Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition.
The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure, to pre-computed structural neighbours in the Dali Database,
and to the PDB format coordinate file where the neighbour
is superimposed onto the query structure.
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Summary
No: Chain Z rmsd lali nres %id PDB Description
1: 2h8r-A 5.9 3.1 70 176 14 PDB MOLECULE: HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 1-BETA;
2: 1ic8-B 5.6 3.2 71 173 17 PDB MOLECULE: HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 1-ALPHA;
3: 2ppx-A 5.1 2.5 55 62 4 PDB MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN ATU1735;
4: 2d5v-A 4.3 2.3 55 135 18 PDB MOLECULE: HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 6;
5: 2w48-B 4.1 2.8 44 313 16 PDB MOLECULE: SORBITOL OPERON REGULATOR;
6: 2auw-B 3.9 3.2 55 155 15 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN NE0471;
7: 3d1n-I 3.6 2.5 56 149 14 PDB MOLECULE: 5'-
8: 1u78-A 3.6 2.2 42 103 12 PDB MOLECULE: TRANSPOSABLE ELEMENT TC3 TRANSPOSASE;
9: 2a6c-A 3.5 2.4 50 76 10 PDB MOLECULE: HELIX-TURN-HELIX MOTIF;
10: 2ntz-A 3.5 2.7 46 183 22 PDB MOLECULE: 5'-
11: 1au7-A 3.4 2.7 53 130 9 PDB MOLECULE: PROTEIN PIT-1;
12: 1r71-B 3.4 3.3 46 116 17 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR PROTEIN KORB;
13: 2zxq-A 3.3 2.6 48 1178 4 PDB MOLECULE: ENDO-ALPHA-N-ACETYLGALACTOSAMINIDASE;
14: 1x2l-A 3.2 2.7 57 101 16 PDB MOLECULE: HOMEOBOX PROTEIN CUX-2;
15: 3ivp-A 3.2 2.6 50 115 6 PDB MOLECULE: PUTATIVE TRANSPOSON-RELATED DNA-BINDING PROTEIN;
16: 3f51-A 3.2 2.6 50 94 14 PDB MOLECULE: CLP GENE REGULATOR (CLGR);
17: 2ahq-A 3.2 3.1 49 67 6 PDB MOLECULE: RNA POLYMERASE SIGMA FACTOR RPON;
18: 2bnm-A 3.1 2.7 51 194 14 PDB MOLECULE: EPOXIDASE;
19: 1wh6-A 3.0 3.4 60 101 13 PDB MOLECULE: HOMEOBOX PROTEIN CUX-2;
20: 1umq-A 3.0 3.6 45 60 9 PDB MOLECULE: PHOTOSYNTHETIC APPARATUS REGULATORY PROTEIN;
21: 1oks-A 3.0 2.6 41 53 12 PDB MOLECULE: RNA POLYMERASE ALPHA SUBUNIT;
22: 1t6o-A 3.0 3.2 44 49 11 PDB MOLECULE: PHOSPHOPROTEIN;
23: 1pdn-C 2.9 2.6 43 123 12 PDB MOLECULE: DNA (5'-
24: 1wwp-A 2.8 3.1 60 119 8 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN TTHA0636;
25: 3ke2-A 2.8 2.8 47 103 13 PDB MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN YP_928783.1;
26: 6pax-A 2.8 2.7 43 133 14 PDB MOLECULE: HOMEOBOX PROTEIN PAX-6;
27: 1x57-A 2.7 3.2 52 91 13 PDB MOLECULE: ENDOTHELIAL DIFFERENTIATION-RELATED FACTOR 1;
28: 3fhz-D 2.7 2.6 45 167 13 PDB MOLECULE: ARGININE REPRESSOR;
29: 2e7x-A 2.7 3.1 41 152 12 PDB MOLECULE: 150AA LONG HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL
30: 1z2c-B 2.7 3.3 39 346 18 PDB MOLECULE: RHO-RELATED GTP-BINDING PROTEIN RHOC;
31: 2b5a-A 2.6 2.9 49 77 14 PDB MOLECULE: C.BCLI;
32: 2o8e-B 2.6 3.2 54 935 11 PDB MOLECULE: DNA MISMATCH REPAIR PROTEIN MSH2;
33: 2dd4-H 2.6 2.4 43 156 2 PDB MOLECULE: THIOCYANATE HYDROLASE ALPHA SUBUNIT;
34: 2ptf-A 2.6 7.9 41 200 15 PDB MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN MTH_863;
35: 2kn6-A 2.5 2.8 51 195 8 PDB MOLECULE: APOPTOSIS-ASSOCIATED SPECK-LIKE PROTEIN
36: 3c4r-C 2.5 3.2 49 127 14 PDB MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN;
37: 3bbz-A 2.5 2.7 40 48 13 PDB MOLECULE: P PROTEIN;
38: 1dgn-A 2.4 3.3 52 89 12 PDB MOLECULE: ICEBERG (PROTEASE INHIBITOR);
39: 2h09-A 2.4 4.2 46 127 15 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR;
40: 1g2h-A 2.4 2.2 41 61 15 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN TYRR HOMOLOG;
41: 3g2b-A 2.4 3.5 40 90 3 PDB MOLECULE: COENZYME PQQ SYNTHESIS PROTEIN D;
42: 2dbb-B 2.3 4.7 44 148 14 PDB MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR
43: 3fbv-D 2.2 3.0 54 425 7 PDB MOLECULE: SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE/ENDORIBONUCLEASE
44: 1z05-A 2.2 3.5 43 396 16 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, ROK FAMILY;
45: 1xvh-A 2.2 2.6 43 120 9 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN, SIMILAR TO STREPTOCOCCAL
46: 1wty-A 2.2 3.1 59 116 7 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN TTHA0048;
47: 2o03-A 2.2 3.9 43 129 19 PDB MOLECULE: PROBABLE ZINC UPTAKE REGULATION PROTEIN FURB;
48: 1sfu-A 2.2 2.4 41 70 10 PDB MOLECULE: 34L PROTEIN;
49: 2pjq-B 2.2 2.8 42 212 7 PDB MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN LP_2664;
50: 2d9a-A 2.2 1.6 37 60 14 PDB MOLECULE: MYB-RELATED PROTEIN B;
51: 2qwt-A 2.2 3.2 41 167 10 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
52: 1u7d-B 2.1 3.8 59 284 2 PDB MOLECULE: TYROSYL-TRNA SYNTHETASE;
53: 2o0y-C 2.1 3.3 50 255 12 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
54: 3iuo-B 2.1 3.3 46 111 9 PDB MOLECULE: ATP-DEPENDENT DNA HELICASE RECQ;
55: 1gvn-A 2.1 3.1 46 87 7 PDB MOLECULE: EPSILON;
56: 1uqv-A 2.1 1.7 40 85 8 PDB MOLECULE: STE50 PROTEIN;
57: 3dfb-A 2.1 2.5 45 83 2 PDB MOLECULE: METAL-BINDING PROTEIN SMBP;
58: 3hot-A 2.1 2.4 37 338 5 PDB MOLECULE: TRANSPOSABLE ELEMENT MARINER, COMPLETE CDS;
59: 1ity-A 2.1 2.6 39 67 8 PDB MOLECULE: TRF1;
Pairwise Structural Alignments
Notation: three-state secondary structure definitions by DSSP (reduced to H=helix, E=sheet, L=coil) are shown above the amino acid sequence. Structurally equivalent residues are in uppercase, structurally non-equivalent residues (e.g. in loops) are in lowercase. Amino acid identities are marked by vertical bars.
No 1: Query=mol1A Sbjct=2h8rA Z-score=5.9
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DSSP ------------LHHHL-LLHHHLL---HHHHHHHHHHHLL--LLLHHHHHLLLLLLHHH Query ------------HHSHX-LPPEQWS---HTTVRNALKDLLK--DXNQSSLAKECPLSQSX 42 ident | | | || Sbjct silkelqalnteEAAEQrAEVDRMLsedPWRAAKMIKGYMQqhNIPQREVVDVTGLNQSH 60 DSSP lhhhhhhhhllhHHHHHhHHHHHHLlllHHHHHHHHHHHHHhhLLLHHHHHHHHLLLHHH DSSP HHHHHHLlllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHL----------------------------- Query ISSIVNStyyANVSAAKCQEFGRWYKHFKKT----------------------------- 73 ident | | | || Sbjct LSQHLNK--gTPMKTQKRAALYTWYVRKQREilrqfnqtvmrrnrfkwgpasqqilyqay 118 DSSP HHHHHLL--lLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllllllllllhhhhhhhhhhh DSSP ---------------------------------------------------------- Query ---------------------------------------------------------- 73 ident Sbjct drqknpskeerealveecnraeclqrgvspskahglgsnlvtevrvynwfanrrkeea 176 DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhllllllhhhhhhhhhhhhllll
DSSP -----------LHHHLL-LHHHL----LHHHHHHHHHHHLL-LLLHHHHHLLLLLLHHHH Query -----------HHSHXL-PPEQW----SHTTVRNALKDLLK-DXNQSSLAKECPLSQSXI 43 ident | | | | | || Sbjct ilkelenlspeEAAHQKaVVETLlqedPWRVAKMVKSYLQQhNIPQREVVDTTGLNQSHL 60 DSSP lllllllllhhHHHHHHhHHHHHllllHHHHHHHHHHHHHHlLLLHHHHHHHHLLLHHHH DSSP HHHHHLllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHL------------------------------ Query SSIVNStyYANVSAAKCQEFGRWYKHFKKT------------------------------ 73 ident | | | || Sbjct SQHLNK--GTPMKTQKRAALYTWYVRKQREvaqqfthrnrfkwgpasqqilfqayerqkn 118 DSSP HHHHHL--LLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLllllllllllllllhhhhhhhhhhhhllll DSSP ------------------------------------------------------- Query ------------------------------------------------------- 73 ident Sbjct pskeeretlveecnraeciqrgvspsqaqglgsnlvtevrvynwfanrrkeeafr 173 DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhlllhhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP lhhhlllhhhllhHHHHHHHHHHllLLLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHLllLLLLLHHHH Query hhshxlppeqwshTTVRNALKDLlkDXNQSSLAKECPLSQSXISSIVNStyYANVSAAKC 60 ident | | Sbjct ------------xPRIKIIRRAL--KLTQEEFSARYHIPLGTLRDWEQG--RSEPDQPAR 44 DSSP ------------lLHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL--LLLLLHHHH DSSP HHHHHHHHHHHH-----l Query QEFGRWYKHFKK-----t 73 ident Sbjct AYLKIIAVDPEGtaaalr 62 DSSP HHHHHHHHLHHHhhhhhl
DSSP lhhhlllhHHLLHHHHHHHHHHHLL--LLLHHHHHLLLL-lLHHHHHHH---hhllllll Query hhshxlppEQWSHTTVRNALKDLLK--DXNQSSLAKECP-lSQSXISSI---vnstyyan 54 ident | | || | | || | Sbjct -------mEEINTKEVAQRITTELKrySIPQAIFAQRVLcrSQGTLSDLlrnpkpwsklk 53 DSSP -------lLLLLHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHHLllLHHHHHHHhhllllhhhll DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHL----------------------------------------- Query vSAAKCQEFGRWYKHFKKT----------------------------------------- 73 ident | Sbjct sGRETFRRMWKWLQEPEFQrmsalrlprlvftdvqrrtlhaifkenkrpskelqitisqq 113 DSSP lLHHHHHHHHHHHHLLHHHhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhh DSSP ---------------------- Query ---------------------- 73 ident Sbjct lglelstvsnffmnarrrsldk 135 DSSP hlllhhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP lhhhlllhhHLLHHHHHHHHHHHLL--LLLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHL--LLLL--- Query hhshxlppeQWSHTTVRNALKDLLK--DXNQSSLAKECPLSQSXISSIVNS--TYYA--- 53 ident | | | | | || Sbjct ---------NSDDIRLIVKIAQLYYeqDMTQAQIARELGIYRTTISRLLKRgrEQGIvti 51 DSSP ---------LLLHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHhhHHLLeee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 53 ident Sbjct ainydynenlwleqqlkqkfglkeavvassdglleeeqlsamgqhgallvdrllepgdii 111 DSSP lllllhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 53 ident Sbjct gfswgravrslvenlpqrsqsrqvicvpiiggpsgklesryhvntltygaaarlkaeshl 171 DSSP eelllhhhhhhhhllllllllllleeeellllllllllhhhlhhhhhhhhhhhhlleell DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 53 ident Sbjct adfpalldnplirngimqsqhfktissywdsldvalvgigspairdganwhafygseesd 231 DSSP lllllllllhhhhhhhhllhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllllllhhhhllhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 53 ident Sbjct dlnarhvagdicsrfydingglvdtnmsektlsiemaklrqarysigiamgeekysgilg 291 DSSP hhhhhleeeeelleeeelllleellhhhhllllllhhhhhllleeeeellllllhhhhhh DSSP --lllhhhhhhhhhhhhhhhhl Query --nvsaakcqefgrwykhfkkt 73 ident Sbjct alhgryinclvtnretaelllk 313 DSSP hhhllllleeeeehhhhhhhll
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct xneyffpkltavealapyrlrttwstgevlevdvgdilrkipdlapildpeafarvhiae 60 DSSP lllllllleeeeeelllleeeeeelllleeeeelhhhhhhlhhhhhhhlhhhhllleell DSSP -----------------lhhhlllhhhlLHHHHHHHHHHHLlllLHHHHHLLLLLLHHHH Query -----------------hhshxlppeqwSHTTVRNALKDLLkdxNQSSLAKECPLSQSXI 43 ident || | | | Sbjct wegsvewfdtefgrdnvyawakeqagevSHEXFGDWXHRNN--lSLTTAAEALGISRRXV 118 DSSP lllleelllllllhhhhhhhhhhhllllLHHHHHHHHHHLL--lLHHHHHHHHLLLHHHH DSSP HHHHhlllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHL--------- Query SSIVnstyYANVSAAKCQEFGRWYKHFKKT--------- 73 ident | | | Sbjct SYYR--taHKIIPRTIWLACLGWEATRPETktlprtlpa 155 DSSP HHHH--llLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLlllllllll
DSSP lhhhlllhhhlLHHHHHHHHHHHLL--LLLHHHHHLLL------lLLHHHHHHHhhlllL Query hhshxlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DXNQSSLAKEC------pLSQSXISSIvnstyY 52 ident | | ||| || Sbjct --------nxeEIREFAKNFKIRRLslGLTQTQVGQAXtategpaYSQSAISRF--eklD 50 DSSP --------lhhHHHHHHHHHHHHHHllLLLHHHHHHHHlllllllLLHHHHHHH--hllL DSSP LLL--LHHHHHHHHHHHHHHHHL------------------------------------- Query ANV--SAAKCQEFGRWYKHFKKT------------------------------------- 73 ident | Sbjct ITPksAQKLKPVLEKWLNEAELRnqegqqnlxefvggepskkrkrrtsftpqaiealnay 110 DSSP LLHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllhhhhhlllllllllllllllhhhhhhhhhh DSSP --------------------------------------- Query --------------------------------------- 73 ident Sbjct feknplptgqeitexakelnydrevvrvwfsnrrqtlkn 149 DSSP hhhlllllhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP lhhhlllhhhllHHHHHHHHHHHL-LLLLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHLLLLLL----- Query hhshxlppeqwsHTTVRNALKDLL-KDXNQSSLAKECPLSQSXISSIVNSTYYAN----- 54 ident | | | | | Sbjct ------prgsalSDTERAQLDVMKlLNVSLHEMSRKISRSRHCIRVYLKDPVSYGtskra 54 DSSP ------llllllLHHHHHHHHHHHhLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHLHHHLLlllll DSSP ------------------------------llhhhhhhhhhhhhhhhhl Query ------------------------------vsaakcqefgrwykhfkkt 73 ident Sbjct prrkalsvrdernviraasnscktardirnelqlsaskrtilnvikrsg 103 DSSP lllllllhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhll
DSSP lhhhlllhhhlLHHHHHHHHHHHLL-LLLHHHHHLLL---llLHHHHHHHhhllllLLLL Query hhshxlppeqwSHTTVRNALKDLLK-DXNQSSLAKEC---plSQSXISSIvnstyyANVS 56 ident | | | | | Sbjct -ihhhhhhxkxRSQLLIVLQEHLRNsGLTQFKAAELLgvtqpRVSDLXRG----kiDLFS 55 DSSP -lllllllhhhHHHHHHHHHHHHHLlLLLHHHHHHHHlllhhHHHHHHLL----lhHHLL DSSP HHHHHHHHHHHHH----hhhl Query AAKCQEFGRWYKH----fkkt 73 ident Sbjct LESLIDXITSIGLkveinikd 76 DSSP HHHHHHHHHHLLLllllllll
DSSP lhHHLLlhhhLLHHHHHHHHHHHLL-LLLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHH----------- Query hhSHXLppeqWSHTTVRNALKDLLK-DXNQSSLAKECPLSQSXISSIVN----------- 48 ident | | | | | | ||| Sbjct --QTAL---qHSIREIGLRLXRXKNdGXSQKDIAAKEGLSQAKVTRALQaasapeelval 55 DSSP --LLLL---lLLHHHHHHHHHHHHHlLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHhhlllhhhhhl DSSP --------LLLL------------------------------------------------ Query --------STYY------------------------------------------------ 52 ident | Sbjct fpvqseltFSDYktlcavgdexgnlefdqliqnispeindilsieexaedevknkilrli 115 DSSP lllhhhllHHHHhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhh DSSP -----------------------------------------------llllhhhhhhhhh Query -----------------------------------------------anvsaakcqefgr 65 ident Sbjct tkeaslltdkksvvtelwkfedkdrfarkrvkgrafsyefnrlskelqeeldrxighilr 175 DSSP lhhhhhhhllllleeellllllllleeeeelllllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhh DSSP hhhhhhhl Query wykhfkkt 73 ident Sbjct ksldkkpk 183 DSSP hlllllll
DSSP lhhhlllhhhlLHHHHHHHHHHHL-LLLLHHHHHLLL------llLHHHHHHhhhllllL Query hhshxlppeqwSHTTVRNALKDLL-KDXNQSSLAKEC------plSQSXISSivnstyyA 53 ident | || | Sbjct -------gmraLEQFANEFKVRRIkLGYTQTNVGEALaavhgsefSQTTICR----fenL 49 DSSP -------lhhhHHHHHHHHHHHHHhHLLLHHHHHHHHhhllllllLHHHHHH----hhlL DSSP LLLHHHHHHHHHHHHHHHHL---------------------------------------- Query NVSAAKCQEFGRWYKHFKKT---------------------------------------- 73 ident | Sbjct QLSFKNACKLKAILSKWLEEaeqkrrttisiaakdalerhfgehskpssqeimrmaeeln 109 DSSP LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhl DSSP --------------------- Query --------------------- 73 ident Sbjct lekevvrvwfcnrrqrekrvk 130 DSSP llhhhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP -----lhhhllLHHHLLHHHHHHHHHHHLL-LLLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHH------ Query -----hhshxlPPEQWSHTTVRNALKDLLK-DXNQSSLAKECPLSQSXISSIVN------ 48 ident | ||| | | | Sbjct yneadqvienlQRNELTPREIADFIGRELAkGKKKGDIAKEIGKSPAFITQHVTlldlpe 60 DSSP llhhhhhhhhhHLLLLLHHHHHHHHHHHHHlLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHhhlllh DSSP ---------llllLLLL----------------------hhhhhhhhhhhhhhhhl Query ---------styyANVS----------------------aakcqefgrwykhfkkt 73 ident | Sbjct kiadafntgrvrdVTVVnelvtafkkrpeeveawldddtqeitrgtvkllreflde 116 DSSP hhhhhhhllllllHHHHhhhhhhhhhlhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhll
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct asetlktkkmevqikknfpsvlqytmtdgkvmygqskdvrtveingtnielgdddvtfkk 60 DSSP leeeeellleeeeeellllleeeeeelllleeellllllleeeelleeeellhhheeeee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct vsdteatytlkvkdeakkidavitvqitvkanqlhlnvtkiknnlsegipegngveenai 120 DSSP eelleeeeeeeeeehhhleeeeeeeeeeeelleeeeeeeeeeelllllllllllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct qtlsfpnqslvsvrssqenaqftgarmssntqkpgdtnfavtedtnvtdsdytygfisga 180 DSSP leeelllllleeeelllllleeeeelllllllllleeeeellllllllleeeleeeeeel DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct glsaglwsnsehdgtyvaapvrggsqntrvyattqqtgdatslglasapwyyhrtvtdsk 240 DSSP leeeeeeellllllllllllllllllllleeeeeeeelleeeeeeeelleelleeeelll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct gkkytvaetalpqmavaiagdenedgavnwqdgaiayrdimnnpykseevpelvawriam 300 DSSP lleeeelllllleeeeeeellllllllllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhlleeeeee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct nfgsqaqnpflttldnvkkvalntdglgqsvllkgygneghdsghpdygdigqrlggadd 360 DSSP lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeellllllllllllllllllhhhlhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct mntmmeegskygarfgvhvnasemypeakafsedmvrrnsagglsygwnwldqgvgidgi 420 DSSP hhhhhhhhhllleeeeeeellleellllllllllllllllllllleeeellleeeellhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct ydlasgsrvsrfadlskevgdnmdfiyldvwgnltssgsedswetrkmskmindngwrmt 480 DSSP hhhhllhhhhhhhhhhhhhllllleeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhhlllleee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct tewgsgneydstfqhwaadltyggytskgensevmrflrnhqkdswvgdypqyggaanap 540 DSSP elllllllllllllhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhllllllllhhhlhhhlll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct llggynmkdfegwqgrndyaayiknlythdvstkfiqhfkvtrwvnnplltadngnaaav 600 DSSP llllllllllllhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeelllllllllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct sdpntnngneqitlkdsngnvvvvsrgsndtssaayrqrtitfngvkvasgvvsagdgsa 660 DSSP lllllhhhlleeeeellllleeeeeelllllllhhhhleeeeelleeeeeelllllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct tgdesyllpwmwdsftgklvkdseqklyhwntkggtttwtlpdswknlssvkvyqltdqg 720 DSSP lllleeeeeelllllllllllhhhleeeeeellleeeeeellhhhlllleeeeeeeelle DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct ktneqtvavsggkvtltadaetpyvvykgeakqiqvnwsegmhvvdagfnggsntltdnw 780 DSSP eeeeeeeelllleeeeeellllleeeelllllllllllllllllllllllllllhhhhll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct tvsgsgkaevegdnnamlrltgkvdvsqrltdlkagqkyalyvgvdnrstgdasvtvtsg 840 DSSP eeellleeeeellllleeeeelleeeeeelllllllleeeeeeeeeellllleeeeeeel DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct gkvlatnstgksiaknyikayghntnsntengssyfqnmyvfftapengdatvtlshkst 900 DSSP leeeeeeeellllllllllllllllllllllllllleeeeeeeellllllleeeeeelll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct dgahtyfddvrivenqysgityekdgtlksltngfennaqgiwpfvvsgsegvednrihl 960 DSSP llleeeeeeeeeeellllleeellllleeeeeellllllllllleeelllllllllleee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct selhapftragwdvkkmddvldgtwsvkvngltqkgtlvyqtipqnvkfeagakykvsfd 1020 DSSP eelllllllllllllllllllllleeeeellllllleeeeeellllllllllleeeeeee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct yqsgsddiyaiavgqgeysagsvkltnlkkalgetgkaefeltggvngdswfgiystata 1080 DSSP eeellllleeeeeeelllllllleeeellleeeeeeeeeeeeelllllleeeeeeellll DSSP -----------------------lhhhlllhHHLLHHHHHHHHHHHLLLLL----hhhHH Query -----------------------hhshxlppEQWSHTTVRNALKDLLKDXN----qssLA 33 ident | Sbjct pdlqgstgnaqdfggykdfvldnlkieriesQTRTKAEAQDKVKEIRGKYDskrawqqYQ 1140 DSSP lllllllllhhhhllllleeeeeeeeeelllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLlllllhhHH DSSP LL--LLLLhhhhhhhhhlllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHL----- Query KE--CPLSqsxissivnstyyaNVSAAKCQEFGRWYKHFKKT----- 73 ident | Sbjct DTlvKARV---------linknGATAEDFTKAYDILVALDEYmktap 1178 DSSP HHhhHHHH---------hhhllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlll
DSSP ------lhhhlllhHHLLHHHHHHHHHHHLL--LLLHHHHHLLLL-lLHHHHHHHHHL-- Query ------hhshxlppEQWSHTTVRNALKDLLK--DXNQSSLAKECP-lSQSXISSIVNS-- 49 ident || | | | || | | Sbjct gssgssgagpgaeeEQLDTAEIAFQVKEQLLkhNIGQRVFGHYVLglSQGSVSEILARpk 60 DSSP llllllllllllllLLLLHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHLLllLHHHHHHHHHLll DSSP --llllllLHHHHHHHHHHHHhHHHL---------------- Query --tyyanvSAAKCQEFGRWYKhFKKT---------------- 73 ident Sbjct pwrkltvkGKEPFIKMKQFLS-DEQNvlalrtiqvrsgpssg 101 DSSP lhhhllhhHHHHHHHHHHHHL-LLHHhhhhhhhhhlllllll
DSSP lhhhlllhhhllhhhhHHHHHHHL-LLLLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHLllLLLLLHHH Query hhshxlppeqwshttvRNALKDLL-KDXNQSSLAKECPLSQSXISSIVNStyYANVSAAK 59 ident | | | Sbjct ----kkedkydfralgLAIKEARKkQGLTREQVGAXIEIDPRYLTNIENK--GQHPSLQV 54 DSSP ----llllllllhhhhHHHHHHHHhLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHL--LLLLLHHH DSSP HHHHHHHHH-----------------------------------------------hhhh Query CQEFGRWYK-----------------------------------------------hfkk 72 ident Sbjct LYDLVSLLNvsvdefflpassqvkstkrrqlenkidnftdadlvixesvadgivkskevg 114 DSSP HHHHHHHHLlllhhhhlllllllllhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh DSSP l Query t 73 ident Sbjct e 115 DSSP l
DSSP lhhhlllhhhlLHHHHHHHHHHHL-LLLLHHHHHLLLllLHHHHHHhhhllllLLLLhhH Query hhshxlppeqwSHTTVRNALKDLL-KDXNQSSLAKECplSQSXISSivnstyyANVSaaK 59 ident | || | | Sbjct ------pepllREALGAALRSFRAdKGVTLRELAEASrvSPGYLSE----lerGRKE--V 48 DSSP ------llllhHHHHHHHHHHHHHhHLLLHHHHHHHHllLHHHHHH----hhlLLLL--L DSSP HHHHHHHHHHHHH--------------------------------l Query CQEFGRWYKHFKK--------------------------------t 73 ident | | Sbjct SSELLASVCHALGasvadvlieaagsmalqaaqedlarvlewshpq 94 DSSP LHHHHHHHHHHLLllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
DSSP --LHHHLLL---HHHLLHHHHHHHHHHHLLL------LLHHHHHLLL-----LLLHHHHH Query --HHSHXLP---PEQWSHTTVRNALKDLLKD------XNQSSLAKEC-----PLSQSXIS 44 ident | | | Sbjct tySLRTFFVresAEGLTQGELMKLIKEIVENedkrkpYSDQEIANILkekgfKVARRTVA 60 DSSP llLLLLLLLlllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHllllllLLHHHHHHHHlllllLLLHHHHH DSSP HHHHLlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhl Query SIVNStyyanvsaakcqefgrwykhfkkt 73 ident Sbjct KYREM----------------------lg 67 DSSP HHHHH----------------------ll
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DSSP -----lhhhllLHHHLLHHHHHHHHHHHLLLL--LHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHLLLll Query -----hhshxlPPEQWSHTTVRNALKDLLKDX--NQSSLAKECPLSQSXISSIVNSTYya 53 ident | | | | Sbjct lakgeslppppENPMSADRVRWEHIQRIYEMCdrNVSETARRLNMHRRTLQRILAKRS-- 58 DSSP lllllllllllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLllLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHLLL-- DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhhl Query nvsaakcqefgrwykhfkkt 73 ident Sbjct ------------------pr 60 DSSP ------------------ll
DSSP lhhhlllhhhLLHHHHHHHHHHHllLLLHHHHHLLllllhhhhhhhhhlllllllLHHHH Query hhshxlppeqWSHTTVRNALKDLlkDXNQSSLAKEcplsqsxissivnstyyanvSAAKC 60 ident | | | | Sbjct ----------ASRSVIRSIIKSS--RLEEDRKRYL------------xtllddikGANDL 36 DSSP ----------LLHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHH------------hhhhhhllLHHHH DSSP HHHHHHHHHHHHL---- Query QEFGRWYKHFKKT---- 73 ident | Sbjct AKFHQXLVKIIXKhhhh 53 DSSP HHHHHHHHHHHHHhhll
DSSP lhhhlllhhHLLHHHHHHHHHHHllLLLHHHHHLLllllhhhhhhhhhllllLLLL-HHH Query hhshxlppeQWSHTTVRNALKDLlkDXNQSSLAKEcplsqsxissivnstyyANVS-AAK 59 ident | | | | Sbjct ---------GASRSVIRSIIKSS--RLEEDRKRYL-------------mtllDDIKgAND 36 DSSP ---------LLLHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHH-------------hhhhHHLLlHHH DSSP HHHHHHHHHHHHHl Query CQEFGRWYKHFKKt 73 ident | Sbjct LAKFHQMLMKIIM- 49 DSSP HHHHHHHHHHHHL-
DSSP -----lhhhlllhhhlLHHHHHHHHHHHL-LLLLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHL----L Query -----hhshxlppeqwSHTTVRNALKDLL-KDXNQSSLAKECPLSQSXISSIVNS----T 50 ident | | | | | Sbjct qgrvnqlggvfingrpLPNNIRLKIVEMAaDGIRPCVISRQLRVSHGCVSKILNRyqetG 60 DSSP leeellllleeellllLLHHHHHHHHHHHhLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHhhhhL DSSP LLLL----------------------------------------llhhhhhhhhhhhhhh Query YYAN----------------------------------------vsaakcqefgrwykhf 70 ident Sbjct SIRPgviggskpriatpeienrieeykrsspgmfsweirekliregvcdrstapsvsais 120 DSSP LLLLllllllllllllllhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhh DSSP hhl Query kkt 73 ident Sbjct rlv 123 DSSP hhl
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DSSP lhhhlllhhhllhHHHHHHHHHHLL--LLLHHHHHLLLllLHHHHHHHhhlllLLLLLHH Query hhshxlppeqwshTTVRNALKDLLK--DXNQSSLAKECplSQSXISSIvnstyYANVSAA 58 ident | | || | | Sbjct --gssgssgdrvtLEVGKVIQQGRQskGLTQKDLATKIneKPQVIADY--esgRAIPNNQ 56 DSSP --lllllllllllLHHHHHHHHHHHllLLLHHHHHHHHllLHHHHHHH--hhlLLLLLHH DSSP HHHHHHHHHH---------hHHHL----------- Query KCQEFGRWYK---------hFKKT----------- 73 ident | Sbjct VLGKIERAIGlklrgkdigkPIEKgpraksgpssg 91 DSSP HHHHHHHHHLllllllllllLLLLlllllllllll
DSSP ---LHHHLLlhhhLLHHHHHHHHHHHLLLL---LHHHHHLLL-----LLLHHHHHHHHHL Query ---HHSHXLppeqWSHTTVRNALKDLLKDX---NQSSLAKEC-----PLSQSXISSIVNS 49 ident | | || | | Sbjct kaaPVAGPE--vaANRAGRQARIVAILSSAqvrSQNELAALLaaegiEVTQATLSRDLEE 58 DSSP lllLLLLLE--elLLHHHHHHHHHHHHHHLlllLHHHHHHHHhllllLLLHHHHHHHHHH DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 49 ident Sbjct lgavklrgadggtgiyvvpedgspvrgvsggtdrmarllgellvstddsgnlavlrtppg 118 DSSP llleeelllllllleeelllllllllllllllhhhhhhhhhhlleeeeelleeeeellll DSSP -------------------------lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhl Query -------------------------tyyanvsaakcqefgrwykhfkkt 73 ident Sbjct aahylasaidraalpqvvgtiagddtilvvarepttgaqlagmfenlrr 167 DSSP hhhhhhhhhhhhlllleeeeeellleeeeeelllllhhhhhhhhhllll
DSSP lhhhlllhhhllHHHHHHHHHHHL---LLLLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHL--LLLL-- Query hhshxlppeqwsHTTVRNALKDLL---KDXNQSSLAKECPLSQSXISSIVNS--TYYA-- 53 ident | | | | | Sbjct ------------MDEIDLRILKILqynAKYSLDEIAREIRIPKSTLSYRIKKleKDGVik 48 DSSP ------------LLHHHHHHHHHHlllLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHhhHLLLll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 53 ident Sbjct gyyayinpaslnldyivitsvkakygknyhvelgnklaqipgvwgvyfvlgdndfivmar 108 DSSP lllllllhhhhllleeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhlllleeeeeelllllleeeeee DSSP ------------------------lllhhhhhhhhhhhhhhhhl Query ------------------------nvsaakcqefgrwykhfkkt 73 ident Sbjct yktreefmekflervmsipevertstqvvvkiikespnivifqq 152 DSSP ellhhhhhhhlhhhhllllleeeeeeeellllllllllllllll
DSSP lhhhlllhhhlLHHHHHHHHHHHLllLLHHHhhllllllHHHHhhhhhllllllLLHHHH Query hhshxlppeqwSHTTVRNALKDLLkdXNQSSlakecplsQSXIssivnstyyanVSAAKC 60 ident | | | | Sbjct -----------VLVLFEQMLVDMN--LNEEK-------qQPLR----------eKDIVIK 30 DSSP -----------LHHHHHHHHHLLL--LLHHH-------hHHHH----------lLLHHHH DSSP HHHHHHHHHHH------------------------------------------------- Query QEFGRWYKHFK------------------------------------------------- 71 ident | | | Sbjct REMVSQYLHTSssrsammyiqelrsglrdmhllscleslrvslnnnpvswvqtfgaegla 90 DSSP HHHHHHHHHLLllllhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 71 ident Sbjct slldilkrlhdekdsrnqheiirclkafmnnkfgiktmleteegilllvramdpavpnmm 150 DSSP hhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhllllllhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 71 ident Sbjct idaakllsalcilpqpedmnervleamteraemdeverfqplldglksgtsialkvgclq 210 DSSP hhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhlllllhhhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 71 ident Sbjct linalitpaeeldfrvhirselmrlglhqvlqelreienedmkvqlcvfdeqgdedffdl 270 DSSP hhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhlhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 71 ident Sbjct kgrlddirmemddfgevfqiilntvkdskaephflsilqhlllvrndyearpqyykliee 330 DSSP hhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhh DSSP --------------hl Query --------------kt 73 ident Sbjct cvsqivlhkngtdpdf 346 DSSP hhhhhhhlllllllll
DSSP lhhhlllhhhlLHHHHHHHHHHHLL--LLLHHHHHLLLllLHHHHHHHhhllllLLLLhh Query hhshxlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DXNQSSLAKECplSQSXISSIvnstyyANVSaa 58 ident || | || || Sbjct -----mineieIKRKFGRTLKKIRTqkGVSQEELADLAglHRTYISEV----erGDRN-- 49 DSSP -----lllhhhHHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHHllLHHHHHHH----hlLLLL-- DSSP HHHHHHHH-----hhHHHH--------l Query KCQEFGRW-----ykHFKK--------t 73 ident Sbjct ISLINIHKicaaldiPASTffrkmeeen 77 DSSP LLHHHHHHhhhhlllLHHHhhhhhhhll
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DSSP lhhhlllhhHLLHHHHHHHHHHHLLL---LLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHH--LLLL--- Query hhshxlppeQWSHTTVRNALKDLLKD---XNQSSLAKECPLSQSXISSIVN--STYY--- 52 ident | | || | | | Sbjct ---------DHIKQINAGRVYKLIDQkgpISRIDLSKESELAPASITKITRelIDAHlih 51 DSSP ---------LHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhHHLLlee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 52 ident Sbjct ettvqeaisrgrpavglqtnnlgwqflsmrlgrgyltialhelggevlidtkidiheidq 111 DSSP eelhhhhhhhlllleeeeelllleeeeeeeeelleeeeeeeelllleeeeeeeelllllh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 52 ident Sbjct ddvlarllfeieeffqtyaaqldrvtsiaitlpglvnseqgivlqmphynvknlalgpei 171 DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeelleeelllleeeellllllllllhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 52 ident Sbjct ykatglpvfvandtrawalaeklfghsqdvdnsvlisihhglgagivldgrvlqgrhgni 231 DSSP hhhhllleeeeehhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeellleeeeeeelleellllllll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 52 ident Sbjct gelghiqidpqgkrchcgnygcletvassqairdqvtariqagepsclatveeisiedic 291 DSSP lllllllllllllllllllllllhhhhlhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 52 ident Sbjct aaaadgdplavdviqqlgrylgaaiaivinlfnpekiliggvinqaksilypsieqcire 351 DSSP hhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeelhhhhhhhhhhhhhhhhhhh DSSP ------------------------llllhhhhhhhhhhhhhhhhl Query ------------------------anvsaakcqefgrwykhfkkt 73 ident Sbjct qslpvyhqdlklvesrfykqatmpgaalikqalydglllmkvveg 396 DSSP hllhhhhllleeeellllllllhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhl
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DSSP lhhhlllhHHLLHHHHHHHHHHHLLL------LLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHLlllll Query hhshxlppEQWSHTTVRNALKDLLKD------XNQSSLAKECPLSQSXISSIVNStyyan 54 ident | || | Sbjct --------CTVNDAEIFSLVKKEVLSlntndyTTAISLSNRLKINKKKINQQLYK-lqke 51 DSSP --------LLLLLHHHHHHHHHHHHLllllleELHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHH-hhhl DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhl Query vsaakcqefgrwykhfkkt 73 ident Sbjct dtvkmvpsnppkwfknync 70 DSSP lleeeellllleeeellll
DSSP lhhhlllhhHLLHHHHHHHHHHHLLLL-------LHHHHHLLLLllhhhhhhhhhlllll Query hhshxlppeQWSHTTVRNALKDLLKDX-------NQSSLAKECPlsqsxissivnstyya 53 ident | | | Sbjct ---------XITETQLTAIQTYALQKLahdhsghGRDHLQRVNR---------larrlak 42 DSSP ---------LLLHHHHHHHHHHHHHHLlllllllLHHHHHHHHH---------hhhhhhh DSSP lllhHHHHHHHHHHhhHHHL---------------------------------------- Query nvsaAKCQEFGRWYkhFKKT---------------------------------------- 73 ident Sbjct degaNLNLTLAAAW-lHDVIlxanpakahqdlivqlnaqnvtaddqtaifaiidhxsfsk 101 DSSP hhllLHHHHHHHHH-hLLLLllllhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllllhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 73 ident Sbjct sfngpqklslegqvvqdadrldaigaigiaralyysghvgekiydpaiaprehxtreqyr 161 DSSP hllllllllhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhh DSSP --------------------------------------------------- Query --------------------------------------------------- 73 ident Sbjct hqpgtainhfyeklfklaalxntdtakalaahrtavxhefvdqfkaewtad 212 DSSP hllllhhhhhhhllllhhhhlllhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhl
DSSP lhhhlllhhhllHHHHHHHHHHHLLLL---LHHHHHLLLL-LLHHHHHHHHHLlllllll Query hhshxlppeqwsHTTVRNALKDLLKDX---NQSSLAKECP-LSQSXISSIVNStyyanvs 56 ident | | || | Sbjct -gssgssgkvkwTHEEDEQLRALVRQFgqqDWKFLASHFPnRTDQQCQYRWLR------- 52 DSSP -lllllllllllLHHHHHHHHHHHHHLlllLHHHHHHHLLlLLHHHHHHHHHH------- DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhl Query aakcqefgrwykhfkkt 73 ident Sbjct ---------vlsgpssg 60 DSSP ---------llllllll
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DSSP lhhhllLHHHLLHHHHHHHHHHHL-LLLLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHH--LLLL----- Query hhshxlPPEQWSHTTVRNALKDLL-KDXNQSSLAKECPLSQSXISSIVN--STYY----- 52 ident | | | | Sbjct ------VRTLANKSKXKVSIVQQIdRKVALDDIAVSHGLDFPELLSEVEtiVYSGtrini 54 DSSP ------LLLHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHhhHHLLlllll DSSP ------------------------------------llllhhhhhhhhhhhhhhhhl Query ------------------------------------anvsaakcqefgrwykhfkkt 73 ident Sbjct dyfinevxdedhledifeyfkesttdsleeaxqelgkdyseeeirlvrikflsexan 111 DSSP hhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhl
DSSP lhhhlllhhhlLHHHHHHHHHHHLLLLL--------------------HHHHHLLLlllh Query hhshxlppeqwSHTTVRNALKDLLKDXN--------------------QSSLAKECplsq 40 ident | Sbjct ----vtyektfEIEIINELSASVYNRVLnyvlnhelnkndsqllevnlLNQLKLAK---- 52 DSSP ----llhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhllllllllllhhhhhHHHHHHHH---- DSSP hhhhhhhhllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHL---------- Query sxissivnstyyANVSAAKCQEFGRWYKHFKKT---------- 73 ident | | Sbjct --------rvnlFDYSLEELQAVHEYWRSMNRYskqvlnkekv 87 DSSP --------lllhHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhllllll
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DSSP lhhhlllhhHLLHHHHHHHHHHHLL-LLLHHHHHL-------lllLLHHHHHHHHHL--- Query hhshxlppeQWSHTTVRNALKDLLK-DXNQSSLAK-------ecpLSQSXISSIVNS--- 49 ident | | Sbjct ---------VPNKEQTRTVLIFCFHlKKTAAESHRmlveafgeqvPTVKTCERWFQRfks 51 DSSP ---------LLLHHHHHHHHHHHHHlLLLHHHHHHhhhhhlllllLLHHHHHHHHHHhll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 49 ident Sbjct gdfdvddkehgkppkryedaelqalldeddaqtqkqlaeqlevsqqavsnrlremgkiqk 111 DSSP llllllllllllllllllhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllleee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 49 ident Sbjct vgrwvphelnerqmerrkntceillsrykrksflhrivtgdekwiffvnpkrkksyvdpg 171 DSSP elleelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeeeeeeeeellllllleeeelll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 49 ident Sbjct qpatstarpnrfgkktmlcvwwdqsgviyyellkpgetvnaaryqqqlinlnralqrkrp 231 DSSP llllleellllllleeeeeeeeellleeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhll DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 49 ident Sbjct eyqhrviflhdnapshtaravrdtletlnwevlphaayspdlapsdyhlfasmghalaeq 291 DSSP lllllleeelllllllllhhhhhhhhhllleelllllllhhhlhhhhlhhhhhhhhhlll DSSP -----------------------lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhl Query -----------------------tyyanvsaakcqefgrwykhfkkt 73 ident Sbjct rfdsyesvkkwldewfaakddefywrgihklperwekcvasdgkyfe 338 DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll
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