A0AVF1  IFT56_HUMAN

Gene name: TTC26   Description: Intraflagellar transport protein 56

Length: 554    GTS: 1.84e-06   GTS percentile: 0.595     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 229      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MMLSRAKPAVGRGVQHTDKRKKKGRKIPKLEELLSKRDFTGAITLLEFKRHVGEEEEDTNLWIGYCAFHLGDYKRALEEYENATKEENCNSEVWVNLACT 100
gnomAD_SAV:    LLV    A A  D  #A N        R         N   T  P    H     K Y DF*T * V  QS FRSV  K #D A  G     G  K VGI
Conservation:  9576426434231110021121212013043221013323521123295122521232234635735765545555544642340122622669838794
SS_PSIPRED:                      HHH       HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                 HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                       HHHH HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                            
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                           
DO_IUPRED2A:               DDDDDDD DD                                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YFFLGMYKQAEAAGFKASKSRLQNRLLFHLAHKFNDEKKLMSFHQNLQDVTEDQLSLASIHYMRSHYQEAIDIYKRILLDNREYLALNVYVALCYYKLDY 200
gnomAD_SAV:     L F L     TGV    ENQPE H#HYPF L     #  I      K  I Y#     V S *   R   #T  Q M G  V #    C #      GC
Conservation:  2858956145513503462418556467653499257439914994949559997997977979779499767976777366246744697797777646
SS_PSIPRED:    HHH   HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHH   HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHH  HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YDVSQEVLAVYLQQIPDSTIALNLKACNHFRLYNGRAAEAELKSLMDNASSSFEFAKELIRHNLVVFRGGEGALQVLPPLVDVIPEARLNLVIYYLRQDD 300
PathogenicSAV:                                                               S                                     
gnomAD_SAV:    C M      L  H   G  TT S  GR   H     V     R  I DPA   K             Q         S         K     *  H  E
Conservation:  4446646644664237474465748766356734664994554264232133449567674776777537144732443746644749977777543469
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH HHHH   HHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHH   H    HHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VQEAYNLIKDLEPTTPQEYILKGVVNAALGQEMGSRDHMKIAQQFFQLVGGSASECDTIPGRQCMASCFFLLKQFDDVLIYLNSFKSYFYNDDIFNFNYA 400
BenignSAV:              N                                                                                          
gnomAD_SAV:       V    TN VLA#          S    *KVSL          Y       #   KV   P    Y      C       H       T# M   S  
Conservation:  6556537548647234859796777565495422564456274367466954476546567757754459753371367376364446443463826565
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QAKAATGNTSEGEEAFLLIQSEKMKNDYIYLSWLARCYIMNKKPRLAWELYLKMETSGESFSLLQLIANDCYKMGQFYYSAKAFDVLERLDPNPEYWEGK 500
gnomAD_SAV:    RV  V   N   K V      #ETE   V   # SQ   T   A  #   H RI N RK  G    M I   RV *  C            SY QC K#R
Conservation:  5546324241566538456455435156573777677462957444992791366584455467656777765466632454353155254213343477
SS_PSIPRED:    HHHHH    HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH     HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH   HHHHHHHHHHH HH   HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50    
AA:            RGACVGIFQMIIAGREPKETLREVLHLLRSTGNTQVEYMIRIMKKWAKENRVSI 554
gnomAD_SAV:    WD R      VTP  KRE   #G HR    I SI   C#MQ L     G KA T
Conservation:  476767564433222544415235502632334434463564545953343511
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                       D
DO_SPOTD:                                                            
DO_IUPRED2A: