Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition.
The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure, to pre-computed structural neighbours in the Dali Database,
and to the PDB format coordinate file where the neighbour
is superimposed onto the query structure.
Expand gaps
Summary
No: Chain Z rmsd lali nres %id PDB Description
1: 2cgj-A 4.4 3.5 79 479 10 PDB MOLECULE: L-RHAMNULOSE KINASE;
2: 1ikt-A 3.5 3.5 83 115 14 PDB MOLECULE: ESTRADIOL 17 BETA-DEHYDROGENASE 4;
3: 3bkr-A 3.4 3.7 84 119 13 PDB MOLECULE: STEROL CARRIER PROTEIN-2 LIKE-3;
4: 2d0o-A 3.3 3.2 69 606 16 PDB MOLECULE: DIOL DEHYDRATASE-REACTIVATING FACTOR LARGE
5: 3fg7-A 3.1 3.3 78 106 8 PDB MOLECULE: VILLIN-1;
6: 2qzt-B 3.1 3.2 73 110 14 PDB MOLECULE: STEROL CARRIER PROTEIN 2-LIKE 2;
7: 3kk7-A 3.1 3.8 73 502 5 PDB MOLECULE: PUTATIVE CELL INVASION PROTEIN WITH MAC/PERFORIN
8: 2cfz-A 3.0 3.3 78 629 15 PDB MOLECULE: SDSA1;
9: 2gpi-A 2.9 5.2 65 91 8 PDB MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;
10: 1pz4-A 2.9 3.5 76 113 13 PDB MOLECULE: STEROL CARRIER PROTEIN 2;
11: 1e4g-T 2.8 4.0 93 380 11 PDB MOLECULE: CELL DIVISION PROTEIN FTSA;
12: 3c7n-A 2.8 3.5 64 648 14 PDB MOLECULE: HEAT SHOCK PROTEIN HOMOLOG SSE1;
13: 3d2e-A 2.8 4.2 71 629 10 PDB MOLECULE: HEAT SHOCK PROTEIN HOMOLOG SSE1;
14: 1m2v-B 2.7 3.9 77 748 9 PDB MOLECULE: PROTEIN TRANSPORT PROTEIN SEC23;
15: 2re2-B 2.7 3.8 68 120 7 PDB MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN TA1041;
16: 1usi-A 2.7 3.7 63 346 6 PDB MOLECULE: LEUCINE-SPECIFIC BINDING PROTEIN;
17: 1ig8-A 2.7 3.9 79 469 10 PDB MOLECULE: HEXOKINASE PII;
18: 1ewr-B 2.7 4.1 81 529 5 PDB MOLECULE: DNA MISMATCH REPAIR PROTEIN MUTS;
19: 2o8e-B 2.6 3.9 90 935 8 PDB MOLECULE: DNA MISMATCH REPAIR PROTEIN MSH2;
20: 1m4j-A 2.5 3.2 70 133 10 PDB MOLECULE: A6 GENE PRODUCT;
21: 3cb5-A 2.5 3.2 66 444 15 PDB MOLECULE: FACT COMPLEX SUBUNIT SPT16;
22: 2e88-A 2.5 5.0 67 381 13 PDB MOLECULE: HEAT SHOCK 70KDA PROTEIN 1A;
23: 1d0n-A 2.4 3.7 76 729 5 PDB MOLECULE: HORSE PLASMA GELSOLIN;
24: 1noy-B 2.4 4.2 100 346 6 PDB MOLECULE: PROTEIN (DNA POLYMERASE (E.C.2.7.7.7));
25: 3bit-A 2.4 3.5 66 447 3 PDB MOLECULE: FACT COMPLEX SUBUNIT SPT16;
26: 1qha-A 2.4 4.4 76 903 7 PDB MOLECULE: PROTEIN (HEXOKINASE);
27: 2v7y-A 2.4 3.2 66 504 15 PDB MOLECULE: CHAPERONE PROTEIN DNAK;
28: 1dt9-A 2.4 4.4 71 398 11 PDB MOLECULE: PROTEIN (EUKARYOTIC PEPTIDE CHAIN RELEASE FACTOR
29: 3hm8-A 2.3 4.3 82 441 7 PDB MOLECULE: HEXOKINASE-3;
30: 3f9m-A 2.3 4.4 77 451 6 PDB MOLECULE: GLUCOKINASE;
31: 1wfr-A 2.2 5.3 75 143 16 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN TT1886;
32: 3fg6-H 2.2 3.1 63 306 6 PDB MOLECULE: ADSEVERIN;
33: 1kcq-A 2.2 3.4 71 103 7 PDB MOLECULE: GELSOLIN;
34: 2fl4-A 2.2 3.5 66 147 9 PDB MOLECULE: SPERMINE/SPERMIDINE ACETYLTRANSFERASE;
35: 2p5g-D 2.2 4.3 102 875 9 PDB MOLECULE: DNA POLYMERASE;
36: 3htv-A 2.2 3.3 76 279 8 PDB MOLECULE: D-ALLOSE KINASE;
37: 3kvg-B 2.2 4.5 89 382 11 PDB MOLECULE: HEAT SHOCK 70 (HSP70) PROTEIN;
38: 3b8a-X 2.2 3.4 74 470 8 PDB MOLECULE: HEXOKINASE-1;
39: 3c6a-A 2.2 4.1 78 198 12 PDB MOLECULE: TERMINASE LARGE SUBUNIT;
40: 1bdg-A 2.2 3.5 72 444 8 PDB MOLECULE: HEXOKINASE;
41: 3c65-A 2.2 2.9 69 152 12 PDB MOLECULE: UVRABC SYSTEM PROTEIN C;
42: 1yuw-A 2.2 3.4 67 554 13 PDB MOLECULE: HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN;
43: 3jvp-D 2.2 3.3 59 554 7 PDB MOLECULE: RIBULOKINASE;
44: 2p3r-G 2.2 3.7 73 510 11 PDB MOLECULE: GLYCEROL KINASE;
45: 2w35-A 2.1 4.4 76 223 8 PDB MOLECULE: ENDONUCLEASE V;
46: 1czh-A 2.1 3.7 91 169 10 PDB MOLECULE: FLAVODOXIN;
47: 3fvw-B 2.1 3.9 99 182 9 PDB MOLECULE: PUTATIVE NAD(P)H-DEPENDENT FMN REDUCTASE;
48: 3cqy-A 2.1 3.4 70 370 7 PDB MOLECULE: ANHYDRO-N-ACETYLMURAMIC ACID KINASE;
49: 2mys-A 2.1 5.0 108 800 4 PDB MOLECULE: MYOSIN;
50: 1woq-A 2.1 3.5 71 253 13 PDB MOLECULE: INORGANIC POLYPHOSPHATE/ATP-GLUCOMANNOKINASE;
51: 3gbt-A 2.1 3.9 73 492 12 PDB MOLECULE: GLUCONATE KINASE;
52: 2qm1-B 2.1 3.2 63 325 11 PDB MOLECULE: GLUCOKINASE;
53: 2wpg-A 2.0 5.0 97 625 8 PDB MOLECULE: AMYLOSUCRASE OR ALPHA AMYLASE;
54: 3ga2-A 2.0 3.5 70 237 4 PDB MOLECULE: ENDONUCLEASE V;
55: 2nzt-A 2.0 3.3 65 871 6 PDB MOLECULE: HEXOKINASE-2;
56: 3iuc-C 2.0 3.2 64 388 11 PDB MOLECULE: HEAT SHOCK 70KDA PROTEIN 5 (GLUCOSE-REGULATED
Pairwise Structural Alignments
Notation: three-state secondary structure definitions by DSSP (reduced to H=helix, E=sheet, L=coil) are shown above the amino acid sequence. Structurally equivalent residues are in uppercase, structurally non-equivalent residues (e.g. in loops) are in lowercase. Amino acid identities are marked by vertical bars.
No 1: Query=mol1A Sbjct=2cgjA Z-score=4.4
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DSSP lllLLEEEEEEELLLllllllllllLEEEEEEEEHHHLEEEEEEELL--lleelllllle Query xkkKPFSILFXGIEDyatkgqkgrsDSLIVVTLDPKNKTXKXLSIPR--dtrvqlasktk 58 ident | | Sbjct ---TFRNCVAVDLGA--------ssGRVMLARYERECRSLTLREIHRfnnglhsqngyvt 49 DSSP ---LLEEEEEEEELL--------leEEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEeellleeelleee DSSP ellllLLLLHHHHHHHHHHHhLLLLLEEEEEL---------------------------- Query inaaySKGGKDETVETVENFlQIPIDKYVTVD---------------------------- 90 ident | | || Sbjct wdvdsLESAIRLGLNKVCAA-GIAIDSIGIDTwgvdfvlldqqgqrvglpvayrdsrtng 108 DSSP llhhhHHHHHHHHHHHHHHL-LLLLLEEEEEElllleeeellllleellllllllhhhll DSSP --------------------------------------------------------hhhh Query --------------------------------------------------------fdgf 94 ident Sbjct lmaqaqqqlgkrdiyqrsgiqflpfntlyqlralteqqpeliphiahallmpdyfsyrlt 168 DSSP hhhhhhhhllhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhllllhhhlleeeehhhhhhhhhh DSSP hhhhhhhllllllllllllhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhllleE Query kdvinevggidvvpexhlngeealayadfgrndrqkqilnalidrxsdkiaekasenveT 154 ident Sbjct gkmnweytnatttqlvninsddwdesllawsgankawfgrpthpgnvighwicpqgneiP 228 DSSP llllllhhhhhhhlleelllleelhhhhhhhlllhhhllllllllleeeeeellllleeE DSSP LLL--------------------------------------------------------- Query NIR--------------------------------------------------------- 157 ident Sbjct VVAvashdtasaviasplngsraaylssgtwslmgfesqtpftndtalaanitneggaeg 288 DSSP EELllllhhhhhhhhllllllleeeeeellleeeeeeellllllhhhhhhlleeellhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 157 ident Sbjct ryrvlknimglwllqrvlqerqindlpaliaatqalpacrfiinpnddrfinpdemcsei 348 DSSP leeeeeeelllhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhllllllllllllllhhhlllllhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 157 ident Sbjct qaacremaqpipesdaelarcifdslallyadvlhelaqlrgedfsqlhivgggcqntll 408 DSSP hhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeelhhhhlhhh DSSP ---------------------------hhHHHHHHH--hlLLLL-LLLLeelllleeeee Query ---------------------------itEGLALQQ--iySGFT-SKKIdtlsitgsdly 187 ident | | Sbjct nqlcadacgirviagpveastlgnigiqlMTLDELNnvddFRQVvSTTA----------- 457 DSSP hhhhhhhhlleeeellllhhhhhhhhhhhHHLLLLLlhhhHHHHhHLLL----------- DSSP elllleeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhlll Query lgpnntyyfepdatnlekvrktlqehldyt 217 ident Sbjct --------nlttftpnpdseiahyvalihs 479 DSSP --------lleeellllllhhhhhhhhlll
DSSP ---------------------lLLLLEEEEEEELLLLlllllllLLLEEEEEEEEhhhlE Query ---------------------xKKKPFSILFXGIEDYatkgqkgRSDSLIVVTLDpknkT 39 ident || | Sbjct lqstfvfeeigrrlkdigpevvKKVNAVFEWHITKGG-------NIGAKWTIDLK--sgS 51 DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHLEEEEEEEELLL-------LEEEEEEEEEL--llL DSSP EEEEEElllleelllllleellllllllhhhhhhhhhhhhlLLLLEEEEELHHHHHHHHH Query XKXLSIprdtrvqlasktkinaayskggkdetvetvenflqIPIDKYVTVDFDGFKDVIN 99 ident | | | | Sbjct GKVYQG--------------------------------pakGAADTTIILSDEDFMEVVL 79 DSSP LEEEEL--------------------------------lllLLLLEEEEEEHHHHHHHHL DSSP HHllllllllllllhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhlllllHHHHHH--LLLEELLL Query EVggidvvpexhlngeealayadfgrndrqkqilnalidrxsdkIAEKAS--ENVETNIR 157 ident || Sbjct GK-----------------------------------------lDPQKAFfsGRLKARGN 98 DSSP LL-----------------------------------------lLHHHHHhlLLLEEEEL DSSP hHHHHHHHHHLLLLLLllleelllleeeeeelllleeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhlll Query iTEGLALQQIYSGFTSkkidtlsitgsdlylgpnntyyfepdatnlekvrktlqehldyt 217 ident || | Sbjct iMLSQKLQMILKDYAK-------------------------------------------l 115 DSSP hHHHHHHHHHHHHHLL-------------------------------------------l
DSSP ---------------------lLLLLEEEEEEELLLLlllllllLLLEEEEEEEEhhhlE Query ---------------------xKKKPFSILFXGIEDYatkgqkgRSDSLIVVTLDpknkT 39 ident | Sbjct alktdqildklneklaqvdrskRSFTVILFVHLRQEG-------KVVRSVVLDFN----D 49 DSSP llhhhhlhhhhhhhhhhlllllLLLLLEEEEEEEELL-------EEEEEEEEELL----L DSSP EEEEEELLlleelllllleellllllllhhhHHHHhhHHHL-LLLLEEEEELHHHHhhhh Query XKXLSIPRdtrvqlasktkinaayskggkdeTVETveNFLQ-IPIDKYVTVDFDGFkdvi 98 ident | | | || | | | Sbjct LKISEIEL----------------------aVTST--ADYPaERIDASITIDDNDF---- 81 DSSP LEEEEELL----------------------lLLLL--LLLLhHHLLEEEEEEHHHH---- DSSP hhhllllllllllllhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhHHHLllllhHHHHH--LLLEE-- Query nevggidvvpexhlngeealayadfgrndrqkqilnaLIDRxsdkiAEKAS--ENVET-- 154 ident | Sbjct -----------------------------------ylVATK--etsFAALIeqGKVDItg 104 DSSP -----------------------------------hhHHLL--lllHHHHHhlLLLEEee DSSP LLLH-hHHHHHHHHLlllllllleelllleeeeeelllleeeeeelhhhhhhhhhhhhhh Query NIRI-tEGLALQQIYsgftskkidtlsitgsdlylgpnntyyfepdatnlekvrktlqeh 213 ident | Sbjct NKQAflTLDEKFRNK--------------------------------------------- 119 DSSP LHHHhhHHHHHHLLL--------------------------------------------- DSSP hlll Query ldyt 217 ident Sbjct ---- 119 DSSP ----
DSSP llllLEEEEEEELLlllllllLLLLlEEEEEEEEHhHLEEEEEEElllleelllllleel Query xkkkPFSILFXGIEdyatkgqKGRSdSLIVVTLDPkNKTXKXLSIprdtrvqlasktkin 60 ident | | ||| Sbjct ----MRYIAGIDIG-------NSST-EVALATLDE-AGALTITHS--------------a 33 DSSP ----LEEEEEEEEL-------LLEE-EEEEEEELL-LLLEEEEEE--------------e DSSP lLLLL---------LLHHHHHHHHHHHHLL---LLLEEEEEL------------------ Query aAYSK---------GGKDETVETVENFLQI---PIDKYVTVD------------------ 90 ident | | | | | | Sbjct lAETTgikgtlrnvFGIQEALALVARGAGIavsDISLIRINEatpvigdvametitetii 93 DSSP eEELLlllllllhhHHHHHHHHHHHHHHLLlhhHEEEEEEEEllleeeeeeeeeleeeee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 90 ident Sbjct testmighnpktpggaglgtgititpqelltrpadapyilvvssafdfadiasvinaslr 153 DSSP lllleelllllllllleeeeeeeelhhhhhlllllleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 90 ident Sbjct agyqitgvilqrddgvlvsnrlekplpivdevlyidriplgmlaaievavpgkvietlsn 213 DSSP llleeeeeeellllhhhhhhllllllleelllllhhhllllleeeeeellllllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 90 ident Sbjct pygiatvfnlspeetknivpmaralignrsavvvktpsgdvkaraipagnlellaqgrsv 273 DSSP hhhhhhhllllhhhhhhlhhhhhhllllleeeeelllllleeeeelllleeeeeelleee DSSP ----------------------------------------------hhhhhhhhhhhlll Query ----------------------------------------------fdgfkdvinevggi 104 ident Sbjct rvdvaagaeaimkavdgcgrldnvtgesgtniggmlehvrqtmaeltnkpsseifiqdll 333 DSSP eeehhhlhhhhhhhhllllllleeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhlleeeee DSSP lllllllllhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhllleELLL------- Query dvvpexhlngeealayadfgrndrqkqilnalidrxsdkiaekasenveTNIR------- 157 ident Sbjct avdtsvpvsvtgglagefsleqavgiasmvksdrlqmamiareieqklnIDVQiggaeae 393 DSSP eeeeeeeeelllllllleeeeeeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhhhlLEEEeeeehhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 157 ident Sbjct aailgalttpgttrplaildlgagstdasiinpkgdiiathlagagdmvtmiiarelgle 453 DSSP hhhhhhllllllllleeeeeellleeeeeeellllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhlll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 157 ident Sbjct drylaeeikkyplakveslfhlrhedgsvqffstplppavfarvcvvkadelvplpgdla 513 DSSP lhhhhhhhhhlleeeelllleeeelllleeellllllhhhllleeeelllleeellllll DSSP ------------------------------------------------hhhhhhhhhhll Query ------------------------------------------------iteglalqqiys 169 ident Sbjct lekvrairrsakervfvtnalralrqvsptgnirdipfvvlvggssldfevpqlvtdala 573 DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhlleeeeelhhhhlllhhhhhhhhll DSSP llllllleelLLLEeeeeelllleeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhlll Query gftskkidtlSITGsdlylgpnntyyfepdatnlekvrktlqehldyt 217 ident Sbjct hyrlvagrgnIRGS---------------egprnavatglilswhkef 606 DSSP lllleeeellHHHL---------------lllllhhhhhhhhhhhhhl
DSSP -LLLLLEEEEEEELLL------lllllllllllEEEEEEEEHhhLEEEEEEELLlleell Query -XKKKPFSILFXGIED------yatkgqkgrsdSLIVVTLDPknKTXKXLSIPRdtrvql 53 ident | Sbjct nLVITPRLFECSNKTGrflateipdfnqddleeDDVFLLDVW--DQVFFWIGKH------ 52 DSSP lLLLLLEEEEEELLLLlleeeelllllhhhlllLLEEEEELL--LLEEEEELLL------ DSSP lllleellllllllhhhhhhhhhhhhllllleeeeelhhhhhhhhhhhllllllllllll Query asktkinaayskggkdetvetvenflqipidkyvtvdfdgfkdvinevggidvvpexhln 113 ident Sbjct ------------------------------------------------------------ 52 DSSP ------------------------------------------------------------ DSSP hhhhhhlllllhHHHHHHHHHHHHHLLLllhhhhhhllleelllhhhhhhHHHHLLLLLl Query geealayadfgrNDRQKQILNALIDRXSdkiaekasenvetniriteglaLQQIYSGFTs 173 ident | | | Sbjct -----------aNEEEKKAAATTAQEYL--------------------ktHPSGRDPET- 80 DSSP -----------lLHHHHHHHHHHHHHHH--------------------hhLLLLLLLLL- DSSP lLLEELLLLeeeeeelllleeeeeelhhhhhhHHHHHHHhHLLL------ Query kKIDTLSITgsdlylgpnntyyfepdatnlekVRKTLQEhLDYT------ 217 ident | | Sbjct -PIIVVKQG----------------------hEPPTFTG-WFLAwdpfkw 106 DSSP -LEEEEELL----------------------lLLHHHHL-LLLLllllll
DSSP --------------------------lLLLLEEEEEEELLllllllllLLLLEEEEEEEE Query --------------------------xKKKPFSILFXGIEdyatkgqkGRSDSLIVVTLD 34 ident | | | Sbjct spgirmsvetiierikarvgavdpngpRKVLGVFQLNIKT--------ASGVEQWIVDLK 52 DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllLLLLLEEEEEEEL--------LLLLEEEEEELL DSSP hhhlEEEEEEElllleelllllleellllllllhhhhhhhhhhhhlLLLLEEEEELHHHH Query pknkTXKXLSIprdtrvqlasktkinaayskggkdetvetvenflqIPIDKYVTVDFDGF 94 ident | | ||| Sbjct ----QLKVDQG---------------------------------vfASPDVTVTVGLEDM 75 DSSP ----LLEEEEL---------------------------------llLLLLEEEEEEHHHH DSSP HHHHHHHllllllllllllhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhlllllHHHHHH--LLL Query KDVINEVggidvvpexhlngeealayadfgrndrqkqilnalidrxsdkIAEKAS--ENV 152 ident | Sbjct LAISGKT-----------------------------------------lTVGDALkqGKI 94 DSSP HHHHLLL-----------------------------------------lLHHHHHhlLLE DSSP EEL----lLHHHHHHHhhhllllllllleelllleeeeeelllleeeeeelhhhhhhhhh Query ETN----iRITEGLALqqiysgftskkidtlsitgsdlylgpnntyyfepdatnlekvrk 208 ident | Sbjct ELSgdadlAAKLAEVI-------------------------------------------- 110 DSSP EEEelhhhHHHHHHHL-------------------------------------------- DSSP hhhhhhlll Query tlqehldyt 217 ident Sbjct --------- 110 DSSP ---------
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct tseiilqernsslprvwskktftdatdflgcsyavengtsiigdfanakypvvnxkklle 60 DSSP llleeeelllllllllllllllllhhhhlleeelllllllllllhhheeeelllhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct rypsyinpkelrttetkalsysdfdrleknktftktvksgfslnlgpfkfgrqktiketf 120 DSSP hlhhheeeeeeeeeeeeeeeellllhhhlllllhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhl DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct vhntddsekvvhgelsievvngxlnlqtapsalrkiaadyldelfvdalynssxvelxqs 180 DSSP llllllhhheeeeeeeeeeeeeeeeelllhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhllhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct ygefvltgyytggrasalfygvdtnsiqfdskekdxdvainasyewknkkptgnlsigtk 240 DSSP hlleeeleeeeeeeeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhleeeelllllleeeelll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct rensetitnkfsalsysiktlggaygysistppyditnysidltpwlqslndpkthtxid 300 DSSP hhhhhhhhlleeeeeeeeeeelllllllllllleellllleelhhhhhhlllhhhleeee DSSP ---------------------------------LLLLLEEEEEEelllllllllllllLE Query ---------------------------------XKKKPFSILFXgiedyatkgqkgrsDS 27 ident | Sbjct lqdgglypisdfileenfkqryndthxdfqyqeSLEEPYIEIIK--xyirksnsgeklYD 358 DSSP elllleeehhhhlllhhhhhhhhhhhlllllllLLLLLEEEEEE--eeeeellllleeEE DSSP EEEEEEEHhHLEEEEEEE-LLLLeelllllleellllLLLLHHHHHHHHHHHHL---lll Query LIVVTLDPkNKTXKXLSI-PRDTrvqlasktkinaaySKGGKDETVETVENFLQ---ipi 83 ident | | Sbjct IVPVLNTR-QGDKLIFSNpDAAS----qsdeelkansIPATFLTKSNAIKDEKSkyyqlk 413 DSSP EEEEEELL-LLLEEEEELhHHLL----llhhhhhhhhLHHHHHHHHHHHHHHHLllllle DSSP LEEEEElhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhlllll Query DKYVTVdfdgfkdvinevggidvvpexhlngeealayadfgrndrqkqilnalidrxsdk 143 ident | Sbjct IKADPN------------------------------------------------------ 419 DSSP EEEEEE------------------------------------------------------ DSSP hhhhhhllleelllhhhhhhhhhhllllllLLLEELLLleeeeeelllleeeeeelhhHH Query iaekasenvetniriteglalqqiysgftsKKIDTLSItgsdlylgpnntyyfepdatNL 203 ident Sbjct -----------------------ktinpiiQLSFQINN-------------------vDE 437 DSSP -----------------------eeellllLLEEEEEL-------------------lLL DSSP HH--------------------------hhhhhhhhHLLL-------------------- Query EK--------------------------vrktlqehLDYT-------------------- 217 ident Sbjct KGxykfknantniwyiynptsxycfayydddyipdaYGILdwvngipikavtxttlyqry 497 DSSP LLleeeeelllleeeeeelllleeeeeelllhhhhhLLLHhhhhhlllllllhhhhhhhl DSSP ----- Query ----- 217 ident Sbjct kiygl 502 DSSP eeeel
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct ttapkppsaftveaqrrveaelpfadradferadrglirrperllirnpdgsvawlggyd 60 DSSP llllllllhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhlleeelllllllllllllllllhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct flldgkprdsinpslqrqallnlkyglfevaegiyqvrgfdlanitfirgdsgwivvdtl 120 DSSP hhllllllllllhhhhhhhhhlllleeeeeelleeeeelllllleeeeelllleeeelll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct ttpataraayelvsrelgerpirtviyshahadhfggvrglvepqqvasgavqiiapagf 180 DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllhhhhllhhhlllhhhhhhllleeeeellh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct meaaikenvlagnammrratyqygtqlpkgpqgqvdmaigkglargplsllaptrliege 240 DSSP hhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllllleeelll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct gedlvldgvpftfqntpgtespaemniwlprqkallmaenvvgtlhnlytlrgaevrdal 300 DSSP eeeeeelleeeeeeellllllllleeeeelllleeellllllllllllllllllllllhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct gwskyinqalhrfgrqaevmfavhnwprwgnaeivevlekqrdlygylhdqtlhlanqgv 360 DSSP hhhhhhhhhhhhlhhhlleeelllllleelhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct tigqvhnrlrlppsldqewydrgyhgsvshnaravlnrylgyydgnpatldplspedsag 420 DSSP llllhhhlllllhhhhllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhllllllhhhlllllhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct ryveymggaerlleqarasyargeyrwvvevvnrlvfaepdnraarelqadaleqlgyqa 480 DSSP hhhhhlllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhl DSSP --------------------------------------------------llLLLEEEEE Query --------------------------------------------------xkKKPFSILF 10 ident | || Sbjct enagwrnsylsaayelrhgvprdqgsadalaamdtgllfdylgvrldagaaeGKALSINL 540 DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhllhhhhlLLLEEEEE DSSP EELLllllllllllLLEEEEEEEEhhHLEEEEEEElllleelllllleellllllllhhh Query XGIEdyatkgqkgrSDSLIVVTLDpkNKTXKXLSIprdtrvqlasktkinaayskggkde 70 ident | | | Sbjct RLPD----------IGENYLLELK--NSHLNNLRG------------------------- 563 DSSP EELL----------LLEEEEEEEE--LLEEEEEEL------------------------- DSSP hhhhhhhhhlLLLLEEEEELhhhHHHHHHHHLLLlllllllllhhhhhhlllllhhhhhh Query tvetvenflqIPIDKYVTVDfdgFKDVINEVGGIdvvpexhlngeealayadfgrndrqk 130 ident | | | Sbjct -------vqsEDAGQTVSID---RADLNRLLLKE-------------------------- 587 DSSP -------lllLLLLEEEEEL---HHHHHHHHLLL-------------------------- DSSP hhhhhhhhlllllHHHHHH--LLLEELLLhHHHHHHHHhLLLLllllleelllleeeeee Query qilnalidrxsdkIAEKAS--ENVETNIRiTEGLALQQiYSGFtskkidtlsitgsdlyl 188 ident | | | Sbjct ------------vSAVRLVfeGKLKSSGNpLLLGQLFG-MLGD----------------- 617 DSSP ------------lLHHHHHhlLLEEEEELlLHHHHHHH-LLLL----------------- DSSP lllleeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhlll Query gpnntyyfepdatnlekvrktlqehldyt 217 ident Sbjct -----------------fdfwfdivtpaa 629 DSSP -----------------llllllllllll
DSSP -LLLLLEE--EEEEELLlllllllllllLEEEEEEEEhhHLEEEEEEELLL--LEELlll Query -XKKKPFS--ILFXGIEdyatkgqkgrsDSLIVVTLDpkNKTXKXLSIPRD--TRVQlas 55 ident | | | Sbjct gXNQSIIFteQLTWDVQ----------lSAIHFTAQQ--QGXVIDCYIGQKvlEHLA--- 45 DSSP lLLLLEEEllLLEEELL----------lLEEEEEEEE--LLEEEEEEEEHHhhHHHH--- DSSP lLEELlllllLLHHHHHHHHHHHHLlllleeeeelhhhhhhhhhhhllllllllllllhh Query kTKINaayskGGKDETVETVENFLQipidkyvtvdfdgfkdvinevggidvvpexhlnge 115 ident | | Sbjct -AEKI-----NNSEQALSLFEQFRF----------------------------------- 64 DSSP -LLLL-----LLHHHHHHHHHHLHH----------------------------------- DSSP hhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhllleelllhhhhhhhhhhllllllll Query ealayadfgrndrqkqilnalidrxsdkiaekasenvetniriteglalqqiysgftskk 175 ident Sbjct -------------------------------------------dieeqaeklieqeafdv 81 DSSP -------------------------------------------hhhhhhhhhhhllllll DSSP lEELLLLEeeeeelllleeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhlll Query iDTLSITGsdlylgpnntyyfepdatnlekvrktlqehldyt 217 ident Sbjct qGHIQVER--------------------------------vd 91 DSSP lLLEEELL--------------------------------ll
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DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct fltpaqeqlhqqirpmnqlypidlltelpppitdltlpppplvippermlvpselsnasp 60 DSSP lllhhhhhhhhhlllllllleeellllllllllhhhlllllllllhhhllllllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct dyirstlnavpknssllkksklpfglvirpyqhlyddidppplnedglivrcrrcrsymn 120 DSSP lleeelllleellhhhhhhhlllleeeelllllllllllllleellllllllllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct pfvtfieqgrrwrcnfcrlandvpmqmdqsdpndpksrydrneikcavmeymapkeytlr 180 DSSP llleeelllleeelllllleeellhhhlllllllhhhhhhlhhhhlleeeeellhhhlll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct qpppatycflidvsqssiksgllattintllqnldsipnhdertrisilcvdnaihyfki 240 DSSP lllllleeeeeellhhhhhllhhhhhhhhhhhlllllllllllleeleeeellleeeeel DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct pldqinmmdiadleepflprpnsmvvslkacrqnietlltkipqifqsnlitnfalgpal 300 DSSP llllleeeeellllllllllllllleellllhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct ksayhliggvggkiivvsgtlpnlgigklqrrnentsketaqllscqdsfyknftidcsk 360 DSSP hhhhhhhlllleeeeeeellllllllllllllllllllhhhhhllllllhhhhhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct vqitvdlflasedymdvaslsnlsrftagqthfypgfsgknpndivkfstefakhismdf 420 DSSP hleeeeeeeeelllllhhhhhhhhhllllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhlll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct cmetvmrargstglrmsrfyghffnrssdlcafstmprdqsylfevnvdesimadycyvq 480 DSSP eeeeeeeeeellleeeeeeellllllllleeeeeeellllleeeeeeellllllleeeee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct vavllslnnsqrririitlamptteslaevyasadqlaiasfynskavekalnsslddar 540 DSSP eeeeeeellleeeeeeeeeeeeeellhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct vlinksvqdilatykkeivvsntaggaplrlcanlrmfpllmhsltkhmafrsgivpsdh 600 DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeehhhllhhhhhhhhhlllllllllllhhh DSSP --------------LLLL---LEEEEEEE------------lllllllllllllleEEEE Query --------------XKKK---PFSILFXG------------iedyatkgqkgrsdsLIVV 31 ident | | Sbjct rasalnnleslplkYLIKniyPDVYSLHDmadeaglpgtivlpqpinatsslferyGLYL 660 DSSP hhhhhhhhhhllhhHHHHhhlLEEEELLLlllllllllllllllllllllllllllLEEE DSSP EEEHhhLEEEEEEELLlleelllllleellllllllhhhhhhhhhhhhllllleeeeelh Query TLDPknKTXKXLSIPRdtrvqlasktkinaayskggkdetvetvenflqipidkyvtvdf 91 ident Sbjct IDNG--NELFLWMGGD-------------------------------------------- 674 DSSP EELL--LEEEEEELLL-------------------------------------------- DSSP hhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhlllLLHHHHhhHHHHHHHHLllllhhhhhhll Query dgfkdvinevggidvvpexhlngeealayadFGRNDRqkQILNALIDRxsdkiaekasen 151 ident | | Sbjct ------------------------------aVPALVFfnQRVRNIINQ------------ 692 DSSP ------------------------------lLLHHHLlhHHHHHHHHH------------ DSSP leelllhhhhhhHHHH-lLLLLllLLEELLlleeeeeelllleeeeeelHHHHHHHHHHH Query vetniriteglaLQQI-ySGFTskKIDTLSitgsdlylgpnntyyfepdATNLEKVRKTL 210 ident | | Sbjct -----------lRNHDdvITYQ--SLYIVR-------------------AREVATLRLWA 720 DSSP -----------lLLLLllLLLL--EEEEEL-------------------LLHHHHHHHHH DSSP HHHHLLL--------------------- Query QEHLDYT--------------------- 217 ident | Sbjct SSTLVEDkilnnesyreflqimkarisk 748 DSSP HHLLLLLlllllllhhhhhhhhhhhhll
DSSP -llLLLEEEEEEELLlllllllllLLLEEEEEEEEHhhLEEEE-EEELllleelllllle Query -xkKKPFSILFXGIEdyatkgqkgRSDSLIVVTLDPknKTXKX-LSIPrdtrvqlasktk 58 ident | | Sbjct nlyFQGXKFAVAVSG--drvngpgESEEVQIYETDG--GNVRLiEKYS------------ 44 DSSP lhhHHLEEEEEEEEL--leellllLLLEEEEEEELL--LLEEEeEEEE------------ DSSP ellLLLLL---LHHHHHHHHHHHhllLLLEEEEElhhhhhhhhhhhllllllllllllhh Query inaAYSKG---GKDETVETVENFlqiPIDKYVTVdfdgfkdvinevggidvvpexhlnge 115 ident | Sbjct --nPALNAtaaRGVFXLKSALDH---GANALVLS-------------------------- 73 DSSP --lHHHHLlllHHHHHHHHHHHL---LLLEEEEL-------------------------- DSSP hhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhllleELLL-----hhhHHHHHHhlll Query ealayadfgrndrqkqilnalidrxsdkiaekasenveTNIR-----iteGLALQQiysg 170 ident | | Sbjct ----------------------eigspgfnfiknkxdvYIVPexpvadalKLILEG---- 107 DSSP ----------------------lllhhhhhhhlllleeEELLlllhhhhhHHHHLL---- DSSP lllllleelllleeeeeelllleeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhlll Query ftskkidtlsitgsdlylgpnntyyfepdatnlekvrktlqehldyt 217 ident Sbjct ----------------------------------kvspatapthdhg 120 DSSP ----------------------------------lllllllllllll
DSSP llllleeeeeeelllllllllllllleeeeeeeehhhLEEEEEE-ELLLleellllllee Query xkkkpfsilfxgiedyatkgqkgrsdslivvtldpknKTXKXLS-IPRDtrvqlasktki 59 ident Sbjct -----------------------------------ddIKVAVVGaMSGP----------- 14 DSSP -----------------------------------llEEEEEEElLLLL----------- DSSP llllllllhhhhhhhhhhhhllllleeeeelhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhh Query naayskggkdetvetvenflqipidkyvtvdfdgfkdvinevggidvvpexhlngeeala 119 ident Sbjct ------------------------------------------------------------ 14 DSSP ------------------------------------------------------------ DSSP llLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLllhhhhhhllleelllhhhhhhHHHHlLLLLllLLEEL Query yaDFGRNDRQKQILNALIDRXSdkiaekasenvetniriteglaLQQIySGFTskKIDTL 179 ident | | Sbjct --IAQWGDMEFNGARQAIKDIN--------------------akGGIK-GDKL--VGVEY 49 DSSP --LHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------------hlLLLL-LLLE--EEEEE DSSP LLLeeeeeelllleeeeeeLHHHHHHHHHHHHHHH------------------------- Query SITgsdlylgpnntyyfepDATNLEKVRKTLQEHL------------------------- 214 ident | | Sbjct DDA---------------cDPKQAVAVANKIVNDGikyvighlcssstqpasdiyedegi 94 DSSP ELL---------------lLHHHHHHHHHHHHHLLlleeellllhhhhhhhhhhhhhhll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 214 ident Sbjct lmispgatnpeltqrgyqhimrtagldssqgptaakyiletvkpqriaiihdkqqygegl 154 DSSP eeeelllllhhhhlllllleeellllhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeelllhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 214 ident Sbjct arsvqdglkaananvvffdgitagekdfsaliarlkkenidfvyyggyypemgqmlrqar 214 DSSP hhhhhhhhhhlllleeeeeellllllllhhhhhhhhhlllleeeeellhhhhhhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 214 ident Sbjct svglktqfmgpegvgnaslsniagdaaegmlvtmpkrydqdpanqgivdalkadkkdpsg 274 DSSP hllllleeeelhhhllhhhhhhhhhhhllleeeelllhhhlhhhhhhhhhhhhlllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 214 ident Sbjct pyvwityaavqslatalertgsdeplalvkdlkangantvigplnwdekgdlkgfdfgvf 334 DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhleeelleeellllllllllllleee DSSP ---------lll Query ---------dyt 217 ident Sbjct qwhadgsstkaf 346 DSSP eellllleeell
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DSSP lllllEEEEEEELLllllllllLLLLeeeeeeeehhhleeeeeeelllleelllllleel Query xkkkpFSILFXGIEdyatkgqkGRSDslivvtldpknktxkxlsiprdtrvqlasktkin 60 ident || | Sbjct ----aKIGLFYGTQ--------TGVT---------------------------------- 14 DSSP ----lLEEEEELLL--------LLHH---------------------------------- DSSP lllllllhhhHHHHHHHhHLLL--LLEEEEEL-------------------------HHH Query aayskggkdeTVETVENfLQIP--IDKYVTVD-------------------------FDG 93 ident | | Sbjct --------qtIAESIQQ-EFGGesIVDLNDIAnadasdlnaydyliigcptwgvgelQSD 65 DSSP --------hhHHHHHHH-HHLLllLEEEEEHHhllhhhhhhlleeeeelleellleeLHH DSSP HHHHHHHHLlllllllllllhhhhhhllllLHHHHHHHHHHHHHHLLLllhhhhhhllle Query FKDVINEVGgidvvpexhlngeealayadfGRNDRQKQILNALIDRXSdkiaekasenve 153 ident || | Sbjct WEGIYDDLDsvnfqgkkvayfgagdqvgysDNFQDAMGILEEKISSLG------------ 113 DSSP HHHHHHHHHhlllllleeeeeeelllllllLLLLHHHHHHHHHHHLLL------------ DSSP elllhhhhhhhhhhlllllllLLEELL------------lleeeeeelllleEEEE-ELH Query tniriteglalqqiysgftskKIDTLS------------itgsdlylgpnntYYFE-PDA 200 ident Sbjct --------------------sQTVGYWpiegydfneskavrnnqfvglaideDNQPdLTK 153 DSSP --------------------lEELLLEellllllllllleelleelleeellLLLHhHHH DSSP HHHHHHHHHHHHHHLLl Query TNLEKVRKTLQEHLDYt 217 ident | Sbjct NRIKTWVSQLKSEFGL- 169 DSSP HHHHHHHHHHHHHHLL-
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DSSP --lllLLEEEEEEEllllllllllllLLEEEEEEEEHhHLEE-EEEEELLlleellllll Query --xkkKPFSILFXGiedyatkgqkgrSDSLIVVTLDPkNKTX-KXLSIPRdtrvqlaskt 57 ident | | | || Sbjct snaxdKKIIGIDLG------------GTTIKFAILTT-DGVVqQKWSIET---------- 37 DSSP lhhhhLEEEEEEEL------------LLEEEEEEEEL-LLLEeEEEEEEL---------- DSSP eellllLLLLhHHHHHHHHHHHL---------lllLEEEEELhhhhhhhhhhhlllllll Query kinaaySKGGkDETVETVENFLQ---------ipiDKYVTVDfdgfkdvinevggidvvp 108 ident | | Sbjct -niledGKHI-VPSIIESIRHRIdlynxkkedfvgIGXGTPG------------------ 77 DSSP -lllllLLLH-HHHHHHHHHHHHhhllllhhheeeEEEEELL------------------ DSSP lllllhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhllleelllhhhHHHHHHHL Query exhlngeealayadfgrndrqkqilnalidrxsdkiaekasenvetniriteGLALQQIY 168 ident Sbjct ---------svdiekgtvvgaynlnwttvqpvkeqiesalgipfaldndanvAALGERWK 128 DSSP ---------eeelllleeellhhhlllllllhhhhhhhhhllleeeeehhhhHHHHHHHH DSSP L----------------------------------------------------------- Query S----------------------------------------------------------- 169 ident Sbjct Gagennpdvifitlgtgvgggivaagkllhgvagcagevghvtvdpngfdctcgkrgcle 188 DSSP Lllllllleeeeeellleeeeeeelleellllllllllhhhllllllllllllllllllh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 169 ident Sbjct tvssatgvvrvarhlseefagdselkqaiddgqdvsskdvfefaekgdhfalxvvdrvcf 248 DSSP hhhlhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhh DSSP -----------------------------llllllleelllleeeeeelllleeeeeelh Query -----------------------------gftskkidtlsitgsdlylgpnntyyfepda 200 ident Sbjct ylglatgnlgntlnpdsvvigggvsaageflrsrvekyfqeftfpqvrnstkiklaelgn 308 DSSP hhhhhhhhhhhhhllleeeeelhhhhhlhhhhhhhhhhhhhlllhhhhllleeeelllhh DSSP hhhhhhhhhhhhhhlll Query tnlekvrktlqehldyt 217 ident Sbjct eagvigaaslalqfske 325 DSSP hhhhhhhhhhhhhhlll
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