A8MT33  SYC1L_HUMAN

Gene name: SYCE1L   Description: Synaptonemal complex central element protein 1-like

Length: 242    GTS: 1.443e-06   GTS percentile: 0.422     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 136      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAGKLKPLNVEAPEATEEAEGQAKSLKTEDLLAMVIKLQKEGSLEPQIEDLISRINDLQQAKKKSSEELRETHSLWEALHRELDSLNGEKVHLEEVLGKK 100
gnomAD_SAV:     TR V LV#   SKTA D AR    F P  F  VMM  E G   D    N   W  Y   V   CNG  G    #*KGPY K HF  A EL V G  DN 
Conservation:  9010011111111100301011111121314423312312472537455265245444547542623862733132527235763521733475443344
SS_PSIPRED:                HHHHHHH        HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH
SS_SPIDER3:                HHHHHHH        HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH
SS_PSSPRED:                HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH  H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                           
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                          
DO_IUPRED2A:     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                    DDDDDD  D D                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QEALRILQMHCQEKESEAQRLDVRGQLEDLMGQHKDLWEFHMLEQRLAREIRALERSKEQLLSERRLVRAKLREVERRLHSPPEVEGAMAVNDGLKAELE 200
gnomAD_SAV:    H   T   RY##    K  TM   R PK P  H     GL I Q   VW  C   K * K H*KM      RQ M LQ PWL  IA SV L N    K  
Conservation:  5556244415352331312532214355234344624454512312621440262132436415433322432152134122112122110123331332
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH  H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         H   HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                   DDDDDDD                                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:          DDD       DDD DDDDD                                              DD   DDDDDDDDDDDDDD         

                       10        20        30        40  
AA:            IFGEQVRSAPEVGAGEGEAGPELPRARDEEDPEPPVAAPDAL 242
gnomAD_SAV:      RK* Q  T#IRVCG D R    C# # #  K     SN V
Conservation:  012111020111111011111111111110111111111111
SS_PSIPRED:    HHHHHH                                    
SS_SPIDER3:    HHHHH                                 HHHH
SS_PSSPRED:    HHH                                       
DO_DISOPRED3:           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    
DO_IUPRED2A:        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD