Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition.
The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure, to pre-computed structural neighbours in the Dali Database,
and to the PDB format coordinate file where the neighbour
is superimposed onto the query structure.
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Summary
No: Chain Z rmsd lali nres %id PDB Description
1: 1f5o-A 3.9 5.7 64 149 3 PDB MOLECULE: HEMOGLOBIN V;
2: 2eq6-A 3.9 4.1 65 460 6 PDB MOLECULE: PYRUVATE DEHYDROGENASE COMPLEX, DIHYDROLIPOAMIDE
3: 2rq5-A 3.7 8.9 58 121 17 PDB MOLECULE: PROTEIN JUMONJI;
4: 1lvl-A 3.6 4.4 64 458 3 PDB MOLECULE: DIHYDROLIPOAMIDE DEHYDROGENASE;
5: 1gt0-D 3.5 5.8 60 79 15 PDB MOLECULE: DNA (5'-
6: 2uuz-A 3.4 3.1 63 89 6 PDB MOLECULE: HOST-NUCLEASE INHIBITOR PROTEIN GAM;
7: 1j46-A 3.4 5.4 61 85 13 PDB MOLECULE: SEX-DETERMINING REGION Y PROTEIN;
8: 2apl-A 3.4 3.1 54 149 6 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PG0816;
9: 3fgh-A 3.4 5.0 51 66 16 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTION FACTOR A, MITOCHONDRIAL;
10: 2e88-A 3.3 9.4 66 381 6 PDB MOLECULE: HEAT SHOCK 70KDA PROTEIN 1A;
11: 2yqu-A 3.2 4.4 65 455 6 PDB MOLECULE: 2-OXOGLUTARATE DEHYDROGENASE E3 COMPONENT;
12: 2lef-A 3.2 3.1 54 86 13 PDB MOLECULE: PROTEIN (LYMPHOID ENHANCER-BINDING FACTOR);
13: 3h84-A 3.1 10.1 68 326 6 PDB MOLECULE: ATPASE GET3;
14: 1t1u-A 3.1 10.7 68 597 9 PDB MOLECULE: CHOLINE O-ACETYLTRANSFERASE;
15: 2owy-A 3.1 9.1 56 306 11 PDB MOLECULE: RECOMBINATION-ASSOCIATED PROTEIN RDGC;
16: 2yxr-A 3.0 9.6 76 422 4 PDB MOLECULE: PREPROTEIN TRANSLOCASE SUBUNIT SECY;
17: 3fe1-B 3.0 9.3 63 387 10 PDB MOLECULE: HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 6;
18: 3iuc-C 3.0 5.7 60 388 13 PDB MOLECULE: HEAT SHOCK 70KDA PROTEIN 5 (GLUCOSE-REGULATED
19: 2kho-A 3.0 8.6 64 600 8 PDB MOLECULE: HEAT SHOCK PROTEIN 70;
20: 3gl1-A 3.0 5.8 61 383 8 PDB MOLECULE: HEAT SHOCK PROTEIN SSB1;
21: 3h86-A 3.0 2.3 49 191 12 PDB MOLECULE: ADENYLATE KINASE;
22: 2zjs-Y 3.0 10.7 61 415 5 PDB MOLECULE: PREPROTEIN TRANSLOCASE SECY SUBUNIT;
23: 2yqi-A 3.0 6.0 56 81 13 PDB MOLECULE: HIGH MOBILITY GROUP PROTEIN B3;
24: 2hro-A 2.9 5.2 69 551 1 PDB MOLECULE: PHOSPHOENOLPYRUVATE-PROTEIN PHOSPHOTRANSFERASE;
25: 1h0l-A 2.9 4.0 58 112 3 PDB MOLECULE: MAJOR PRION PROTEIN;
26: 1ebd-A 2.9 4.4 64 455 3 PDB MOLECULE: DIHYDROLIPOAMIDE DEHYDROGENASE;
27: 1yuw-A 2.9 5.9 61 554 5 PDB MOLECULE: HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN;
28: 3bd9-A 2.9 9.7 58 258 5 PDB MOLECULE: HEPARAN SULFATE GLUCOSAMINE 3-O-SULFOTRANSFERASE
29: 1ew6-A 2.8 4.1 64 137 3 PDB MOLECULE: DEHALOPEROXIDASE;
30: 2wqd-A 2.8 4.4 68 570 6 PDB MOLECULE: PHOSPHOENOLPYRUVATE-PROTEIN PHOSPHOTRANSFERASE;
31: 1jeh-A 2.8 4.1 66 478 9 PDB MOLECULE: DIHYDROLIPOAMIDE DEHYDROGENASE;
32: 3i33-A 2.8 9.0 61 380 5 PDB MOLECULE: HEAT SHOCK-RELATED 70 KDA PROTEIN 2;
33: 2co9-A 2.8 6.8 60 102 17 PDB MOLECULE: THYMUS HIGH MOBILITY GROUP BOX PROTEIN TOX;
34: 1wz6-A 2.8 6.1 57 82 9 PDB MOLECULE: HMG-BOX TRANSCRIPTION FACTOR BBX;
35: 1i11-A 2.8 5.0 52 70 12 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTION FACTOR SOX-5;
36: 1ch1-A 2.7 4.1 64 154 11 PDB MOLECULE: PROTEIN (MYOGLOBIN);
37: 1us7-B 2.7 3.1 56 193 7 PDB MOLECULE: HEAT SHOCK PROTEIN HSP82;
38: 1ith-A 2.7 3.6 61 141 11 PDB MOLECULE: HEMOGLOBIN (CYANO MET);
39: 3h4e-K 2.7 7.3 65 198 8 PDB MOLECULE: CAPSID PROTEIN P24;
40: 3k7a-B 2.7 5.9 72 1122 6 PDB MOLECULE: DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1;
41: 1v64-A 2.7 7.8 61 108 8 PDB MOLECULE: NUCLEOLAR TRANSCRIPTION FACTOR 1;
42: 2c5z-A 2.7 3.2 53 93 9 PDB MOLECULE: SET DOMAIN PROTEIN 2;
43: 2cs1-A 2.7 5.9 57 92 12 PDB MOLECULE: PMS1 PROTEIN HOMOLOG 1;
44: 1dxl-A 2.7 3.7 61 467 2 PDB MOLECULE: DIHYDROLIPOAMIDE DEHYDROGENASE;
45: 2jln-A 2.7 3.4 49 463 6 PDB MOLECULE: MHP1;
46: 1wgf-A 2.7 10.1 61 90 10 PDB MOLECULE: UPSTREAM BINDING FACTOR 1;
47: 2gzk-A 2.7 13.5 60 159 8 PDB MOLECULE: SEX-DETERMINING REGION ON Y / HMGB1;
48: 1k99-A 2.7 11.4 57 91 14 PDB MOLECULE: UPSTREAM BINDING FACTOR 1;
49: 3lad-A 2.7 4.1 63 472 10 PDB MOLECULE: DIHYDROLIPOAMIDE DEHYDROGENASE;
50: 1zk7-A 2.7 4.9 63 467 2 PDB MOLECULE: MERCURIC REDUCTASE;
51: 2oyy-A 2.7 4.4 51 71 8 PDB MOLECULE: HEXAMERIC CYTOCHROME;
52: 1emy-A 2.6 4.0 64 153 14 PDB MOLECULE: MYOGLOBIN;
53: 1eia-A 2.6 5.2 68 207 9 PDB MOLECULE: EIAV CAPSID PROTEIN P26;
54: 2c0k-A 2.6 3.9 61 149 13 PDB MOLECULE: HEMOGLOBIN;
55: 1l6n-A 2.6 12.5 72 288 8 PDB MOLECULE: GAG POLYPROTEIN;
56: 2r4z-B 2.6 5.2 66 146 2 PDB MOLECULE: GLOBIN-1;
57: 1gjn-A 2.6 4.0 64 153 11 PDB MOLECULE: MYOGLOBIN;
58: 1sct-A 2.6 5.9 70 149 10 PDB MOLECULE: HEMOGLOBIN II (CARBONMONOXY) (ALPHA CHAIN);
59: 2pem-E 2.6 3.1 55 112 5 PDB MOLECULE: ORF134;
60: 1gh0-A 2.6 4.0 64 162 3 PDB MOLECULE: C-PHYCOCYANIN ALPHA SUBUNIT;
61: 2aze-A 2.6 3.8 60 149 10 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTION FACTOR DP-1;
62: 3gty-X 2.6 5.9 61 412 13 PDB MOLECULE: TRIGGER FACTOR;
63: 2vkd-A 2.6 11.1 63 542 10 PDB MOLECULE: CYTOTOXIN L;
64: 1or7-A 2.6 3.1 51 181 4 PDB MOLECULE: RNA POLYMERASE SIGMA-E FACTOR;
65: 3dl8-G 2.6 11.1 62 406 11 PDB MOLECULE: PROTEIN TRANSLOCASE SUBUNIT SECA;
66: 2crj-A 2.6 5.6 55 92 13 PDB MOLECULE: SWI/SNF-RELATED MATRIX-ASSOCIATED ACTIN-
67: 3f51-A 2.6 5.4 56 94 5 PDB MOLECULE: CLP GENE REGULATOR (CLGR);
68: 2cto-A 2.6 4.8 54 93 19 PDB MOLECULE: NOVEL PROTEIN;
69: 2e6o-A 2.6 12.5 60 87 12 PDB MOLECULE: HMG BOX-CONTAINING PROTEIN 1;
70: 1zrh-A 2.6 9.7 58 263 9 PDB MOLECULE: HEPARAN SULFATE GLUCOSAMINE 3-O-SULFOTRANSFERASE
71: 2owl-A 2.6 9.3 59 302 8 PDB MOLECULE: RECOMBINATION-ASSOCIATED PROTEIN RDGC;
72: 2oif-G 2.5 3.7 63 154 13 PDB MOLECULE: NON-LEGUME HEMOGLOBIN;
73: 2hwg-A 2.5 5.2 67 572 6 PDB MOLECULE: PHOSPHOENOLPYRUVATE-PROTEIN PHOSPHOTRANSFERASE;
74: 1d1d-A 2.5 4.6 69 220 10 PDB MOLECULE: PROTEIN (CAPSID PROTEIN);
75: 1yhu-D 2.5 7.2 64 149 11 PDB MOLECULE: HEMOGLOBIN A1 CHAIN;
76: 1qgw-D 2.5 4.5 66 177 5 PDB MOLECULE: PROTEIN (CRYPTOPHYTAN PHYCOERYTHRIN (ALPHA-1
77: 1b33-A 2.5 4.1 64 160 9 PDB MOLECULE: ALLOPHYCOCYANIN, ALPHA CHAIN;
78: 1mni-A 2.5 4.0 64 153 13 PDB MOLECULE: MYOGLOBIN;
79: 1wwi-A 2.5 4.2 70 148 7 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN TTHA1479;
80: 2bk9-A 2.5 3.9 60 153 8 PDB MOLECULE: CG9734-PA;
81: 2vjt-A 2.5 4.1 64 160 9 PDB MOLECULE: ALLOPHYCOCYANIN ALPHA SUBUNIT;
82: 1sct-B 2.5 5.2 63 150 10 PDB MOLECULE: HEMOGLOBIN II (CARBONMONOXY) (ALPHA CHAIN);
83: 2wwb-A 2.5 6.3 73 476 1 PDB MOLECULE: PROTEIN TRANSPORT PROTEIN SEC61 SUBUNIT ALPHA
84: 1r4v-A 2.5 4.2 67 151 10 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN AQ_328;
85: 1jeb-A 2.5 4.1 63 141 11 PDB MOLECULE: HEMOGLOBIN ZETA CHAIN;
86: 1x9f-D 2.5 3.9 59 140 7 PDB MOLECULE: GLOBIN IV, EXTRACELLULAR;
87: 1dos-A 2.5 4.6 67 358 6 PDB MOLECULE: ALDOLASE CLASS II;
88: 1gyn-A 2.5 4.7 67 333 6 PDB MOLECULE: FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE II;
89: 1cpc-A 2.5 4.1 64 162 5 PDB MOLECULE: C-PHYCOCYANIN (ALPHA SUBUNIT);
90: 1e7u-A 2.5 13.7 64 872 8 PDB MOLECULE: PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE CATALYTIC SUBUNIT;
91: 3cqz-A 2.5 10.0 66 1349 8 PDB MOLECULE: DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1;
92: 2kp7-A 2.5 2.4 47 80 4 PDB MOLECULE: CROSSOVER JUNCTION ENDONUCLEASE MUS81;
93: 1k83-A 2.5 10.0 67 1366 7 PDB MOLECULE: DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II LARGEST SUBUNIT;
94: 1a81-A 2.5 9.1 60 254 10 PDB MOLECULE: SYK KINASE;
95: 1e7j-A 2.5 5.5 52 74 10 PDB MOLECULE: DNA (5'-
96: 3bo1-A 2.4 9.6 69 442 3 PDB MOLECULE: 23S RIBOSOMAL RNA;
97: 1f1e-A 2.4 3.6 65 151 9 PDB MOLECULE: HISTONE FOLD PROTEIN;
98: 1lhs-A 2.4 4.0 64 153 9 PDB MOLECULE: MYOGLOBIN;
99: 1h97-A 2.4 4.5 64 147 13 PDB MOLECULE: GLOBIN-3;
100: 2d2m-B 2.4 3.3 57 142 14 PDB MOLECULE: GIANT HEMOGLOBIN, A1(B) GLOBIN CHAIN;
101: 2kfl-A 2.4 2.7 55 112 4 PDB MOLECULE: MAJOR PRION PROTEIN;
102: 2zfo-C 2.4 6.3 62 147 6 PDB MOLECULE: EXTRACELLULAR GIANT HEMOGLOBIN MAJOR GLOBIN
103: 1it2-A 2.4 5.7 64 146 8 PDB MOLECULE: HEMOGLOBIN;
104: 2vjh-B 2.4 3.8 62 177 3 PDB MOLECULE: PHYCOERYTHRIN ALPHA CHAIN;
105: 3hyb-A 2.4 3.5 53 115 8 PDB MOLECULE: RBCX PROTEIN;
106: 1f99-A 2.4 4.2 65 162 5 PDB MOLECULE: R-PHYCOCYANIN;
107: 1f99-B 2.4 3.7 62 172 3 PDB MOLECULE: R-PHYCOCYANIN;
108: 2vjr-A 2.4 4.3 64 162 3 PDB MOLECULE: PHYCOCYANIN ALPHA CHAIN;
109: 1i7y-A 2.4 4.2 65 162 5 PDB MOLECULE: C-PHYCOCYANIN ALPHA SUBUNIT;
110: 2rko-A 2.4 4.5 61 280 15 PDB MOLECULE: VACUOLAR PROTEIN SORTING-ASSOCIATED PROTEIN 4;
111: 1x9n-A 2.4 12.7 59 632 7 PDB MOLECULE: DNA LIGASE I;
112: 1cg7-A 2.4 13.7 58 93 12 PDB MOLECULE: PROTEIN (NON HISTONE PROTEIN 6 A);
113: 2yuk-A 2.4 6.9 55 90 7 PDB MOLECULE: MYELOID/LYMPHOID OR MIXED-LINEAGE LEUKEMIA
114: 1cf3-A 2.4 9.7 61 581 2 PDB MOLECULE: PROTEIN (GLUCOSE OXIDASE);
115: 2h8r-A 2.4 3.5 52 176 2 PDB MOLECULE: HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 1-BETA;
116: 2f4m-A 2.4 6.4 52 295 10 PDB MOLECULE: PEPTIDE N-GLYCANASE;
117: 1i9y-A 2.4 6.5 49 336 8 PDB MOLECULE: PHOSPHATIDYLINOSITOL PHOSPHATE PHOSPHATASE;
118: 1orq-C 2.3 4.2 64 223 5 PDB MOLECULE: 6E1 FAB LIGHT CHAIN;
119: 1or7-B 2.3 2.9 49 164 4 PDB MOLECULE: RNA POLYMERASE SIGMA-E FACTOR;
120: 1dm1-A 2.3 4.0 61 146 5 PDB MOLECULE: MYOGLOBIN;
121: 1oj6-B 2.3 4.3 60 151 7 PDB MOLECULE: NEUROGLOBIN;
122: 2yvx-A 2.3 11.3 73 442 7 PDB MOLECULE: MG2+ TRANSPORTER MGTE;
123: 1n4m-A 2.3 3.5 61 345 10 PDB MOLECULE: RETINOBLASTOMA POCKET;
124: 1x9f-C 2.3 3.8 59 149 7 PDB MOLECULE: GLOBIN IV, EXTRACELLULAR;
125: 1yhu-C 2.3 4.6 60 148 8 PDB MOLECULE: HEMOGLOBIN A1 CHAIN;
126: 2py8-C 2.3 3.7 54 123 7 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN RBCX;
127: 2f3o-A 2.3 10.7 68 773 4 PDB MOLECULE: PYRUVATE FORMATE-LYASE 2;
128: 1p7n-A 2.3 8.7 73 176 7 PDB MOLECULE: GAG POLYPROTEIN CAPSID PROTEIN P27;
129: 1b8d-A 2.3 4.1 65 164 6 PDB MOLECULE: PROTEIN (RHODOPHYTAN PHYCOERYTHRIN (ALPHA CHAIN)
130: 1b0b-A 2.3 4.2 61 142 8 PDB MOLECULE: HEMOGLOBIN;
131: 3bm3-A 2.3 5.6 61 259 3 PDB MOLECULE: PSPGI RESTRICTION ENDONUCLEASE;
132: 2bv8-B 2.3 3.8 59 172 3 PDB MOLECULE: C-PHYCOCYANIN ALPHA SUBUNIT;
133: 1lia-A 2.3 4.1 65 164 8 PDB MOLECULE: R-PHYCOERYTHRIN;
134: 2vjr-B 2.3 3.7 62 172 2 PDB MOLECULE: PHYCOCYANIN ALPHA CHAIN;
135: 2iu5-A 2.3 10.8 64 179 5 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YCEG;
136: 1bhy-A 2.3 12.4 68 482 6 PDB MOLECULE: P64K;
137: 2hvu-A 2.3 13.9 53 116 8 PDB MOLECULE: PDCD5-LIKE PROTEIN;
138: 1q2h-A 2.3 3.1 49 63 6 PDB MOLECULE: ADAPTOR PROTEIN WITH PLECKSTRIN HOMOLOGY AND SRC
139: 1msw-D 2.2 5.3 71 863 8 PDB MOLECULE: DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE;
140: 1x3k-A 2.2 4.4 61 152 15 PDB MOLECULE: HEMOGLOBIN COMPONENT V;
141: 2kfo-A 2.2 3.0 57 114 0 PDB MOLECULE: MAJOR PRION PROTEIN;
142: 1yhu-B 2.2 6.9 62 144 5 PDB MOLECULE: HEMOGLOBIN A1 CHAIN;
143: 1x9f-A 2.2 4.5 60 147 17 PDB MOLECULE: GLOBIN IV, EXTRACELLULAR;
144: 2olp-A 2.2 3.8 59 151 8 PDB MOLECULE: HEMOGLOBIN II;
145: 2vyw-A 2.2 4.4 65 148 9 PDB MOLECULE: HEMOGLOBIN;
146: 2d2m-A 2.2 4.0 61 140 3 PDB MOLECULE: GIANT HEMOGLOBIN, A1(B) GLOBIN CHAIN;
147: 2wlv-A 2.2 7.7 69 144 3 PDB MOLECULE: GAG POLYPROTEIN;
148: 2nrm-A 2.2 5.0 64 146 9 PDB MOLECULE: MYOGLOBIN;
149: 1phn-B 2.2 4.3 63 172 5 PDB MOLECULE: PHYCOCYANIN;
150: 3fs4-A 2.2 4.3 63 141 14 PDB MOLECULE: HEMOGLOBIN SUBUNIT ALPHA-A;
151: 1gux-A 2.2 2.6 48 177 15 PDB MOLECULE: RETINOBLASTOMA PROTEIN;
152: 2c5u-A 2.2 10.4 64 375 13 PDB MOLECULE: RNA LIGASE;
153: 2c7j-A 2.2 3.9 63 162 6 PDB MOLECULE: PHYCOERYTHROCYANIN ALPHA CHAIN;
154: 1y2s-A 2.2 4.0 55 113 2 PDB MOLECULE: MAJOR PRION PROTEIN;
155: 1dmt-A 2.2 4.9 68 697 4 PDB MOLECULE: NEUTRAL ENDOPEPTIDASE;
156: 1kr7-A 2.2 6.3 55 110 9 PDB MOLECULE: NEURAL GLOBIN;
157: 1xu0-A 2.2 2.8 53 102 8 PDB MOLECULE: PRION PROTEIN;
158: 2ffh-A 2.2 14.4 61 407 8 PDB MOLECULE: PROTEIN (FFH);
159: 3ckd-B 2.2 8.2 64 244 5 PDB MOLECULE: INVASION PLASMID ANTIGEN, SECRETED BY THE MXI-SPA
160: 3h9v-A 2.2 3.7 50 329 6 PDB MOLECULE: P2X PURINOCEPTOR;
161: 1kx5-D 2.2 11.4 55 122 9 PDB MOLECULE: HISTONE H3;
162: 1ic8-B 2.2 3.7 56 173 5 PDB MOLECULE: HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 1-ALPHA;
163: 2kbz-A 2.2 5.7 57 99 5 PDB MOLECULE: 15 PROTEIN (BACTERIOPHAGE SPP1 COMPLETE
164: 1jvs-A 2.2 7.5 55 400 2 PDB MOLECULE: 1-DEOXY-D-XYLULOSE 5-PHOSPHATE REDUCTOISOMERASE;
165: 1re5-D 2.1 5.0 64 448 8 PDB MOLECULE: 3-CARBOXY-CIS,CIS-MUCONATE CYCLOISOMERASE;
166: 2qae-A 2.1 4.4 65 465 6 PDB MOLECULE: DIHYDROLIPOYL DEHYDROGENASE;
167: 2ims-A 2.1 3.2 60 163 8 PDB MOLECULE: APOPTOSIS REGULATOR BAK;
168: 2bv8-A 2.1 4.0 63 162 6 PDB MOLECULE: C-PHYCOCYANIN ALPHA SUBUNIT;
169: 1xx7-A 2.1 3.6 64 172 9 PDB MOLECULE: OXETANOCIN-LIKE PROTEIN;
170: 1c7d-A 2.1 9.9 68 284 10 PDB MOLECULE: PROTEIN (DEOXYHEMOGLOBIN (ALPHA CHAIN));
171: 1x9f-B 2.1 7.0 59 145 3 PDB MOLECULE: GLOBIN IV, EXTRACELLULAR;
172: 2d2m-D 2.1 3.6 57 145 4 PDB MOLECULE: GIANT HEMOGLOBIN, A1(B) GLOBIN CHAIN;
173: 3c7n-A 2.1 9.8 64 648 8 PDB MOLECULE: HEAT SHOCK PROTEIN HOMOLOG SSE1;
174: 1yhu-A 2.1 3.6 56 145 7 PDB MOLECULE: HEMOGLOBIN A1 CHAIN;
175: 1gh0-B 2.1 4.3 63 172 10 PDB MOLECULE: C-PHYCOCYANIN ALPHA SUBUNIT;
176: 2vjh-A 2.1 3.9 60 164 8 PDB MOLECULE: PHYCOERYTHRIN ALPHA CHAIN;
177: 1all-B 2.1 4.3 61 161 2 PDB MOLECULE: ALLOPHYCOCYANIN;
178: 2v4x-A 2.1 4.4 58 131 10 PDB MOLECULE: CAPSID PROTEIN P27;
179: 2vjt-B 2.1 4.3 61 161 3 PDB MOLECULE: ALLOPHYCOCYANIN ALPHA SUBUNIT;
180: 1i7y-B 2.1 4.3 59 172 7 PDB MOLECULE: C-PHYCOCYANIN ALPHA SUBUNIT;
181: 3gb8-A 2.1 7.5 58 958 3 PDB MOLECULE: EXPORTIN-1;
182: 2pv3-A 2.1 2.6 52 284 4 PDB MOLECULE: CHAPERONE SURA;
183: 1sb0-A 2.1 4.0 55 87 9 PDB MOLECULE: PROTEIN CBP;
184: 1u2m-A 2.1 3.1 46 86 11 PDB MOLECULE: HISTONE-LIKE PROTEIN HLP-1;
185: 2np2-A 2.1 4.0 43 102 14 PDB MOLECULE: HBB;
186: 3cm8-A 2.0 6.1 73 435 3 PDB MOLECULE: POLYMERASE ACIDIC PROTEIN;
187: 1gk2-A 2.0 3.7 60 509 8 PDB MOLECULE: HISTIDINE AMMONIA-LYASE;
188: 2dc3-A 2.0 4.0 60 172 8 PDB MOLECULE: CYTOGLOBIN;
189: 2cqz-A 2.0 3.5 64 173 11 PDB MOLECULE: 177AA LONG HYPOTHETICAL PROTEIN;
190: 1phn-A 2.0 4.2 65 162 8 PDB MOLECULE: PHYCOCYANIN;
191: 1w36-B 2.0 11.3 69 1158 4 PDB MOLECULE: DNA HAIRPIN;
192: 1hlm-A 2.0 6.2 65 158 3 PDB MOLECULE: HEMOGLOBIN (CYANO MET);
193: 2e2o-A 2.0 13.8 73 299 7 PDB MOLECULE: HEXOKINASE;
194: 3cvr-A 2.0 9.2 67 477 4 PDB MOLECULE: INVASION PLASMID ANTIGEN;
195: 1yyk-A 2.0 4.9 65 221 8 PDB MOLECULE: RIBONUCLEASE III;
196: 1cpc-B 2.0 4.3 59 172 7 PDB MOLECULE: C-PHYCOCYANIN (ALPHA SUBUNIT);
197: 1z9h-A 2.0 5.6 54 274 2 PDB MOLECULE: MEMBRANE-ASSOCIATED PROSTAGLANDIN E SYNTHASE-2;
198: 3ic3-A 2.0 10.5 49 98 6 PDB MOLECULE: PUTATIVE PYRUVATE DEHYDROGENASE;
Pairwise Structural Alignments
Notation: three-state secondary structure definitions by DSSP (reduced to H=helix, E=sheet, L=coil) are shown above the amino acid sequence. Structurally equivalent residues are in uppercase, structurally non-equivalent residues (e.g. in loops) are in lowercase. Amino acid identities are marked by vertical bars.
No 1: Query=mol1E Sbjct=1f5oA Z-score=3.9
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DSSP lllllLLLL-----lllllllLLLHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlleelllllll Query ankldYIPE-----pxdlslvDLPESLIQLSERIAENVHEVWAKARIDEgwtygekrddi 55 ident | Sbjct -pivdTGSVaplsaaektkirSAWAPVYSTYETSGVDILVKFFTSTPAA-------qeff 52 DSSP -llllLLLLllllhhhhhhhhHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLHHH-------hhhl DSSP lleELLLLL--HHHLlHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL---------------------- Query hkkHPCLVP--YDELpEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLG---------------------- 91 ident | Sbjct pkfKGLTTAdqLKKS-ADVRWHAERIINAVNDAVASMDdtekmsmklrdlsgkhaksfqv 111 DSSP hhhLLLLLHhhHHHL-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhllll DSSP -------------------------------lllllll Query -------------------------------frieked 98 ident Sbjct dpqyfkvlaaviadtvaagdagfeklmsmicillrsay 149 DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllll
DSSP --------------------llllllllllllllLLLLLHHH-HLLHHHHHHHHHHHHHH Query --------------------ankldyipepxdlsLVDLPESL-IQLSERIAENVHEVWAK 39 ident | | Sbjct mktydlivigtgpggyhaairaaqlglkvlaveaGEVGGVCLnVGCIPTKALLHAAETLH 60 DSSP leeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhlllleeeeelLLLLHHHHhLLHHHHHHHHHHHHHHH DSSP HHHLLLleelllllllLLEELLlllhhhlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL------- Query ARIDEGwtygekrddiHKKHPClvpydelPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLGF------- 92 ident | | Sbjct HLKVAE------gfglKAKPEL-------DLKKLGGWRDQVVKKLTGGVGTLLkgngvel 107 DSSP HHHHHH------hhleELLLEE-------LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 92 ident Sbjct lrgfarlvgpkevevggerygakslilatgseplelkgfpfgedvwdstralkveeglpk 167 DSSP eelleeeeelleeeelleeeeeeeeeellleeellllllllllleelhhhhllhhhllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 92 ident Sbjct rllvigggavglelgqvyrrlgaevtlieympeilpqgdpetaallrralekegirvrtk 227 DSSP eeeeelllhhhhhhhhhhhhllleeeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeell DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 92 ident Sbjct tkavgyekkkdglhvrlepaeggegeevvvdkvlvavgrkprteglglekagvkvdergf 287 DSSP eeeeeeeeelleeeeeeeelllllleeeeeleeeellleeellllllhhhhlllllllll DSSP -----------------------llLLLL------------------------------- Query -----------------------riEKED------------------------------- 98 ident Sbjct irvnarmetsvpgvyaigdaarpplLAHKamregliaaenaagkdsafdyqvpsvvytsp 347 DSSP llllllllllllleeelhhhlllllLHHHhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeellll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 98 ident Sbjct ewagvglteeeakragykvkvgkfplaasgraltlggaegmvkvvgdeetdlllgvfivg 407 DSSP eeeeeellhhhhhhlllleeeeeeehhhlhhhhhlllllleeeeeeellllleeeeeeee DSSP ----------------------------------------------------- Query ----------------------------------------------------- 98 ident Sbjct pqageliaeaalalemgatltdlaltvhphptlseslmeaaeafhkqaihiln 460 DSSP llhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhlllllllll
DSSP lllllllllllllLLLLLlhhHHLLHHHHHHHHHHHHHHH-------------------- Query ankldyipepxdlSLVDLpesLIQLSERIAENVHEVWAKA-------------------- 40 ident || | Sbjct ---------gplgSLGRR--wGPNVQRLACIKKHLRSQGItmdelpliggceldlacffr 49 DSSP ---------llllLLLLL--lLHHHHHHHHHHHHHHHLLLlllllleelleellhhhhhh DSSP --------------------hhlllleellllLLLLLE---ellLLLHHHLLHHHHHHHH Query --------------------ridegwtygekrDDIHKK---hpcLVPYDELPEEEKEYDR 77 ident | || | || Sbjct linemggmqqvtdlkkwnkladmlripktaqdRLAKLQeaycqyLLSYDSLSPEEHRRLE 109 DSSP hhhhlllhhhhhhlllhhhhhhhlllllllllHHHHHHhhhhllHHHHHHLLHHHHHHHH DSSP HHHHHHHHHHHHlllllllll Query NTAXNTIKXVKKlgfrieked 98 ident | Sbjct KEVLMEKEILEK--------- 121 DSSP HHHHHHHHLLLL---------
DSSP ----------------------llllllllllllllLLLLLHHHH-LLHHHHHHHHHHHH Query ----------------------ankldyipepxdlsLVDLPESLI-QLSERIAENVHEVW 37 ident | | Sbjct qqtiqttlliigggpggyvaairagqlgiptvlvegQALGGTCLNiGCIPSKALIHVAEQ 60 DSSP llleelleeeelllhhhhhhhhhhhhhllleeeellLLLLHHHHHhLHHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHHLLLleellllllllLEELLlllhhhlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL----- Query AKARIDEGwtygekrddihKKHPClvpydelPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLGF----- 92 ident Sbjct FHQASRFT--epsplgisvASPRL-------DIGQSVAWKDGIVDRLTTGVAALLkkhgv 111 DSSP HHHHHHLL--lllllllllLLLLL-------LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 92 ident Sbjct kvvhgwakvldgkqvevdgqriqcehlllatgsssvelpmlplggpvisstealapkalp 171 DSSP eeellleeeeelleeeelleeeelleeeellleeellllllllllleelhhhhlllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 92 ident Sbjct qhlvvvgggyiglelgiayrklgaqvsvvearerilptydseltapvaeslkklgialhl 231 DSSP leeeeelllhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlleeel DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 92 ident Sbjct ghsvegyengcllandgkggqlrleadrvlvavgrrprtkgfnlecldlkmngaaiaide 291 DSSP lleeeeeelleeeeellllllleelllleeellleeellllllhhhlllleelleellll DSSP ------------------llLLLL------------------------------------ Query ------------------riEKED------------------------------------ 98 ident Sbjct rcqtsmhnvwaigdvagepmLAHRamaqgemvaeiiagkarrfepaaiaavcftdpevvv 351 DSSP lllllllleeelhhhhllllLHHHhhhhhhhhhhhhllllllllllllleeelllleeee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 98 ident Sbjct vgktpeqasqqgldcivaqfpfaangramslesksgfvrvvarrdnhlilgwqavgvavs 411 DSSP eellhhhhhhlllleeeeeeehhhlhhhhhlllllleeeeeeellllleeeeeeeellhh DSSP ----------------------------------------------- Query ----------------------------------------------- 98 ident Sbjct elstafaqslemgacledvagtihahptlgeavqeaalralghalhi 458 DSSP hhhhhhhhhhhhlllhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhlllllll
DSSP lllllllllllllllllllhhhhllhhhHHHHHHHHHHHHHHLLLleellllllLLLE-- Query ankldyipepxdlslvdlpesliqlserIAENVHEVWAKARIDEGwtygekrddIHKK-- 58 ident | | Sbjct ---------------------drvkrpmNAFMVWSRGQRRKMAQE-------npKMHNse 32 DSSP ---------------------lllllllLHHHHHHHHHHHHHHLL-------llLLLHhh DSSP -eLLLL-LHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLL----- Query -hPCLV-PYDELPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLGFRIEKED----- 98 ident | | | || | | Sbjct isKRLGaEWKLLSETEKRPFIDEAKRLRALHMKEHPDYKYRPrrktk 79 DSSP hhHHHHhHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLlllll
DSSP ----llllllllllllllLLLL-lHHHHLLHhhHHHHHHHHHHHHHHLLLLEElllllll Query ----ankldyipepxdlsLVDL-pESLIQLSerIAENVHEVWAKARIDEGWTYgekrddi 55 ident | Sbjct rleaqswarhyqqlareeKEAElaDDMEKGI--PQHLFESLCIDHLQRHGASK------- 51 DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhHHHHLLL--LHHHHHHHHHHHHHHHLLLH------- DSSP lleeLLLLL-HHHLlHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllllll Query hkkhPCLVP-YDELpEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLGFrieked 98 ident | | | Sbjct ----KSITRaFDDD-VEFQERMAEHIRYMVETIAHHQV-didse 89 DSSP ----HHHHHhHHLL-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-hhhll
DSSP lllllllllllllllllllhhhhllhhhHHHHHHHHHHHHHHLLLLeellllllLLLE-- Query ankldyipepxdlslvdlpesliqlserIAENVHEVWAKARIDEGWtygekrddIHKK-- 58 ident | | Sbjct -------------------mqdrvkrpmNAFIVWSRDQRRKMALEN-------pRMRNse 34 DSSP -------------------lllllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHL-------lLLLHhh DSSP -eLLLL-LHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLL--------- Query -hPCLV-PYDELPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLGFRIEKED--------- 98 ident | | | || | Sbjct isKQLGyQWKMLTEAEKWPFFQEAQKLQAMHREKYPNYKYRPrrkakmlpk 85 DSSP hhHHHHhHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLlllllllll
DSSP llllllllllllllllllLHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHhlllleellllllllleeL Query ankldyipepxdlslvdlPESLIQLSERIAENVHEVWAKARidegwtygekrddihkkhP 60 ident Sbjct ------------------KSTEKKELSHFRLKLETYLNEHF-----------------pE 25 DSSP ------------------LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL-----------------hH DSSP LLLlhhhlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL------------------------- Query CLVpydelPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLGFRIE------------------------- 95 ident | || Sbjct XSG-----NNPFITARSDEALTAYCDAVAQGFSHPeaesxasevlyqglhfsrydtlvsv 80 DSSP HLL-----LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 95 ident Sbjct lerefeqelpsplperlapillknkaiqsvfakydltddfeaspeyehlyteltgtivll 140 DSSP hhhhllllllllhhhhhhhhhhllhhhhhhhllllllllhhhllhhhhhhhhhhhhhhhh DSSP ------lll Query ------ked 98 ident Sbjct iesnhlpti 149 DSSP hhlllllll
DSSP lllllllllllllllllllhhhhllhhhHHHHHHHHHHHHHHLllleellllllLLLE-- Query ankldyipepxdlslvdlpesliqlserIAENVHEVWAKARIDegwtygekrddIHKK-- 58 ident | || Sbjct ---------------------gkpkrprSAYNVYVAERFQEAK----------gDSPQek 29 DSSP ---------------------lllllllLHHHHHHHHHHHHHL----------lLLHHhh DSSP -ellLLLHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlllll Query -hpcLVPYDELPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLGFRieked 98 ident | ||| | Sbjct lktvKENWKNLSDSEKELYIQHAKEDETRYHNEMKS----w 66 DSSP hhhhHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----l
DSSP -LLLL----------------------llLLLL--------------------------- Query -ANKL----------------------dyIPEP--------------------------- 10 ident | Sbjct kAAAIgidlgttyscvgvfqhgkveiianDQGNrttpsyvaftdterligdaaknqvaln 60 DSSP lLLLEeeelllleeeeeeeelleeeelllLLLLlleelleeelllleeelhhhhhlllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 10 ident Sbjct pqntvfdakrligrkfgdpvvqsdmkhwpfqvindgdkpkvqvsykgetkafypeeissm 120 DSSP hhheellhhhllllllllhhhhhhhllllleeeeelleeeeeeeelleeeeelhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 10 ident Sbjct vltkmkeiaeaylgypvtnavitvpayfndsqrqatkdagviaglnvlriineptaaaia 180 DSSP hhhhhhhhhhhhhllllleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeehhhhhhhh DSSP -----------llllllLLLH-------------------------HHHLLHHHHHHHHH Query -----------xdlslvDLPE-------------------------SLIQLSERIAENVH 34 ident | Sbjct ygldrtgkgernvlifdLGGGtfdvsiltiddgifevkatagdthlGGEDFDNRLVNHFV 240 DSSP lllllllllleeeeeeeLLLLleeeeeeeeelleeeeeeeeeehhhLHHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHHHHHlllleellllllllleellLLLHhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL--- Query EVWAKARIdegwtygekrddihkkhpcLVPYdeLPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLG--- 91 ident | | Sbjct EEFKRKHK-------------------KDIS--QNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTqas 279 DSSP HHHHHHHL-------------------LLHH--HLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLeee DSSP ------------------------lllLLLL----------------------------- Query ------------------------friEKED----------------------------- 98 ident Sbjct leidslfegidfytsitrarfeelcsdLFRStlepvekalrdakldkaqihdlvlvggst 339 DSSP eeeeeeelleeeeeeeehhhhhhhlhhHHHHlhhhhhhhhhhhlllhhhlleeeeelhhh DSSP ------------------------------------------ Query ------------------------------------------ 98 ident Sbjct ripkvqkllqdffngrdlnksinpdeavaygaavqaailmgd 381 DSSP hlhhhhhhhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP -------------------lllllllllllllLLLLLLHHH-HLLHHHHHHHHHHHHHHH Query -------------------ankldyipepxdlSLVDLPESL-IQLSERIAENVHEVWAKA 40 ident | | Sbjct mydllvigagpggyvaairaaqlgmkvgvvekEKALGGTCLrVGCIPSKALLETTERIYE 60 DSSP leeeeeelllhhhhhhhhhhhhlllleeeeelLLLLLHHHHhHLHHHHHHHHHHHHHHHH DSSP HHLLLleellllllllLEELLlllhhhlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL-------- Query RIDEGwtygekrddihKKHPClvpydelPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLGF-------- 92 ident | | Sbjct AKKGL------lgakvKGVEL-------DLPALMAHKDKVVQANTQGVEFLFkkngiarh 107 DSSP HHHLL------lleeeLLEEE-------LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlleee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 92 ident Sbjct qgtarflserkvlveetgeelearyiliatgsaplippwaqvdyervvtstealsfpevp 167 DSSP elleeelllleeeellllleeeeeeeeellleeelllllllllllleelhhhhlllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 92 ident Sbjct krlivvgggviglelgvvwhrlgaevivleymdrilptmdlevsraaervfkkqgltirt 227 DSSP leeeeelllhhhhhhhhhhhhllleeeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlleeel DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 92 ident Sbjct gvrvtavvpeakgarveleggevleadrvlvavgrrpyteglslenaglstdergripvd 287 DSSP llleeeeeeelleeeeeelllleeeeleeeellleeellllllhhhhlllllllllllll DSSP -------------------llLLLL----------------------------------- Query -------------------riEKED----------------------------------- 98 ident Sbjct ehlrtrvphiyaigdvvrgpmLAHKaseegiaavehmvrgfghvdyqaipsvvythpeia 347 DSSP llllllllleeelhhhlllllLHHHhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhlleeelllleee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 98 ident Sbjct avgyteeelkaqgipykvgkfpysasgraramgetegfikvlahaktdrilgvhgigarv 407 DSSP eeellhhhhhhhllleeeeeeehhhlhhhhhhllllleeeeeeellllleeeeeeeellh DSSP ------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------ 98 ident Sbjct gdvlaeaalalffkasaedlgraphahpslseilkeaalaawerpihl 455 DSSP hhhhhhhhhhhhllllhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhllllll
DSSP lllllllllllllllllllhhhhllhhhHHHHHHHHHHHHHHLLLLeellllllllleel Query ankldyipepxdlslvdlpesliqlserIAENVHEVWAKARIDEGWtygekrddihkkhp 60 ident | | Sbjct ---------------------mhikkplNAFMLYMKEMRANVVAES---tlkesaainqi 36 DSSP ---------------------lllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHL---llllhhhhhhh DSSP llLLHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL-LLLL----------- Query clVPYDELPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLGFRI-EKED----------- 98 ident | || | | Sbjct lgRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWsARDNygkkkkrkrek 86 DSSP hhHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlLLLLlllllllllll
DSSP LLLLL------lLLLL--------------------------llllLLLLLHHH------ Query ANKLD------yIPEP--------------------------xdlsLVDLPESL------ 22 ident Sbjct VEPNLhslitstTHKWifvggkggvgkttsscsiaiqmalsqpnkqFLLISTDPahnlsd 60 DSSP LLLLLhhhhlllLLLEeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllEEEEELLLllhhhh DSSP ----------------------hlLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLleellllllllleel Query ----------------------iqLSERIAENVHEVWAKARIDEGwtygekrddihkkhp 60 ident | Sbjct afgekfgkdarkvtgmnnlscmeiDPSAALKDMNDMAVSRANNNG--sdgqgddlgsllq 118 DSSP hhlllllllleelllllleeeeelLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL--lllllllhhhhlh DSSP lLLLHHHL--LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL--------------------------- Query cLVPYDEL--PEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLG--------------------------- 91 ident | | | Sbjct gGALADLTgsIPGIDEALSFMEVMKHIKRQEQGegetfdtvifdtaptghtlrflqlpnt 178 DSSP hHLLHHHLllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlllllleeeeellllllllhhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 91 ident Sbjct lskllekfdisgklnelkanvetirqqftdpdlttfvcvciseflslyeterliqelisy 238 DSSP hhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhl DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 91 ident Sbjct dmdvnsiivnqllfaendqehnckrcqarwkmqkkyldqidelyedfhvvkmplcageir 298 DSSP llleeeeeeeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeelllllll DSSP ---------------------lllllll Query ---------------------frieked 98 ident Sbjct glnnltkfsqflnkeynpitdgkviyel 326 DSSP hhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhl
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct eldlpklpvpplqqtlatylqcmqhlvpeeqfrksqaivkrfgapgglgetlqekllerq 60 DSSP lllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhh DSSP -----------------LLLLLLL--llllllllllllHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHH Query -----------------ANKLDYI--pepxdlslvdlpESLIQLSERIAENVHEVWAKAR 41 ident | | | | Sbjct ektanwvseywlndmylNNRLALPvnsspavifarqhfQDTNDQLRFAACLISGVLSYKT 120 DSSP hhlllllhhhhhhhhllLLLLLHHhhllleeeelllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DSSP HLLL------------------------------------leelllLLLLLLEELL---- Query IDEG------------------------------------wtygekRDDIHKKHPC---- 61 ident | Sbjct LLDShslptdwakgqlsgqplcmkqyyrlfssyrlpghtqdtlvaqKSSIMPEPEHviva 180 DSSP HHHHlllllllllllllllllllllhhhllleeeelllllleeeelLLLLLLLLLEeeee DSSP -------lllhhhllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL---------------------- Query -------lvpydelpeeEKEYDRNTAXNTIKXVKKLGF---------------------- 92 ident | Sbjct ccnqffvldvvinfrrlSEGDLFTQLRKIVKMASNEDErlppiglltsdgrsewakartv 240 DSSP elleeeeeeleelleelLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLllllhhhhhhllhhhhhhhhhh DSSP ----------------------llLLLL-------------------------------- Query ----------------------riEKED-------------------------------- 98 ident Sbjct llkdstnrdsldmierciclvcldGPGTgelsdthralqllhgggcslnganrwydkslq 300 DSSP hlllhhhhhhhhhhhlllleeeelLLLLllllhhhhhhhhhhllllllllllllllllee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 98 ident Sbjct fvvgrdgtcgvvcehspfdgivlvqctehllkhmmtsnkklvradsvselpaprrlrwkc 360 DSSP eeellllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllleelllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 98 ident Sbjct spetqghlassaeklqrivknldfivykfdnygktfikkqkyspdgfiqvalqlayyrly 420 DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeeeeeellllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 98 ident Sbjct qrlvptyesasirrfqegrvdnirsatpealafvqamtdhkaampaseklqllqtamqaq 480 DSSP llllleeeeeelllllllleeeellllhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 98 ident Sbjct teytvmaitgmaidnhllalrelardlckeppemfmdetylmsnrfvlstsqvpttmemf 540 DSSP hhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhlhhhhhhlllleeeeellllllee DSSP --------------------------------------------------------- Query --------------------------------------------------------- 98 ident Sbjct ccygpvvpngygacynpqpeaitfcissfhscketssvefaeavgaslvdmrdlcss 597 DSSP eelllllllleeeeeeelllleeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ----------------------lLLLL--lllllLLLLL--------------------- Query ----------------------aNKLD--yipepXDLSL--------------------- 15 ident | | Sbjct mwfrnllvyrltqdlqldadsleKALGeksarpcASQELttygftapfgkgpdaplvhvs 60 DSSP lllllleeeeelllllllhhhhhHHHHlllllllLLLLLeeeeellllllllllllleee DSSP ------------LLLLhhhHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHlllleellllllllleellll Query ------------VDLPeslIQLSERIAENVHEVWAKARIdegwtygekrddihkkhpclv 63 ident || Sbjct qdfflisarkeeRILP---GSVVRDALKEKVDEIEAQQM--------------------- 96 DSSP lleeeeeeeeeeELLL---HHHHHHHHHHHHHHHHLLLL--------------------- DSSP lhhHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------------------------------- Query pydELPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKK---------------------------------- 89 ident | | Sbjct --rKVYKKERDQLKDEIVQTLLPRAFirrsstfaaiapslglilvdsasakkaedllstl 154 DSSP --lLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLeeeeeeeeeeehhhleeeellllhhhhhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 89 ident Sbjct realgslpvrplsvkvaptatltdwvktqeaagdfhvldecelrdthedggvvrckrqdl 214 DSSP hhhhlllleeellllllhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeeellllllleeeeellll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 89 ident Sbjct tseeiqlhltagklvtqlslawsdklsfvlddklavkrlrfedllqeqaekdggedalgq 274 DSSP llhhhhhhhhllleeeeeeeeellleeeeeelllleeeeeelhhhhhhhhhhhlllhhhh DSSP -----------------------lllllllll Query -----------------------lgfrieked 98 ident Sbjct ldasftlmmltfaeflpalfealggeeipqgv 306 DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllll
DSSP -------LLLLL------------------------------------------------ Query -------ANKLD------------------------------------------------ 5 ident Sbjct kklipilEKIPEvelpvkeitfkeklkwtgivlvlyfimgcidvytagaqipaifggtli 60 DSSP lllhhhhHHLLLlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhlll DSSP -------------------llLLLLL---------------------------------- Query -------------------yiPEPXD---------------------------------- 12 ident | Sbjct tlgigpivtagiimqllvgsgIIQMDlsipenralfqgcqkllsiimcfveavlfvgaga 120 DSSP lhhhlhhhhhhhhhhhhllllLLLLLlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 12 ident Sbjct fgiltpllaflviiqiafgsiiliyldeivskygigsgiglfiaagvsqtifvgalgpeg 180 DSSP lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll DSSP -----------------------------------------------------llllllL Query -----------------------------------------------------lslvdlP 19 ident Sbjct ylwkflnsliqgvpnieyiapiigtiivflmvvyaecmrveiplahgrikgavgkypikF 240 DSSP hhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeellllllllllllleeelL DSSP HHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL------LLEEllllllllLEEL--LLLL------- Query ESLIQLSERIAENVHEVWAKARIDE------GWTYgekrddihKKHP--CLVP------- 64 ident | | Sbjct VYVSNIPVILAAALFANIQLWGLALyrmgipILGH--yeggraVDGIayYLSTpyglssv 298 DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllllllLLLL--llllllLLLHhhHLLLlllllll DSSP -----hhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHLL--------------------------- Query -----ydeLPEEEKEYDRNTAXNTIKX-VKKLG--------------------------- 91 ident Sbjct isdpihaiVYMIAMIITCVMFGIFWVEtTGLDPksmakrigslgmaikgfrksekaiehr 358 DSSP lllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlLLLLHhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhh DSSP ---------------------------------------lllLLLL-------------- Query ---------------------------------------friEKED-------------- 98 ident Sbjct lkryippltvmssafvgflatianfigalgggtgvlltvsivYRMYeqllrekvselhpa 418 DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhHHHHhhhhhhhhhlllll DSSP ---- Query ---- 98 ident Sbjct iakl 422 DSSP llll
DSSP --------LLLL---------------------llLLLL--------------------- Query --------ANKL---------------------dyIPEP--------------------- 10 ident Sbjct nlyfqsmeLAVGidlgttyscvgvfqqgrveilanDQGNrttpsyvaftdterlvgdaak 60 DSSP lhhhhhllLLEEeelllleeeeeeeelleeeelllLLLLlleelleeelllleeelhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 10 ident Sbjct sqaalnphntvfdakrligrkfadttvqsdmkhwpfrvvseggkpkvrvcyrgedktfyp 120 DSSP hlllllhhheellhhhllllllllhhhhhhhllllleeeeelleeeeeeeelleeeeelh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 10 ident Sbjct eeissmvlskmketaeaylgqpvkhavitvpayfndsqrqatkdagaiaglnvlriinep 180 DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeehh DSSP ------------------------------------------lllllllllhHHHLLHHH Query ------------------------------------------xdlslvdlpeSLIQLSER 28 ident | Sbjct taaaiaygldrrgagernvlifdlgggtfdvsvlsidagvfevkatagdthlGGEDFDNR 240 DSSP hhhhhhlllllllllleeeeeeeelllleeeeeeeeelleeeeeeeeeelllLHHHHHHH DSSP HHHHHHHHHHHHHHlllleellllllllleellLLLHhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH Query IAENVHEVWAKARIdegwtygekrddihkkhpcLVPYdeLPEEEKEYDRNTAXNTIKXVK 88 ident | | Sbjct LVNHFMEEFRRKHG-------------------KDLS--GNKRALRRLRTACERAKRTLS 279 DSSP HHHHHHHHHHHHHL-------------------LLLL--LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL DSSP HLL--------------------------------------------------------- Query KLG--------------------------------------------------------- 91 ident Sbjct SSTqatleidslfegvdfytsitrarfeelcsdlfrstlepvekalrdakldkaqihdvv 339 DSSP LLLeeeeeeeeeelleeeeeeeehhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhllllhhhlleee DSSP -----lLLLLL------------------------------------l Query -----fRIEKE------------------------------------d 98 ident || | Sbjct lvggstRIPKVqkllqdffngkelnksinpdeavaygaavqaavlmgd 387 DSSP eelhhhHLHHHhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhll
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DSSP lllllllllllllllllllhhhhllhhhHHHHHHHHHHHHHHLLLleellllllLLLE-- Query ankldyipepxdlslvdlpesliqlserIAENVHEVWAKARIDEGwtygekrddIHKK-- 58 ident | Sbjct --------------gssgssgnapkrppSGFFLFCSEFRPKIKST-------npGISIgd 39 DSSP --------------llllllllllllllLHHHHHHHHHHHHHHHH-------llLLLHhh DSSP -ELLL-LLHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlllll Query -HPCL-VPYDELPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLGFRieked 98 ident | | || | | Sbjct vAKKLgEMWNNLNDSEKQPYITKAAKLKEKYEKDVADykskg 81 DSSP hHHHHhHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhllll
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DSSP --------------llllllllllllllllLLLHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLll Query --------------ankldyipepxdlslvDLPESLIQLSERIAENVHEVWAKARIDEgw 46 ident | Sbjct vsqsqrlehnwnkffasfvpnlikknpqskQFDHENIKQCAKDIVKILTTKELKKDSS-- 58 DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL-- DSSP eellllllllleelllllhhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllllll Query tygekrddihkkhpclvpydeLPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLGFrieked 98 ident | | || Sbjct ------------rappddltkGKRHKVKEFINSYMDKIILKKKQKK-----a 93 DSSP ------------llllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----l
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DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct earsllnpsnaptryaersvgpfslaaiwfamaiqvaifiaagqmtssfqvwqvivaiaa 60 DSSP llllllllllllllhhhllllhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhh DSSP -----------------------------llllllllllllllllllLHHHHLLHHHHHH Query -----------------------------ankldyipepxdlslvdlPESLIQLSERIAE 31 ident | Sbjct gctiavillfftqsaairwginftvaarmpfgirgslipitlkallsLFWFGFQTWLGAL 120 DSSP hhhhhhhhhhhhlhhhhhhlllhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHHHHHHHHlllleellllllllleelllllhhhllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL Query NVHEVWAKARIdegwtygekrddihkkhpclvpydelpeeEKEYDRNTAXNTIKXVKKLG 91 ident | | Sbjct ALDEITRLLTG---------------------------ftNLPLWIVIFGAIQVVTTFYG 153 DSSP HHHHHHHHHHL---------------------------llLHHHHHHHHHHHHHHHHLLH DSSP L----------------------------------------------------------- Query F----------------------------------------------------------- 92 ident Sbjct Itfirwmnvfaspvllamgvymvylmldgadvslgevmsmggenpgmpfstaimifvggw 213 DSSP Hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhlllllllllllhhhhhhhhhlll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 92 ident Sbjct iavvvsihdivkeckvdpnasregqtkadaryataqwlgmvpasiifgfigaasmvlvge 273 DSSP hhhhlllhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll DSSP -------------------------------------lLLLL------------------ Query -------------------------------------rIEKE------------------ 97 ident Sbjct wnpviaitevvggvsipmailfqvfvllatwstnpaanLLSPaytlcstfprvftfktgv 333 DSSP llhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhLHHHhhhhhhhllllllhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 97 ident Sbjct ivsavvgllmmpwqfagvlntflnllasalgplagimisdyflvrrrrislhdlyrtkgi 393 DSSP hhhhhhhhhllhhhlhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 97 ident Sbjct ytywrgvnwvalavyavalavsfltpdlmfvtgliaalllhipamrwvaktfplfseaes 453 DSSP llllllllhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhh DSSP ---------l Query ---------d 98 ident Sbjct rnedylrpig 463 DSSP hhhhhhllll
DSSP LLLLLLLllllllllllllhhhhllhhhHHHHHHHHHHHHHHLLLLeelllllllLLEE- Query ANKLDYIpepxdlslvdlpesliqlserIAENVHEVWAKARIDEGWtygekrddiHKKH- 59 ident | | Sbjct GSSGSSG---kpsqeggkggsekpkrpvSAMFIFSEEKRRQLQEER--------pELSEs 49 DSSP LLLLLLL---llllllllllllllllllLHHHHHHHHLHHHHHHHL--------lLLLHh DSSP ----lllLLHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllLLLLLL-- Query ----pclVPYDELPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKklgfRIEKED-- 98 ident | | | | Sbjct eltrllaRMWNDLSEKKKAKYKAREAALKAQSE----RKSGPSsg 90 DSSP hhhhhhhHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLL----LLLLLLll
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DSSP lllllllllllllllLLLL-HHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLllleellllllllleE Query ankldyipepxdlslVDLP-ESLIQLSERIAENVHEVWAKARIDegwtygekrddihkkH 59 ident | | | Sbjct ------glsdgewqlVLNVwGKVEADVAGHGQEVLIRLFKGHPE-------tlekfdkfK 47 DSSP ------lllhhhhhhHHHHhHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHLHH-------hhhhlhhhL DSSP LLLLL--HHHLlHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL-------------------------- Query PCLVP--YDELpEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLG-------------------------- 91 ident | | || | Sbjct HLKSEdeMKAS-EDLKKVGNTHLTALGGILKKKGhheaeltplaqshatkhkipvkylef 106 DSSP LLLLHhhHHHL-HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLllhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhh DSSP ------------lllLLLL---------------------------- Query ------------friEKED---------------------------- 98 ident Sbjct iseaiiqvlqskhpgDFGAdaqgamskalelfrndmaakykelgfqg 153 DSSP hhhhhhhhhhhhlllLLLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
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DSSP llllllllllllllllllLHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLllleellllllllleEL Query ankldyipepxdlslvdlPESLIQLSERIAENVHEVWAKARIDegwtygekrddihkkHP 60 ident | Sbjct ------mnsdevqlikktWEIPVATPTDSGAAILTQFFNRFPS-------nlekfpfrDV 47 DSSP ------llhhhhhhhhhhHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHLHH-------hhhhllllLL DSSP LL-LLHHhlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL---------------------------- Query CL-VPYDelPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLG---------------------------- 91 ident | || Sbjct PLeELSG--NARFRAHAGRIIRVFDESIQVLGqdgdlekldeiwtkiavshiprtvskes 105 DSSP LHhHHHH--LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhh DSSP ------------lllLLLL----------------------------- Query ------------friEKED----------------------------- 98 ident | Sbjct ynqlkgvildvltaaSSLDesqaatwaklvdhvyaiifkaidddgnak 153 DSSP hhhhhhhhhhhhhhhLLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllll
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DSSP --llllllllllllllllllLHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHlllleellllllllle Query --ankldyipepxdlslvdlPESLIQLSERIAENVHEVWAKARIdegwtygekrddihkk 58 ident | | Sbjct ssglvprgshmnlkqiakdtAKTLQSYLTYQALRTVLAQLGETN--------------pp 46 DSSP llllllllllllhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL--------------hh DSSP elLLLL-------------------hhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLL------ Query hpCLVP-------------------ydeLPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKkLGFR------ 93 ident | | Sbjct laLWLHnfsagkvqdgekyieelflekpDLALRIMTVREHIAEEIAEFL-PEMVvtgiqq 105 DSSP hhHHHHhhhllllllhhhhhhhhhhhlhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHhhhhhh DSSP -----lllll Query -----ieked 98 ident Sbjct anmekrrqhl 115 DSSP hhhhhhhhll
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DSSP llllllllllllllllllLHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHlllleellllllllleel Query ankldyipepxdlslvdlPESLIQLSERIAENVHEVWAKARIdegwtygekrddihkkhp 60 ident | | Sbjct ---------qtkhiaqatVKVLQSYLTYQAVLRIQSELGETN--------------ppqa 37 DSSP ---------lhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL--------------hhhh DSSP LLLL--------------------hhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLL------ Query CLVP--------------------ydeLPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKkLGFRI------ 94 ident | | Sbjct IWLNqylashsiqngetfltelldenkELVLRILAVREDIAESVLDFL-PGMTRnslaes 96 DSSP HHHHhhhhhlllllhhhhhhhhllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHhhhhhh DSSP -----------------------llll Query -----------------------eked 98 ident Sbjct niahrrhllerltrtvaevdnfpsets 123 DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll
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DSSP llllllllllllllllllLHHHHL-----LHHHHHHHHHHHHHHHHHLllleelllllll Query ankldyipepxdlslvdlPESLIQ-----LSERIAENVHEVWAKARIDegwtygekrddi 55 ident | | | Sbjct ----dccsyedrreirhiWDDVWSssftdRRVAIVRAVFDDLFKHYPT------------ 44 DSSP ----llllhhhhhhhhhhHHHHLLllllhHHHHHHHHHHHHHHHHLHH------------ DSSP lleELLL-llHHHL-LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL---------------------- Query hkkHPCL-vpYDEL-PEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLG---------------------- 91 ident || | | | | Sbjct -skALFErvkIDEPeSGEFKSHLVRVANGLKLLINLLDdtlvlqshlghladqhiqrkgv 103 DSSP -hhHHHLlllLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhlllll DSSP -------------------lllLLLL------------------ Query -------------------friEKED------------------ 98 ident | Sbjct tkeyfrgigeafarvlpqvlscFNVDawnrcfhrlvariakdlp 147 DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLLHHhhhhhhhhhhhhhlllll
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DSSP llllllllllllllLLLL--LHHHHL---LHHHHHHHHHHHHHHHHHLllleelllllll Query ankldyipepxdlsLVDL--PESLIQ---LSERIAENVHEVWAKARIDegwtygekrddi 55 ident | | Sbjct ------avltqtqiDSILadLAHHTDtteHITEMGVSIYKTLFAAHPE------yisyfs 48 DSSP ------llllhhhhHHHHhhHHHHLLlhhHHHHHHHHHHHHHHHHLHH------hhhhlh DSSP llEELL-LLLHhHLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL----------------------- Query hkKHPC-LVPYdELPEeEKEYDRNTAXNTIKXVKKLG----------------------- 91 ident | | | | Sbjct klQGLTkDNVG-QSEG-IRYYGRTLGEELIRLLKAASnpsvleerivqgakdhkarpvtk 106 DSSP hhLLLLlLLHH-HLLH-HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlhhhhhhhhhhhhhhhllllllh DSSP -------------lllLLLL---------------------- Query -------------friEKED---------------------- 98 ident Sbjct dqftgaapifikffqgLLKKqedkdaiekfllhvmqaiaakm 148 DSSP hhhhhlhhhhhhhhhhHLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
DSSP lllllllllllllllllLLHHHH--LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLllleellllllllle Query ankldyipepxdlslvdLPESLI--QLSERIAENVHEVWAKARIDegwtygekrddihkk 58 ident | Sbjct ----vcnrleqilvktqWAQSYGeaENRAAFSRDLFSELFNIQGS-------------sr 43 DSSP ----lllhhhhhhhhhhHHHHHLllLLHHHHHHHHHHHHHHLLHH-------------hh DSSP ELLL----LLHHhlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL----------------------- Query HPCL----VPYDelPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLG----------------------- 91 ident | Sbjct ALFSgvgvDDMN--SAAFTAHCLRVTGALNRLISQLDqqatinadlahlagqhasrnlda 101 DSSP HHHLllllLLLL--LHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlhhhhhhhhhhhhhhlllllllh DSSP -------------lllLLLL------------------- Query -------------friEKED------------------- 98 ident Sbjct snfaamgqavmsvvptHLDCfnqhawgecyeriasgisg 140 DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhHLLLllhhhhhhhhhhhhhhlll
DSSP ---------lllllLLLL----llLLLLLLL----------------------------l Query ---------ankldYIPE----pxDLSLVDL----------------------------p 19 ident Sbjct pvqhvggtythiplSPRTlnawvkLVEEKKFgaevvpgfqalsegctpydinqmlncvgd 60 DSSP leeeelleeeelllLHHHhhhhhhHHHHHLLlllhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhllll DSSP HHHHLL-HHHHHHHHHHHHHHHHHLllleellllLLLL-lEELLL--LLHHH-------- Query ESLIQL-SERIAENVHEVWAKARIDegwtygekrDDIH-kKHPCL--VPYDE-------- 67 ident | | Sbjct HQAAMQiIREIINEEAAEWDVQHPI-------pgPLPAgqLREPRgsDIAGTtstveeqi 113 DSSP LHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHLLLL-------llLLLLllLLLLLhhHHLLLlllhhhhh DSSP ----------lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllllll Query ----------lPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKklgfrieked 98 ident Sbjct qwmfrpqnpvpVGNIYRRWIQIGLQKCVRMY---------- 144 DSSP hhhhlllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL----------
DSSP llllllllllllllLLLL--LHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLllleellllllllle Query ankldyipepxdlsLVDL--PESLIQLSERIAENVHEVWAKARIDegwtygekrddihkk 58 ident | | | | Sbjct -----------adfDAVLkxWGPVEADYTTIGGLVLTRLFKEHPE------tqklfpkfa 43 DSSP -----------lhhHHHHllLHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHLHH------hhlllllll DSSP ELLL-LLHHhlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL-------------------------- Query HPCL-VPYDelPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLG-------------------------- 91 ident | | Sbjct GIAQaDIAG--NAAVSAHGATVLKKLGELLKAKGshaailkplanshatkhkipinnfkl 101 DSSP LLLHhHLLL--LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhh DSSP ----------lllLLLL---------------------------- Query ----------friEKED---------------------------- 98 ident Sbjct isevlvkvmqekaGLDAggqtalrnvmgiiiadleanykelgfsg 146 DSSP hhhhhhhhhhhhlLLLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
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DSSP --------------------------------------------llllllllllllllll Query --------------------------------------------ankldyipepxdlslv 16 ident Sbjct ntiqqlmmilnsasdqpsenlisyfnnctvnpkesilkrvkdigyifkekfakavgqgcv 60 DSSP lhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll DSSP llLHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHhlllleellllllllleELLLllhhhlLHHHHHHH Query dlPESLIQLSERIAENVHEVWAKARidegwtygekrddihkkHPCLvpydelPEEEKEYD 76 ident | | | | | | Sbjct eiGSQRYKLGVRLYYRVMESMLKSE---------------nfSKLL-----nDNIFHMSL 100 DSSP hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL---------------lhHHHH-----hLHHHHHHH DSSP HHHHHHHHHHHHH----------------------------------------------- Query RNTAXNTIKXVKK----------------------------------------------- 89 ident | Sbjct LACALEVVMATYSfpwilnvlnlkafdfykviesfikaegnltremikhlercehrimes 160 DSSP HHHHHHHHHHHLLllhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhl DSSP --------lllllllll Query --------lgfrieked 98 ident Sbjct lawlsdsplfdlikqsk 177 DSSP hhhllllhhhhhhhhhl
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DSSP llllllLLLLlllllllllHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHlllleellllllllleel Query ankldyIPEPxdlslvdlpESLIQLSERIAENVHEVWAKARIdegwtygekrddihkkhp 60 ident | Sbjct ------QRVK--rllsitnDKHDEYLTEMVPLLVEFAKDECH--------------npfi 38 DSSP ------LLLH--hhhllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL--------------llll DSSP llllhHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHLLLLLL----------------------ll Query clvpyDELPEEEKEYDRNTAXNTIKXV-KKLGFRIE----------------------ke 97 ident | | Sbjct dkdgnESIPSGVLIFVAKAAQFYMTNAgLTGRSMDTvsynfateipstilkklnpyrkma 98 DSSP lllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHlLLLLLLLLllllllllllllhhhlllllllll DSSP l Query d 98 ident Sbjct r 99 DSSP l
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DSSP ----------------------LLLLLL-----LLLL----------------------- Query ----------------------ANKLDY-----IPEP----------------------- 10 ident | Sbjct mstpfgldlgnnnsvlavarnrGIDIVVnevsnRSTPsvvgfgpknrylgetgknkqtsn 60 DSSP lleeeeeeellleeeeeeeellEEEELLlllllLLEElleeelllleeelhhhhhhllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 10 ident Sbjct ikntvanlkriigldyhhpdfeqeskhftsklvelddkktgaevrfagekhvfsatqlaa 120 DSSP hhheellhhhllllllllllhhhhhllllleeeellllleeeeeeelleeeeeehhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 10 ident Sbjct mfidkvkdtvkqdtkanitdvciavppwyteeqryniadaariaglnpvrivndvtaagv 180 DSSP hhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeehhhhhhh DSSP ------------------------------------------lllllllllhHHHLLHHH Query ------------------------------------------xdlslvdlpeSLIQLSER 28 ident Sbjct sygifktdlpegeekprivafvdighssytcsimafkkgqlkvlgtacdkhfGGRDFDLA 240 DSSP hhhhhllllllllllleeeeeeeelllleeeeeeeeelleeeeeeeeeelllLHHHHHHH DSSP HHHHHHHHHHHHHhlllleellllllllleelllLLHHhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH Query IAENVHEVWAKARidegwtygekrddihkkhpclVPYDeLPEEEKEYDRNTAXNTIKXVK 88 ident | | | | Sbjct ITEHFADEFKTKY--------------------kIDIR-ENPKAYNRILTAAEKLKKVLS 279 DSSP HHHHHHHHLLLLL--------------------lLLLL-LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL DSSP HLL--------------------------------------------------------- Query KLG--------------------------------------------------------- 91 ident Sbjct ANTnapfsvesvmndvdvssqlsreeleelvkpllervtepvtkalaqaklsaeevdfve 339 DSSP LLLeeeeeelllllllleeeeeehhhhhhhhllhhhllhhhhhhhhhhllllhhhlleee DSSP ------llLLLLL----------------------------------------------- Query ------frIEKED----------------------------------------------- 98 ident Sbjct iiggttriPTLKQsiseafgkplsttlnqdeaiakgaaficaihsptlrvrpfkfedihp 399 DSSP eelhhhhlHHHHHhhhhhhllleelllllllhhhhhhhhhhhhlllleeellleeeeeel DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 98 ident Sbjct ysvsyswdkqvededhmevfpagssfpstklitlnrtgdfsmaasytditqlppntpeqi 459 DSSP lleeeeelllllllleeeeellleeeleeeeeeellllleeeeeeellhhhlllllllee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 98 ident Sbjct anweitgvqlpegqdspvklklrcdpsglhtieeaytiedieveepiplpedapedaeqe 519 DSSP eeeeeellllllllllleeeeeeellllleeeeeeeeeeeeelleeelllllllllllle DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 98 ident Sbjct fkkvtktvkkddltivahtfgldakklneliekenemlaqdklvaetedrkntleeyiyt 579 DSSP eelleeeeeeeeleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 98 ident Sbjct lrgkleeeyapfasdaektklqgmlnkaeewlydegfdsikakyiakyeelaslgniirg 639 DSSP hhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh DSSP --------- Query --------- 98 ident Sbjct rylakeeek 648 DSSP hhhllllll
DSSP lllllllllllllllllLLHHHHL--LHHHHHHHHHHHHHHHHHLllleellllllllle Query ankldyipepxdlslvdLPESLIQ--LSERIAENVHEVWAKARIDegwtygekrddihkk 58 ident Sbjct ----acamlerakvkdeWAKAYGIgaARSKFGDALWRNVFNYAPN-------------ar 43 DSSP ----lllhhhhhhhhhhHHHHHLLlhHHHHHHHHHHHHHHHHLHH-------------hh DSSP ELLL--llhHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL------------------------- Query HPCL--vpyDELPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLG------------------------- 91 ident | | | | Sbjct DIFEsvnskDMASPEFKAHIARVLGGLDRVISMLDnqatldadlahlksqhdprtidpvn 103 DSSP HHHHhhlllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhh DSSP -----------------------------------lllllll Query -----------------------------------frieked 98 ident Sbjct fvvfrkaliatvagtfgvcfdvpawqgcyniiakgitgsdaa 145 DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
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DSSP lllllllllllllllLLLLhhhhlLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEellllllllleel Query ankldyipepxdlslVDLPesliqLSERIAENVHEVWAKARIDEGWTygekrddihkkhp 60 ident | | Sbjct --------vdkvaavVNNG----vVLESDVDGLMQSVKLNAAQARQQ------------- 35 DSSP --------llleeeeELLE----eEEHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL------------- DSSP llllhhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL---------------------------- Query clvpydeLPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLGF---------------------------- 92 ident Sbjct -----lpDDATLRHQIMERLIMDQIILQMGQKmgvkisdeqldqaianiakqnnmtldqm 90 DSSP -----llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllllhhhhhhhhhhhhhhllllhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 92 ident Sbjct rsrlaydglnyntyrnqirkemiisevrnnevrrritilpqeveslaqqvgnqndastel 150 DSSP hhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhllllllle DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 92 ident Sbjct nlshiliplpenptsdqvneaesqaraivdqarndfgklaiahsadqqalnggqmgwgri 210 DSSP eeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhlllllllllllleeeeell DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 92 ident Sbjct qelpgifaqalstakkgdivgpirsgvgfhilkvndlaaqkdrayrmlmnrkfseeaasw 270 DSSP llllhhhhhhhllllllleeeeeeelleeeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh DSSP --------llllll Query --------rieked 98 ident Sbjct mqeqrasayvkils 284 DSSP hhhhhhllleeell
DSSP lllllllllllllLLLL--LLHHHHLLHHHHHHHHHHHHHhhhhlllleellllllllle Query ankldyipepxdlSLVD--LPESLIQLSERIAENVHEVWAkaridegwtygekrddihkk 58 ident | Sbjct -------------GVRKgwHEHVTQDLRSHLVHKLVQAIF-------------------- 27 DSSP -------------LLLLllHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHL-------------------- DSSP elLLLLhHHLL----HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllLLLL------------------- Query hpCLVPyDELP----EEEKEYDRNTAXNTIKXVkklgFRIE------------------- 95 ident | | | | Sbjct -pTPDP-AALKdrrmENLVAYAKKVEGDMYESA----NSRDeyyhllaekiykiqkelee 81 DSSP -lLLLH-HHHHlhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHL----LLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhll DSSP ---lll Query ---ked 98 ident Sbjct krrsrl 87 DSSP llllll
DSSP lllllllllllllllllllhhhhlLHHHHHHHHHHHHHhhhhlllleellllllllleel Query ankldyipepxdlslvdlpesliqLSERIAENVHEVWAkaridegwtygekrddihkkhp 60 ident | Sbjct ---------------gxadkiaivNXGSLFQQVAQKTG---------------------v 24 DSSP ---------------llllleeeeLHHHHHHHHHHHHL---------------------l DSSP LLLL-hhhlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL-LLLLLL---------------------- Query CLVP-ydelPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKL-GFRIEK---------------------- 96 ident || | | Sbjct SNTLerarrSNEERGKLVTRIQTAVKSVANSqDIDLVVdanavaynssdvkditadvlkq 84 DSSP LLLLllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlLLLEEEehhheeeelllllllhhhhhhh DSSP ll Query ed 98 ident Sbjct vk 86 DSSP ll
DSSP lllllllllllllllllllhhhhlLHHHHHHHHHHHHHHHHhlllleellllllllleel Query ankldyipepxdlslvdlpesliqLSERIAENVHEVWAKARidegwtygekrddihkkhp 60 ident | Sbjct --------------------rpkvTKSDIVDQIALNIKNNN------------------- 21 DSSP --------------------lleeEHHHHHHHHHHHHHHLL------------------- DSSP llllhhhllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL----------------------------- Query clvpydelpeeEKEYDRNTAXNTIKXVKKLG----------------------------- 91 ident || | | | Sbjct --------lklEKKYIRLVIDAFFEELKSNLcsnnviefrsfgtfevrkrkgrlnarnpq 73 DSSP --------lllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhllleeeellleeeeeeeellllllllll DSSP -----------lLLLLLL----------- Query -----------fRIEKED----------- 98 ident Sbjct tgeyvkvldhhvAYFRPGkdlkervwgik 102 DSSP llllllllleeeEEEEELhhhhhhhhlll
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DSSP -------lllllllllllllLLLL-lLHHHhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEellll Query -------ankldyipepxdlSLVD-lPESLiQLSERIAENVHEVWAKARIDEGWTygekr 52 ident ||| | | | Sbjct miekillvqtlkrlprmgwlIKGVqePESI-ADHSFGVAFITLVLADVLEKRGKR----- 54 DSSP lhhhhhhhhhhhllllhhhhHLLLllLLLH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL----- DSSP llllleelLLLLHHHL-------------------------------------------- Query ddihkkhpCLVPYDEL-------------------------------------------- 68 ident Sbjct -------iDVEKALKMaivhdlaeaiitdiplsaqefvdkdkaealvfkkvfpefyelyr 107 DSSP -------lLHHHHHHHhhhllllhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhh DSSP --------lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL--------------------------- Query --------pEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLGFR--------------------------- 93 ident | Sbjct eyqecsspeAQLVRIADKLDMILQAYQYELSGNknldefweaieeikrlelskylediln 167 DSSP hhhhlllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlllhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhh DSSP -lllll Query -ieked 98 ident Sbjct svgrlk 173 DSSP hhhlll
DSSP ---------------------lllllllllllllllLLLL-HHHHLLHHHHHHHHHHHHH Query ---------------------ankldyipepxdlslVDLP-ESLIQLSERIAENVHEVWA 38 ident || || Sbjct mktpiteaiaaadnqgrflsntelqavngryqraaaSLEAaRSLTSNAERLINGAAQAVY 60 DSSP lllhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhHHHHHLHHHHHHHHHHHHH DSSP HHHHlllleELLLLllllleELLLllhhHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL------- Query KARIdegwtYGEKRddihkkHPCLvpydELPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLG------- 91 ident | Sbjct SKFP--ytsQMPGP------QYAS--saVGKAKCARDIGYYLRMVTYCLVVGGtgpmdey 110 DSSP HHLL--hhhHLLLL------LLLL--lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlhhhhhh DSSP ---------------------------lllLLLL------------------ Query ---------------------------friEKED------------------ 98 ident Sbjct liagleeinrtfdlspswyvealnyikanhGLSGqaaneantyidyainals 162 DSSP llllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhlLLLHhhhhhhhhhhhhhhhhhl
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DSSP llLLLLL------llllllllLLLL-HHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLllleelllll Query anKLDYI------pepxdlslVDLP-ESLIQLSERIAENVHEVWAKARIDegwtygekrd 53 ident | | Sbjct --GATQSfqsvgdltpaekdlIRSTwDQLMTHRTGFVADVFIRIFHNDPT-----aqrkf 53 DSSP --LLLLLllllllllhhhhhhHHHHhHHHLLLLHHHHHHHHHHHLLLLLL-----lllll DSSP llllEELLLLLHHhlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL---------------------- Query dihkKHPCLVPYDelPEEEKEYDRNTAXNTIKXVKKLG---------------------- 91 ident Sbjct pqmaGLSPAELRT--SRQMHAHAIRVSALMTTYIDEMDtevlpellatltrthdknhvgk 111 DSSP llllLLLLLLLLL--LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlllhhhhhhhhhhhhhhhlllh DSSP ----------------------------------------lllllll Query ----------------------------------------frieked 98 ident Sbjct knydlfgkvlmeaikaelgvgftkqvhdawaktfaivqgvlitkhas 158 DSSP hhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
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