A6NFE2  SMCO2_HUMAN

Gene name: SMCO2   Description: Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2

Length: 343    GTS: 1.089e-06   GTS percentile: 0.263     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 132      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MALTPTNLNNKMSLQMKMDCQEQQLTKKNNGFFQKLNVTEGAMQDLLKEIIKVDHILDRSDDEDDISSENPQTDFLHKGMLELEAEHDQDLSKQDKQETD 100
gnomAD_SAV:       M     H    P#    RQ      SS I R      DSV#   TK   A      L HG    FK S     YRRK       #EV          
Conservation:  2120111402113462112135333122311344201004211013624222342243233323122453223324222124333411422222454411
SS_PSIPRED:                    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHH HHHHHHHHHH    HHHHHHH   
SS_SPIDER3:                        HHHHHHHH   HHHH H HHHHHHHHHHHHHHHHHH                          HHH      H  H     
SS_PSSPRED:                  HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                        HHHHHHH    HHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDD D                                               DDDDDDD             DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D     D                             DDDDDDDDDDDD    DDDD     DDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VDEDPQASTSLQFSKKNLLELCLKGMFLKLNYWNTKIGLQVKELGADYIDGTEKIDNIIKKINVTENTVKSLLKDMLTLKGQIEKLEDRGLDLDQGTSTE 200
gnomAD_SAV:     E GA*V I  *     I DP    L     C*   #             VM ET#SM #  KA    MR            TKQ   WD     E NP 
Conservation:  0032710234312441222321241132263274125246457642640262475335333320552453566264325436331343352333422133
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HH
SS_SPIDER3:                  H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    H  HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             
SS_PSSPRED:               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDD                                                                             D           
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDD                                                                       DDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD                                                                                 D          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VNTCNEVYELKKKVIERLEDLCKNVELLSAKLRMYQMEAEDTDSHSSEEIDTEEMEALLPQAPASFLVQKSPPRNTAWKRALRIFIMFDVLTVTGLLCYI 300
gnomAD_SAV:        K F    TR L  V  FF      R    I      N  F G   # M G K   A TST    P  S H  V  C      I VI SI  F * M
Conservation:  2234353146454310245464635123433541431432245415334111330424354432312212344102176256443315534243445793
STMI:                                                                                             MMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HH   HHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                          DDDDDDDDDDD DDDDD  DDDDD  DDDDD                             
DO_SPOTD:      DD                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD               D  DDD                              
DO_IUPRED2A:                                         D   DDDDDDDDDDDDD                                             

                       10        20        30        40   
AA:            LFFGATFLFERVLLRMLGCRTTWDLREMREPFLNLEVEALLPS 343
gnomAD_SAV:      S       K    I   C  *  W  KD S S    D  L 
Conservation:  9647369599439423563135845643316663445545964
STMI:          MMMM                                       
SS_PSIPRED:    HHH HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH HHHHHH   
SS_SPIDER3:    H HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH HHHHH    
SS_PSSPRED:    HHH  HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH  HHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                            D
DO_SPOTD:                                                D
DO_IUPRED2A: