Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition.
The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure, to pre-computed structural neighbours in the Dali Database,
and to the PDB format coordinate file where the neighbour
is superimposed onto the query structure.
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Summary
No: Chain Z rmsd lali nres %id PDB Description
1: 1od2-A 3.0 4.0 69 719 7 PDB MOLECULE: ACETYL-COENZYME A CARBOXYLASE;
2: 3fwb-A 2.9 4.7 65 153 8 PDB MOLECULE: CELL DIVISION CONTROL PROTEIN 31;
3: 1kfu-L 2.9 4.3 89 699 10 PDB MOLECULE: M-CALPAIN LARGE SUBUNIT;
4: 1sxj-A 2.8 3.6 70 441 10 PDB MOLECULE: ACTIVATOR 1 95 KDA SUBUNIT;
5: 1kfx-L 2.7 4.7 90 640 8 PDB MOLECULE: M-CALPAIN LARGE SUBUNIT;
6: 1uyv-A 2.7 2.9 61 571 8 PDB MOLECULE: ACETYL-COA CARBOXYLASE;
7: 1f4o-A 2.6 8.0 93 165 3 PDB MOLECULE: GRANCALCIN;
8: 1jr3-D 2.6 3.6 66 338 11 PDB MOLECULE: DNA POLYMERASE III SUBUNIT GAMMA;
9: 2dnw-A 2.6 5.4 73 99 8 PDB MOLECULE: ACYL CARRIER PROTEIN;
10: 3dwc-B 2.5 3.9 84 506 7 PDB MOLECULE: METALLOCARBOXYPEPTIDASE;
11: 1lkj-A 2.5 3.5 65 146 11 PDB MOLECULE: CALMODULIN;
12: 1ysy-A 2.5 3.4 68 85 3 PDB MOLECULE: REPLICASE POLYPROTEIN 1AB (PP1AB) (ORF1AB);
13: 1sl8-A 2.4 3.6 83 181 6 PDB MOLECULE: AEQUORIN 1;
14: 2i7a-A 2.4 4.9 82 157 9 PDB MOLECULE: CALPAIN 13;
15: 2cfo-B 2.3 3.7 73 487 5 PDB MOLECULE: GLUTAMYL-TRNA SYNTHETASE;
16: 2v6z-M 2.3 2.5 54 75 9 PDB MOLECULE: DNA POLYMERASE EPSILON SUBUNIT 2;
17: 2ccm-A 2.3 3.6 89 190 10 PDB MOLECULE: CALEXCITIN;
18: 1nya-A 2.3 4.2 94 176 10 PDB MOLECULE: CALERYTHRIN;
19: 1y1x-A 2.3 6.0 89 182 3 PDB MOLECULE: LEISHMANIA MAJOR HOMOLOG OF PROGRAMMED CELL
20: 3ce7-A 2.3 2.6 59 90 8 PDB MOLECULE: SPECIFIC MITOCHODRIAL ACYL CARRIER PROTEIN;
21: 3gzl-A 2.3 2.5 58 81 5 PDB MOLECULE: ACYL CARRIER PROTEIN;
22: 3cs1-A 2.2 4.3 87 192 6 PDB MOLECULE: FLAGELLAR CALCIUM-BINDING PROTEIN;
23: 1zei-B 2.2 2.5 47 53 9 PDB MOLECULE: INSULIN;
24: 1qxp-B 2.2 5.6 85 788 8 PDB MOLECULE: MU-LIKE CALPAIN;
25: 2v3c-C 2.2 8.5 92 403 12 PDB MOLECULE: SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 19 KDA PROTEIN;
26: 1ozo-A 2.2 3.6 73 95 10 PDB MOLECULE: S-100P PROTEIN;
27: 3b9p-A 2.1 4.7 69 268 4 PDB MOLECULE: CG5977-PA, ISOFORM A;
28: 2chq-A 2.1 3.4 61 313 18 PDB MOLECULE: REPLICATION FACTOR C SMALL SUBUNIT;
29: 1zei-C 2.1 2.4 47 53 9 PDB MOLECULE: INSULIN;
30: 2sas-A 2.1 3.6 85 185 7 PDB MOLECULE: SARCOPLASMIC CALCIUM-BINDING PROTEIN;
31: 2hps-A 2.1 6.8 93 184 9 PDB MOLECULE: COELENTERAZINE-BINDING PROTEIN WITH BOUND
32: 2c9o-C 2.1 3.4 63 311 8 PDB MOLECULE: RUVB-LIKE 1;
33: 3bos-B 2.1 3.6 65 231 3 PDB MOLECULE: PUTATIVE DNA REPLICATION FACTOR;
34: 1s20-G 2.0 8.3 84 335 7 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL OXIDOREDUCTASE YIAK;
35: 2j1o-A 2.0 5.0 71 255 7 PDB MOLECULE: GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE;
36: 1dgp-A 2.0 4.2 75 290 7 PDB MOLECULE: ARISTOLOCHENE SYNTHASE;
Pairwise Structural Alignments
Notation: three-state secondary structure definitions by DSSP (reduced to H=helix, E=sheet, L=coil) are shown above the amino acid sequence. Structurally equivalent residues are in uppercase, structurally non-equivalent residues (e.g. in loops) are in lowercase. Amino acid identities are marked by vertical bars.
No 1: Query=mol1A Sbjct=1od2A Z-score=3.0
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DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct atpypvkewlqpkrykahlxgttyvydfpelfrqasssqwknfsadvkltddffisneli 60 DSSP llllllhhhhlhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeeee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct edengelteverepganaigxvafkitvktpeyprgrqfvvvanditfkigsfgpqedef 120 DSSP ellllleeeelllllllllleeeeeeeeeelleeeeeeeeeeeelllhhhhlllhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct fnkvteyarkrgipriylaansgarigxaeeivplfqvawndaanpdkgfqylyltsegx 180 DSSP hhhhhhhhhhhllleeeeeellllllllllllhhhleeeelllllhhhleeeeeelhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct etlkkfdkensvltertvingeerfviktiigsedglgveclrgsgliagatsrayhdif 240 DSSP hhlhhhllllleellllllllllleelleellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct titlvtcrsvgigaylvrlgqraiqvegqpiiltgapainkxlgrevytsnlqlggtqix 300 DSSP eeeeeeeeeelhhhhhhhhllleeeelllleelllhhhhhhhlllllllllhhhhlhhhh DSSP ------------------------------LLLL-------------------------- Query ------------------------------MKVF-------------------------- 4 ident Sbjct ynngvshltavddlagvekivewxsyvpakRNXPvpiletkdtwdrpvdftptndetydv 360 DSSP hhhlllleeellhhhhhhhhhhhhllllllLLLLlllllllllllllllllllllllllh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 4 ident Sbjct rwxiegretesgfeyglfdkgsffetlsgwakgvvvgrarlggiplgvigvetrtvenli 420 DSSP hhhhheeeelleeeelllllllleeellllllleeeeeeeelleeeeeeeelllleeeee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 4 ident Sbjct padpanpnsaetliqepgqvwhpnsafktaqaindfnngeqlpxxilanwrgfsggqrdx 480 DSSP llllllllllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeellllllllllhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 4 ident Sbjct fnevlkygsfivdalvdykqpiiiyipptgelrggswvvvdptinadqxexyadvnarag 540 DSSP hllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllleeehhhhhlllhhhhllleeeeeellleee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 4 ident Sbjct vlepqgxvgikfrreklldtxnrlddkyrelrsqlsnkslapevhqqiskqladrerell 600 DSSP lllhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh DSSP -----------------------------------lllLLLL-LHHHHHHHHHHHHHHhL Query -----------------------------------krvAGIK-DKAAIKTLISAAYRQiF 28 ident Sbjct piygqislqfadlhdrssrxvakgviskelewtearrfFFWRlRRRLNEEYLIKRLSH-Q 659 DSSP hhhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllleeelhhhhhhhHHHHhHHHHHHHHHHHHLLL-L DSSP LLLLLHHHHHHHLHHH---------hhhHHHL-lLLHHHHHHHHHHLhhHHHHHLLLLLH Query ERDIAPYIAQNEFSGW---------eskLGNG-eITVKEFIEGLGYSnlYLKEFYTPYPN 78 ident | | | | | Sbjct VGEASRLEKIARIRSWypasvdheddrqVATWieENYKTLDDKLKGL--KLESFAQDLAK 717 DSSP LLLLLHHHHHHHHHLLlllllllllhhhHHHHhhHLHHHHHHHHHHH--HHHHLLHHHHL DSSP Hhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllhhhhhhllllllllll Query Tkvielgtkhflgrapidqaeirkynqilatqgirafinalvnsqeynevfgedtvpyrr 138 ident Sbjct K----------------------------------------------------------- 718 DSSP L----------------------------------------------------------- DSSP lllllllllll Query fptlehhhhhh 149 ident Sbjct ----------i 719 DSSP ----------l
DSSP llllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhlhhhhhhhhhllLLHHHHHH Query mkvfkrvagikdkaaiktlisaayrqiferdiapyiaqnefsgwesklgngeITVKEFIE 60 ident Sbjct -------------------------------------------qsgplnselLEEQKQEI 17 DSSP -------------------------------------------lllllllllLHHHHHHH DSSP HHHhlhhHHHHhlllllHHHHHHHHHHHHlLLLLlLHHHHHHHHHHHHH-----lLHHHH Query GLGysnlYLKEfytpypNTKVIELGTKHFlGRAPiDQAEIRKYNQILAT-----qGIRAF 115 ident | | || | Sbjct YEA-fslFDMN-ndgflDYHELKVAMKAL-GFEL-PKREILDLIDEYDSegrhlmKYDDF 73 DSSP HHH-hhhHLLL-llleeLHHHHHHHHHHL-LLLL-LHHHHHHHHHHHLLllllleEHHHH DSSP HHHHHLLhhHHHHllllllllllllllLLLL----------------------------- Query INALVNSqeYNEVfgedtvpyrrfptlEHHH----------------------------- 146 ident Sbjct YIVMGEK--ILKR-------dpldeikRAFQlfdddhtgkisiknlrrvakelgetltde 124 DSSP HHHHHHH--HHLL-------lhhhhhhHHHHhhlllllleelhhhhhhhhhhllllllhh DSSP --------------------------lll Query --------------------------hhh 149 ident Sbjct elramieefdldgdgeinenefiaictds 153 DSSP hhhhhhhllllllllleehhhhhhhhhhl
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct agiaaklakdreaaeglgsheraikylnqdyealrnecleagtlfqdpsfpaipsalgfk 60 DSSP llhhhhhhhhhhhhhlllllllleehhhllhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct elgpyssktrgmrwkrpteicadpqfiiggatrtdicqgalgdcwllaaiasltlneeil 120 DSSP llllllllllleeeelhhhhllllllllllllllleellllllhhhhhhhhhllllhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct arvvplnqsfqenyagifhfqfwqygewvevvvddrlptkdgellfvhsaegsefwsall 180 DSSP lllllllllllllllleeeeeeelllleeeeeeelleeeelleellleellllllhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct ekayakingcyealsggattegfedftggiaewyelkkpppnlfkiiqkalqkgsllgcs 240 DSSP hhhhhhllllhhhlllllhhhhhhhlllleeeeeelllllllhhhhhhhhhlllleeeee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct iditsaadseaitfqklvkghaysvtgaeevesngslqklirirnpwgevewtgrwndnc 300 DSSP lllllllllllllllllllllleeeeeeeeelllllleeeeeeellllllllllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct pswntidpeererltrrhedgefwmsfsdflrhysrleicnltpdtltsdtykkwkltkm 360 DSSP llllllllhhhhllllllllllllllhhhhhllleeeeeellhhhlllllllllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct dgnwrrgstaggcrnypntfwmnpqylikleeededeedgesgctflvgliqkhrrrqrk 420 DSSP leeelllllllllllllllhhhlllleeellllllllllllllleeeeeeeellllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct mgedmhtigfgiyevpeelsgqtnihlsknffltnrarersdtfinlrevlnrfklppge 480 DSSP llllllleeeeeeellllllllllllllhhhhhhlllllllllllllleelleeelllle DSSP --------------------------------------llLLLLLLLLLLhhhhhhhhhh Query --------------------------------------mkVFKRVAGIKDkaaiktlisa 22 ident | | Sbjct yilvpstfepnkdgdfcirvfsekkadyqavddeieanleEFDISEDDID---------- 530 DSSP eeeeeeelllllleeeeeeeeellllleelllllllllllLLLLLLLLLL---------- DSSP hhhhhllllllhhhhhhhlhhhhhhhHHLL------------------------------ Query ayrqiferdiapyiaqnefsgwesklGNGE------------------------------ 52 ident Sbjct --------------------------DGVRrlfaqlagedaeisafelqtilrrvlakrq 564 DSSP --------------------------LHHHhhhhhhlllllleehhhhhhhhhhhlllll DSSP -------------------------------LLHHHHHHHHHHLhhHHHHHLLL----lL Query -------------------------------ITVKEFIEGLGYSnlYLKEFYTP----yP 77 ident | Sbjct diksdgfsietckimvdmldsdgsgklglkeFYILWTKIQKYQK--IYREIDVDrsgtmN 622 DSSP llllllllhhhhhhhhhlllllllleellhhHHHHHHHHHHHHH--HHHLLLLLlllleE DSSP HHHhHHHHHHHHlLLLLlLHHHHHHHHHHHHH----lLHHHHHHHHHLLhHHHHHlllll Query NTKvIELGTKHFlGRAPiDQAEIRKYNQILAT----qGIRAFINALVNSqEYNEVfgedt 133 ident | | | || | Sbjct SYE-MRKALEEA-GFKM-PCQLHQVIVARFADdqliiDFDNFVRCLVRL-ETLFK----- 673 DSSP LLL-HHHHLLLL-LLLL-LHHHHHHHHHHHLLllleeLHHHHHHHHHHH-HHHHH----- DSSP lllllllllLLLLLLL----------- Query vpyrrfptlEHHHHHH----------- 149 ident Sbjct -ifkqldpeNTGTIELdliswlcfsvl 699 DSSP -hhhhhlllLLLLEEEehhhhhhhhll
DSSP llllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhlhhhhhhhhhllllhhHHHH Query mkvfkrvagikdkaaiktlisaayrqiferdiapyiaqnefsgwesklgngeitvkEFIE 60 ident Sbjct --------------------------------------------------------DKLW 4 DSSP --------------------------------------------------------LLLH DSSP -HHHHLHHhhHHHLLL-------------------------------------------- Query -GLGYSNLylKEFYTP-------------------------------------------- 75 ident Sbjct tVKYAPTN-lQQVCGNkgsvmklknwlanwenskknsfkhagkdgsgvfraamlygppgi 63 DSSP hHHLLLLL-hHHLLLLhhhhhhhhhhhhlhhhhhhllllllllllllllleeeeelllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 75 ident Sbjct gkttaahlvaqelgydileqnasdvrsktllnagvknaldnmsvvgyfkhqnlngkhfvi 123 DSSP lhhhhhhhhhhhllleeeeelllllllhhhhhhlhhhhllllllllllllllllllleee DSSP -----------------------------------------------------------l Query -----------------------------------------------------------y 76 ident Sbjct imdevdgmsggdrggvgqlaqfcrktstplilicnernlpkmrpfdrvcldiqfrrpdan 183 DSSP eellhhhlllllllhhhhhhhhhhhlllleeeeellllllllhhhlllleeeelllllhh DSSP LHHHHHHHHHHHHlLLLLLlHHHHHHHHHHHHHlLHHHHHHHHHLLhHHHHHllllllll Query PNTKVIELGTKHFlGRAPIdQAEIRKYNQILATqGIRAFINALVNSqEYNEVfgedtvpy 136 ident | | || || | Sbjct SIKSRLMTIAIRE-KFKLD-PNVIDRLIQTTRG-DIRQVINLLSTI-STTTK-------- 231 DSSP HHHHHHHHHHHHH-LLLLL-LLHHHHHHHHLLL-LHHHHHHHHLHH-HHHLL-------- DSSP lLLLLL------------------------------------------------------ Query rRFPTL------------------------------------------------------ 142 ident Sbjct tINHENineiskaweknialkpfdiahkmldgqiysdigsrnftlndkialyfddfdftp 291 DSSP lLLLLHhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhllhhhllllhhhlllhhhhhhhhllllllhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 142 ident Sbjct lmiqenylstrpsvlkpgqshleavaeaancislgdivekkirsseqlwsllplhavlss 351 DSSP hhhhhhlllleellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhl DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 142 ident Sbjct vypaskvaghmagrinftawlgqnsksakyyrllqeihyhtrlgxxxxxxxxxxxxxxxx 411 DSSP hhhhhllleelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhlllhhhhhh DSSP -----------------------lllllll Query -----------------------ehhhhhh 149 ident Sbjct xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx 441 DSSP hhlllllhhhhhhllllllhhhhhhhhhhl
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct agiaaklakdreaaeglgsheraikylnqdyealrnecleagtlfqdpsfpaipsalgfk 60 DSSP lhhhhhhhhhhhhhhlllllllleehhhllhhhhhhhhhlllllllllllllllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct elgpyssktrgmrwkrpteicadpqfiiggatrtdicqgalgdcwllaaiasltlneeil 120 DSSP llllllhhhllleeellhhhllllllllllllllleeellllllhhhhhhhhhhlllllh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct arvvplnqsfqenyagifhfqfwqygewvevvvddrlptkdgellfvhsaegsefwsall 180 DSSP hhhllllllllllllleeeeeeeelleeeeeeeelleeellllllleeellllllhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct ekayakingcyealsggattegfedftggiaewyelkkpppnlfkiiqkalqkgsllgcs 240 DSSP hhhhhhhlllhhhlllllhhhhhhhhhlleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlleeeel DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct idkghaysvtgaeevesngslqklirirnpwgevewtgrwmsfsdflrhysrleicnltp 300 DSSP lllllleeellllllllllllllllleelllllllllllllllhhhhllleeeeeellll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct dtltsdtykkwkltkmdgnwrrgstaggcrnypntfwmnpqylikleeedectflvgliq 360 DSSP llllllllllleeeeeeeeelllllllllllllllhhhllleeeeelllllleeeeeeel DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct khrrrqrkmgedmhtigfgiyevpeetnihlsknffltnrarersdtfinlrevlnrfkl 420 DSSP llllllllllllllleeeeeeellllllllllhhhhhllllllllllllllllleeeeel DSSP -----------------------------------------lllLLLLL-LLLLHhhhhh Query -----------------------------------------mkvFKRVA-GIKDKaaikt 18 ident | Sbjct ppgeyilvpstfepnkdgdfcirvfsekkadyqavddeieanleEFDISeDDIDD----- 475 DSSP llleeeeeeeelllllleeeeeeeeellleeellllllleelllLLLLLlLLLLL----- DSSP hhhhhhhhhllllllhhhhhhhlhhhhhhhHHLL-------------------------- Query lisaayrqiferdiapyiaqnefsgwesklGNGE-------------------------- 52 ident Sbjct ----------------------------gvRRLFaqlagedaeisafelqtilrrvlakr 507 DSSP ----------------------------hhHHLLhhhlllllleehhhhhhhhhllllll DSSP -----------------------------LLHHHHHHHHHHLhhHHHHHLLL----LLHH Query -----------------------------ITVKEFIEGLGYSnlYLKEFYTP----YPNT 79 ident | Sbjct ksdgfsietckimvdmldsdgsgklglkeFYILWTKIQKYQK--IYREIDVDrsgtMNSY 565 DSSP llllllhhhhhhhhhlllllllleelhhhHHHHHHHHHHHHH--HHHHHLLLllllEELL DSSP hHHHHHHHHHlLLLLlLHHHHHHHHHHHHH----lLHHHHHHHHHLL-HHHHHhllllll Query kVIELGTKHFlGRAPiDQAEIRKYNQILAT----qGIRAFINALVNS-QEYNEvfgedtv 134 ident | | | || Sbjct -EMRKALEEA-GFKM-PCQLHQVIVARFADdqliiDFDNFVRCLVRLeTLFKI------- 615 DSSP -HHHHHHHHL-LEEL-LHHHHHHHHHLLLLllleeLHHHHHHHHHHHhHHHHH------- DSSP llllllllLLLLLLL---------- Query pyrrfptlEHHHHHH---------- 149 ident Sbjct fkqldpenTGTIELDliswlcfsvl 640 DSSP hhhhllllLLLLLEEhhhhhhhhll
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct piatpypvkewlqpkrykahlmgttyvydfpelfrqasssqwknfsadvkltddffisne 60 DSSP llllllllhhhhllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhheeeee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct liedengelteverepganaigmvafkitvktpeyprgrqfvvvanditfkigsfgpqed 120 DSSP eeellllleeeelllllllllleeeeeeeelllllllleeeeeeeellllhhhlllhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct effnkvteyarkrgipriylaansgarigmacirgsgliagatsrayhdiftitlvtcrs 180 DSSP hhhhhhhhhhhhhllleeeeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeeeee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct vgigaylvrlgqraiqvegqpiiltgapainkmlgrevytsnlqlggtqimynngvshlt 240 DSSP elhhhhhhhhlleeeeelllleelllhhhhhhhhllllllllhhhhlhhhhhhhllllee DSSP ---------------------LLLL----------------------------------- Query ---------------------MKVF----------------------------------- 4 ident Sbjct avddlagvekivewmsyvpakRNMPvpiletkdtwdrpvdftptndetydvrwmiegret 300 DSSP ellhhhhhhhhhhhhllllllLLLLlllllllllllllllllllllllllhhhhhhleel DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 4 ident Sbjct esgfeyglfdkgsffetlsgwakgvvvgrarlggiplgvigvetrtvenlipadpanpns 360 DSSP llleellllllllleeellllllleeeeeeeelleeeeeeeelllleeeeelllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 4 ident Sbjct aetliqepgqvwhpnsafktaqaindfnngeqlpmmilanwrgfsggqrdmfneilkygs 420 DSSP lleeeeellleelhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeelllleelllhhhhhllhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 4 ident Sbjct fivdalvdykqpiiiyipptgelrggswvvvdptinadqmemyadvnaragvlerssrmv 480 DSSP hhhhhhhhlllleeeeelllleelhhhhhhhlhhhhllleeeeeellleelllllhhhhh DSSP ---------------llllLLLLHHHHHHHHHHHHHHhLLLLLLHHHHHHHLHHH----- Query ---------------krvaGIKDKAAIKTLISAAYRQiFERDIAPYIAQNEFSGW----- 44 ident | Sbjct akgviskelewtearrfffWRLRRRLNEEYLIKRLSH-QVGEASRLEKIARIRSWypasv 539 DSSP lllllleeelhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HLLLLLHHHHHHHHHLLlllll DSSP ----hhhHHHL-lLLHHHHHHHHHHLhhHHHHHlllllhhhhhhhhhhhhlllllllhhh Query ----eskLGNG-eITVKEFIEGLGYSnlYLKEFytpypntkvielgtkhflgrapidqae 99 ident | | | | Sbjct dheddrqVATWieENYKTLDDKLKGL--KLESF--------------------------- 570 DSSP llllhhhHHHHhhHLHHHHHHHHHHH--HHHLL--------------------------- DSSP hhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllhhhhhhlllllllllllllllllllll Query irkynqilatqgirafinalvnsqeynevfgedtvpyrrfptlehhhhhh 149 ident Sbjct -------------------------------------------------a 571 DSSP -------------------------------------------------l
DSSP ----llllllLLLLLLH-HHHHHHHHH---hhhhhllllllhhhhhhhlhhhhhhhHHLL Query ----mkvfkrVAGIKDK-AAIKTLISA---ayrqiferdiapyiaqnefsgwesklGNGE 52 ident Sbjct svytyfsavaGQDGEVDaEELQRCLTQsgingtyspfsletcrimiamldrdhtgkMGFN 60 DSSP lhhhhhhhhlLLLLLEEhHHHHHHHHHhllllllllllhhhhhhhhhhhlllllleELHH DSSP LLHHHHHHHHHHLHhHHHHHL----LLLLHHHHHHHHHHHhlLLLLlLHHHHHHHHHHHH Query ITVKEFIEGLGYSNlYLKEFY----TPYPNTKVIELGTKHflGRAPiDQAEIRKYNQILA 108 ident | Sbjct AFKELWAALNAWKE-NFMTVDqdgsGTVEHHELRQAIGLM--GYRL-SPQTLTTIVKRYS 116 DSSP HHHHHHHHHHHHHH-HHHHHLllllLEELHHHHHHHHHHL--LLLL-LHHHHHHHHHHLL DSSP H------lLHHHHHHHHHLLHHhhhhllllllllllllllLLLLLL------------l Query T------qGIRAFINALVNSQEynevfgedtvpyrrfptlEHHHHH------------h 149 ident | | Sbjct KngriffdDYVACCVKLRALTD----------ffkkrdhlQQGSADfiyddflqgtmai 165 DSSP LllleehhHHHHHHHHHHHHHH----------hhhlllllLLLEEEeehhhhhhhhhhl
DSSP llllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhLLLLL--------------------------LH Query mkvfkrvagikdkaaiktlisaayrqiFERDI--------------------------AP 34 ident | | Sbjct ----------------------mirlyPEQLRaqlneglraaylllgndplllqesqdAV 38 DSSP ----------------------leeelLLLHHhhhhhlllleeeeeellhhhhhhhhhHH DSSP HHHHH------------------------------------------------------- Query YIAQN------------------------------------------------------- 39 ident Sbjct RQVAAaqgfeehhtfsidpntdwnaifslcqamslfasrqtlllllpengpnaaineqll 98 DSSP HHHHHhhllleeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeelllllllllhhhhhh DSSP ----------hlhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhlhhhhHHHLLlLLHHHHHHHHHHHH Query ----------efsgwesklgngeitvkefieglgysnlylKEFYTpYPNTKVIELGTKHF 89 ident | Sbjct tltgllhddlllivrgnklskaqenaawftalanrsvqvtCQTPEqAQLPRWVAARAKQL 158 DSSP hhhlllllleeeeeeellllllllllhhhhhhlllleeeeELLLLlLHHHHHHHHHHHHL DSSP lLLLLLlHHHHHHHHHHHHhlLHHHHHHHHHLLHHHHHH--------------------- Query lGRAPIdQAEIRKYNQILAtqGIRAFINALVNSQEYNEV--------------------- 128 ident | | || Sbjct -NLELD-DAANQVLCYCYE-gNLLALAQALERLSLLWPDgkltlprveqavndaahftpf 215 DSSP -LLEEL-HHHHHHHHHLLL-lLHHHHHHHHHHHHHHLLLleelhhhhhhhhhhhllllhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 128 ident Sbjct hwvdallmgkskralhilqqlrlegsepvillrtlqrellllvnlkrqsahtplralfdk 275 DSSP hhhhhhllllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhh DSSP ------------------------------------------llllllllllllllllll Query ------------------------------------------fgedtvpyrrfptlehhh 146 ident Sbjct hrvwqnrrgmmgealnrlsqtqlrqavqlltrteltlkqdygqsvwaeleglslllchkp 335 DSSP hlllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlllll DSSP lll Query hhh 149 ident Sbjct lad 338 DSSP lll
DSSP llllllllllLLHHhhHHHHhhhhhhhllllllhhhhhhhlhhhhhhhhhllllhhhHHH Query mkvfkrvagiKDKAaiKTLIsaayrqiferdiapyiaqnefsgwesklgngeitvkeFIE 60 ident Sbjct ---------gSSGS--SGMP------------------------------------pLTL 13 DSSP ---------lLLLL--LLLL------------------------------------lLLH DSSP HHHHL--HHHHHHhLLLL--------------------LHHHHHHHHHHHHlLLLLllhh Query GLGYS--NLYLKEfYTPY--------------------PNTKVIELGTKHFlGRAPidqa 98 ident || | | | | Sbjct EGIQDrvLYVLKL-YDKIdpeklsvnshfmkdlgldslDQVEIIMAMEDEF-GFEI---- 67 DSSP HHHHHhhHHHHHH-LLLLllllllllllhhhhhlllhhHHHHHHHHHHHHL-LLLL---- DSSP HHHHHHHHHhhlLHHHHHHHHHLLhhHHHHlllllllllllLLLLLlllll Query EIRKYNQILatqGIRAFINALVNSqeYNEVfgedtvpyrrfPTLEHhhhhh 149 ident Sbjct PDIDAEKLM---CPQEIVDYIADK-kDVYE----------sGPSSG----- 99 DSSP LHHHHLLLL---LHHHHHHHHHHH-lLLLL----------lLLLLL-----
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