Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition.
The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure, to pre-computed structural neighbours in the Dali Database,
and to the PDB format coordinate file where the neighbour
is superimposed onto the query structure.
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Summary
No: Chain Z rmsd lali nres %id PDB Description
1: 1u9n-A 16.2 3.1 179 194 13 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR ETHR;
2: 2ibd-A 15.8 3.6 174 192 13 PDB MOLECULE: POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
3: 1ui5-B 15.5 3.6 182 203 14 PDB MOLECULE: A-FACTOR RECEPTOR HOMOLOG;
4: 3ccy-A 15.5 3.2 172 192 12 PDB MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
5: 1jt0-A 14.7 3.0 177 188 20 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR IN QACA
6: 3him-B 14.6 3.1 174 192 20 PDB MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
7: 2w53-A 14.6 2.9 178 202 17 PDB MOLECULE: REPRESSOR;
8: 1vi0-A 14.4 3.5 175 189 15 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
9: 2g7s-A 14.4 3.0 181 190 11 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
10: 2qtq-A 14.3 2.9 176 204 13 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
11: 2gfn-B 14.3 3.7 181 193 10 PDB MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PKSA RELATED
12: 2qib-A 14.2 3.6 184 222 11 PDB MOLECULE: TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
13: 3knw-A 14.2 3.2 175 182 14 PDB MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR (TETR/ACRR
14: 2np5-A 14.0 3.1 173 187 8 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
15: 3geu-A 14.0 3.1 180 189 18 PDB MOLECULE: INTERCELLULAR ADHESION PROTEIN R;
16: 2zcn-D 14.0 3.1 178 184 19 PDB MOLECULE: BIOFILM OPERON ICAABCD HTH-TYPE NEGATIVE
17: 3f0c-A 13.8 4.0 177 193 11 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
18: 2eh3-A 13.8 3.2 166 171 20 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
19: 3bru-A 13.7 3.3 179 191 13 PDB MOLECULE: REGULATORY PROTEIN, TETR FAMILY;
20: 3crj-A 13.6 3.4 178 190 10 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTION REGULATOR;
21: 2oer-B 13.6 3.5 178 189 16 PDB MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
22: 2hku-A 13.5 3.5 173 191 16 PDB MOLECULE: A PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
23: 3bcg-A 13.1 3.5 181 207 19 PDB MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR ACRR;
24: 3g7r-B 13.0 3.2 167 202 14 PDB MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
25: 3eup-A 13.0 3.4 174 203 16 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
26: 3f1b-A 12.9 3.0 167 183 12 PDB MOLECULE: TETR-LIKE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
27: 2hyj-A 12.9 3.6 174 193 14 PDB MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
28: 3frq-A 12.7 3.6 177 185 17 PDB MOLECULE: REPRESSOR PROTEIN MPHR(A);
29: 1zk8-A 12.5 3.4 159 177 11 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
30: 2o7t-A 12.4 3.4 169 188 17 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
31: 3dew-A 12.3 3.8 168 192 14 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
32: 2iai-A 12.2 4.0 158 200 12 PDB MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SCO3833;
33: 2g3b-A 12.1 4.1 174 188 16 PDB MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
34: 2gen-A 11.7 3.7 171 188 17 PDB MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
35: 1z0x-A 11.7 4.2 165 216 12 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
36: 3dpj-A 11.6 3.9 176 194 16 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTION REGULATOR, TETR FAMILY;
37: 2q24-B 11.5 4.2 164 175 16 PDB MOLECULE: PUTATIVE TETR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
38: 3c07-A 11.4 4.4 172 221 16 PDB MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
39: 2fd5-A 11.4 3.4 157 180 11 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
40: 2pbx-A 11.3 3.9 174 196 11 PDB MOLECULE: HEMAGGLUTININ/PROTEASE REGULATORY PROTEIN;
41: 1t33-A 11.2 3.7 175 220 13 PDB MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR (TETR/ACRR
42: 2id6-A 11.2 3.5 169 202 15 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
43: 3kkd-C 11.1 3.6 170 206 14 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
44: 3jsj-A 11.1 3.5 165 184 14 PDB MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
45: 3c2b-A 11.0 4.1 182 200 13 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
46: 2id3-A 11.0 4.3 168 191 9 PDB MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
47: 1pb6-A 10.9 3.7 163 198 15 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YCDC;
48: 1sgm-A 10.9 3.9 165 184 14 PDB MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YXAF;
49: 3iuv-A 10.9 3.3 156 173 13 PDB MOLECULE: UNCHARACTERIZED TETR FAMILY PROTEIN;
50: 2fbq-A 10.8 3.9 156 213 16 PDB MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
51: 3dcf-A 10.7 3.7 165 185 15 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR OF THE TETR/ACRR
52: 2d6y-B 10.4 3.3 157 188 10 PDB MOLECULE: PUTATIVE TETR FAMILY REGULATORY PROTEIN;
53: 3bhq-A 10.1 3.7 151 202 16 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
54: 2oi8-A 10.1 3.5 163 203 14 PDB MOLECULE: PUTATIVE REGULATORY PROTEIN SCO4313;
55: 2pz9-A 10.1 3.3 150 179 15 PDB MOLECULE: PUTATIVE REGULATORY PROTEIN;
56: 2zcx-A 10.0 4.1 151 205 16 PDB MOLECULE: TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
57: 2dh0-B 9.8 3.6 145 181 11 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
58: 3he0-C 9.7 4.1 157 186 14 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
59: 2f07-A 9.6 3.8 146 197 12 PDB MOLECULE: YVDT;
60: 3b6a-A 9.6 5.1 146 213 18 PDB MOLECULE: ACTR PROTEIN;
61: 3cdl-B 9.6 3.8 117 188 19 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR AEFR;
62: 2qko-B 9.5 3.6 147 176 11 PDB MOLECULE: POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY
63: 3col-A 9.3 4.1 149 180 11 PDB MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTION REGULATOR;
64: 2jj7-B 9.3 4.1 154 183 12 PDB MOLECULE: HEMOLYSIN II REGULATORY PROTEIN;
65: 3egq-A 9.3 3.4 150 165 9 PDB MOLECULE: TETR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
66: 3bni-A 9.2 4.4 133 174 14 PDB MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
67: 2iu5-A 9.0 4.3 140 179 14 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YCEG;
68: 3cjd-A 8.9 4.3 145 182 10 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
69: 3bqy-A 8.8 4.3 150 205 13 PDB MOLECULE: PUTATIVE TETR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
70: 2hxo-A 8.4 4.6 151 207 16 PDB MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
71: 3bjb-B 8.4 5.1 140 183 10 PDB MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY
72: 2rek-B 8.3 3.7 137 175 12 PDB MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
73: 3b81-A 8.2 4.7 153 183 15 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, ACRR FAMILY;
74: 1bjy-A 8.2 5.1 152 207 18 PDB MOLECULE: TETRACYCLINE REPRESSOR;
75: 2zb9-A 8.1 4.6 138 188 14 PDB MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
76: 3fiw-A 8.1 4.6 132 173 17 PDB MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
77: 2g7g-A 8.0 4.8 142 197 13 PDB MOLECULE: RHA04620, PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
78: 2guh-A 7.8 3.7 134 179 13 PDB MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
79: 3gzi-A 7.7 4.4 158 203 16 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
80: 2ns7-D 7.6 5.1 140 178 18 PDB MOLECULE: TETRACYCLINE REPRESSOR PROTEIN;
81: 2of7-A 7.5 4.5 142 191 15 PDB MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
82: 2qwt-A 7.5 3.7 132 167 12 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
83: 2ns8-C 7.4 5.1 134 206 19 PDB MOLECULE: TETRACYCLINE REPRESSOR PROTEIN;
84: 2vpr-A 7.3 5.2 132 197 16 PDB MOLECULE: TETRACYCLINE RESISTANCE REPRESSOR PROTEIN;
85: 2ras-B 7.0 4.2 144 204 9 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
86: 3cwr-A 6.2 3.8 119 193 14 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
87: 2fq4-A 6.2 5.5 114 184 15 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
88: 2np3-B 6.1 3.7 111 180 14 PDB MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY REGULATOR;
89: 2rae-A 5.8 4.4 105 193 15 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, ACRR FAMILY PROTEIN;
90: 2hxi-B 5.6 6.7 116 198 13 PDB MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
91: 2dg7-A 5.6 3.2 96 187 15 PDB MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
92: 2nx4-A 5.0 4.4 104 194 14 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY PROTEIN;
93: 2i10-B 5.0 6.8 100 182 17 PDB MOLECULE: PUTATIVE TETR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
94: 2o8r-B 4.7 4.2 95 605 8 PDB MOLECULE: POLYPHOSPHATE KINASE;
95: 2k9s-A 4.7 3.9 90 107 12 PDB MOLECULE: ARABINOSE OPERON REGULATORY PROTEIN;
96: 1v2a-B 4.3 2.9 84 209 6 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE TRANSFERASE GST1-6;
97: 2dg8-B 4.1 4.3 91 176 15 PDB MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATORY
98: 1a0f-A 3.9 3.7 84 201 4 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE S-TRANSFERASE;
99: 3f63-A 3.7 2.7 83 218 8 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE TRANSFERASE GST1-4;
100: 3e7q-B 3.5 4.1 94 210 14 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
101: 1oyj-A 3.5 4.2 92 228 7 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE S-TRANSFERASE;
102: 3f6f-A 3.5 3.5 85 209 4 PDB MOLECULE: CG18548-PA (IP02196P) (IP02193P);
103: 1pn9-A 3.5 3.2 84 209 5 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE S-TRANSFERASE 1-6;
104: 3a6p-A 3.3 4.2 103 1072 5 PDB MOLECULE: EXPORTIN-5;
105: 1key-B 3.2 3.8 94 221 13 PDB MOLECULE: TRANSLIN;
106: 3gb8-A 3.1 4.7 111 958 5 PDB MOLECULE: EXPORTIN-1;
107: 2v4j-C 3.1 2.7 57 103 9 PDB MOLECULE: SULFITE REDUCTASE, DISSIMILATORY-TYPE SUBUNIT
108: 1qkn-A 3.0 4.4 96 228 9 PDB MOLECULE: ESTROGEN RECEPTOR BETA;
109: 1r5a-A 3.0 3.2 75 214 5 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE TRANSFERASE;
110: 2pmt-A 3.0 3.3 74 201 1 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE TRANSFERASE;
111: 2ao9-A 3.0 8.5 76 117 13 PDB MOLECULE: PHAGE PROTEIN;
112: 3cbu-B 2.9 5.5 86 213 5 PDB MOLECULE: PROBABLE GST-RELATED PROTEIN;
113: 1syy-A 2.9 5.0 98 317 7 PDB MOLECULE: RIBONUCLEOSIDE-DIPHOSPHATE REDUCTASE BETA CHAIN;
114: 1k0m-B 2.9 3.4 81 236 4 PDB MOLECULE: CHLORIDE INTRACELLULAR CHANNEL PROTEIN 1;
115: 1jlv-A 2.9 3.4 76 207 5 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE TRANSFERASE GST1-3;
116: 3grp-D 2.9 4.1 79 209 11 PDB MOLECULE: 3-OXOACYL-(ACYL CARRIERPROTEIN) REDUCTASE;
117: 2o8r-A 2.9 6.9 81 648 5 PDB MOLECULE: POLYPHOSPHATE KINASE;
118: 2cz3-A 2.8 3.1 82 190 5 PDB MOLECULE: MALEYLACETOACETATE ISOMERASE;
119: 2c3n-A 2.8 3.3 84 239 1 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE S-TRANSFERASE THETA 1;
120: 1fx7-A 2.8 3.6 69 230 14 PDB MOLECULE: IRON-DEPENDENT REPRESSOR IDER;
121: 3epz-A 2.8 3.3 60 227 13 PDB MOLECULE: DNA (CYTOSINE-5)-METHYLTRANSFERASE 1;
122: 2jt1-A 2.8 2.6 51 71 16 PDB MOLECULE: PEFI PROTEIN;
123: 1qku-A 2.7 4.4 94 250 11 PDB MOLECULE: ESTRADIOL RECEPTOR;
124: 2il3-A 2.7 3.4 79 220 6 PDB MOLECULE: EPSILON-CLASS GLUTATHIONE S-TRANSFERASE;
125: 1rp3-A 2.7 4.2 64 235 16 PDB MOLECULE: RNA POLYMERASE SIGMA FACTOR SIGMA-28 (FLIA);
126: 1c0w-B 2.7 4.9 72 219 14 PDB MOLECULE: DIPHTHERIA TOXIN REPRESSOR;
127: 2p4y-A 2.6 4.1 102 244 9 PDB MOLECULE: PEROXISOME PROLIFERATOR-ACTIVATED RECEPTOR GAMMA;
128: 1yp0-A 2.6 4.9 94 239 10 PDB MOLECULE: NUCLEAR RECEPTOR SUBFAMILY 5, GROUP A, MEMBER 1;
129: 1mkm-B 2.6 6.8 89 247 11 PDB MOLECULE: ICLR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
130: 3hrs-A 2.6 5.7 74 214 12 PDB MOLECULE: METALLOREGULATOR SCAR;
131: 1ofc-X 2.6 4.0 68 265 6 PDB MOLECULE: ISWI PROTEIN;
132: 1cf7-B 2.6 3.2 58 82 10 PDB MOLECULE: PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4);
133: 2qvo-A 2.6 2.4 50 87 8 PDB MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN AF_1382;
134: 2coh-A 2.6 2.4 52 194 13 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
135: 2oqr-A 2.6 3.3 55 226 9 PDB MOLECULE: SENSORY TRANSDUCTION PROTEIN REGX3;
136: 1ej6-C 2.5 5.0 122 1221 7 PDB MOLECULE: LAMBDA2;
137: 3fp3-A 2.5 3.4 92 498 7 PDB MOLECULE: TPR REPEAT-CONTAINING PROTEIN YHR117W;
138: 1xiu-B 2.5 4.6 101 224 10 PDB MOLECULE: RXR-LIKE PROTEIN;
139: 2cz2-A 2.5 3.2 82 211 5 PDB MOLECULE: MALEYLACETOACETATE ISOMERASE;
140: 1uhl-B 2.5 3.9 92 219 13 PDB MOLECULE: RETINOIC ACID RECEPTOR RXR-BETA;
141: 1fw1-A 2.5 3.2 82 208 4 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE TRANSFERASE ZETA;
142: 1ljr-A 2.5 3.8 87 244 3 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE S-TRANSFERASE;
143: 2vt3-B 2.5 9.8 94 208 7 PDB MOLECULE: REDOX-SENSING TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR REX;
144: 2gdr-A 2.5 3.8 69 202 3 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE S-TRANSFERASE;
145: 2p6s-G 2.5 4.7 83 159 17 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, LRP/ASNC FAMILY;
146: 2cfx-A 2.5 5.5 68 140 12 PDB MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPC;
147: 2obp-A 2.5 2.9 53 81 11 PDB MOLECULE: PUTATIVE DNA-BINDING PROTEIN;
148: 2nnn-A 2.5 6.8 53 134 11 PDB MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
149: 1bby-A 2.5 2.8 54 69 6 PDB MOLECULE: RAP30;
150: 3kbc-A 2.4 4.2 88 412 6 PDB MOLECULE: 425AA LONG HYPOTHETICAL PROTON GLUTAMATE SYMPORT
151: 1yuc-A 2.4 4.5 90 240 11 PDB MOLECULE: ORPHAN NUCLEAR RECEPTOR NR5A2;
152: 3ein-A 2.4 3.1 84 207 5 PDB MOLECULE: GLUTATHIONE S-TRANSFERASE 1-1;
153: 1jhf-A 2.4 4.1 79 197 14 PDB MOLECULE: LEXA REPRESSOR;
154: 2f5c-A 2.4 9.2 79 140 14 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR;
155: 2v6k-A 2.4 3.7 85 214 7 PDB MOLECULE: MALEYLPYRUVATE ISOMERASE;
156: 1sau-A 2.4 1.9 52 114 15 PDB MOLECULE: SULFITE REDUCTASE, DESULFOVIRIDIN-TYPE SUBUNIT
157: 1sfx-A 2.4 8.5 63 109 14 PDB MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN AF2008;
158: 2cmx-A 2.4 2.8 49 70 20 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL 13.2 KDA PROTEIN;
159: 2jzy-A 2.4 3.7 60 104 7 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN PCOR;
160: 2gau-A 2.4 2.1 50 218 14 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP/FNR FAMILY;
161: 3gyt-A 2.3 4.3 96 242 8 PDB MOLECULE: NUCLEAR HORMONE RECEPTOR OF THE STEROID/THYROID
162: 1nff-A 2.3 4.1 84 244 4 PDB MOLECULE: PUTATIVE OXIDOREDUCTASE RV2002;
163: 1nhy-A 2.3 3.7 78 219 5 PDB MOLECULE: ELONGATION FACTOR 1-GAMMA 1;
164: 2dt5-B 2.2 9.7 95 211 5 PDB MOLECULE: AT-RICH DNA-BINDING PROTEIN;
165: 2eth-A 2.2 7.8 71 141 13 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, PUTATIVE, MAR FAMILY;
166: 3k69-A 2.2 6.8 70 151 10 PDB MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTION REGULATOR;
167: 2d1h-A 2.2 7.8 61 102 21 PDB MOLECULE: 109AA LONG HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL
168: 2htj-A 2.2 4.7 61 81 13 PDB MOLECULE: P FIMBRIAL REGULATORY PROTEIN KS71A;
169: 1ust-A 2.2 2.8 58 92 10 PDB MOLECULE: HISTONE H1;
170: 2vbx-A 2.2 6.8 66 149 11 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN;
171: 3elk-A 2.2 3.1 53 104 8 PDB MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TA0346;
172: 3i54-D 2.2 2.3 49 228 16 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP/FNR FAMILY;
173: 1or7-B 2.2 2.1 47 164 11 PDB MOLECULE: RNA POLYMERASE SIGMA-E FACTOR;
174: 1stz-A 2.1 8.1 87 323 9 PDB MOLECULE: HEAT-INDUCIBLE TRANSCRIPTION REPRESSOR HRCA
175: 2z99-A 2.1 8.2 81 160 10 PDB MOLECULE: PUTATIVE UNCHARACTERIZED PROTEIN;
176: 3bdd-A 2.1 7.0 58 140 16 PDB MOLECULE: REGULATORY PROTEIN MARR;
177: 2oz6-A 2.1 2.9 49 201 14 PDB MOLECULE: VIRULENCE FACTOR REGULATOR;
178: 2kko-A 2.1 6.7 55 108 13 PDB MOLECULE: POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN
179: 2r7x-A 2.0 5.5 88 1073 9 PDB MOLECULE: RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE;
Pairwise Structural Alignments
Notation: three-state secondary structure definitions by DSSP (reduced to H=helix, E=sheet, L=coil) are shown above the amino acid sequence. Structurally equivalent residues are in uppercase, structurally non-equivalent residues (e.g. in loops) are in lowercase. Amino acid identities are marked by vertical bars.
No 1: Query=mol1A Sbjct=1u9nA Z-score=16.2
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DSSP -LLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHH Query -XKTRDKILLSSLELFNDKGERNITTNHIAAHLAISPGNLYYHFRNKSDIIYEIFQEYEK 59 ident || | | | | || | | | Sbjct gDDRELAILATAENLLEDRPLADISVDDLAKGAGISRPTFYFYFPSKEAVLLTLLDRVVN 60 DSSP lHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHHLL-LLLL--lllLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHLHHHHHHHLHHHHHHHHHH Query LVDYYLD-IPED--rpiTLEDXTFYLESVFDGLWSYRFFHRDLEYLLDSDPRLRQDYREF 116 ident | | | | | | | Sbjct QADXALQtLAENpadtdRENXWRTGINVFFETFGSHKAVTRAGQAARATSVEVAELWSTF 120 DSSP HHHHHHHhHHHLlllllHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHH DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHL-HHHH--HHHHlllLHHH Query TNRCLAAINRIFAKLADAGIIQPQPedLRSAXSLNVWLVITN-WXAF--LKTAhltELKQ 173 ident | | | | | Sbjct XQKWIAYTAAVIDAERDRGAAPRTL--PAHELATALNLXNERtLFASfaGEQP-svPEAR 177 DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLL--LHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhLLLL-llLHHH DSSP HHHHH-HHHHH-hHLLHhhhhhhhhhhhllll Query GIYQV-LTLEV-pYLTPeyrervlalrekyrp 203 ident | Sbjct VLDTLvHIWVTsiYGEN--------------- 194 DSSP HHHHHhHHHHHhhHLLL---------------
DSSP --LLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH Query --XKTRDKILLSSLELFNDKGERNITTNHIAAHLAISPGNLYYHFRNKSDIIYEIFQEYE 58 ident | | || | | | || | | || || | || Sbjct gkSGRRTELLDIAATLFAERGLRATTVRDIADAAGILSGSLYHHFDSKESXVDEILRGFL 60 DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHHHLL--LLLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHH----LHHHHHLHHHHHHhLHHHhHH Query KLVDYYLD--IPEDrpITLEDXTFYLESVFDGLWS----YRFFHRDLEYLLDsDPRLrQD 112 ident | | Sbjct DDLFGKYReiVASG-lDSRATLEALVTTSYEAIDAshsaVAIYQDEVKHLVA-NERF-TY 117 DSSP HHHHHHHHhhHHLL-lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHlhhhHHHHHHLLHHHLL-LHHH-HH DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHhhhLLLL-- Query YREFTNRCLAAINRIFAKLADAGIIQPQPedLRSAXSLNVWLVITNWXAFLktaHLTE-- 170 ident | | Sbjct LSELNTEFRELWXGVLEAGVKDGSFRSDI--DVELAFRFLRDTAWVAVRWY---RPGGsv 172 DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLL--LHHHHHHHHHHHLLHHHHLL---LLLLll DSSP -hHHHH-HHHHHHHHHhllhhhhhhhhhhhhllll Query -lKQGI-YQVLTLEVPyltpeyrervlalrekyrp 203 ident Sbjct tvDTVAkQYLSIVLDG---------------lasp 192 DSSP lhHHHHhHHHHHHHHL---------------llll
DSSP ---LLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH Query ---XKTRDKILLSSLELFNDKGERNITTNHIAAHLAISPGNLYYHFRNKSDIIYEIFQEY 57 ident || | || | | | || | || || | | | Sbjct lraEQTRATIIGAAADLFDRRGYESTTLSEIVAHAGVTKGALYFHFAAKEDLAHAILEIQ 60 DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHHHHLLLLlllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHH---LHHHHHL-HHHHHhhlhhHHHHH Query EKLVDYYLDIPedrPITLEDXTFYLESVFDGLWS---YRFFHRD-LEYLLdsdprLRQDY 113 ident || | | | Sbjct SRTSRRLAKDL---YSSLEALXRLTFGXARLCVQgpvLRAGLRLaTAGVP-----VRLPH 112 DSSP HHHHHHHHHLL---LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHllhHHHHHHHhHLLLL-----LLLLL DSSP hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHL-hhhhhhhhlLLLHH Query reFTNRCLAAINRIFAKLADAGIIQPQPedLRSAXSLNVWLVITN-wxaflktahLTELK 172 ident Sbjct --PFTEWREIATSRLLDAVRQSDVHQDI--DVDSVAHTLVCSVVGtrvvggtlepAGREP 168 DSSP --HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLL--LHHHHHHHHHHHHHHhhhhllllllLLLHH DSSP HHHHHHHHHHH-HHLLHHHHHHHHHHHHLLLL--- Query QGIYQVLTLEV-PYLTPEYRERVLALREKYRP--- 203 ident | | | Sbjct RRLAEXWYILIrGXVPVTRRARYVTLAARLEQetg 203 DSSP HHHHHHHHHHHhHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHhhl
DSSP -LLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHH Query -XKTRDKILLSSLELFNDKGERNITTNHIAAHLAISPGNLYYHFRNKSDIIYEIFQEYEK 59 ident || | | | || | || | | Sbjct yENIRDTIIERAAAXFARQGYSETSIGDIARACECSKSRLYHYFDSKEAVLRDXLTTHVD 60 DSSP lLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHHLL--LLLLLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHH----LHHHHHLHhHHHHhlHHHHHHH Query LVDYYLD--IPEDRPITLeDXTFYLESVFDGLWS----YRFFHRDLeYLLDsdPRLRQDY 113 ident | | | Sbjct SLLERCRqvLYGSNEPKT-RFLQIVKLFLEIYATsrdrHVVXLTCL-DALP--EDQRKAL 116 DSSP HHHHHHHhhHLLLLLHHH-HHHHHHHHHHHHHHHhhhhHHHHHHHH-HHLL--LHHHHHH DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllLLLL-LHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHhhllLLHH Query REFTNRCLAAINRIFAKLAdagiIQPQ-PEDLRSAXSLNVWLVITNWXAFLKtahlTELK 172 ident | | | | | Sbjct IAKQRELIAYVRDALLQLR----PDXAaNRTLAHVDTXLFFGXINWTYTWYK-adgSVSP 171 DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHL----HHHLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL-lllLLLH DSSP -HHHHHHH-HHHHHhllhhhhhhhhhhhhllll Query -QGIYQVL-TLEVPyltpeyrervlalrekyrp 203 ident Sbjct dALAERTVqLFLDG------------ylnllsa 192 DSSP hHHHHHHHhHHHHL------------hhhllll
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHH Query xKTRDKILLSSLELFNDKGERNITTNHIAAHLAISPGNLYYHFRNKSDIIYEIFQEYEKL 60 ident |||| ||| | || | | ||||||| | || | Sbjct -NLKDKILGVAKELFIKNGYNATTTGEIVKLSESSKGNLYYHFKTKENLFLEILNIEESK 59 DSSP -LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHLL-lllllLLLHHHHHHHHHHHHHHhHHLHhHHHLHHHHHHHLH---HHHHHHHHH Query VDYYLD-ipedrPITLEDXTFYLESVFDGlWSYRfFHRDLEYLLDSDP---RLRQDYREF 116 ident | | | | Sbjct WQEQWKkeqikaKTNREKFYLYNELSLTT-EYYYpLQNAIIEFYTEYYktnSINEKMNKL 118 DSSP HHHHHHhhhhhlLLHHHHHHHHHHHHHHL-LLLLlLHHHHHHHHHHHHhlhHHHHHHHHH DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLlhhHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHLLLLHH-HHH Query TNRCLAAINRIFAKLADAGIIQPQpedLRSAXSLNVWLVITNWXAFLKTAHLTELK-QGI 175 ident | | || | | | | | Sbjct ENKYIDAYHVIFKEGNLNGEWSIN---DVNAVSKIAANAVNGIVTFTHEQNINERIkLMN 175 DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLL---LHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHhHHH DSSP HHHHHHHHHHLLHhhhhhhhhhhhllll Query YQVLTLEVPYLTPeyrervlalrekyrp 203 ident Sbjct KFSQIFLNGLSKH--------------- 188 DSSP HHHHHHHHHLLLL---------------
DSSP ---LLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH Query ---XKTRDKILLSSLELFNDKGERNITTNHIAAHLAISPGNLYYHFRNKSDIIYEIFQEY 57 ident | | | | || || ||| | ||| | | | | | | Sbjct lgtSKAAARIRAAAIEVFAAKGYGATTTREIAASLDMSPGAVYPHYKTKESLLYAISLEG 60 DSSP lllLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHHHHLL--LLLLLLL--lhHHHHHHHHHHHHHHHHL-HHHHHLhHHHHhhLHHHHHH Query EKLVDYYLD--IPEDRPI--tlEDXTFYLESVFDGLWSY-RFFHRDlEYLLdsDPRLRQD 112 ident | | | | | Sbjct HHSVLAAITaaDFPDIAApdrlMSTVTAYVTWHADNRASaRVGQYE-LRSL--SPEHFAI 117 DSSP HHHHHHHHHhhLLLLLLHhhhhHHHHHHHHHHHHHLHHHhHHHHHL-HHHL--LHHHHHH DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLlhhHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHhhhllLLHH Query YREFTNRCLAAINRIFAKLADAGIIQPQpedLRSAXSLNVWLVITNWXAFLktahlTELK 172 ident || | || | | | Sbjct IADIRRSTTKVFTRIIEAGATAGDFHPF---DIEAAALAITSLGIDVSRWF-pshtYSDP 173 DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLL---LHHHHHHHHHHHHHHHHHHL-llllLLLH DSSP -HHHHHHH-HHHH-hHLLHhhhhhhhhhhhllll Query -QGIYQVL-TLEV-pYLTPeyrervlalrekyrp 203 ident Sbjct rIIAARYVeLALRmvGCAD--------------- 192 DSSP hHHHHHHHhHHHHhlLLLL---------------
DSSP ---llHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH Query ---xkTRDKILLSSLELFNDKGERNITTNHIAAHLAISPGNLYYHFRNKSDIIYEIFQEY 57 ident || || | | | | | | | || ||| | Sbjct edtqaTREGILDAAEACFHEHGVARTTLEMIGARAGYTRGAVYWHFKNKSEVLAAIVERV 60 DSSP lhhhlLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHHHHLLL--LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH------HHLH-HHHHLhhhhhhhlhh Query EKLVDYYLDI--PEDRPITLEDXTFYLESVFDGL------WSYR-FFHRDleylldsdpr 108 ident | | | | | | Sbjct HLPFMQELERtsTDQRDTPVHDLRAVMIHSFIELsederlRKTMeIMLRS---------- 110 DSSP HHHHHHHHHHllLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHhhlhhhHHHHhHHHLL---------- DSSP hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLlhhHHHHHHHHHHHHHHLHHHHH-HHHL Query lRQDYREFTNRCLAAINRIFAKLADAGIIQPQpedLRSAXSLNVWLVITNWXAFL-KTAH 167 ident | | | | Sbjct -TEMQQAGFRDALDRMERALRRARDLGQLREG--aDPKIAARMLHATVLGVLHGAmVEPE 167 DSSP -LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLL--lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL DSSP llLHHH-HHHHHHHHHHHHLLhhhHHHHhhHHHLL---ll Query ltELKQ-GIYQVLTLEVPYLTpeyRERVlaLREKY---rp 203 ident || | | Sbjct lmDLKRdGMLALDMTLAAYVK---DGVF--VPGTVpeplp 202 DSSP llLHHHhHHHHHHHHHHHHLL---LLLL--LLLLLlllll
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHH Query xKTRDKILLSSLELFNDKGERNITTNHIAAHLAISPGNLYYHFRNKSDIIYEIFQEYEKL 60 ident | | | || | | | || || | | Sbjct -PKYXQIIDAAVEVIAENGYHQSQVSKIAKQAGVADGTIYLYFKNKEDILISLFKEKXGQ 59 DSSP -LHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHLL--LLLLlllLHHHHHHHHHHHHHHHHH---LHHH-HHLHHHhhHHLHHHHHHHH Query VDYYLD--IPEDrpiTLEDXTFYLESVFDGLWS---YRFF-HRDLEYllDSDPRLRQDYR 114 ident | | | | | | Sbjct FIERXEedIKEK-atAKEKLALVISKHFSLLAGdhnLAIVtQLELRQ--SNLELRQKINE 116 DSSP HHHHHHhhHLLL-llHHHHHHHHHHHHHHHHHLlhhHHHHhHLLLLL--LLHHHHHHHHH DSSP hHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHLL-LLHHH Query eFTNRCLAAINRIFAKLADAGIIQPQPedLRSAXSLNVWLVITNWXAFLKTAHL-TELKQ 173 ident | | | | | | Sbjct -ILKGYLNILDGILTEGIQSGEIKEGL--DVRLARQXIFGTIDETVTTWVXNDQkYDLVA 173 DSSP -HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLL--LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlLLHHH DSSP HH-HHHHHHHHHhllhhhhhhhhhhhhllll Query GI-YQVLTLEVPyltpeyrervlalrekyrp 203 ident | Sbjct LSnSVLELLVSG---------------ihnk 189 DSSP HHhHHHHHHHHL---------------llll
DSSP --LLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH Query --XKTRDKILLSSLELFNDKGERNITTNHIAAHLAISPGNLYYHFRNKSDIIYEIFQEYE 58 ident | || | | | | || ||| | Sbjct npQSKADDILQCARTLIIRGGYNSFSYADISQVVGIRNASIHHHFPSKSDLVCKLVSQYR 60 DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHHHLL--LLLLlLLLHHHHHHHHHHHHHH----hHHLHHHHHLHHHHHHHLHHHHHH Query KLVDYYLD--IPEDrPITLEDXTFYLESVFDG----lWSYRFFHRDLEYLLDSDPRLRQD 112 ident || | Sbjct QEAEAGIAelEKNI-SDPLEQLRAYIGYWEGCiadatHPFCVCALLASEIPVLPETVVLE 119 DSSP HHHHHHHHhhHHHL-LLHHHHHHHHHHHHHHHhhhllLLLLHHHHHHLLHHHLLHHHHHH DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHLllLHH Query YREFTNRCLAAINRIFAKLADAGIIQPQPedLRSAXSLNVWLVITNWXAFLKTAHltELK 172 ident | | | | Sbjct VRAHFRSLSDWLTAVLERGIAQGRLVLTG--TARANAEIFXATVHGAXLSARAHG--DAA 175 DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLL--LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL--LLL DSSP HHHHHHHHHHHHHLLhhhhhhhhhhhhllll Query QGIYQVLTLEVPYLTpeyrervlalrekyrp 203 ident Sbjct TFGAITRPXLERITA---------------- 190 DSSP HHHHHHHHHHHHHLL----------------
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DSSP -LLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHH Query -XKTRDKILLSSLELFNDKGERNITTNHIAAHLAISPGNLYYHFRNKSDIIYEIFQEYEK 59 ident | | | | || | | | | | Sbjct hDERRRALADAVLALIAREGISAVTTRAVAEESGWSTGVLNHYFGSRHELLLAALRRAGD 60 DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHHLL--LLLLLLLLHHHHHHHHHHHHH---hHHHLHHHHHLHHHHHHHLHHHHHHHH Query LVDYYLD--IPEDRPITLEDXTFYLESVFD---gLWSYRFFHRDLEYLLDSDPRLRQDYR 114 ident | | | | Sbjct IQGDRYRtiLDEEGAGPIEKLRNITASILPlderRLAXTRVFLFFYAEGAAEETARGEIA 120 DSSP HHHHHHHhhHLLLLLLHHHHHHHHHHLLLLllhhHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHH DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHLHHHHH-HHHL-LLLHH Query EFTNRCLAAINRIFAKLADAGIIQPQPedLRSAXSLNVWLVITNWXAFL-KTAH-LTELK 172 ident | | | | Sbjct AFLARWRGVVRESVVAAQREGTVSTDL--DADAVTVALVALTDGLALQAiLDPVvXKAIS 178 DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLL--LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlLLHHhHHHHH DSSP H--HHHHH-HHHHHHhllhhhhhhhhhhhhllll Query Q--GIYQV-LTLEVPyltpeyrervlalrekyrp 203 ident Sbjct AedAAARCvDAAVRR------------------- 193 DSSP LllHHHHHhHHHLLL-------------------
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DSSP -LLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHH Query -XKTRDKILLSSLELFNDKGERNITTNHIAAHLAISPGNLYYHFRNKSDIIYEIFQEYEK 59 ident | || | | || | | | | | | | Sbjct sEAKRQHILDSGFHLVLRKGFVGVGLQEILKTSGVPKGSFYHYFESKEAFGCELLKHYIS 60 DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHHLL--LLLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHhlHHHHHLHHHHhHHLHHHHHHHHHHH Query LVDYYLD--IPEDrPITLEDXTFYLESVFDGLWsyRFFHRDLEYLlDSDPRLRQDYREFT 117 ident | || | | Sbjct DYQIRLNqlWTTE-TSARDKLXNYLQCWVKDES--CLIVKXAAEVaDLSEDXRLIXNDGV 117 DSSP HHHHHHHhhHLLL-LLHHHHHHHHHHHHHHLLH--HHHHHHHHLHhHLLHHHHHHHHHHH DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLlhhHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHLlLLHHH-HHH Query NRCLAAINRIFAKLADAGIIQPQpedLRSAXSLNVWLVITNWXAFLKTAHlTELKQ-GIY 176 ident | | | || | Sbjct KRLIARXADLIRIGQQEGSIQTS--vVPDVLAQVIYQXYLGAALLSKLYKhKAPLFqALE 175 DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL--lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlLHHHHhHHH DSSP HHHHHHHhhllhhhhhhhhhhhhllll Query QVLTLEVpyltpeyrervlalrekyrp 203 ident Sbjct STKXXLD-------------------- 182 DSSP HHHHHHL--------------------
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHH Query xKTRDKILLSSLELFNDKGERNITTNHIAAHLAISPGNLYYHFRNKSDIIYEIFQEYEKL 60 ident | | | | || | Sbjct -TSPERLAAALFDVAAESGLEGASVREVAKRAGVSIGAVQHHFSTKDEXFAFALRTLVDK 59 DSSP -LHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHLL-LLLLlLLLHHHHHHHHHHHHH---hHHHL-HHHHHLHHhHHHHLHHHHHHHHH Query VDYYLD-IPEDrPITLEDXTFYLESVFD---gLWSY-RFFHRDLEyLLDSDPRLRQDYRE 115 ident | | | | Sbjct LLARLSeVERG-GDPARALFAAXSQLLPldeaRSREaHVXAAFAV-RAATSPSLAEIRRK 117 DSSP HHHHHHlLLLL-LLHHHHHHHHHHLLLLllhhHHHHhHHHHHHHH-HHLLLHHHHHHHHH DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHhhlllllLLLHhhHHHHHHHHHHHHHLHHHHH-HHHLlLLHH-H Query FTNRCLAAINRIFAKLadagiiqPQPEdlRSAXSLNVWLVITNWXAFL-KTAHlTELK-Q 173 ident || Sbjct TLFTIRTGLSAVLIGI-------GTPE--AETRAALLLATVDGLALDAiGSPA-LYPPeY 167 DSSP HHHHHHHHHHHHHHLL-------LLLL--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLHH-HLLHhH DSSP HHHHHHHHHH-----hHLLHhhhhhhhhhhhllll Query GIYQVLTLEV-----pYLTPeyrervlalrekyrp 203 ident | Sbjct LEHALDIQIGxilqgaDVVP--------------- 187 DSSP HHHHHHHHHHhhllllLLLL---------------
DSSP -LLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHH Query -XKTRDKILLSSLELFNDKGERNITTNHIAAHLAISPGNLYYHFRNKSDIIYEIFQEYEK 59 ident ||| || || | || | ||||| | | Sbjct sNAXKDKIIDNAITLFSEKGYDGTTLDDIAKSVNIKKASLYYHFDSKKSIYEQSVKCCFD 60 DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHLLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHHLL-LLLLlLLLHHHHHHHHHHHH-HHHHHL-HHHHhLHHHHHH-HLHHHHHHHHH Query LVDYYLD-IPEDrPITLEDXTFYLESVF-DGLWSY-RFFHrDLEYLLD-SDPRLRQDYRE 115 ident | | | | | Sbjct YLNNIIXxNQNKsNYSIDALYQFLFEFIfDIEERYiRXYV-QLSNTPEeFSGNIYGQIQD 119 DSSP HHHHHHHhHHHHlLLLHHHHHHHHHHHHhHLLHHHhHHHH-HHHHLLHhHLLLHHHHHHH DSSP HHHHHHHHHHHhhHHHHhlLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHL-LLLHHH- Query FTNRCLAAINRifAKLAdaGIIQpQPEDLRSAXSLNVWLVITNWXAFLKTAH-LTELKQ- 173 ident | | | | | | Sbjct LNQSLSKEIAK--FYDE--SKIK-XTKEDFQNLILLFLESWYLKASFSQKFGaVEESKSq 174 DSSP HHHHHHHHHHL--LLLL--LLLL-LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlHHHHHHh DSSP HHHHHHHHHHHHLLhhhhhhhhhhhhllll Query GIYQVLTLEVPYLTpeyrervlalrekyrp 203 ident | | | Sbjct FKDEVYSLLNIFLK---------------k 189 DSSP HHHHHHHHHHHHLL---------------l
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