;
131: 2ys6-A 2.2 6.8 62 422 10 PDB MOLECULE: PHOSPHORIBOSYLGLYCINAMIDE SYNTHETASE;
132: 2abj-A 2.1 4.2 73 366 10 PDB MOLECULE: BRANCHED-CHAIN-AMINO-ACID AMINOTRANSFERASE,
133: 2rcq-A 2.1 2.9 61 141 7 PDB MOLECULE: RETINOL-BINDING PROTEIN II, CELLULAR;
134: 3a2k-A 2.1 7.9 64 462 9 PDB MOLECULE: TRNA(ILE)-LYSIDINE SYNTHASE;
135: 1x6c-A 2.1 2.8 50 118 2 PDB MOLECULE: TYROSINE-PROTEIN PHOSPHATASE, NON-RECEPTOR TYPE
136: 3ci0-I 2.1 3.0 52 83 4 PDB MOLECULE: PSEUDOPILIN GSPI;
137: 1lck-A 2.0 6.2 63 164 8 PDB MOLECULE: P56==LCK== TYROSINE KINASE;
138: 3cfi-J 2.0 3.3 52 81 10 PDB MOLECULE: TYPE II SECRETORY PATHWAY, PSEUDOPILIN EPSI;
139: 3ka5-B 2.0 2.3 41 59 5 PDB MOLECULE: RIBOSOME-ASSOCIATED PROTEIN Y (PSRP-1);
Pairwise Structural Alignments
Notation: three-state secondary structure definitions by DSSP (reduced to H=helix, E=sheet, L=coil) are shown above the amino acid sequence. Structurally equivalent residues are in uppercase, structurally non-equivalent residues (e.g. in loops) are in lowercase. Amino acid identities are marked by vertical bars.
No 1: Query=mol1A Sbjct=3fg8A Z-score=12.9
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DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLEEEEEELLLLEEEELHHHHHLLLLLHHHHLLLLHHHHL Query fqsnaxaksrlllselldqLSFALCIVRNDYVIVKVNEYFESRVIFDGETXQGKNILELF 60 ident | | || | | | Sbjct -----------grenlyfqGGLGFXALDEDLRIIYVNSGCLRHVRRSRDELLGRVVTEVL 49 DSSP -----------llllllllLLLEEEEELLLLLEEEELHHHHHHHLLLHHHHLLLLHHHHL DSSP HHHHHH-HHHHHHHHHHHLLLEEEELllllLLLLLllEEEEEEEEEEEllllleEEEEEE Query PESADY-LKRKIDTALVIESSSFSSWeqkpHLLPFeqXYQNLEVIPIHsedgtiEHVCLC 119 ident || | | | Sbjct PETQGSyFDALCRKVLATGREQQTRV---dSLYSP-gXTIEVTAAADS------GALVVH 99 DSSP HHHLLLhHHHHHHHHHHHLLLEEEEE---eLLLLL-lLEEEEEEEEEL------LEEEEE DSSP EEEEELl Query VYDVTIq 126 ident ||| Sbjct FRDVTAe 106 DSSP EEELLLl
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLEEEEEELLLLEEEELHHHHHLLLLLHHHHLLLLHHHhL Query fqsnaxaksrlllselldqlSFALCIVRNDYVIVKVNEYFESRVIFDGETXQGKNILElF 60 ident | | | | | | | Sbjct -----------fsesileslETAIITLSKDGRITEWNKKAEQLFGLKKENVLGRRLKD-L 48 DSSP -----------lllllhhhlLLEEEEEELLLLLLLLLHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLL-L DSSP HHHHhHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLlLLLLllllleEEEEEEEEEELL-LLLEEEEEEE Query PESAdYLKRKIDTALVIESSSFSSWEqKPHLlpfeqxYQNLEVIPIHSE-DGTIEHVCLC 119 ident | | | | | | | | Sbjct PDFE-EIGSVAESVFENKEPVFLNFY-KFGE-----rYFNIRFSPFRNAkTQLLEGVIIT 101 DSSP LLLL-HHHHHHHHHHHHLLLLEEELL-LLLL-----lLLEEEEEEELLLlLLLLLEEEEE DSSP EE-EEEL----------------------------------------------------- Query VY-DVTI----------------------------------------------------- 125 ident Sbjct IDdVTELykyeeerkrrerlsilgemtarvaheirnpitiiggfimrmkkhlddpetlkk 161 DSSP EElLLLLllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 125 ident Sbjct yiniitnelsrletivkeileyskervleftefnlnelirevyvlfeekirkmnidfcfe 221 DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhllllllleee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 125 ident Sbjct tdnedlrveadrtrikqvlinlvqnaieatgengkikitsedmytkvrvsvwnsgppipe 281 DSSP ellllleeeelhhhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeeeeeelleeeeeeeeelllllh DSSP ----------------------------------------------------l Query ----------------------------------------------------q 126 ident Sbjct elkekifspffttlglsicrkiiedehggkiwtenrengvvfifeipktpekr 334 DSSP hhhllllllllllllllhhhhhhhhllllllleeellleeeeeeeeellllll
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLLEEEEEELLLLEEEELHHHHHLLLLLHHHHLLLLHHHHL Query fqsnaxaksrlllsellDQLSFALCIVRNDYVIVKVNEYFESRVIFDGETXQGKNILELF 60 ident | || | | | | Sbjct -----------------SDSPDGIVHLTTNGTILSVNPSXAGRLGADPDTLVGQQLSAVX 43 DSSP -----------------LLLLLEEEEEELLLLEEEELHHHHHHHLLLHHHHLLLLHHHLL DSSP -HHHHhHHHHHHHHHHHhlLLEEEELLLLLLlllllleeEEEEEEEEELLlLLEEEEEEE Query -PESAdYLKRKIDTALVieSSSFSSWEQKPHllpfeqxyQNLEVIPIHSEdGTIEHVCLC 119 ident | | | | || | | Sbjct dSEAAnQRLEAGKSAVEngTATRSEDAVGGR-------hYHNQYIPVDSH-RKSDTFQLV 95 DSSP lHHHHhHHHHHHHHHHHhlLLEEEEEEELLE-------eEEEEEEELLLL-LLLLEEEEE DSSP EEEEEll Query VYDVTiq 126 ident | | Sbjct SRDIT-- 100 DSSP EEELL--
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhHHHHH---------------------LLEEEEEELLLLEEEELHH Query fqsnaxaksrlllseLLDQL---------------------SFALCIVRNDYVIVKVNEY 39 ident | | | | Sbjct ---------------MEHVAfgsedientlakmddgqldglAFGAIQLDGDGNILQYNAA 45 DSSP ---------------LLLLLlllllhhhhhllllhhhhlllLLEEEEEELLLLEEEELHH DSSP HHHLLLLLHHHHLLLLHHH-HLHHHHH-HHHHHHHHHHHHLL-LEEEELllllLLLL-ll Query FESRVIFDGETXQGKNILE-LFPESAD-YLKRKIDTALVIES-SSFSSWeqkpHLLP-fe 95 ident | | ||| | | Sbjct EGDIVGRDPKQVIGKNFFKdVAPCTDSpEFYGKFKEGVASGNlNTMFEY----TFDYqmt 101 DSSP HHHHHLLLHHHHLLLLHHHhHLHHHLLlLLHHHHHHHHHHLLlEEEEEE----EELLlll DSSP leEEEEEEEEEELllllEEEEEEEEEEEell Query qxYQNLEVIPIHSedgtIEHVCLCVYDVtiq 126 ident | | | Sbjct ptKVKVHMKKALS----GDSYWVFVKRV--- 125 DSSP leEEEEEEEELLL----LLEEEEEEEEL---
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLEEEEEELLLLEEEELHHHHHLLLLLHHHHLLLLHH-HH Query fqsnaxaksrlllselldqlSFALCIVRNDYVIVKVNEYFESRVIFDGETXQGKNIL-EL 59 ident | || | | | | | Sbjct ----irgtidgmgtaefdalPVGAIQVDGSGVIHRYNRTESRLSGRIPERVIGRNFFtEV 56 DSSP ----lllllllllhhhhlllLLEEEEEELLLLEEEELHHHHHHHLLLHHHHLLLLHHhHH DSSP LHHHHH-HHHHHHHHHHHHLL-LEEEELlLLLLlllllleEEEEEEEEEELllllEEEEE Query FPESAD-YLKRKIDTALVIES-SSFSSWeQKPHllpfeqxYQNLEVIPIHSedgtIEHVC 117 ident | Sbjct APCTNIpAFSGRFMDGVTSGTlDARFDF-VFDF--qmapvRVQIRMQNAGV----PDRYW 109 DSSP LHHHLLlLLHHHHHHHHHHLLlEEEEEE-EELL--lllleEEEEEEEELLL----LLEEE DSSP EEEEEeell Query LCVYDvtiq 126 ident | Sbjct IFVRK---- 114 DSSP EEEEL----
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DSSP lhhhhhhhhhhhhhHHHHHHLLEEEEEELLLLEEEELHHHHhlllllhhhhllllhhhhl Query fqsnaxaksrlllsELLDQLSFALCIVRNDYVIVKVNEYFEsrvifdgetxqgknilelf 60 ident | | | | Sbjct --swqtyvddhlmcDIDGHRLTAAAIIGHDGSVWAQSSSFP------------------- 39 DSSP --llllllllllllLLLLLLLLLLEEEELLLLLLEELLLLL------------------- DSSP hhHHHHHHHHHHHH----------------------hhHLLLEEEELllllllllllleE Query peSADYLKRKIDTA----------------------lvIESSSFSSWeqkphllpfeqxY 98 ident | Sbjct qfKSDEVAAVMKDFdepgslaptglhlggtkymviqgePGAVIRGKK-----------gS 88 DSSP llLHHHHHHHHHHHhllllhhhhleelllleeeellllLLLLLEEEL-----------lL DSSP EEEEEEEEelllllEEEEEEEEEEEE--------------------ll Query QNLEVIPIhsedgtIEHVCLCVYDVT--------------------iq 126 ident | || Sbjct GGITVKRT------GQALIIGIYDEPltpgqcnmiverlgdylldqgl 130 DSSP LEEEEEEL------LLEEEEEEELLLllhhhhhhhhhhhhhhhhllll
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DSSP --lhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLEEEEEELL-----LLEEEELhhHHHLllllhhhHLL Query --fqsnaxaksrlllselldqLSFALCIVRND-----YVIVKVNeyFESRvifdgetXQG 53 ident | | | Sbjct ghxsrnllaivhpilrnlxeeSGETVNXAVLDqsdheAIIIDQV--QCTH-lxrxsaPIG 57 DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLEEEEEEEElllleEEEEEEE--LLLL-leeellLLL DSSP LLHhhhlhhhhhhHHHH--HHHHHHHL--------------------------------- Query KNIlelfpesadyLKRK--IDTALVIE--------------------------------- 78 ident | Sbjct GKL----------PXHAsgAGKAFLAQlseeqvtkllhrkglhaythatlvspvhlkedl 107 DSSP LEE----------ELLLlhHHHHHHHHllhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhh DSSP ------LLEEEELLlllllllllleEEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEEE-------- Query ------SSSFSSWEqkphllpfeqxYQNLEVIPIHSEDGTIEHVCLCVYDVT-------- 124 ident || | | | Sbjct aqtrkrGYSFDDEE--------halGLRCLAACIFDEHREPFAAISISGPISritddrvt 159 DSSP hhhhhhLLEEEELL--------lllLEEEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEELLlllhhhhh DSSP ---------------------ll Query ---------------------iq 126 ident Sbjct efgaxvikaakevtlayggxrgs 182 DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
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DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllleeeelhhhhhlllllhhhhllllhhhhl Query fqsnaxaksrlllselldqlsfalcivrndyvivkvneyfesrvifdgetxqgknilelf 60 ident Sbjct ------------------------------------------------------lsdypw 6 DSSP ------------------------------------------------------llllll DSSP hhhhhHHHHHHHHHHH-----hLLLEEEELLLllllllllleEEEEEEEEEEllllleEE Query pesadYLKRKIDTALV-----iESSSFSSWEQkphllpfeqxYQNLEVIPIHsedgtiEH 115 ident | | Sbjct fhgtlSRVKAAQLVLAggprshGLFVIRQSET--------rpGECVLTFNFQ------GK 52 DSSP lllllLHHHHHHHHHLlhhhhlLLEEEEELLL--------llLLEEEEEEEL------LE DSSP EEEEEEE-----------------------eell Query VCLCVYD-----------------------vtiq 126 ident Sbjct AKHLRLSgqchvqhlwfqsvfdxlrhfhthpipl 86 DSSP EEEEEELllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll
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DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllleeeelhhhhhlllllhhhhllllhhhhl Query fqsnaxaksrlllselldqlsfalcivrndyvivkvneyfesrvifdgetxqgknilelf 60 ident Sbjct ----------------------------------------------------gssgssgw 8 DSSP ----------------------------------------------------llllllll DSSP hhhhhHHHHHHHHHHHHL---LLEEEELLLllllllllleEEEEEEEEEE--LLLL-LEE Query pesadYLKRKIDTALVIE---SSSFSSWEQkphllpfeqxYQNLEVIPIH--SEDG-TIE 114 ident Sbjct yhghmSGGQAETLLQAKGepwTFLVRESLS--------qpGDFVLSVLSDqpKAGPgSPL 60 DSSP lllllLHHHHHHHHHHHLlllEEEEEELLL--------llLLEEEEEEEEeeLLLLlLLE DSSP EEEEEEEEEEL----------------------------------------------l Query HVCLCVYDVTI----------------------------------------------q 126 ident | Sbjct RVTHIKVMCEGgrytvggletfdsltdlvehfkktgieeasgafvylrqpyysgpssg 118 DSSP EEEEEEEEEELleeelllllllllhhhhhhhhhhhleellllleellleellllllll
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