Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition.
The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure, to pre-computed structural neighbours in the Dali Database,
and to the PDB format coordinate file where the neighbour
is superimposed onto the query structure.
Expand gaps
Summary
No: Chain Z rmsd lali nres %id PDB Description
1: 1dbg-A 12.0 3.8 227 481 10 PDB MOLECULE: CHONDROITINASE B;
2: 2pyh-B 11.5 3.5 211 377 6 PDB MOLECULE: POLY(BETA-D-MANNURONATE) C5 EPIMERASE 4;
3: 1ktw-A 11.3 3.7 215 457 8 PDB MOLECULE: IOTA-CARRAGEENASE;
4: 2v5i-A 10.8 3.6 207 553 8 PDB MOLECULE: SALMONELLA TYPHIMURIUM DB7155 BACTERIOPHAGE DET7
5: 1hg8-A 10.8 3.1 191 349 8 PDB MOLECULE: ENDOPOLYGALACTURONASE;
6: 2iq7-A 10.3 3.6 197 339 8 PDB MOLECULE: ENDOPOLYGALACTURONASE;
7: 2inu-A 10.2 3.3 183 399 10 PDB MOLECULE: INULIN FRUCTOTRANSFERASE;
8: 1ia5-A 10.2 3.5 195 339 6 PDB MOLECULE: POLYGALACTURONASE;
9: 1ru4-A 10.1 3.5 212 400 7 PDB MOLECULE: PECTATE LYASE;
10: 1nhc-A 9.8 3.8 212 336 8 PDB MOLECULE: POLYGALACTURONASE I;
11: 1jta-A 9.6 4.2 217 361 9 PDB MOLECULE: PECTATE LYASE A;
12: 1bn8-A 9.5 4.1 216 399 8 PDB MOLECULE: PROTEIN (PECTATE LYASE);
13: 1qjv-A 9.5 4.3 198 342 6 PDB MOLECULE: PECTIN METHYLESTERASE;
14: 2vji-A 9.4 3.6 199 598 9 PDB MOLECULE: TAILSPIKE PROTEIN;
15: 1vbl-A 9.0 3.8 215 416 7 PDB MOLECULE: PECTATE LYASE 47;
16: 1gq8-A 9.0 4.1 198 319 7 PDB MOLECULE: PECTIN METHYLESTERASE;
17: 1ogm-X 8.5 3.6 198 572 8 PDB MOLECULE: DEXTRANASE;
18: 3grh-A 8.5 3.8 185 397 6 PDB MOLECULE: ACYL-COA THIOESTER HYDROLASE YBGC;
19: 1bhe-A 8.5 3.5 193 376 5 PDB MOLECULE: POLYGALACTURONASE;
20: 2iou-G 8.5 3.3 175 508 10 PDB MOLECULE: MAJOR TROPISM DETERMINANT P1;
21: 1xg2-A 8.3 4.0 201 317 5 PDB MOLECULE: PECTINESTERASE 1;
22: 1idj-A 8.3 3.8 196 359 8 PDB MOLECULE: PECTIN LYASE A;
23: 1qcx-A 8.2 3.6 176 359 7 PDB MOLECULE: PECTIN LYASE B;
24: 2w7z-B 8.2 3.2 159 208 6 PDB MOLECULE: PENTAPEPTIDE REPEAT FAMILY PROTEIN;
25: 2qx3-A 8.1 3.6 175 330 9 PDB MOLECULE: PECTATE LYASE II;
26: 1dab-A 8.0 3.4 200 539 7 PDB MOLECULE: P.69 PERTACTIN;
27: 1pxz-A 8.0 3.4 167 346 8 PDB MOLECULE: MAJOR POLLEN ALLERGEN JUN A 1;
28: 3jur-D 7.5 3.3 165 446 12 PDB MOLECULE: EXO-POLY-ALPHA-D-GALACTURONOSIDASE;
29: 2uve-A 7.4 3.7 204 571 7 PDB MOLECULE: EXOPOLYGALACTURONASE;
30: 1ee6-A 7.4 3.1 146 197 9 PDB MOLECULE: PECTATE LYASE;
31: 3jx8-A 7.2 3.5 162 247 10 PDB MOLECULE: PUTATIVE LIPOPROTEIN;
32: 1o88-A 6.7 4.1 184 352 9 PDB MOLECULE: PECTATE LYASE C;
33: 3b4n-A 6.4 3.3 137 314 7 PDB MOLECULE: ENDO-PECTATE LYASE;
34: 1k5c-A 6.1 3.7 169 333 9 PDB MOLECULE: ENDOPOLYGALACTURONASE;
35: 3eqn-A 5.4 3.8 162 752 6 PDB MOLECULE: GLUCAN 1,3-BETA-GLUCOSIDASE;
36: 2vfp-A 5.2 4.9 181 556 4 PDB MOLECULE: P22 TAILSPIKE PROTEIN;
37: 2qyu-A 5.2 3.1 140 620 9 PDB MOLECULE: SECRETED EFFECTOR PROTEIN;
38: 2z7x-B 4.9 4.8 166 520 7 PDB MOLECULE: TOLL-LIKE RECEPTOR 2, VARIABLE LYMPHOCYTE
39: 2yuh-A 4.9 4.2 135 179 6 PDB MOLECULE: TUBULIN-SPECIFIC CHAPERONE C;
40: 3gqn-A 4.8 4.7 169 767 7 PDB MOLECULE: PRENECK APPENDAGE PROTEIN;
41: 1xwd-C 4.7 3.9 153 242 4 PDB MOLECULE: GLYCOPROTEIN HORMONES ALPHA CHAIN;
42: 1wxr-A 4.5 3.8 133 1035 8 PDB MOLECULE: HAEMOGLOBIN PROTEASE;
43: 2v9t-B 4.4 4.1 138 210 4 PDB MOLECULE: ROUNDABOUT HOMOLOG 1;
44: 3h09-B 4.1 4.4 168 964 8 PDB MOLECULE: IMMUNOGLOBULIN A1 PROTEASE;
45: 2odl-A 4.1 4.5 169 372 9 PDB MOLECULE: ADHESIN;
46: 1ds9-A 4.0 4.5 126 198 6 PDB MOLECULE: OUTER ARM DYNEIN;
47: 1h80-A 3.9 4.4 149 432 9 PDB MOLECULE: IOTA-CARRAGEENASE;
48: 2qv3-A 3.8 4.1 160 447 7 PDB MOLECULE: VACUOLATING CYTOTOXIN;
49: 1rwr-A 3.8 3.9 148 297 11 PDB MOLECULE: FILAMENTOUS HEMAGGLUTININ;
50: 2v70-A 3.8 4.4 131 210 8 PDB MOLECULE: SLIT HOMOLOG 2 PROTEIN N-PRODUCT;
51: 2vbk-A 3.7 4.3 172 511 4 PDB MOLECULE: TAILSPIKE-PROTEIN;
52: 3fxi-A 3.7 4.3 146 601 10 PDB MOLECULE: TOLL-LIKE RECEPTOR 4;
53: 2a0z-A 3.5 4.5 137 671 6 PDB MOLECULE: TOLL-LIKE RECEPTOR 3;
54: 2bm5-A 3.5 3.5 116 183 6 PDB MOLECULE: PENTAPEPTIDE REPEAT FAMILY PROTEIN;
55: 1yy9-A 3.4 3.9 133 613 5 PDB MOLECULE: EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR;
56: 1k8f-A 3.4 3.8 109 157 7 PDB MOLECULE: ADENYLYL CYCLASE-ASSOCIATED PROTEIN;
57: 2z7x-A 3.3 4.2 149 549 5 PDB MOLECULE: TOLL-LIKE RECEPTOR 2, VARIABLE LYMPHOCYTE
58: 1m6b-B 3.2 4.0 118 584 6 PDB MOLECULE: RECEPTOR PROTEIN-TYROSINE KINASE ERBB-3;
59: 1ogq-A 3.1 3.7 137 313 4 PDB MOLECULE: POLYGALACTURONASE INHIBITING PROTEIN;
60: 2z80-A 2.9 4.1 131 321 7 PDB MOLECULE: TOLL-LIKE RECEPTOR 2, VARIABLE LYMPHOCYTE
61: 1czf-A 2.9 3.9 114 335 15 PDB MOLECULE: POLYGALACTURONASE II;
62: 3g04-C 2.9 4.3 131 228 8 PDB MOLECULE: HUMAN THYROID STIMULATING AUTOANTIBODY M22 LIGHT
63: 2wfh-A 2.8 4.2 117 181 5 PDB MOLECULE: SLIT HOMOLOG 2 PROTEIN C-PRODUCT;
64: 2dtg-E 2.7 4.4 128 807 7 PDB MOLECULE: FAB 83-7 HEAVY CHAIN;
65: 2o6r-A 2.7 4.0 109 177 5 PDB MOLECULE: VARIABLE LYMPHOCYTE RECEPTOR B;
66: 1rmg-A 2.6 4.3 140 422 5 PDB MOLECULE: RHAMNOGALACTURONASE A;
67: 2zu0-A 2.5 4.8 133 416 7 PDB MOLECULE: PROTEIN SUFD;
68: 2b0r-A 2.3 3.7 101 164 5 PDB MOLECULE: POSSIBLE ADENYL CYCLASE-ASSOCIATED PROTEIN;
69: 1jiw-P 2.2 5.0 135 470 12 PDB MOLECULE: ALKALINE METALLOPROTEINASE;
70: 2z64-A 2.1 4.1 132 599 7 PDB MOLECULE: TOLL-LIKE RECEPTOR 4;
Pairwise Structural Alignments
Notation: three-state secondary structure definitions by DSSP (reduced to H=helix, E=sheet, L=coil) are shown above the amino acid sequence. Structurally equivalent residues are in uppercase, structurally non-equivalent residues (e.g. in loops) are in lowercase. Amino acid identities are marked by vertical bars.
No 1: Query=mol1A Sbjct=1dbgA Z-score=12.0
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DSSP --------------------------llLLLLLlHHHH---------------------- Query --------------------------dsYTRVPgDGAG---------------------- 12 ident | | Sbjct qvvasnetlyqvvkevkpgglvqiadgtYKDVQlIVSNsgksglpitikalnpgkvfftg 60 DSSP leellhhhhhhhhhhllllleeeelleeEELLEeEELLllllllleeeeellllleeeee DSSP hlllllLLLLllLEEELLHH--------------hhLLHHhhllllLLEEEEEllLEELL Query glfekgNGTDskPYXIXNAT--------------qiRNXRsvlksgXKVYFQLgaDIDXA 58 ident | Sbjct dakvelRGEH--LILEGIWFkdgnraiqawkshgpgLVAI-----yGSYNRIT--ACVFD 111 DSSP lleeeeLLLL--EEEELLEEeeelllllllllllllLEEE-----lLLLLEEE--LLEEE DSSP LLL-LLLL----lllllLLLLLEEEEEeeEEEElLEELLLllLLLLLEE----------- Query GID-DWQS----lngsgDFPYEIDFDGdsHVIKnFKCSAGdyPSFFGVL----------- 102 ident | | Sbjct CFDeANSAyittsltedGKVPQHCRID--HCSF-TDKITF--DQVINLNntaraikdgsv 166 DSSP LLLlLLLLleeelllllLLLLLLLEEE--LLEE-ELLLLL--LLLEEELlllllllllll DSSP ----LEEEEEEEEEeEEEELLLLlEELLeeEELLLLLllhhhLEEEELLEEEEEEEElll Query ----CGDCRNVGFVnASVSSARQgIGIItgYLGLKDKgngnkTGRIVNCYTTGEVIGsga 158 ident | | | | Sbjct ggpgMYHRVDHCFF-SNPQKPGNaGGGI--RIGYYRN--digRCLVDSNLFMRQDSE--- 218 DSSP llllLLLEEELLEE-EELLLLLLlLLLE--EELLLLL--lllLLEEELLEEEEELLL--- DSSP EELLeeEELLLllllLLEEEEEEELLEEeellllleeeELLEeEELLLLLEEEEEEELLL Query AGGIagVLANSydgqESYIKNCYSNATVsdraasggkaGGIAgRKVGVGGFIENCYAYGA 218 ident | | | | | | | Sbjct AEII--TSKSQ----ENVYYGNTYLNCQ----------GTMN-FRHGDHQVAINNFYIGN 261 DSSP LEEE--EEELL----LLEEELLEEELLL----------LEEE-EEELLLLEEELLEEEEL DSSP eeelleeeeLLEEEELllLLEEEEEEEELL-LEEELllllEEELlEEEL----------H Query vsatkggvgGILGQIDksCDIAIKNSAAWS-NLTGVdassTVGRiVGVS----------A 267 ident | | | Sbjct ---dqrfgyGGMFVWG--SRHVIACNYFELsETIKS---rGNAA-LYLNpgamasehalA 312 DSSP ---llllllLLEEELL--LLLEEELLEEEElLLLHH---hLLEE-EEELllllllllllL DSSP HHEEEEEEEEElLLLEE-------------------------------------ellEEE Query SLGSYENCYACeSIVLK-------------------------------------vneKTI 290 ident | Sbjct FDMLIANNAFI-NVNGYaihfnplderrkeycaanrlkfetphqlmlkgnlffkdkpYVY 371 DSSP LLEEEELLEEE-LLLLEeeellllhhhhhhhhhhlllllllllleeeelleeellllLLL DSSP LLLLL--------------------------------------lllllllllleeelhhh Query TASDE--------------------------------------ssatgttfhgvaksaee 312 ident Sbjct PFFKDdyfiagknswtgnvalgvekgipvnisanrsaykpvkikdiqpiegialdlnali 431 DSSP LLEELlllllllleeelleeellllllllllllllllllllllllllllllllllhhhhh DSSP hhHHHHhhlllleelllllLLEE-LLLL-------------------------------- Query lgNIIVawnpnlwkkgtngYPIF-QWSE-------------------------------- 339 ident | | Sbjct skGITG-------------KPLSwDEVRpywlkempgtyaltarlsadraakfkavikrn 478 DSSP hhLLLL-------------LLLLhHHLLllllllllllhhhhllllhhhhhhhhhhhhhl DSSP --- Query --- 339 ident Sbjct keh 481 DSSP lll
DSSP ------------------------------------------------------LLLLll Query ------------------------------------------------------DSYTrv 6 ident Sbjct mdynvkdfgalgdgvsddrasiqaaidaayaagggtvylpageyrvsaagepgdGCLM-- 58 DSSP lleehhhhlllleeeeelhhhhhhhhhhhhhllleeeellleeeeelllllhhhLLEE-- DSSP llHHHH----------------------------------HLLL---------------- Query pgDGAG----------------------------------GLFE---------------- 16 ident | Sbjct -lKDGVylagagmgetviklidgsdqkitgmvrsaygeetSNFGmrdltldgnrdntsgk 117 DSSP -eLLLEeeelllllleeeeellllllllllleeellllllEEEEeeeeeeellhhhllll DSSP --------lllllLLLLEEELLHH-hhllhhhhllllLLEEEEElllEELL--lllllLL Query --------kgngtDSKPYXIXNAT-qirnxrsvlksgXKVYFQLgadIDXA--giddwQS 65 ident | Sbjct vdgwfngyipggdGADRDVTIERVevremsgygfdphEQTINLT--iRDSVahdngldGF 175 DSSP llleeelllllllLLEEEEEEEEEeeelllllleeelLLEEEEE--eELLEeelllllLE DSSP LLllllllLLEEEEEeeeeEELLEEL-LLLLLLllLEELE-EEEEeeEEEEEEELLLLLE Query LNgsgdfpYEIDFDGdshvIKNFKCS-AGDYPSffGVLCG-DCRNvgFVNASVSSARQGI 123 ident | | | Sbjct VA------DYLVDSV----FENNVAYaNDRHGF--NVVTStHDFV--MTNNVAYGNGSSG 221 DSSP EE------ELEEEEE----EELLEEElLLLLLE--EEELLlEEEE--EELLEEELLLLLL DSSP ElleEEELLllLLLHhHLEEEElLEEEEEEE-ELLLEElleEEELlllllllLEEEeEEE Query GiitGYLGLkdKGNGnKTGRIVnCYTTGEVI-GSGAAGgiaGVLAnsydgqeSYIKnCYS 182 ident | Sbjct L---VVQRG--LEDL-ALPSNI-LIDGGAYYdNAREGV---LLKM-------TSDI-TLQ 263 DSSP E---EEELL--LLLL-LLLEEE-EEELLEEElLLLLLE---EEEL-------LEEE-EEE DSSP LLEEEELLlllEEEElleEEELlllLEEEeEEELLLE-EELL---EEEElleEEELLL-- Query NATVSDRAasgGKAGgiaGRKVgvgGFIEnCYAYGAV-SATK---GGVGgilGQIDKS-- 236 ident || Sbjct NADIHGNG---SSGV---RVYG---AQDV-QILDNQIhDNAQaaaVPEV---LLQSFDdt 310 DSSP LLEEELLL---LLLE---EEEL---LLLL-EEELLEEeLLLLlllLLLE---EEELEEll DSSP -------lLEEEEeEEELLLEEELLllLEEElleEELHHHEEEeeEEEEllLLEEELlee Query -------cDIAIKnSAAWSNLTGVDasSTVGrivGVSASLGSYenCYACesIVLKVNekt 289 ident | | | Sbjct agasgtyyTTLNT-RIEGNTISGSAnsTYGI---QERNDGTDY-sSLID-nDIAGVQ--- 361 DSSP lllllleeLLLLE-EEELLEEELLLllLEEE---EELLLLLLL-eEEEL-lEEELLL--- DSSP elllllLLLLlllllLEEELHhhhhhhhhhhlllleellllllleellll Query itasdeSSATgttfhGVAKSAeelgniivawnpnlwkkgtngypifqwse 339 ident | Sbjct --qpiqLYGP---hsTVSGEP----------------------------- 377 DSSP --eeeeLLLL---llEEELLL-----------------------------
DSSP -----------------------------------LLLLLLLlhhhHHLL-LLLL----- Query -----------------------------------DSYTRVPgdgaGGLF-EKGN----- 19 ident Sbjct vspktykdadfyvaptqqdvnydlvddfgangndtSDDSNAL---qRAINaISRKpnggt 57 DSSP lllllllhhhllllllllleeeehhhhhlllllllLLLHHHH---hHHHHhHHLLlllee DSSP ---------llllllEEELLH------------hhhllhhhhlllllLEEEEELlLEELL Query ---------gtdskpYXIXNA------------tqirnxrsvlksgxKVYFQLGaDIDXA 58 ident Sbjct llipngtyhflgiqmKSNVHIrvesdviikptwngdgknhrlfevgvNNIVRNF-SFQGL 116 DSSP eeellleeeelleelLLLEEEeelllleeeelllllllleeeeeellLLLEEEE-EEEEL DSSP --LLLL---------lLLLLllllllllEEEEEeeEEEElLEELL---LLLLLllLEELE Query --GIDD---------wQSLNgsgdfpyeIDFDGdsHVIKnFKCSA---GDYPSffGVLCG 104 ident | | | | Sbjct gnGFLVdfkdsrdknlAVFK-------lGDVRN--YKIS-NFTIDdnkTIFAS--ILVDV 164 DSSP llLEEEelllllllleEEEE-------eLLEEE--EEEE-EEEEElllLLLLL--EEELE DSSP --------EEEEEEEEeEEEELLL--LLEElleEEELllllllhhhleEEELLEEEEEEE Query --------DCRNVGFVnASVSSAR--QGIGiitGYLGlkdkgngnktgRIVNCYTTGEVI 154 ident || | Sbjct terngrlhWSRNGIIE-RIKQNNAlfGYGL---IQTY-----------GADNILFRNLHS 209 DSSP eeelleeeEEEEEEEE-EEEEELLllLLEE---EEEL-----------EEEEEEEEEEEE DSSP ELLLEElleEEELL---LLLLLLLEEEEEEELLEEEELLlllEEEElleEEELLlLLEEE Query GSGAAGgiaGVLAN---SYDGQESYIKNCYSNATVSDRAasgGKAGgiaGRKVGvGGFIE 211 ident | | | | | Sbjct EGGIAL---RMETDnllMKNYKQGGIRNIFADNIRCSKG---LAAV---MFGPH-FMKNG 259 DSSP ELLEEE---EEELLlhhHHHHLLLEEEEEEEEEEEEELL---LEEE---EEELL-LLLLL DSSP EEEELLLEEELLEEEElleEEELLL----------------------------------- Query NCYAYGAVSATKGGVGgilGQIDKS----------------------------------- 236 ident | | Sbjct DVQVTNVSSVSCGSAV---RSDSGFvelfsptdevhtrqswkqavesklgrgcaqtpyaw 316 DSSP LEEEEEEEEELLLLLE---EELLLLleeellllllllhhhhhhhhhhhhlllllllllll DSSP --------------------lleEEEEEEELLLEEELL---------------------- Query --------------------cdiAIKNSAAWSNLTGVD---------------------- 254 ident Sbjct aarvtqkdacldkakleygiepgSFGTVKVFDVTARFGynadlkqdqldyfstsnpmckr 376 DSSP eeellllhhhhhhhhhhhlllllLLLLEEEEEEEEELLlleeelhhhhhhhhllllllll DSSP ------------------LLLEEElleEELHH----HEEEeeEEEEllLLEEELLEeell Query ------------------ASSTVGrivGVSAS----LGSYenCYACesIVLKVNEKtita 292 ident | | | Sbjct vclptkeqwskqgqiyigPSLAAV---IDTTPetskYDYD--VKTF--NVKRINFP-vns 428 DSSP llllllllllllllleeeLLLLLE---EELLLllllLLLL--LEEE--EEEEELLL-lll DSSP llllLLLLllllleeelhhhhhhhhhhhlllleellllllleellll Query sdesSATGttfhgvaksaeelgniivawnpnlwkkgtngypifqwse 339 ident Sbjct hktiDTNT------------------essrvcnyygmsecsssrwer 457 DSSP lleeELLL------------------lllllllllllllllhhhhhl
DSSP ---------------------LLLL--lllLHHHHH-------------------LLLL- Query ---------------------DSYT--rvpGDGAGG-------------------LFEK- 17 ident || Sbjct aafrqeankkfkysvklsdysTLQDavtdaVDGLLIdinynftdgesvdfxgkilTINCk 60 DSSP lhhhhhhhhhllleeehhhllLHHHhhhhlLLEEEEllleelllleeeellllllEEEEl DSSP -----------lllllLLLEEELLH----------------------------------- Query -----------gngtdSKPYXIXNA----------------------------------- 31 ident Sbjct akfigdgalifnnmgpGSVINQPFMeskttpwvifpwdadgkwitdaalvaatlkqskie 120 DSSP lleelleeeeeellllLLEEELLEEellllleelllllllllllllhhhhhllleellll DSSP ---------------------------hhhLLHHhhlLLLLLEEEEEllLEELlllllll Query ---------------------------tqiRNXRsvlKSGXKVYFQLgaDIDXagiddwq 64 ident | | Sbjct gyqpgvndwvkfpgleallpqnvkdqhiaaTLDI---RSASRVEIRN-aGGLM------- 169 DSSP lllllhhhhhhlllhhhhllhhhhllllleEEEE---ELLLLLEEEL-lEEEE------- DSSP lllllllLLLL-EEEEEeeEEEELLEElllllLLLLLE-------eLEEEEEEEEEEEEE Query slngsgdFPYE-IDFDGdsHVIKNFKCsagdyPSFFGV-------lCGDCRNVGFVNASV 116 ident | | | Sbjct --aaylfRSCHhCKVID-sDSIIGGKD-----GIITFEnlsgdwglGNYVIGGRVHYGSG 221 DSSP --eeeeeELLLlLEEEE-eEEEEELLL-----LLEEEEllllllllLLEEEEEEEEELLL DSSP ellllleELLEEEELLLLLllhhhLEEEELLEEEEEEEellleELLEEE----ellllll Query ssarqgiGIITGYLGLKDKgngnkTGRIVNCYTTGEVIgsgaaGGIAGV----lansydg 172 ident | | Sbjct -------SGVQFLRNNGGE---shNGGVIGVTSWRAGE-----SGFKTYqgsvgggtarn 266 DSSP -------LLEEEELLLLLL---llLLEEELLEEELLLL-----LLEEELlleelleelll DSSP lLLEEEEEEELLEEEellllleeeELLEEEEL-----------------------LLLLE Query qESYIKNCYSNATVSdraasggkaGGIAGRKV-----------------------GVGGF 209 ident | | Sbjct yNLQFRDSVALSPVW---------DGFDLGSDpgmapepdrpgdlpvseypfhqlPNNHL 317 DSSP lLLEEEEEEEELLLL---------LLEELLLLlllllllllllllllllllllllLLLLE DSSP EEEEEELLLEEelleeeELLEeEELLllLEEEEEEEEL-LLEEellllleeeLLEEELhH Query IENCYAYGAVSatkggvGGILgQIDKscDIAIKNSAAW-SNLTgvdasstvgRIVGVSaS 268 ident | | | Sbjct VDNILVMNSLG------VGLG-MDGS--GGYVSNVTVQdCAGA---------GMLAHT-Y 358 DSSP EEEEEEELLLL------EEEE-EEEE--LLEEEEEEEElLLLE---------EEEEEE-E DSSP HEEEEEEEEElLLLE-EELL-----------------------EEELLLLLlllLLLL-- Query LGSYENCYACeSIVL-KVNE-----------------------KTITASDEssaTGTT-- 302 ident | | Sbjct NRVFSNITVI-DCNYlNFDSdqiiiigdcivngiraagikpqpSNGLVISA--pNSTIsg 415 DSSP LLEEEEEEEE-LLLLlLLLLlleeelllleeeeeellllllllLLLLLEEE--eEEEEee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 302 ident Sbjct lvgnvppdkilvgnlldpvlgqsrvigfnsdtaelalrinklsatldsgalrshlngyag 475 DSSP eellllllleeeeeelllllllllllllllleeeeeellllllllllleeeeeeelllll DSSP -----------------------------------------llleeelhhhhhhhhhhhl Query -----------------------------------------fhgvaksaeelgniivawn 321 ident Sbjct sgsawteltalsgstpnavslkvnrgdyktteipisgtvlpdegvldintmslyldagal 535 DSSP llleeeeeeeeelleeeeeeeeelhhhllleelllllllllhhhllllleeeeeeellee DSSP llleellllllleellll Query pnlwkkgtngypifqwse 339 ident Sbjct walirlpdgsktrmklsv 553 DSSP eeeeellllleeeeelll
DSSP llllllllhhhhhllllllllllllEEELlhhHHLLHHHHLLllllEEEEElLLEELllL Query dsytrvpgdgagglfekgngtdskpYXIXnatQIRNXRSVLKsgxkVYFQLgADIDXagI 60 ident | Sbjct -----------------------dpCSVT---EYSGLATAVS--scKNIVL-NGFQV--P 29 DSSP -----------------------llLEEL---LHHHHHHHHH--hlLEEEE-LLLEE--L DSSP LLLLLLLllllLLLL--EEEEEEeEEEElLEELL-lLLLLLlLEEL--EEEEE---EEEE Query DDWQSLNgsgdFPYE--IDFDGDsHVIKnFKCSA-gDYPSFfGVLC--GDCRN---VGFV 112 ident | | | | Sbjct TGKQLDL----SSLQndSTVTFK-GTTT-FATTAdnDFNPI-VISGsnITITGasgHVID 82 DSSP LLLLEEE----LLLLllLEEEEL-LEEE-ELLLLllLLLLE-EEEEelLEEEElllLEEE DSSP EEE----------eelllllEELLeEEELLLllllhhHLEEEELLEEEEEEEellleeLL Query NAS----------vssarqgIGIItGYLGLKdkgngnKTGRIVNCYTTGEVIgsgaagGI 162 ident | | | Sbjct GNGqaywdgkgsnsnsnqkpDHFI-VVQKTT------GNSKITNLNIQNWPV------HC 129 DSSP LLHhhlllllllllllllllLEEE-EEEEEE------LLEEEELLEEELLLL------EE DSSP EEEELLLllllLLEEEEEEELL------eeeellllleeeeLLEEEELLLLLEEEEEEEL Query AGVLANSydgqESYIKNCYSNA------tvsdraasggkagGIAGRKVGVGGFIENCYAY 216 ident | | | | Sbjct FDITGSS----QLTISGLILDNragdkpnaksgslpaahntDGFDISSSDHVTLDNNHVY 185 DSSP EEEELLE----EEEEEEEEEELhhhllllllllllllllllLLEEEELLEEEEEEEEEEE DSSP LLEeelleeeELLEEEELllLLEEEEEEEELLLEeellllleeeLLEEEL--------hH Query GAVsatkggvGGILGQIDksCDIAIKNSAAWSNLtgvdasstvgRIVGVS--------aS 268 ident | | | Sbjct NQD-------DCVAVTSG--TNIVVSNMYCSGGH----------GLSIGSvggksdnvvD 226 DSSP LLL-------LLEEELLE--EEEEEEEEEEELLL----------LEEEEEelllllleeE DSSP HEEEEEEEEElLLLE----------------------eelleEELLL------------- Query LGSYENCYACeSIVL----------------------kvnekTITAS------------- 293 ident Sbjct GVQFLSSQVV-NSQNgcriksnsgatgtinnvtyqnialtniSTYGVdvqqdylnggptg 285 DSSP EEEEEEEEEE-EEEEeeeeeeelllleeeeeeeeeeeeeeeeEEEEEeeeeeelllllll DSSP ---llllllllllllEEEL---------------hhhhhhhhhhhlllleelllllllee Query ---dessatgttfhgVAKS---------------aeelgniivawnpnlwkkgtngypif 335 ident | Sbjct kptngvkisnikfikVTGTvassaqdwfilcgdgscsgftfsgnaitgggktsscnyptn 345 DSSP llllleeeeeeeeeeEEEEelllleeeeeellllleeeeeeelleeelllllleelllll DSSP llll Query qwse 339 ident Sbjct tcps 349 DSSP llll
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DSSP llllllllhhhhhlllllllllllLEEELLH-HHHLLHHHHL------lLLLLEEeeell Query dsytrvpgdgagglfekgngtdskPYXIXNA-TQIRNXRSVL------kSGXKVYfqlga 53 ident Sbjct ------------------------ATSSPSSpADWAKKLTDAvlrqkagETLTAA----- 31 DSSP ------------------------LLLLLLLhHHHHHHHHHHhhhhhllLLLLLL----- DSSP leelllllllllllllllllllEEEEEeeeEEELLEEL---LLLLL--lllLEELEEEEE Query didxagiddwqslngsgdfpyeIDFDGdshVIKNFKCS---AGDYP--sffGVLCGDCRN 108 ident || | | | Sbjct ---------------------dRDFSN--aDFRNITFSkilPPSFMerdgdIIKGFNFSN 68 DSSP ---------------------lLLLLL--lLLLLLLHHhllLHHHHlllllLEELLLLLL DSSP EEEEEEEEELlllleellEEEELllllllhhhlEEEELLEE-EEEEEEllleelleEEEL Query VGFVNASVSSarqgigiiTGYLGlkdkgngnktGRIVNCYT-TGEVIGsgaaggiaGVLA 167 ident | | | Sbjct SKFTYSDISH--------LHFDE----------CRFTYSTLsDVVCSN-------tKFSN 103 DSSP LLLLLLLLLL--------LEEEL----------LLLLLLLLlLLLLLL-------lEEEL DSSP lllllllLEEEEEEELL--EEEEllllleeeelleEEELlllLEEEEEEELlleeellee Query nsydgqeSYIKNCYSNA--TVSDraasggkaggiaGRKVgvgGFIENCYAYgavsatkgg 225 ident | | | Sbjct -------SDMNEVFLQYsiTTQQ----------qpSFID---TTLKNTLIR--------- 134 DSSP -------LLLLLLEELLllLLLL----------llEEEE---EELLLLEEL--------- DSSP eELLEEEElllllEEEE--------------------eEEELlleeellllleeelleee Query vGGILGQIdkscdIAIK--------------------nSAAWsnltgvdasstvgrivgv 265 ident Sbjct -HKANLSG-----VILNepdnssppsvsgggnfirlgdIWLQ------------------ 170 DSSP -LLLEEEE-----EELLllllllllllllllleeeellEEEE------------------ DSSP lhhheeeeeeeeelllLEEELL----------eeellllLLLLllllllLEEEL------ Query saslgsyencyacesiVLKVNE----------ktitasdESSAtgttfhGVAKS------ 309 ident | Sbjct ----mpllwtenavdgFLNHEHnngksilmtidslpdkySQEK----vqAMEDLvkslrg 222 DSSP ----llllllhhhhhhHHLLLLlllllhhhhhhlllhhhHHHH----hhHHHHHhhhhhl DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 309 ident Sbjct grlteacirpvesslvsvlahppytqsalisewlgpvqerffahqcqtyndvplpapdty 282 DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 309 ident Sbjct yqqrilpvlldsfdrnsaamtthsglfnqvilhcmtgvdctdgtrqkaaalyeqylahpa 342 DSSP hhhhlhhhhhhhhhhlllhhhhlhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhlll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 309 ident Sbjct vsphihnglfgnydgspdwttraadnflllssqdsdtammlstdtlltmlnptpdtawdn 402 DSSP lhhhlllllllllllllllllllllleeeelllllleeeeelhhhhhhhhllllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 309 ident Sbjct fyllragenvstaqispvelfrhdfpvflaafnqqatqrrfgelidiilsteehgelnqq 462 DSSP leeeelleeellllllhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 309 ident Sbjct flaatnqkhstvkliddasvsrlatifdpllpegklspahyqhilsayhltdatpqkqae 522 DSSP hhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlhhhlllhhhhhhhhhhlllllllhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 309 ident Sbjct tlfclstafarysssaifgtehdsppalrgyaealmqkawelspaifpsseqftewsdrf 582 DSSP hhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhlllhhhhhhhhhhh DSSP --------hhhhhhhhhhhlllleellllllleellll Query --------aeelgniivawnpnlwkkgtngypifqwse 339 ident Sbjct hglhgaftctsvvadsmqrharkyfpsvlssilplawa 620 DSSP lllllllllllhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhllhhhl
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DSSP LLLLllllhhhhhlllllllllllleeellhhhhllhhhhlllllleeeeellleellll Query DSYTrvpgdgagglfekgngtdskpyxixnatqirnxrsvlksgxkvyfqlgadidxagi 60 ident | Sbjct GSSG------------------------------------------------------ss 6 DSSP LLLL------------------------------------------------------ll DSSP LLLLLLLlllllllLEEEEEeeEEEE---LLEElllllLLLLleELEEEEEEEEEEEEEE Query DDWQSLNgsgdfpyEIDFDGdsHVIK---NFKCsagdyPSFFgvLCGDCRNVGFVNASVS 117 ident | | Sbjct GSWVCGF------sNLESQV--LEKRaseLHQR-----DVLL--TELSNCTVRLYGNPNT 51 DSSP LLLEEEL------lLLLLLE--EEELhhhHLLL-----EEEE--LLLLLLEEEELLLLLL DSSP llllleelleEEELllllllhhhlEEEELLEEEEEEEEllleellEEEELlllllllLEE Query sarqgigiitGYLGlkdkgngnktGRIVNCYTTGEVIGsgaaggiAGVLAnsydgqeSYI 177 ident Sbjct ---------lRLTK----------AHSCKLLCGPVSTS-------VFLED-------CSD 78 DSSP ---------eEEEL----------LLLLEEELLLLLLL-------EEEEL-------LLL DSSP EEEEEllEEEEllllleeeellEEEELlllLEEEEEEEllLEEElleeeellEEEElllL Query KNCYSnaTVSDraasggkaggiAGRKVgvgGFIENCYAygAVSAtkggvggiLGQIdksC 237 ident | Sbjct CVLAV--ACQQ-----------LRIHS---TKDTRIFL--QVTS-------rAIVE---D 110 DSSP LEEEL--LLLE-----------EEEEL---LLLLEEEL--LLLL-------eEEEE---L DSSP LEEEEeEEELL----------leeellllleeeLLEEEL-------hHHEEEEEeeeell Query DIAIKnSAAWS----------nltgvdasstvgRIVGVS-------aSLGSYENcyaces 280 ident | | | | Sbjct CSGIQ-FAPYTwsypeidkdfessgldrsknnwNDVDDFnwlardmaSPNWSIL------ 163 DSSP LLLEE-EELLLllllllhhhhhhhlllllllllLLEELLllllllllLLLEELL------ DSSP lleeelleeellllllllllllllleeelhhhHHHHHHhhLLLLeellllllleellll Query ivlkvnektitasdessatgttfhgvaksaeeLGNIIVawNPNLwkkgtngypifqwse 339 ident Sbjct --------------------------------PEEERN--IQWD---------sgpssg 179 DSSP --------------------------------LLLLLL--LLLL---------llllll
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DSSP llllllllhhhhhLLLL-lLLLLllleeellhhhhllhhhhllllllEEEEElLLEELLl Query dsytrvpgdgaggLFEK-gNGTDskpyxixnatqirnxrsvlksgxkVYFQLgADIDXAg 59 ident | Sbjct -------------CHHRicHCSN------------------------RVFLC-QESKVT- 21 DSSP -------------LLLLleEELL------------------------LEEEE-ELLLLL- DSSP llllllllllllllLLEEEEEeeEEEELLEelllllllLLLE-----elEEEEEEE-EEE Query iddwqslngsgdfpYEIDFDGdsHVIKNFKcsagdypsFFGV-----lcGDCRNVG-FVN 113 ident | Sbjct -------eipsdlpRNAIELR-fVLTKLRV--------IQKGafsgfgdLEKIEISqNDV 65 DSSP -------lllllllLLLLEEE-eELLLLLE--------ELLLlllllllLLEEEEElLLL DSSP EEEellllleelleEEELLlllllhhHLEEEELLEEE-EEEEellleelleEEELLLlll Query ASVssarqgigiitGYLGLkdkgngnKTGRIVNCYTT-GEVIgsgaaggiaGVLANSydg 172 ident | | Sbjct LEV--------ieaDVFSN------lPKLHEIRIEKAnNLLY------inpEAFQNL--- 102 DSSP LLE--------ellLLEEL------lLLLLEEEEELLlLLLE------ellLLEELL--- DSSP LLLEEEEEEELLEEeellllleeeeLLEEEELLLL--lEEEEEEELLLEeelleeeelle Query QESYIKNCYSNATVsdraasggkagGIAGRKVGVG--gFIENCYAYGAVsatkggvggil 230 ident Sbjct PNLQYLLISNTGIK-----------HLPDVHKIHSlqkVLLDIQDNINI-----htiern 146 DSSP LLLLEEEEELLLLL-----------LLLLLLLLLLlllEEEEEELLLLL-----leelll DSSP EEELlllleEEEEEEELLLeeellllleeelleeelHHHE-EEEEEEE-ELLLleeelle Query GQIDkscdiAIKNSAAWSNltgvdasstvgrivgvsASLG-SYENCYA-CESIvlkvnek 288 ident | | Sbjct SFVGlsfesVILWLNKNGI----------qeihncaFNGTqLDELNLSdNNNL------- 189 DSSP LLLLlllllEEEELLLLLL----------leellllLLLLlEEEEELLlLLLL------- DSSP eELLLllllLLLL---lllLEEEL--hhhhhhhhhhhlllleellllllleellll Query tITASdessATGT---tfhGVAKS--aeelgniivawnpnlwkkgtngypifqwse 339 ident Sbjct -EELP--ndVFHGasgpviLDISRtrihslpsyglenlkklrarstynlkklptle 242 DSSP -LLLL--llLLLLllllleEELLLllllllllllllllleeellleelllllllll
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct gtvnnelgyqlfrdfaenkgmfrpgatniaiynkqgefvgtldkaampdfsavdseigva 60 DSSP leeelllllhhhhhhhlllhhhlllllleeeellllleeeeellllllllllllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct tlinpqyiasvkhnggytnvsfgdgenrynivdrnnapsldfhaprldklvtevaptavt 120 DSSP eeeelleeellllllllleelllllllleeeeelllllllllllleelllllllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct aqgavagayldkerypvfyrlgsgtqyikdsngqltkmggayswltggtvgslssyqnge 180 DSSP lllllllhhhllllllleeeeellleeeellllleeeeelllllleeeeellleeellll DSSP ------------llllllllhhhhhlllllllllllleeellhhhhllhhhhllllllee Query ------------dsytrvpgdgagglfekgngtdskpyxixnatqirnxrsvlksgxkvy 48 ident Sbjct 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tkadklvinksatghdnsiwvnflkkpsnkdtldiplvsapeatadnlfrastrvvgfsd 992 DSSP lllleeeeeeeeeeeleeeeeelllllllllllleeeeeeellllhhheeelllllllll DSSP -----lllleeelhhhhhhhhhhhlllleellllllleellll Query -----tfhgvaksaeelgniivawnpnlwkkgtngypifqwse 339 ident Sbjct vtpilsvrkedgkkewvldgyqvaraaatfmhisynnfitevn 1035 DSSP leeeeeeelllleeeeeeeeeelllllllhhhllhhhhhhhhl
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