Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition.
The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure, to pre-computed structural neighbours in the Dali Database,
and to the PDB format coordinate file where the neighbour
is superimposed onto the query structure.
Expand gaps
Summary
No: Chain Z rmsd lali nres %id PDB Description
1: 2zkq-c 4.0 4.3 80 192 10 PDB MOLECULE: 18S RIBOSOMAL RNA;
2: 2qx2-A 3.8 4.1 78 318 12 PDB MOLECULE: SEX PHEROMONE STAPH-CAM373;
3: 1wf3-A 3.7 3.2 72 296 10 PDB MOLECULE: GTP-BINDING PROTEIN;
4: 2pt7-G 3.7 2.9 68 145 4 PDB MOLECULE: CAG-ALFA;
5: 2nrk-A 3.6 4.0 74 165 7 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN GRPB;
6: 1ega-B 3.5 2.9 73 293 3 PDB MOLECULE: PROTEIN (GTP-BINDING PROTEIN ERA);
7: 1k23-C 3.5 3.2 67 308 7 PDB MOLECULE: MANGANESE-DEPENDENT INORGANIC PYROPHOSPHATASE;
8: 3dns-A 3.4 3.8 77 131 5 PDB MOLECULE: RIBOSOMAL-PROTEIN-ALANINE ACETYLTRANSFERASE;
9: 1kkg-A 3.4 4.5 82 108 7 PDB MOLECULE: RIBOSOME-BINDING FACTOR A;
10: 3gku-A 3.3 3.1 67 206 6 PDB MOLECULE: PROBABLE RNA-BINDING PROTEIN;
11: 2eb0-B 3.3 4.1 71 307 7 PDB MOLECULE: MANGANESE-DEPENDENT INORGANIC PYROPHOSPHATASE;
12: 1lql-C 3.2 3.4 66 146 8 PDB MOLECULE: OSMOTICAL INDUCIBLE PROTEIN C LIKE FAMILY;
13: 1jos-A 3.2 3.0 68 100 6 PDB MOLECULE: RIBOSOME-BINDING FACTOR A;
14: 1i74-A 3.2 3.4 76 309 1 PDB MOLECULE: PROBABLE MANGANESE-DEPENDENT INORGANIC
15: 2enx-A 3.2 3.2 71 310 6 PDB MOLECULE: MANGANESE-DEPENDENT INORGANIC PYROPHOSPHATASE;
16: 2onf-A 3.2 3.5 68 140 12 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN TA0195;
17: 1ml8-A 3.1 3.0 66 131 9 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN (CRP REGION);
18: 3eyx-A 3.1 3.4 76 197 7 PDB MOLECULE: CARBONIC ANHYDRASE;
19: 2rff-A 3.1 3.5 68 111 6 PDB MOLECULE: PUTATIVE NUCLEOTIDYLTRANSFERASE;
20: 3bbn-C 3.0 4.6 74 217 8 PDB MOLECULE: 16S RRNA;
21: 1xhj-A 3.0 3.4 68 88 9 PDB MOLECULE: NITROGEN FIXATION PROTEIN NIFU;
22: 1nye-D 3.0 4.4 72 162 10 PDB MOLECULE: OSMOTICALLY INDUCIBLE PROTEIN C;
23: 2kdn-A 2.9 2.7 62 108 3 PDB MOLECULE: PUTATIVE UNCHARACTERIZED PROTEIN PFE0790C;
24: 2zzt-A 2.9 3.2 64 83 5 PDB MOLECULE: PUTATIVE UNCHARACTERIZED PROTEIN;
25: 3byr-A 2.9 3.3 70 88 14 PDB MOLECULE: CZRB PROTEIN;
26: 2w1j-A 2.9 8.4 87 195 1 PDB MOLECULE: PUTATIVE SORTASE;
27: 1k20-A 2.9 2.9 69 310 6 PDB MOLECULE: MANGANESE-DEPENDENT INORGANIC PYROPHOSPHATASE;
28: 1ny8-A 2.9 2.7 64 97 3 PDB MOLECULE: PROTEIN YRBA;
29: 2d7v-A 2.9 3.9 68 155 3 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN VCA0330;
30: 1wh9-A 2.8 3.2 63 92 11 PDB MOLECULE: 40S RIBOSOMAL PROTEIN S3;
31: 1sdj-A 2.8 4.3 79 310 8 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YDDE;
32: 3k93-A 2.8 3.3 68 223 6 PDB MOLECULE: PHAGE RELATED EXONUCLEASE;
33: 3bt7-A 2.7 3.3 69 369 10 PDB MOLECULE: TRNA (URACIL-5-)-METHYLTRANSFERASE;
34: 2azp-A 2.7 4.4 75 318 5 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PA1268;
35: 2bh2-A 2.7 4.4 75 419 7 PDB MOLECULE: 23S RRNA (URACIL-5-)-METHYLTRANSFERASE RUMA;
36: 3fov-A 2.7 3.8 67 102 6 PDB MOLECULE: UPF0102 PROTEIN RPA0323;
37: 2b78-A 2.7 3.9 64 376 8 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN SMU.776;
38: 2dyj-A 2.6 3.3 63 91 8 PDB MOLECULE: RIBOSOME-BINDING FACTOR A;
39: 2q6b-A 2.6 3.6 64 425 6 PDB MOLECULE: 3-HYDROXY-3-METHYLGLUTARYL-COENZYME A REDUCTASE;
40: 2e7g-A 2.6 4.0 77 129 8 PDB MOLECULE: PUTATIVE RIBOSOME-BINDING FACTOR A;
41: 3i07-B 2.6 3.4 68 148 7 PDB MOLECULE: ORGANIC HYDROPEROXIDE RESISTANCE PROTEIN;
42: 1bpx-A 2.5 3.9 77 331 3 PDB MOLECULE: PROTEIN (DNA POLYMERASE BETA);
43: 2vs1-A 2.5 3.0 58 399 0 PDB MOLECULE: UNCHARACTERIZED RNA METHYLTRANSFERASE PYRAB10780;
44: 1s1h-C 2.5 3.8 66 188 9 PDB MOLECULE: 18S RIBOSOMAL RNA;
45: 2be3-A 2.5 4.0 80 203 14 PDB MOLECULE: GTP PYROPHOSPHOKINASE;
46: 3jyy-B 2.4 4.1 66 266 12 PDB MOLECULE: LINCOSAMIDE NUCLEOTIDYLTRANSFERASE;
47: 1otg-A 2.4 3.1 60 125 13 PDB MOLECULE: 5-CARBOXYMETHYL-2-HYDROXYMUCONATE ISOMERASE;
48: 2dhm-A 2.4 3.1 65 107 6 PDB MOLECULE: PROTEIN BOLA;
49: 3h2t-A 2.4 3.1 63 326 3 PDB MOLECULE: BASEPLATE STRUCTURAL PROTEIN GP6;
50: 1w36-B 2.4 3.5 77 1158 6 PDB MOLECULE: DNA HAIRPIN;
51: 2zvy-A 2.4 2.9 74 183 3 PDB MOLECULE: CHEMOTAXIS PROTEIN MOTB;
52: 3l0a-A 2.4 3.3 71 266 0 PDB MOLECULE: PUTATIVE EXONUCLEASE;
53: 2a5v-B 2.4 4.0 79 210 4 PDB MOLECULE: CARBONIC ANHYDRASE (CARBONATE DEHYDRATASE)
54: 1ija-A 2.4 3.9 71 148 7 PDB MOLECULE: SORTASE;
55: 2z5e-A 2.4 3.6 62 122 5 PDB MOLECULE: PROTEASOME ASSEMBLING CHAPERONE 3;
56: 2qb6-A 2.3 3.7 68 393 7 PDB MOLECULE: EXOPOLYPHOSPHATASE;
57: 1ym5-A 2.3 4.6 75 294 7 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL 32.6 KDA PROTEIN IN DAP2-SLT2
58: 2otn-A 2.3 4.0 73 293 8 PDB MOLECULE: DIAMINOPIMELATE EPIMERASE;
59: 2a8c-A 2.3 3.4 76 221 7 PDB MOLECULE: CARBONIC ANHYDRASE 2;
60: 1i6o-B 2.3 3.2 73 214 4 PDB MOLECULE: CARBONIC ANHYDRASE;
61: 1lq9-A 2.3 5.0 70 112 10 PDB MOLECULE: ACTVA-ORF6 MONOOXYGENASE;
62: 2z5c-B 2.3 3.1 58 106 10 PDB MOLECULE: PROTEIN YPL144W;
63: 1amu-A 2.2 3.0 57 509 12 PDB MOLECULE: GRAMICIDIN SYNTHETASE 1;
64: 1vs5-C 2.2 3.8 65 206 8 PDB MOLECULE: 16S RIBOSOMAL RNA;
65: 3ejx-D 2.2 3.8 78 301 5 PDB MOLECULE: DIAMINOPIMELATE EPIMERASE, CHLOROPLASTIC;
66: 1g5c-A 2.2 4.0 64 169 9 PDB MOLECULE: BETA-CARBONIC ANHYDRASE;
67: 2od6-A 2.2 4.4 65 110 8 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;
68: 3f9r-A 2.2 3.4 65 246 9 PDB MOLECULE: PHOSPHOMANNOMUTASE;
69: 1vyi-A 2.2 3.7 61 111 10 PDB MOLECULE: RNA POLYMERASE ALPHA SUBUNIT;
70: 3g7k-B 2.1 3.8 85 387 5 PDB MOLECULE: 3-METHYLITACONATE ISOMERASE;
71: 1v60-A 2.1 4.3 72 123 7 PDB MOLECULE: RIKEN CDNA 1810037G04;
72: 2nlv-A 2.1 3.6 64 112 11 PDB MOLECULE: XISI PROTEIN-LIKE;
73: 3c6v-B 2.1 2.9 55 147 9 PDB MOLECULE: PROBABLE TAUTOMERASE/DEHALOGENASE AU4130;
74: 3edn-A 2.1 4.4 74 299 12 PDB MOLECULE: PHENAZINE BIOSYNTHESIS PROTEIN, PHZF FAMILY;
75: 1ekj-G 2.1 4.4 75 220 5 PDB MOLECULE: BETA-CARBONIC ANHYDRASE;
76: 2q0e-A 2.1 5.1 75 331 5 PDB MOLECULE: RNA URIDYLYL TRANSFERASE;
77: 2ql8-A 2.1 3.5 61 141 3 PDB MOLECULE: PUTATIVE REDOX PROTEIN;
78: 2p0p-A 2.1 3.6 61 126 7 PDB MOLECULE: ALR1010 PROTEIN;
79: 3gxs-A 2.1 3.4 66 106 6 PDB MOLECULE: PHENYLACETATE-COENZYME A LIGASE;
80: 3ipl-A 2.0 3.2 53 445 6 PDB MOLECULE: 2-SUCCINYLBENZOATE--COA LIGASE;
81: 2pvz-A 2.0 4.0 87 387 2 PDB MOLECULE: PRPF METHYLACONITATE ISOMERASE;
82: 3ib5-A 2.0 4.7 101 342 5 PDB MOLECULE: SEX PHEROMONE PRECURSOR;
83: 2vsq-A 2.0 3.5 66 1274 8 PDB MOLECULE: SURFACTIN SYNTHETASE SUBUNIT 3;
84: 2hhi-A 2.0 8.2 73 204 7 PDB MOLECULE: IMMUNOGENIC PROTEIN MPT64;
85: 1ukk-A 2.0 4.2 73 141 10 PDB MOLECULE: OSMOTICALLY INDUCIBLE PROTEIN C;
86: 3fgv-A 2.0 4.5 61 94 11 PDB MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN WITH FERREDOXIN-LIKE
Pairwise Structural Alignments
Notation: three-state secondary structure definitions by DSSP (reduced to H=helix, E=sheet, L=coil) are shown above the amino acid sequence. Structurally equivalent residues are in uppercase, structurally non-equivalent residues (e.g. in loops) are in lowercase. Amino acid identities are marked by vertical bars.
No 1: Query=mol1A Sbjct=2zkqc Z-score=4.0
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DSSP -lllhHHHHHhHHHHHHHHHHHLllleeLLLL-EEEEEEEEELLEEEEEEEELhhHHHH- Query -gaslKDFELsKXLEKVAKESSVgtpraINED-ILDQGYTVEGNQLINHLSVRasHAER- 57 ident | | || | Sbjct avqisKKRKF-VADGIFKAELNEfltreLAEDgYSGVEVRVTPTRTEIIILAT--RTQNv 57 DSSP lllllLLLLH-HHHHHHHHHHHHhhhhhLLLLlEEEEELLEELLEELLEEEEL--LHHHh DSSP HHHLHhHHHHHHHHHHHLLhHHHHHHllllEEEEEEEELLL------------------- Query XRSNPdSVRSQLGDSVCSNtGYRQLLargaILTYSFTEYKT------------------- 98 ident | | | Sbjct LGEKG-RRIRELTAVVQKR-FGFPEG----SVELYAEKVATrglcaiaqaeslrykllgg 111 DSSP HLHHH-HHHHHHHHHHHHH-LLLLLL----LLLLEEEELLLhhhlhhhhhhhhhhhhhhl DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 98 ident Sbjct lavrracygvlrfimesgakgcevvvsgklrgqraksmkfvdglmihsgdpvnyyvdtav 171 DSSP llhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeelllhhhlllllllleeellhhhhlllllleeeee DSSP ------lleeeeeeelhhhhl Query ------nqpvaterfdagscr 113 ident Sbjct rhvllrqgvlgikvkimlpwd 192 DSSP elllllllllleeeeeellll
DSSP ---------------lllHHHHH------------------------------------- Query ---------------gasLKDFE------------------------------------- 8 ident | Sbjct llqdnxansynggdfedgLLNLSkevfptdkylyqdgqfldkktinaylnpkytkreidk 60 DSSP llllllllhhhhhhhhhhHHHHHhhhlllllleeeelllllhhhhhhhhlllllhhhhhl DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 8 ident Sbjct xsekdkkdkkanenlglnpshegetnpekiaekspaylsnileqdfygknikgxtiglax 120 DSSP llhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhlllleeeeeeeeeellllleeeeeeee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 8 ident Sbjct nsvyyykkekdgptfskklddsevkkqgkqxaseilsrlrenddlkdipihfaiykqsse 180 DSSP lleeeelllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhlllleeeeeeellll DSSP -----------------------hhhhhHHHHhhHHLL-----------lleelllleeE Query -----------------------lskxlEKVAkeSSVG-----------tprainedilD 34 ident Sbjct dsitpgefitqataeksqtklewhnineKSAL--LPSStaadydenlnnnfkqfndnlqQ 238 DSSP lllllleeeeeeeellllllllleelleEEEE--ELLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllL DSSP EEEEEE-----lLEEEEEEEELHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHLlhhhhhhhlllLEE Query QGYTVE-----gNQLINHLSVRASHAERXRSNPDSVRSQLGDSVCSntgyrqllargAIL 89 ident | | | | | Sbjct AVGKVKfvdkkpQRLVVDLPIDYYGQAETIGITQYVTEQANKYFDK----------iDNY 288 DSSP LEEEEEeelleeEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL----------lLLE DSSP EEEEEELLllLEEEEEEELHHHH--------l Query TYSFTEYKtnQPVATERFDAGSC--------r 113 ident || | Sbjct EIRIKDGN--QPRALISKTKDDKepqvhiysn 318 DSSP EEEEELLL--LEEEEEEELLLLLlleeeelll
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct ektysgfvaivgkpnvgkstllnnllgvkvapisprpqttrkrlrgiltegrrqivfvdt 60 DSSP llleeeeeeeellllllhhhhhhhhhllllllllllllllllleeeeeeelleeeeeeel DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct pglhkpmdalgefmdqevyealadvnavvwvvdlrhpptpedelvaralkplvgkvpill 120 DSSP llllllllhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhllllleee DSSP ------------------------------------------------lllhhhhhhhhh Query ------------------------------------------------gaslkdfelskx 12 ident Sbjct vgnkldaakypeeamkayhellpeaeprmlsalderqvaelkadllalmpegpffypedy 180 DSSP eeelhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeelllllhhhhhhhhhhhhllllllllllllll DSSP hhhhhHHHHL-----------llleelLLLEEEEEEEEEL-----LEEEEEEEEL-HHHH Query lekvaKESSV-----------gtpraiNEDILDQGYTVEG-----NQLINHLSVR-ASHA 55 ident | | | | Sbjct aksdqTFGEWvaeilreeamkrlwhevPYAVATKVEEVAErengvLYIKAILYVErPSQK 240 DSSP lllllLHHHHhhhhhhhhhhhlllllhHHHLEEEEEEEEEellleEEEEEEEEELlHHHH DSSP HHH-HHLHHHHHHHHHHHHHLLhhHHHHhLLLLEEEEEEEELLLlleeeeeeelhhhhl Query ERX-RSNPDSVRSQLGDSVCSNtgYRQLlARGAILTYSFTEYKTnqpvaterfdagscr 113 ident | | | Sbjct AIViGEGGRKIKEIGQATRKQL--EALL-GKKVYLDLEVKVYPDwrkdpealrelgyrs 296 DSSP HHHhLHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHH-LLEEEEEEEEEELLLhhhlhhhhhhhllll
DSSP lllhhhhhhhhhhhhHHHHHHL---llleelLLLEEEEEEEEEL-LEEEEEEEELhhHHH Query gaslkdfelskxlekVAKESSV---gtpraiNEDILDQGYTVEG-NQLINHLSVRasHAE 56 ident | | | Sbjct ---------------KLHEIKQelkdlfshlPYKINKVEVSLYEpGVLLIDIDGE--DSA 43 DSSP ---------------LHHHHHHhhhhhllllLLLEEEEEEEEEElLEEEEEEEEH--HHL DSSP H-HHHLHHHHHHHHHHHHHLlhhHHHHHlllLEEEEEEeelllllEEEE----------- Query R-XRSNPDSVRSQLGDSVCSntgYRQLLargAILTYSFteyktnqPVAT----------- 104 ident Sbjct LlIGEKGYRYKALSYLLFNW--iHPTYG---YSIRLEI-------STFLqnqekvmdtql 91 DSSP LlLLHHHHHHHHHHHHHHHH--hHHHHL---LEEEEEE-------LLHHhhhhhhhhhhh DSSP ---------------------------------------------eeelhhhhl Query ---------------------------------------------erfdagscr 113 ident Sbjct qsvimtvhevgkgqmkapdgvltyialkklrkafpnkyvsiktnlndekyivin 145 DSSP hhhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhhhhhhhllllleeeeellllleeeeel
DSSP lllhhHHHHhHHHHHHHHHHHLllleeLLLLEEEEEEEEE--------LLEEEEEEEELh Query gaslkDFELsKXLEKVAKESSVgtpraINEDILDQGYTVE--------GNQLINHLSVRa 52 ident | | | | Sbjct ---ivTEYQ-PAWVEQFEEEAQalkqiLKENCLKVEHIGStsvpnlaaKPIIDFLVIVE- 55 DSSP ---llLLLL-LHHHHHHHHHHHhhhhhHHHHEEEEEEELHhhllllllLLLEEEEEEEL- DSSP hHHHHHHhlhhhHHHHHHHHHHL------------lhhHHHHHllllEEEEEEEELLLL- Query sHAERXRsnpdsVRSQLGDSVCS------------ntgYRQLLargaILTYSFTEYKTN- 99 ident | Sbjct -EIEKVD----lLQWEFERIGYEyxgefglsgrrylrkGPIKR----THHVHIYQFDNTq 106 DSSP -LLHHHH----hHHHHHHHLLLEelllllllleeeeeeLLLLL----LEEEEEEELLLHh DSSP ---------------------------------------------leeeeeeelhhhhl Query ---------------------------------------------qpvaterfdagscr 113 ident Sbjct eilrhlafrnylrenpaiattygtlkkqlaqahpdsidkyxkdafikkiekealkkywe 165 DSSP hhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct dksycgfiaivgrpnvgkstllnkllgqkisitsrkaqttrhrivgihtegayqaiyvdt 60 DSSP llleeeeeeeellllllhhhhhhhhhllleeellllllllllleeeeeeelleeeeeell DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct pglhmeekrainrlmnkaasssigdvelvifvvegtrwtpddemvlnklregkapvilav 120 DSSP llllhhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhhllllleeeee DSSP ---------------------------------------------------lllhhhhhh Query ---------------------------------------------------gaslkdfel 9 ident Sbjct nkvdnvqekadllphlqflasqmnfldivpisaetglnvdtiaaivrkhlpeathhfped 180 DSSP elhhhlllhhhhhhhhhhhllllllleeeeelllllllhhhhhhhhhhllllllllllll DSSP hhhhhHHHHH--------hhlllleelLLLEEEEEEEEEL-----LEEEEEEEEL-HHHH Query skxleKVAKE--------ssvgtpraiNEDILDQGYTVEG-----NQLINHLSVR-ASHA 55 ident | Sbjct yitdrSQRFMaseiireklmrflgaelPYSVTVEIERFVSnerggYDINGLILVErEGQK 240 DSSP lllllLHHHHhhhhhhhhhhhhlllllLLLEEELEEEEELlllllEEEEEEEEELlHHHH DSSP HHH-HHLHHHHHHHHHHHHHLlhhHHHHhLLLLEEEEEEEELLLLLeeeeeeelhhhhl Query ERX-RSNPDSVRSQLGDSVCSntgYRQLlARGAILTYSFTEYKTNQpvaterfdagscr 113 ident | Sbjct KMViGNKGAKIKTIGIEARKD--mQEMF-EAPVHLELWVKVKSGWA---dderalrslg 293 DSSP HHHhLHHHHHHHHHHHHHHHH--hHHLL-LLLEEEEEEEEELLLLL---hhhhhhhlll
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct xekilifghqnpdtdticsaiayadlknklgfnaepvrlgqvngetqyaldyfkqesprl 60 DSSP lleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeelllllhhhhhhhhhllllllee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct vetaanevngvilvdhnerqqsikdieevqvlevidhhrianfetaeplyyraepvgcta 120 DSSP llllllllleeeeellllhhhllllhhhleeeeeeellllllllllllleeeelllllhh DSSP -------------------------------------------lllhhhhhhhhhhhhhh Query -------------------------------------------gaslkdfelskxlekva 17 ident Sbjct tilnkxykennvkiekeiaglxlsaiisdsllfksptctdqdvaaakelaeiagvdaeey 180 DSSP hhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhllllhhhh DSSP hhhhllllEELLL----leeeEEEEEEL----LEEEEEEEELhhHHHHhhhlHHHHhHHH Query kessvgtpRAINE----dildQGYTVEG----NQLINHLSVRasHAERxrsnPDSVrSQL 69 ident | | | Sbjct glnxlkagADLSKktveelisLDAKEFTlgskKVEIAQVNTV--DIED---vKKRQ-AEL 234 DSSP hhhhhhllLLLLLllhhhhhhHEEEEELhhhlLEEEEEEEEL--LHHH---hHLLH-HHH DSSP HHHHHLLhhHHHHHlllLEEEEEEEELLLLLEeEEEEELH-------------------- Query GDSVCSNtgYRQLLargAILTYSFTEYKTNQPvATERFDA-------------------- 109 ident | | Sbjct EAVISKV--VAEKN--lDLFLLVITDILENDS-LALAIGNeaakvekafnvtlenntall 289 DSSP HHHHHHH--HHHLL--lLEEEEEEEELLLLEE-EEEEEELhhhhhhhhlllllllleeee DSSP ---------------hhhl Query ---------------gscr 113 ident Sbjct kgvvsrkkqvvpvltdaxa 308 DSSP llllllllllhhhhhllll
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLEELL-----LLEEEEEEEEE--LLEEEEEEEELHH Query gaslkdfelskxlekvakessVGTPRAIN-----EDILDQGYTVE--GNQLINHLSVRAS 53 ident | | Sbjct ------axlkgkytkiekvngVEREYLITdkygiTIGRIFIVDLNkdNRFCXFRXKIYKQ 54 DSSP ------leeellleeeeelllLLLEEEEEellllEEEEEEEEEEEllLLEEEEEEEELLL DSSP hhhHHHHLHHHHHHHHHHHHHLLHHHhhhhlllLEEEEEEEelllLLEE----------- Query haeRXRSNPDSVRSQLGDSVCSNTGYrqllargAILTYSFTeyktNQPV----------- 102 ident | Sbjct -gkSINTYIKEILSVFXEFLFKSNDI-------NKVNIIVD----EEVStqpfvelgfaf 102 DSSP -llLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL-------LEEEEEEE----LLLLlhhhhhlllee DSSP -----------------eEEEELHHHHL- Query -----------------aTERFDAGSCR- 113 ident | Sbjct egiinksiieknvlkdefLFGXDYKNYNs 131 DSSP eeeeeeeeeelleeeeeeEEEEEHHHHHl
DSSP ---lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL-lllEELLlleEEEEE-EEEL------LEEEEEEE Query ---gASLKDFELSKXLEKVAKESSV-gtpRAINediLDQGY-TVEG------NQLINHLS 49 ident | || Sbjct makeFGRPQRVAQEMQKEIALILQReikdPRLG---MMTTVsGVEMsrdlayAKVYVTFL 57 DSSP llllLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLllllHHHL---LLLLLlLEEEelllleEEEEELLL DSSP ElhhHHHHHhhlhhHHHHHHHHHHHLL-HHHHH----hhLLLLEEEEEEEElllLLEEee Query VrasHAERXrsnpdSVRSQLGDSVCSN-TGYRQ----llARGAILTYSFTEyktNQPVat 104 ident | | | Sbjct N--dKDEDA---vkAGIKALQEASGFIrSLLGKamrlriVPELTFFYDNSL--vEGMR-- 108 DSSP H--hHLHHH---hhHHHHHHHHLHHHHhHHHHHhlllllLLEEEEEELLLL--lLLLL-- DSSP eeelhhhhl Query erfdagscr 113 ident Sbjct --------- 108 DSSP ---------
DSSP -----------------------------------------lllhhhhhhhhhhhHHHH- Query -----------------------------------------gaslkdfelskxleKVAK- 18 ident Sbjct xdxvtvtaktveeavtkalielqttsdkltyeivekgsagfigskpaiirakrkeTLQDk 60 DSSP llleeeeellhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeeeellllllllllleeeeeeellLHHHh DSSP --hhhlllleelLLLEEEeEEEEE--LLEEEEEEEELHhHHHHhHHLHHHHHHHHHHHHH Query --essvgtpraiNEDILDqGYTVE--GNQLINHLSVRAsHAERxRSNPDSVRSQLGDSVC 74 ident | | | | Sbjct aiefleqvfdaxNXAVDI-SVEYNetEKEXNVNLKGDD-XGIL-IGKRGQTLDSLQYLVS 117 DSSP hhhhhhhhhhhlLLLLEE-EEEEEllLLEEEEEEELHH-HHHL-LLLHHHHHHHHHHHHH DSSP LLhhHHHHhLLLLEEEEEEeelllllEEEE------------------------------ Query SNtgYRQLlARGAILTYSFteyktnqPVAT------------------------------ 104 ident Sbjct LV-vNKSS-SDYIRVKLDT-------ENYRerrketletlakniaykvkrtkrsvslepx 168 DSSP HH-hHHLL-LLLLEEEEEL-------LLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleellll DSSP -----------------------------eeelhhhhl Query -----------------------------erfdagscr 113 ident Sbjct npyerriihaalqndkyvvtrsdgeepfrhviislkre 206 DSSP lhhhhhhhhhhlllllleeeeeelllllleeeeeelll
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DSSP ----------------------------------lllhhhhhhhhhhHHHHHHH------ Query ----------------------------------gaslkdfelskxlEKVAKES------ 20 ident Sbjct yfqghmdkkyditavlnedssmtaisdqfqitldarpkhtakgfgplAALLSGLaacela 60 DSSP leelllleeeeeeeeellllleeeeelleeeeellllllllllllhhHHHHHHHhhhhhh DSSP ----hlllleellLLEEEeEEEEE-----------LLEEEEEEEElhhhHHHHhhLHHHH Query ----svgtprainEDILDqGYTVE-----------GNQLINHLSVrashAERXrsNPDSV 65 ident | | | Sbjct tanlmapakmitiNKLLM-NVTGSrstnptdgyfgLREINLHWEI----HSPN--SETEI 113 DSSP hhhhhhhhhllllLEEEE-EEEEEellllllllllLLEEEEEEEE----ELLL--LHHHH DSSP HHHHHHHHHLLHHHHHHHLLL-LEEEEEEEEllllleeeeeeelhhhhl Query RSQLGDSVCSNTGYRQLLARG-AILTYSFTEyktnqpvaterfdagscr 113 ident | | Sbjct KEFIDFVSKRCPAHNTLQGVSqLKINVNVTL----------------vh 146 DSSP HHHHHHHHHHLHHHHHHHLLLlLEEEEEEEE----------------el
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DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhHHHLL--------------------------llEELL----- Query gaslkdfelskxlekvakESSVG--------------------------tpRAIN----- 29 ident Sbjct -----------skilvfgHQNPDsdaigssxayaylkrqlgvdaqavalgnPNEEtafvl 49 DSSP -----------lleeeelLLLLLhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeelllllLLHHhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 29 ident Sbjct dyfgiqappvvksaqaegakqviltdhnefqqsiadirevevvevvdhhrvanfetanpl 109 DSSP hhlllllllllllllllllleeeeellllhhhllllhhhleeeeeeelllllllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 29 ident Sbjct yxrlepvgsassivyrlykengvaipkeiagvxlsglisdtlllksptthasdpavaedl 169 DSSP eeeelllllhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhh DSSP -----------------LLEE----------eEEEEEEL----LEEEEEEEELhhHHHHH Query -----------------EDIL----------dQGYTVEG----NQLINHLSVRasHAERX 58 ident Sbjct akiagvdlqeyglaxlkAGTNlasktaaqlvdIDAKTFElngsQVRVAQVNTV--DINEV 227 DSSP hhhhlllhhhhhhhhhhHLLLlllllhhhhllLLEEEEEelleEEEEEEEEEL--LHHHH DSSP hhlHHHHhHHHHHHHHLLhhHHHHHlllLEEEEEEEELLLLLEeEEEEELH--------- Query rsnPDSVrSQLGDSVCSNtgYRQLLargAILTYSFTEYKTNQPvATERFDA--------- 109 ident | Sbjct ---LERQ-NEIEEAIKAS--QAANG--ySDFVLXITDILNSNS-EILALGNntdkveaaf 278 DSSP ---HHHH-HHHHHHHHHH--HHHHL--lLEEEEEEEELLLLEE-EEEEEELlhhhhhhhh DSSP ---------------------------hhhl Query ---------------------------gscr 113 ident Sbjct nftlknnhaflagavsrkkqvvpqltesfng 309 DSSP llllllleeeelllllhhhhlhhhhhhhhll
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DSSP lllhhhhhhhhhhhHHHHHHHLllleeLLLLEEEEEEEEE---LLEEEEEEEELHHHHhh Query gaslkdfelskxleKVAKESSVgtpraINEDILDQGYTVE---GNQLINHLSVRASHAer 57 ident | | Sbjct --------------VTATDYDTfvserFGSIIQAVQTFTDstkPGYAFIAAKPKSGLY-l 45 DSSP --------------LLHHHHHHhhhhhLLLLLLEEEEEELlllLLEEEEEEELLLLLL-l DSSP HHHLHhHHHHHHHHHHhllhhhHHHHlllLEEEEEEE----------------------- Query XRSNPdSVRSQLGDSVcsntgyRQLLargAILTYSFT----------------------- 94 ident Sbjct TTVQR-EDIKNYLKDY------NLAP---ITPSIISPnylfiktnlkvtyalnklqeseq 95 DSSP LLLLL-LLLHHHHLLL------LLLL---LEEEEELLeeeeeeeeeeeeeelllllllhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 94 ident Sbjct wlegqiidkidryytedveifnssfakskmltyvddadhsvigssatiqmvrevqnfykt 155 DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleelhhhhhhhhhllllllleeelleeeeeeellllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 94 ident Sbjct peagikynnqikdrsmesntfsfnsgrkvvnpdtgleedvlydvrivstdrdskgigkvi 215 DSSP lllllllllllllllleelleeeelllllllllllllllleeeeeeeellllllleeeee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 94 ident Sbjct igpfasgdvteneniqpytgndfnklansdgrdkyyvigeinypadviywniakinltse 275 DSSP eellllllllllllllllllllllllllllllllleeeeeeelllleeeelhhhllllhh DSSP --------------------------------ellllleeeeeeelhhhhl Query --------------------------------eyktnqpvaterfdagscr 113 ident Sbjct kfevqtielysdptddviftrdgslivfendlrpqyltidlepisqlehhh 326 DSSP hllllleeeeelllllleelllleeelllllllllleeellleelllllll
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct msdvaetldplrlplqgerlieasagtgktftiaalylrlllglggsaafprpltveell 60 DSSP llllleellhhhlllllleeeellllllhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllhhhee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct vvtfteaataelrgrirsnihelriaclrettdnplyerlleeiddkaqaaqwlllaerq 120 DSSP eeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct mdeaavftihgfcqrmlnlnafesgmlfeqqliedesllryqacadfwrrhcyplpreia 180 DSSP hhhlleeehhhhhhhhhhhlhhhhlllllleellllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct 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DSSP lllhhhhhhhhhhhHHHHH---------------------hhllLLEE----lLLLEEEE Query gaslkdfelskxleKVAKE---------------------ssvgTPRA----iNEDILDQ 35 ident || | | Sbjct --------------MQAKPqipkdkskvagyieipdadikepvyPGPAtpeqlNRGVSFA 46 DSSP --------------LLLLLlllllllllleeeeelllleeeeeeLLLLlhhhhLLLEEEL DSSP ----EEEEelleEEEEEEELH------HHHHHHHHLHHhhHHHH----hHHHH------- Query ----GYTVegnqLINHLSVRA------SHAERXRSNPDsvRSQL----gDSVC------- 74 ident Sbjct eeneSLDD----QNISIAGHTfidrpnYQFTNLKAAKK-gSMVYfkvgnETRKykmtsir 101 DSSP llllLLLL----LEEEEEEELllllllLLLLHHHHLLL-lLEEEeeellEEEEeeeeeel DSSP ---llhhhhhhhllLLEEEEEEEELL----------LLLEeEEEEELHhhhl Query ---sntgyrqllarGAILTYSFTEYK----------TNQPvATERFDAgscr 113 ident | Sbjct dvkptdvgvldeqkGKDKQLTLITCDdynektgvweKRKI-FVATEVK---- 148 DSSP llllllllllllllLLLLEEEEEEELleelllleelLLLE-EEEELLL----
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DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct tlmvpfkqvdvftekpfmgnpvavinfleidenevsqeelqaianwtnlsettflfkpsd 60 DSSP leeeeeeeeeelllllllleeeeeeelllllhhhllhhhhhhhhhhhlllleeeeellll DSSP ------LLLH----HHHHH----------------------------------------- Query ------GASL----KDFEL----------------------------------------- 9 ident Sbjct kkydykLRIFtprsELPFAghptigsckafleftknttatslvqeckigavpitinegli 120 DSSP lllleeEEEEllllEELLLhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeelleeeeeeeellee DSSP -hhhhhHHHHhHHLL-----lleelllLEEE-EEEEEElLEEEEEEEELH-HHHHHHHhl Query -skxleKVAKeSSVG-----tpraineDILD-QGYTVEgNQLINHLSVRA-SHAERXRsn 61 ident | | Sbjct sfkapmADYE-SISSemiadyekaiglKFIKpPALLHT-GPEWIVALVEDaETCFNAN-- 176 DSSP eeelllLEEE-ELLHhhhhhhhhhhllLLLLlLEEEEL-LLEEEEEELLLhHHHHHLL-- DSSP hhhHHHHHHHHHHLLhhhhhhhlllleEEEEEEELL-------LLLEeEEEEE------- Query pdsVRSQLGDSVCSNtgyrqllargaiLTYSFTEYK-------TNQPvATERF------- 107 ident | | | Sbjct --pNFAMLAHQTKQN----------dhVGIILAGPKkeaaiknSYEM-RAFAPvinvyed 223 DSSP --lLHHHHHHHHHHH----------llLEEEEEEELlllllllEEEE-EEEEHhhleeee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 107 ident Sbjct pvcgsgsvalarylqevykfekttditiseggrlkrnglmlasikkeadnstsyyiagha 283 DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeelhhhllleeeeeeeeellllleeeeeeele DSSP -----lhhhhl Query -----dagscr 113 ident Sbjct ttvidgkikvh 294 DSSP eeeeeeeeeel
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DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhHHHHllllEELLLLEEEeEEEEELLEEEEEEEEL--------- Query gaslkdfelskxlekvaKESSvgtpRAINEDILDqGYTVEGNQLINHLSVR--------- 51 ident | | Sbjct -----------------ISYE----FQTHKELYV-QATHFNNTILLQIRLNgemdstyev 38 DSSP -----------------LEEE----EEELLLEEE-EEELLLLLLLEEEEELlllleeeee DSSP ---------hhhhhhhHHLHHHHHHHHHHHH-HLLHHhhhhhllLLEEEEEEE---elll Query ---------ashaerxRSNPDSVRSQLGDSV-CSNTGyrqllarGAILTYSFT---eykt 98 ident | | | | Sbjct sskglyqvvtklgdsaDPKVPVVCVQIAELYrRVILP-------QFSLLISMSskiwndf 91 DSSP ellllleeeeeellllLLLHHHHHHHHHHHHhLLLLL-------LLEEEEEELhhhllll DSSP lleeeeeeelhhhhl Query nqpvaterfdagscr 113 ident Sbjct gklvfvlkcikdmya 106 DSSP hhhhhhhhhhhllll
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