A6NDK9  GOG6C_HUMAN

Gene name: GOLGA6C   Description: Golgin subfamily A member 6C

Length: 693    GTS: 8.901e-07   GTS percentile: 0.193     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 188      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MWPQPYLPPHPMMLEESRQNKLAAAKKKLKEYQQRKSPGIPAGAKTKKKKTDSSPETTTSGGGHSPGDSQYQELAVALESSSVTINQLNENIESLKQQKK 100
gnomAD_SAV:          V  D I SD  #        T            V   T       N   Q    S CY                                    
Conservation:  5021210122311112201022232211746534742472315353333241337423423423243421332011021432032018113334413344
SS_PSIPRED:                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                  HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  BBBBBBBDDDDDDDDDDDDDDDD       DD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          DDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QVEHQLEEAKKTNNEIHKAQMEQLETINILTLEKADLKTTLYHTKRAARHFEEESKDLAGRLQYSLQRIQELERALSAVSTQQQEEDRSSSCREAVLQRR 200
gnomAD_SAV:             R          TQ                                      L     P   K  Q V   P      G FL FS VF HQQ
Conservation:  2334464445735353433326244444393455327444777432512245333357423451454221433233454255337543342223433243
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH   H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH    HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D             DD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                D  DDDDDDDDDDDDD                     DDDDDDDDDDDDDDDDDD      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LQQTIKERALLNAHVTQVTESLKQVQLERDEYAKHIKGERARWQERMWKMSVEARTLKEEKKRDIHRIQELERSLSELKNQMAEPPSLAPPAVTSVVEQL 300
gnomAD_SAV:      *I  D V   T M       R  R  #Y# T QL    DQ          G        Q                     K                
Conservation:  7235157266432222323155344244545521253576344443524341331274276323344375974344235462543212454423624479
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHH
DO_DISOPRED3:  D                                 D DDDDDD DDDDDD  DD    D     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                        D    DD  DD     D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QDEAKHLRQEVEGLEGKLQSQVENNQALSLLSKEQKQRLQEQEEMLREQEAQRVREQERLCEQNERLREQQKTLQEQGERLRKQEQRLRKQEERLRKEEE 400
gnomAD_SAV:                            S         K                  MW L          Q             Q      H      Q    
Conservation:  5775449643772234474476357515446413643643174433355354434727495545549457455935754994977222222239947573
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD     DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D     DDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDD   DD         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDDD 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RLQKQEKRLWDQEERLWKKEERLQKQEERLALSQNHKLDKQLAEPQCSFEDLNNEKKSALQLEQQVKELQEKLDEEHLEAASQRNQQLETQLSLVALPGE 500
gnomAD_SAV:               E      E D                          N Q                                                  
Conservation:  9945772994255457425754974595551234423535699777537638896477465634354699854235233433223323213434244775
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                       D    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GDGGQHLDSEEEEAPRPTPNIPEDLESREATSSFMDLPKEKADGTEQVERRELGFVQPSGVTDGMRESFTVYESQGAVPNTRHQEMEDVIRLAQKEEEMK 600
gnomAD_SAV:                 VS S A        Q S  R    L     RM     QD  LIH       L     I          #     N V       VL 
Conservation:  7455473546952493545334444733563345023236552437564235333247531445454143245445444214634264323944547745
SS_PSIPRED:                          HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH                 HH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                            HHHHHHHHH HHHHHHHH HHHHHHHHHH                           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:             HHH           HHHHHHHHHHHH  HHHH  HHHHHHHHHH                          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90   
AA:            VKLLELQELVLPLVGNHEGHGKFLIAAQNPADEPTPGAPAPQELGAAGEQDDFYEVSLDNNVEPAPGAAREGSPHDNPPVQQIVQLSPVMQDT 693
gnomAD_SAV:        K # M      #QK R     V    VVK  LEPA T   V  SK AV * #NPESK# TESEVVKKV LQVSLRIL*MLH PS  EVI
Conservation:  354644442745334526341544234433132426528553364431323144546512734431513434631347753343473452744
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH                                                                HHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH         HH                               E                       HHHHHHHH HHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH                                                                      HHH       
DO_DISOPRED3:  DDDD                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:              D       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD