Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition.
The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure, to pre-computed structural neighbours in the Dali Database,
and to the PDB format coordinate file where the neighbour
is superimposed onto the query structure.
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Summary
No: Chain Z rmsd lali nres %id PDB Description
1: 3evh-A 23.5 3.7 315 353 14 PDB MOLECULE: ALGINATE LYASE;
2: 1nc5-A 12.2 4.0 256 363 9 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YTER;
3: 2fuq-A 11.7 4.5 258 747 9 PDB MOLECULE: HEPARINASE II PROTEIN;
4: 2g02-A 11.7 4.0 240 404 7 PDB MOLECULE: NISIN BIOSYNTHESIS PROTEIN NISC;
5: 1kkt-A 11.4 3.7 250 475 10 PDB MOLECULE: MANNOSYL-OLIGOSACCHARIDE ALPHA-1,2-MANNOSIDASE;
6: 2gz6-A 11.4 4.0 248 372 8 PDB MOLECULE: N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE 2-EPIMERASE;
7: 1j0m-A 11.2 3.2 287 752 9 PDB MOLECULE: XANTHAN LYASE;
8: 1hcu-B 10.9 3.8 250 489 10 PDB MOLECULE: ALPHA-1,2-MANNOSIDASE;
9: 1ojn-A 10.8 3.5 295 722 7 PDB MOLECULE: HYALURONATE LYASE;
10: 1rw9-A 10.6 3.3 286 754 10 PDB MOLECULE: CHONDROITIN AC LYASE;
11: 3e6u-A 10.5 4.2 242 409 7 PDB MOLECULE: LANC-LIKE PROTEIN 1;
12: 1nxc-A 10.4 3.8 253 467 10 PDB MOLECULE: MANNOSYL-OLIGOSACCHARIDE 1,2-ALPHA-MANNOSIDASE
13: 1fp3-A 10.1 4.2 236 402 6 PDB MOLECULE: N-ACYL-D-GLUCOSAMINE 2-EPIMERASE;
14: 1hzf-A 10.0 4.2 218 302 9 PDB MOLECULE: COMPLEMENT FACTOR C4A;
15: 1h12-A 9.6 4.1 247 403 9 PDB MOLECULE: ENDO-1,4-BETA-XYLANASE;
16: 1cb8-A 9.5 3.4 257 674 11 PDB MOLECULE: PROTEIN (CHONDROITINASE AC);
17: 2b39-A 9.5 3.8 220 1610 8 PDB MOLECULE: C3;
18: 1v5c-A 9.3 3.8 237 386 9 PDB MOLECULE: CHITOSANASE;
19: 3cu7-A 9.3 4.0 220 1625 7 PDB MOLECULE: COMPLEMENT C5;
20: 1f1s-A 9.3 3.7 291 814 9 PDB MOLECULE: HYALURONATE LYASE;
21: 1v7v-A 9.3 4.1 248 779 6 PDB MOLECULE: CHITOBIOSE PHOSPHORYLASE;
22: 3k7x-A 9.2 4.1 222 348 12 PDB MOLECULE: LIN0763 PROTEIN;
23: 2a73-B 9.2 4.2 222 976 9 PDB MOLECULE: COMPLEMENT C3;
24: 3gt5-A 9.1 3.9 215 391 7 PDB MOLECULE: N-ACYLGLUCOSAMINE 2-EPIMERASE;
25: 2ds3-A 9.0 3.9 230 758 7 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YGJK;
26: 2pn5-A 8.9 3.8 201 1283 8 PDB MOLECULE: THIOESTER-CONTAINING PROTEIN I;
27: 1f9d-A 8.8 4.0 271 629 5 PDB MOLECULE: ENDO-1,4-BETA-GLUCANASE F;
28: 1vd5-A 8.8 4.1 214 377 11 PDB MOLECULE: UNSATURATED GLUCURONYL HYDROLASE;
29: 1fmi-A 8.7 4.2 242 456 11 PDB MOLECULE: ENDOPLASMIC RETICULUM ALPHA-MANNOSIDASE I;
30: 1lf6-A 8.6 4.6 230 674 8 PDB MOLECULE: GLUCOAMYLASE;
31: 1n4p-B 8.6 4.4 222 346 7 PDB MOLECULE: PROTEIN FARNESYLTRANSFERASE ALPHA SUBUNIT;
32: 2nvp-A 8.4 4.5 236 430 6 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;
33: 1dce-B 8.3 3.9 220 329 11 PDB MOLECULE: PROTEIN (RAB GERANYLGERANYLTRANSFERASE ALPHA
34: 2bb5-A 8.2 4.2 211 409 11 PDB MOLECULE: TRANSCOBALAMIN II;
35: 2zzr-A 8.1 3.9 221 397 5 PDB MOLECULE: UNSATURATED GLUCURONYL HYDROLASE;
36: 2drs-A 8.1 4.2 245 379 7 PDB MOLECULE: XYLANASE Y;
37: 2cqs-A 8.0 4.1 229 822 10 PDB MOLECULE: CELLOBIOSE PHOSPHORYLASE;
38: 3cih-A 8.0 4.4 220 714 7 PDB MOLECULE: PUTATIVE ALPHA-RHAMNOSIDASE;
39: 1js4-A 8.0 4.6 237 605 8 PDB MOLECULE: ENDO/EXOCELLULASE E4;
40: 3k11-A 8.0 3.8 203 439 9 PDB MOLECULE: PUTATIVE GLYCOSYL HYDROLASE;
41: 1kwf-A 7.9 4.0 224 363 8 PDB MOLECULE: ENDOGLUCANASE A;
42: 1w6j-A 7.9 4.3 223 727 10 PDB MOLECULE: LANOSTEROL SYNTHASE;
43: 2p0v-A 7.9 4.4 230 443 10 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN BT3781;
44: 1qqf-A 7.8 4.0 183 277 7 PDB MOLECULE: PROTEIN (COMPLEMENT C3DG);
45: 2jg0-A 7.6 4.3 234 507 3 PDB MOLECULE: PERIPLASMIC TREHALASE;
46: 1ug9-A 7.6 5.0 226 1019 7 PDB MOLECULE: GLUCODEXTRANASE;
47: 2c74-A 7.5 3.9 170 235 5 PDB MOLECULE: 14-3-3 PROTEIN ETA;
48: 2b05-A 7.5 3.9 165 233 5 PDB MOLECULE: 14-3-3 PROTEIN GAMMA;
49: 2br9-A 7.5 4.0 172 230 5 PDB MOLECULE: 14-3-3 PROTEIN EPSILON;
50: 2btp-A 7.4 4.1 174 248 6 PDB MOLECULE: 14-3-3 PROTEIN TAU;
51: 1yz5-B 7.3 4.2 168 226 6 PDB MOLECULE: 14-3-3 PROTEIN SIGMA;
52: 2okx-A 7.2 4.3 214 954 4 PDB MOLECULE: RHAMNOSIDASE B;
53: 1ia7-A 7.2 4.8 229 431 8 PDB MOLECULE: CELLULASE CEL9M;
54: 2npm-A 7.2 4.3 163 237 7 PDB MOLECULE: 14-3-3 DOMAIN CONTAINING PROTEIN;
55: 1qjb-B 7.1 3.8 163 232 8 PDB MOLECULE: 14-3-3 PROTEIN ZETA/DELTA;
56: 3gzk-A 7.1 4.7 227 531 8 PDB MOLECULE: CELLULASE;
57: 3eu8-A 7.0 4.2 233 422 7 PDB MOLECULE: PUTATIVE GLUCOAMYLASE;
58: 1ks8-A 6.9 4.4 210 433 9 PDB MOLECULE: ENDO-B-1,4-GLUCANASE;
59: 2zbl-B 6.9 4.8 226 418 7 PDB MOLECULE: PUTATIVE ISOMERASE;
60: 1g87-B 6.8 4.3 227 613 10 PDB MOLECULE: ENDOCELLULASE 9G;
61: 1gai-A 6.8 4.3 233 472 5 PDB MOLECULE: GLUCOAMYLASE-471;
62: 2pmv-A 6.8 4.0 183 378 9 PDB MOLECULE: GASTRIC INTRINSIC FACTOR;
63: 2o98-B 6.8 4.7 160 237 6 PDB MOLECULE: 14-3-3-LIKE PROTEIN C;
64: 1wzz-A 6.7 4.3 214 319 7 PDB MOLECULE: PROBABLE ENDOGLUCANASE;
65: 1dl2-A 6.7 4.5 244 510 6 PDB MOLECULE: CLASS I ALPHA-1,2-MANNOSIDASE;
66: 2bb6-A 6.6 3.9 189 414 11 PDB MOLECULE: TRANSCOBALAMIN II;
67: 1clc-A 6.6 5.5 213 541 8 PDB MOLECULE: ENDOGLUCANASE CELD; EC: 3.2.1.4;
68: 2bq0-B 6.4 4.5 165 231 7 PDB MOLECULE: 14-3-3 BETA/ALPHA;
69: 2ijp-B 6.4 3.8 160 228 11 PDB MOLECULE: 14-3-3 PROTEIN;
70: 2sqc-A 6.3 4.0 171 623 12 PDB MOLECULE: SQUALENE-HOPENE CYCLASE;
71: 3h7l-A 6.1 3.7 195 576 8 PDB MOLECULE: ENDOGLUCANASE;
72: 1r76-A 6.1 4.4 196 384 8 PDB MOLECULE: PECTATE LYASE;
73: 1ut9-A 6.0 5.9 221 605 8 PDB MOLECULE: CELLULOSE 1,4-BETA-CELLOBIOSIDASE;
74: 2f6d-A 6.0 3.9 191 492 8 PDB MOLECULE: GLUCOAMYLASE GLU1;
75: 2vn4-A 5.9 4.1 220 599 3 PDB MOLECULE: GLUCOAMYLASE;
76: 3c2g-A 5.8 4.2 197 618 6 PDB MOLECULE: SYS-1 PROTEIN;
77: 1hn0-A 5.7 4.5 261 971 10 PDB MOLECULE: CHONDROITIN ABC LYASE I;
78: 2q1f-A 5.4 3.8 262 991 10 PDB MOLECULE: CHONDROITINASE;
79: 2grm-A 5.3 4.0 157 315 9 PDB MOLECULE: PRGX;
80: 2z07-B 5.2 3.8 167 403 8 PDB MOLECULE: PUTATIVE UNCHARACTERIZED PROTEIN TTHA0978;
81: 2v8i-A 5.1 7.0 201 543 9 PDB MOLECULE: PECTATE LYASE;
82: 1a37-A 5.1 4.0 148 195 9 PDB MOLECULE: 14-3-3 PROTEIN ZETA;
83: 3a6p-A 5.0 7.0 165 1072 5 PDB MOLECULE: EXPORTIN-5;
84: 1gxm-B 5.0 4.7 173 332 13 PDB MOLECULE: PECTATE LYASE;
85: 1wa5-C 4.8 4.7 176 937 9 PDB MOLECULE: GTP-BINDING NUCLEAR PROTEIN RAN;
86: 1h54-B 4.8 6.0 173 754 9 PDB MOLECULE: MALTOSE PHOSPHORYLASE;
87: 2pfv-A 4.5 14.5 191 549 5 PDB MOLECULE: EXOCYST COMPLEX COMPONENT EXO70;
88: 2ww2-A 4.4 5.9 205 737 10 PDB MOLECULE: ALPHA-1,2-MANNOSIDASE;
89: 1wa5-B 4.4 4.3 156 463 5 PDB MOLECULE: GTP-BINDING NUCLEAR PROTEIN RAN;
90: 1ho8-A 4.3 4.8 155 447 6 PDB MOLECULE: VACUOLAR ATP SYNTHASE SUBUNIT H;
91: 1l1y-A 4.3 5.9 232 642 7 PDB MOLECULE: CELLOBIOHYDROLASE;
92: 2z5k-A 4.3 4.8 173 840 8 PDB MOLECULE: TRANSPORTIN-1;
93: 3ebb-A 4.2 4.3 122 265 5 PDB MOLECULE: PHOSPHOLIPASE A2-ACTIVATING PROTEIN;
94: 1gw5-B 4.2 4.4 167 579 8 PDB MOLECULE: ADAPTOR-RELATED PROTEIN COMPLEX 2 ALPHA 2
95: 2ong-A 4.2 4.2 145 542 13 PDB MOLECULE: 4S-LIMONENE SYNTHASE;
96: 2r17-C 4.2 4.7 149 298 7 PDB MOLECULE: VACUOLAR PROTEIN SORTING-ASSOCIATED PROTEIN 29;
97: 3icq-T 4.1 6.6 154 949 6 PDB MOLECULE: EXPORTIN-T;
98: 1ial-A 4.1 7.7 158 438 6 PDB MOLECULE: IMPORTIN ALPHA;
99: 2i2o-A 4.0 3.8 133 211 2 PDB MOLECULE: EIF4G-LIKE PROTEIN;
100: 1w63-B 4.0 4.6 176 575 9 PDB MOLECULE: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1
101: 2j5c-B 4.0 4.1 136 491 11 PDB MOLECULE: 1,8-CINEOLE SYNTHASE;
102: 3dra-B 3.9 4.4 162 364 7 PDB MOLECULE: PROTEIN
103: 3c5w-A 3.9 7.1 153 228 8 PDB MOLECULE: PP2A A SUBUNIT;
104: 1u6g-C 3.8 5.1 166 1146 7 PDB MOLECULE: CULLIN HOMOLOG 1;
105: 2qfc-A 3.6 4.5 137 284 5 PDB MOLECULE: PLCR PROTEIN;
106: 2eab-A 3.6 4.4 233 888 6 PDB MOLECULE: ALPHA-FUCOSIDASE;
107: 1gw5-A 3.5 5.0 165 584 5 PDB MOLECULE: ADAPTOR-RELATED PROTEIN COMPLEX 2 ALPHA 2
108: 2wvz-B 3.5 4.9 197 742 6 PDB MOLECULE: PUTATIVE ALPHA-1,2-MANNOSIDASE;
109: 1hz4-A 3.5 5.4 175 366 11 PDB MOLECULE: MALT REGULATORY PROTEIN;
110: 2b7m-B 3.5 12.3 157 523 4 PDB MOLECULE: EXOCYST COMPLEX COMPONENT EXO70;
111: 2o8p-A 3.5 4.1 133 220 8 PDB MOLECULE: 14-3-3 DOMAIN CONTAINING PROTEIN;
112: 1ya0-B 3.4 4.2 159 464 7 PDB MOLECULE: SMG-7 TRANSCRIPT VARIANT 2;
113: 1xqr-A 3.4 4.6 157 268 6 PDB MOLECULE: HSPBP1 PROTEIN;
114: 1ji6-A 3.4 4.2 154 589 8 PDB MOLECULE: PESTICIDIAL CRYSTAL PROTEIN CRY3BB;
115: 1w63-A 3.4 4.6 154 589 10 PDB MOLECULE: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1
116: 2vsx-E 3.4 8.1 152 240 10 PDB MOLECULE: ATP-DEPENDENT RNA HELICASE EIF4A;
117: 1oxj-A 3.4 3.7 110 170 8 PDB MOLECULE: RNA-BINDING PROTEIN SMAUG;
118: 3fdh-A 3.3 4.4 154 472 8 PDB MOLECULE: SUSD HOMOLOG;
119: 2jdq-B 3.3 5.7 164 426 5 PDB MOLECULE: IMPORTIN ALPHA-1 SUBUNIT;
120: 1w99-A 3.3 6.1 155 558 6 PDB MOLECULE: PESTICIDIAL CRYSTAL PROTEIN CRY4BA;
121: 3cwg-B 3.3 4.4 103 507 12 PDB MOLECULE: SIGNAL TRANSDUCER AND ACTIVATOR OF TRANSCRIPTION
122: 1ciy-A 3.2 5.0 154 577 9 PDB MOLECULE: CRYIA(A);
123: 1bg1-A 3.2 4.1 111 559 8 PDB MOLECULE: PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR STAT3B);
124: 1hxg-A 3.2 4.0 129 534 6 PDB MOLECULE: 5-EPI-ARISTOLOCHENE SYNTHASE;
125: 1yvl-B 3.2 9.5 129 653 7 PDB MOLECULE: SIGNAL TRANSDUCER AND ACTIVATOR OF TRANSCRIPTION
126: 2rdy-A 3.2 4.7 220 787 9 PDB MOLECULE: BH0842 PROTEIN;
127: 1oyz-A 3.2 4.1 152 273 7 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YIBA;
128: 2c9k-A 3.2 3.9 131 598 11 PDB MOLECULE: PESTICIDAL CRYSTAL PROTEIN CRY4AA;
129: 4gtu-A 3.2 6.2 132 217 4 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE S-TRANSFERASE;
130: 3c98-B 3.2 3.9 114 230 5 PDB MOLECULE: SYNTAXIN-BINDING PROTEIN 1;
131: 3jys-A 3.1 4.8 150 479 6 PDB MOLECULE: SUSD SUPERFAMILY PROTEIN;
132: 1gsq-A 3.1 3.9 121 202 9 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE S-TRANSFERASE;
133: 2qk1-A 3.0 11.0 130 247 4 PDB MOLECULE: PROTEIN STU2;
134: 1hx8-A 3.0 9.8 136 270 4 PDB MOLECULE: SYNAPSE-ENRICHED CLATHRIN ADAPTOR PROTEIN LAP;
135: 3gs3-A 3.0 10.0 137 249 7 PDB MOLECULE: SYMPLEKIN;
136: 1v2a-B 2.9 3.8 109 209 6 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE TRANSFERASE GST1-6;
137: 1qgk-A 2.8 4.7 187 876 4 PDB MOLECULE: PROTEIN (IMPORTIN BETA SUBUNIT);
138: 1y1u-A 2.8 4.5 121 544 9 PDB MOLECULE: SIGNAL TRANSDUCER AND ACTIVATOR OF TRANSCRIPTION
139: 2cai-B 2.8 5.0 109 209 7 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE S-TRANSFERASE 28 KDA;
140: 2fef-B 2.8 5.4 140 284 4 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PA2201;
141: 3ejn-A 2.7 4.4 141 450 8 PDB MOLECULE: SUSD HOMOLOG;
142: 1w3b-B 2.7 3.8 130 368 8 PDB MOLECULE: UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE--PEPTIDE N-
143: 3g4d-A 2.7 6.2 131 516 2 PDB MOLECULE: (+)-DELTA-CADINENE SYNTHASE ISOZYME XC1;
144: 1h2u-A 2.7 5.2 156 705 5 PDB MOLECULE: 80 KDA NUCLEAR CAP BINDING PROTEIN;
145: 3ihv-A 2.7 7.4 161 535 5 PDB MOLECULE: SUSD HOMOLOG;
146: 1z1w-A 2.7 10.2 155 780 9 PDB MOLECULE: TRICORN PROTEASE INTERACTING FACTOR F3;
147: 1jlv-A 2.7 5.1 109 207 7 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE TRANSFERASE GST1-3;
148: 3clj-A 2.7 3.4 97 146 8 PDB MOLECULE: PROTEIN NRD1;
149: 2veq-A 2.6 4.7 137 520 7 PDB MOLECULE: CENTROMERE DNA-BINDING PROTEIN COMPLEX
150: 3iv0-A 2.6 4.4 154 466 5 PDB MOLECULE: SUSD HOMOLOG;
151: 3fp3-A 2.6 5.7 142 498 7 PDB MOLECULE: TPR REPEAT-CONTAINING PROTEIN YHR117W;
152: 1ft1-B 2.6 4.5 138 416 9 PDB MOLECULE: PROTEIN FARNESYLTRANSFERASE;
153: 1n1z-A 2.6 4.1 133 537 5 PDB MOLECULE: (+)-BORNYL DIPHOSPHATE SYNTHASE;
154: 2qk2-A 2.6 3.3 90 241 7 PDB MOLECULE: LP04448P;
155: 2v7i-A 2.6 4.0 122 347 7 PDB MOLECULE: PRNB;
156: 2r17-D 2.6 6.9 131 276 8 PDB MOLECULE: VACUOLAR PROTEIN SORTING-ASSOCIATED PROTEIN 29;
157: 2iqc-A 2.6 4.4 117 173 8 PDB MOLECULE: FANCONI ANEMIA GROUP F PROTEIN;
158: 2fi7-A 2.5 4.7 135 223 8 PDB MOLECULE: TYPE 4 FIMBRIAL BIOGENESIS PROTEIN PILF;
159: 1elk-A 2.5 3.1 94 153 7 PDB MOLECULE: TARGET OF MYB1;
160: 3fga-B 2.5 8.3 141 403 8 PDB MOLECULE: SERINE/THREONINE-PROTEIN PHOSPHATASE 2A 65 KDA
161: 3i4r-B 2.5 5.0 117 528 3 PDB MOLECULE: NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP107;
162: 3lg6-A 2.5 4.3 108 229 6 PDB MOLECULE: PUTATIVE GLUTATHIONE TRANSFERASE;
163: 2bnx-B 2.4 5.3 125 339 6 PDB MOLECULE: DIAPHANOUS PROTEIN HOMOLOG 1;
164: 2of3-A 2.4 10.1 124 266 6 PDB MOLECULE: ZYG-9;
165: 1gw6-A 2.4 6.1 132 610 10 PDB MOLECULE: LEUKOTRIENE A-4 HYDROLASE;
166: 2yv9-A 2.4 5.0 114 285 2 PDB MOLECULE: CHLORIDE INTRACELLULAR CHANNEL EXC-4;
167: 1u3i-A 2.4 5.2 103 208 3 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE S-TRANSFERASE 28 KDA;
168: 1bx9-A 2.4 4.2 100 210 5 PDB MOLECULE: PROTEIN (GLUTATHIONE S-TRANSFERASE);
169: 2her-A 2.4 8.0 122 334 5 PDB MOLECULE: FARNESYL PYROPHOSPHATE SYNTHASE;
170: 3etv-A 2.4 10.3 131 315 8 PDB MOLECULE: PROTEIN TRANSPORT PROTEIN TIP20,LINKER,PROTEIN
171: 1xnf-B 2.4 4.3 132 262 14 PDB MOLECULE: LIPOPROTEIN NLPI;
172: 1m0u-A 2.4 5.2 109 203 7 PDB MOLECULE: GST2 GENE PRODUCT;
173: 1qbk-B 2.4 3.8 108 879 12 PDB MOLECULE: KARYOPHERIN BETA2;
174: 1yq1-A 2.3 4.9 102 201 8 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE S-TRANSFERASE;
175: 2oa6-D 2.3 10.7 131 306 3 PDB MOLECULE: ARISTOLOCHENE SYNTHASE;
176: 3cbu-B 2.3 3.7 109 213 5 PDB MOLECULE: PROBABLE GST-RELATED PROTEIN;
177: 1dlc-A 2.2 4.6 152 584 11 PDB MOLECULE: DELTA-ENDOTOXIN CRYIIIA;
178: 3gw4-B 2.2 5.3 126 197 9 PDB MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN;
179: 2v0p-A 2.2 3.4 97 219 8 PDB MOLECULE: TYPE 2A PHOSPHATASE-ASSOCIATED PROTEIN 42;
180: 2r5g-A 2.2 4.1 95 237 5 PDB MOLECULE: CHLORIDE INTRACELLULAR CHANNEL PROTEIN 2;
181: 1jpl-A 2.2 3.3 91 161 8 PDB MOLECULE: ADP-RIBOSYLATION FACTOR BINDING PROTEIN GGA3;
182: 1m56-A 2.2 4.4 149 547 7 PDB MOLECULE: CYTOCHROME C OXIDASE;
183: 2cmr-A 2.2 3.6 86 192 8 PDB MOLECULE: TRANSMEMBRANE GLYCOPROTEIN;
184: 1xm9-A 2.1 4.8 129 420 9 PDB MOLECULE: PLAKOPHILIN 1;
185: 3g2s-A 2.1 3.4 89 146 7 PDB MOLECULE: ADP-RIBOSYLATION FACTOR-BINDING PROTEIN GGA1;
186: 1uus-A 2.1 3.4 83 465 4 PDB MOLECULE: STAT PROTEIN;
187: 1dce-A 2.1 9.2 97 567 6 PDB MOLECULE: PROTEIN (RAB GERANYLGERANYLTRANSFERASE ALPHA
188: 2o6y-A 2.1 5.0 120 515 6 PDB MOLECULE: PUTATIVE HISTIDINE AMMONIA-LYASE;
189: 3cke-D 2.1 9.7 124 284 4 PDB MOLECULE: ARISTOLOCHENE SYNTHASE;
190: 2gw1-A 2.0 3.8 110 487 7 PDB MOLECULE: MITOCHONDRIAL PRECURSOR PROTEINS IMPORT RECEPTOR;
191: 3h3d-Y 2.0 4.3 122 314 2 PDB MOLECULE: MATERNAL PROTEIN PUMILIO;
192: 3i3n-B 2.0 4.7 112 267 2 PDB MOLECULE: KELCH-LIKE PROTEIN 11;
193: 2pft-A 2.0 4.9 136 519 4 PDB MOLECULE: EXOCYTOSIS PROTEIN;
Pairwise Structural Alignments
Notation: three-state secondary structure definitions by DSSP (reduced to H=helix, E=sheet, L=coil) are shown above the amino acid sequence. Structurally equivalent residues are in uppercase, structurally non-equivalent residues (e.g. in loops) are in lowercase. Amino acid identities are marked by vertical bars.
No 1: Query=mol1A Sbjct=3evhA Z-score=23.5
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DSSP ---------llllLLLLLLHHHHHHHHHLLLLLL-LHHHHhhHHHHhhHHHHLLLLLHHh Query ---------gqvaNTRIYAAEKLAKVKEKADSPL-YAPAVktLLRDadKALKXTPPSVXd 50 ident | | Sbjct gshpfdqavvkdpTASYVDVKARRTFLQSGQLDDrLKAAL--PKEY--DCTTEATPNPQ- 55 DSSP lllllllllllllLLLLLLHHHHHHHHHHLLLLHhHHHHL--LLLL--LHHHLLLLLLL- DSSP lllllllllLLLLEEELllEELLllllllLLLEelllllLHHHHHLlHHHHHHHHHHHHH Query ktxtadsgdKHDYXSXGpyWWPDpskpdgLPYIrkdgqrNPELDKLdRNKLGDXSKAVTT 110 ident || | | | Sbjct ---------QGEMVIPR--RYLS------GNHG----pvNPDYEPV-VTLYRDFEKISAT 93 DSSP ---------LLLLLLLL--LLLL------LLLL----llLLLHHHH-HHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHLllllLLLLLLLEeeellllhhhlLLHHHHHHH-L Query LGLAYYFSGDEKYAQKAVDFLNVWFLdaktKXNPHLTYgqtipgknkgxGRGAGXIDI-Y 169 ident || | | || | | Sbjct LGNLYVATGKPVYATCLLNMLDKWAK----ADALLNYD-----------PKSQSWYQVeW 138 DSSP HHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHH----LLLLLLLL-----------LLLHHHHHHhH DSSP LHHHHHHHHHHLL-LLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlhhHHHH--hLLLLHHHHHH Query SFTEXIDAXTLXE-NSKAfTPKVKKGXKEWFTQLVEWXQtspvAAEE--qRAKNNHGLAY 226 ident | | | || Sbjct SAATAAFALSTMMaEPNV-DTAQRERVVKWLNRVARHQT----SFPGgdtSCCNNASYWR 193 DSSP HHHHHHHHHHLLLlLLLL-LHHHHHHHHHHHHHHHHHHL----LLLLlllLLLLHHHHHH DSSP HHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHhHLHHhHLLLLLLLHHHHLLL-LHHHHHHHHHHHH Query DVQLTAYALYTGNQDLAXKTIQEFPeKRLFaQIEPDGKQPLELART-TALGYTIFNLGHX 285 ident | | | || | | | | Sbjct GQEATIIGVISKDDELFRWGLGRYV-QAMG-LINEDGSFVHEMTRHeQSLHYQNYAMLPL 251 DSSP HHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHH-HHHL-LLLLLLLLLLHHHLHhHHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHHHHHHLLLLLLLLLLlLLLLHHHHHHHHHHHLlLLHHH-LLLL-lLLLHhHHHH-- Query LDXCSIASTLGQDIYNATSqDGRSITAALKFLIPYIgKPQSE-WPYQ-qIKEWdKKQE-- 341 ident || | | | || | | || | | Sbjct TMIAETASRQGIDLYAYKE-NGRDIHSARKFVFAAV-KNPDLiKKYAsePQDT-RAFKpg 308 DSSP HHHHHHHHLLLLLHHHLLL-LLLLHHHHHHHHHHHH-HLLHHhHLLLllLLLL-LLLLll DSSP -HHHHHHHHHHLLLHhhlHHHHHHllLLLLL------llLHHHHLLLL-- Query -EACWILRRASFFDPkagYEAIGAqfRETPA------nkRIHLIYSLE-- 382 ident | | Sbjct rGDLNWIEYQRARFG---FADELG--FMTVPifdprtggSATLLAYKPqg 353 DSSP lHHHHHHHHHHHHHL---LLLLLL--LLLLLleehhhleEHHHHLLLLll
DSSP llllllllllhhhhhhhhhlllllllHHHHHHHHHHHHHHHH-LLLLlhhhlllllllll Query gqvantriyaaeklakvkekadsplyAPAVKTLLRDADKALK-XTPPsvxdktxtadsgd 59 ident | | Sbjct --------------------------KSPLTYAEALANTIMNtYTVE------------- 21 DSSP --------------------------LLHHHHHHHHHHHHHHhLLLL------------- DSSP lllleeellleellllllllllleellllllhhhhhllHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHH Query khdyxsxgpywwpdpskpdglpyirkdgqrnpeldkldRNKL--GDXSKAVTTLGLAYYF 117 ident Sbjct -----------------------------------elpPANRwhYHQGVFLCGVLRLWEA 46 DSSP -----------------------------------lllLLLLllHHHHHHHHHHHHHHHH DSSP HLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLllLLLLLLleeeellllhhhlllhhHHHHHLLHHhHHHH Query SGDEKYAQKAVDFLNVWFLDAktKXNPHLtygqtipgknkgxgrgaGXIDIYSFTeXIDA 177 ident | | | | | Sbjct TGEKRYFEYAKAYADLLIDDN-gNLLFRR----------------dELDAIQAGL-ILFP 88 DSSP HLLHHHHHHHHHHHHHHLLLL-lLLLLLL----------------lLHHHLHHHH-HHHH DSSP HHhllllllLLHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHLHH----hHHHH----LLLLHHHHH-HHH Query XTlxenskaFTPKvkKGXKEWFTQLVEWXQTSPV----aAEEQ----RAKNNHGLA-YDV 228 ident | | | || Sbjct LY------eQTKD--ERYVKAAKRLRSLYGTLNRtseggFWHKdgypYQMWLDGLYmGGP 140 DSSP HH------hHHLL--HHHHHHHHHHHHHHHLLLLlllllLLLLllllLEEELHHHHhHHH DSSP HHHHHHHHlLLHHHHHHHHHHHHHHLHHHHLLL-LLLLHH---------------hhLLL Query QLTAYALYtGNQDLAXKTIQEFPEKRLFAQIEP-DGKQPL---------------elART 272 ident || | Sbjct FALKYANL-KQETELFDQVVLQESLMRKHTKDAkTGLFYHawdeakkmpwaneetgcSPE 199 DSSP HHHHHHHH-HLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlLLLLLLeeellllllllllllllLLL DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL----LLLLlllllllLHHHHHHHHHHHLLLL---- Query TALGYTIFNLGHXLDXCSIAsTLGQ----DIYNatsqdgrSITAALKFLIPYIGKP---- 324 ident | | | | | Sbjct FWARSIGWYVMSLADMIEEL-PKKHpnrhVWKN-------TLQDMIKSICRYQDKEtglw 251 DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHHHHL-LLLLhhhhHHHH-------HHHHHHHHHHLLLLLLllll DSSP -hhhLLLL--lLLLHHHHHHHHHHHHHHHH--LLLHhHLHHHHHHLL-LLLL-------- Query -qseWPYQ--qIKEWDKKQEEACWILRRAS--FFDPkAGYEAIGAQF-RETP-------- 370 ident || Sbjct yqivDKGDrsdNWLESSGSCLYMYAIAKGInkGYLD-RAYETTLLKAyQGLIqhktetse 310 DSSP llllLLLLlllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhLLLL-HHHHHHHHHHhHHHHhhheeell DSSP --------------------------------------llLLHHHhLLLL---- Query --------------------------------------anKRIHLiYSLE---- 382 ident Sbjct dgaflvkdicvgtsagfydyyvsrerstndlhgagafilaMTELE-PLFRsagk 363 DSSP llleeelleelllllllhhhhhllleelllhhhhhhhhhhHHHHH-HHHHhlll
DSSP -------------------lllLLLLLLLHHHhHHHHHL-LLLLLLHHHHHHhhhhhhhh Query -------------------gqvANTRIYAAEKlAKVKEK-ADSPLYAPAVKTllrdadka 40 ident | Sbjct xtkadvvwkdvdgvsmpippktHPRLYLREQQ-VPDLKNrMNDPKLKKVWAD-------- 51 DSSP llllllleeeelleeeelllllLLLLLLLHHH-HHHHHHhHLLHHHHHHHHH-------- DSSP hhlllllhhhllllllllllllleeellleellllllllllleellllllHHHHHLL--- Query lkxtppsvxdktxtadsgdkhdyxsxgpywwpdpskpdglpyirkdgqrnPELDKLD--- 97 ident Sbjct ----------------------------------------mikmqedwkpADIPEVKdfr 71 DSSP ----------------------------------------hhhhllllllLLLLLLLlhh DSSP -hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHlllllLLLLlLLEEEellllh Query -rnkLGDXSKAVTTLGLAYYFSGDEKYAQKAVDFLNVWFldaktKXNPhLTYGQtipgkn 156 ident | | | | | | Sbjct fyfnQKGLTVRVELMALNYLMTKDPKVGREAITSIIDTL-----ETAT-FKPAG------ 119 DSSP hhhlLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHH-----HHLL-LLLLL------ DSSP hhlllhHHHHHHLL-HHHHHHHHHHLLLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlhhhhhh Query kgxgrgAGXIDIYS-FTEXIDAXTLXENSkaFTPKVKKGXKEWFTQLVEWXqtspvaaee 215 ident | | | | | Sbjct ------DISRGIGLfMVTGAIVYDWCYDQ--LKPEEKTRFVKAFVRLAKML--ecgyppv 169 DSSP ------LHHHHHHHhHHHHHHHHHHLHHH--LLHHHHHHHHHHHHHHHLLL--lllllll DSSP HLLL----LHHHhHHHHHHHHHH-HHLL-LHHHHHHHHHHHHHHLHHHHLLL--LLLLhh Query QRAK----NNHGlAYDVQLTAYA-LYTG-NQDLAXKTIQEFPEKRLFAQIEP--DGKQpl 267 ident | | | | Sbjct KDKSivghASEW-MIMRDLLSVGiAIYDeFPEMYNLAAGRFFKEHLVARNWFypSHNY-- 226 DSSP LLLLlllhHHLH-HHHLHHHHHHhHHLLlLLHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHhhHLLL-- DSSP hHLLLLHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHhlllLLLLllllllllHHHHHHHHHHHLlLLHH Query eLARTTALGYTIFNLGHXL-DXCSIAStlgqDIYNatsqdgrsITAALKFLIPYIgKPQS 326 ident | | | | | Sbjct -HQGMSYLNVRFTNDLFALwILDRMGA----GNVF--------NPGQQFILYDAI-YKRR 272 DSSP -LLHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHLL----LLLL--------LHHHHHLLHHHH-HLLL DSSP ----HLLLLLLL----lHHHHhHHHHH-HHHHHHlllhhhlhHHHHHLL--LLLL---ll Query ----EWPYQQIK----eWDKKqEEACW-ILRRASffdpkagyEAIGAQF--RETP---an 372 ident Sbjct pdgqILAGGDVDysrkkPKYY-TMPALlAGSYYK--------DEYLNYEflKDPNvephc 323 DSSP llllLLLLLLLLlllllLLLL-HHHHHhHHHHHL--------LHHHHHHhhHLLLllhhh DSSP LLHHHHLLL--------------------------------------------------- Query KRIHLIYSL--------------------------------------------------- 381 ident | Sbjct KLFEFLWRDtqlgsrkpddlplsrysgspfgwmiartgwgpesviaemkvneysflnhqh 383 DSSP HHHHHHHLLlllllllhhhllleeeellllleeeeellllllleeeeeelllllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 381 ident Sbjct qdagafqiyykgplaidagsytgssggynsphnknffkrtiahnslliydpketfsssgy 443 DSSP llllleeeeelleeelllllllllllllllhhhhhllllhhhllleeeelllllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 381 ident Sbjct ggsdhtdfaandggqrlpgkgwiaprdlkemlagdfrtgkilaqgfgpdnqtpdytylkg 503 DSSP lllllllllllllllllllllllllllhhhhhhlllllleeeeeeeellllllleeeeee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 381 ident Sbjct ditaaysakvkevkrsflflnlkdakvpaamivfdkvvasnpdfkkfwllhsieqpeikg 563 DSSP elhhhlllleeeeeeeeeeeellllllleeeeeeeeeeellllleeeeeeeelllleeel DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 381 ident Sbjct nqitikrtkngdsgmlvntallpdaansnitsiggkgkdfwvfgtnytndpkpgtdeale 623 DSSP leeeeellllllleeeeeeeeellhhheeeeeeelllllleelleellllllllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 381 ident Sbjct rgewrveitpkkaaaedyylnviqiadntqqklhevkridgdkvvgvqladrivtfskts 683 DSSP llleeeeeeellllleeeeeeeeeeeellllllllleeeellleeeeeelleeeeeelll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 381 ident Sbjct etvdrpfgfsvvgkgtfkfvmtdllpgtwqvlkdgkilypalsakgddgalyfegtegty 743 DSSP lllllleeeeellllleeeeellllleeeeeeelleeeeeeeeelllllleeeeelleee DSSP ---l Query ---e 382 ident Sbjct rflr 747 DSSP eeel
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct kknikrnvekiiaqwdertrkdfgeltlstglpgiilmlaelknkdnskiyqkkidnyie 60 DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhlllllhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhh DSSP ----------llllllllllhhhhhhHHHLLLLLL-LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllhH Query ----------gqvantriyaaeklakVKEKADSPL-YAPAVKTLLRDADKALKXTPpsvX 49 ident | | | Sbjct yivsklstyglltgslysgaagialsILHLREDDEkYKNLLDSLNRYIEYFVREKI-egF 119 DSSP hhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhHHHHHHHLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-hlL DSSP HLLllllllllllleeellleellllllllllleellllllhhhhHLLHHHHH---HHHH Query DKTxtadsgdkhdyxsxgpywwpdpskpdglpyirkdgqrnpeldKLDRNKLG---DXSK 106 ident | Sbjct NLE------------------------------------------NITPPDYDvieGLSG 137 DSSP LHH------------------------------------------HLLHHHLLlllLHHH DSSP HHHHHHHHhhhhLLHHHHHHHHHHHHHHHlllllLLLL----llleEEEL--------LL Query AVTTLGLAyyfsGDEKYAQKAVDFLNVWFldaktKXNP----hltyGQTI--------PG 154 ident | | || | | Sbjct ILSYLLLI----NDEQYDDLKILIINFLS-----NLTKennglislYIKSenqmsqseSE 188 DSSP HHHHHLLL----LLHHHHHHHHHHHHHHH-----HLLLllllllllLLLHhhlllhhhHH DSSP LHHHLLLhhHHHH---HLLH-HHHHHHHHHLLllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHL- Query KNKGXGRgaGXID---IYSF-TEXIDAXTLXEnskaftpkVKKGXKEWFTQLVEWXQTS- 209 ident | Sbjct MYPLGCL--NMGLahgLAGVgCILAYAHIKGY--------SNEASLSALQKIIFIYEKFe 238 DSSP HLLLLLE--ELLLlllHHHHhHHHHHHHHHLL--------LLHHHHHHHHHHHHHHHHHl DSSP -----hhHHHH----------------hlLLLH---HHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHH Query -----pvAAEE----------------qrAKNN---HGLAYDVQLTAYALYTGNQDLAXK 245 ident | | | | Sbjct lerkkqfLWKDglvadelkkekvireasfIRDAwcyGGPGISLLYLYGGLALDNDYFVDK 298 DSSP llhhhllLLLLeelhhhhhhlllllllllLLLLlllLHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHH DSSP HHHHHHhHLHHHhllllllLHHHhlllLHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLLLl Query TIQEFPeKRLFAqiepdgkQPLElartTALG---YTIFNLGHXLDXCSIAStlgQDIYNa 302 ident Sbjct AEKILE-SAMQR-------KLGI----DSYMichGYSGLIEICSLFKRLLN---TKKFD- 342 DSSP HHHHHH-HHHHH-------LLLL----LLLLlllLHHHHHHHHHHHHHHHL---LLLLH- DSSP lllllLLHHHHHHHHHHHLLLLHhhllllllLLHHH---HHHHHHHHHHHHHLLlhhhlh Query tsqdgRSITAALKFLIPYIGKPQsewpyqqiKEWDK---KQEEACWILRRASFFdpkagy 359 ident | Sbjct -----SYMEEFNVNSEQILEEYG-------dESGTGfleGISGCILVLSKFEYS------ 384 DSSP -----HHHHHHHHLHHHHHHLLL-------lLLLLLlllLHHHHHHHHHHHHLL------ DSSP hhhhhllllllllllhHHHL-----------lll Query eaigaqfretpankriHLIY-----------sle 382 ident Sbjct --------------inFTYWrqalllfddflkgg 404 DSSP --------------llLLLHhhhhllllllllll
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