O00322  UPK1A_HUMAN

Gene name: UPK1A   Description: Uroplakin-1a

Length: 258    GTS: 2.728e-06   GTS percentile: 0.856     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 183      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MASAAAAEAEKGSPVVVGLLVVGNIIILLSGLSLFAETIWVTADQYRVYPLMGVSGKDDVFAGAWIAIFCGFSFFMVASFGVGAALCRRRSMVLTYLVLM 100
BenignSAV:                                     A                                                                   
gnomAD_SAV:     T V  V SKQRCRFLAC PF  S   P * MA     T M  NH C * PTEI  N EI T  *VVVL*D   L#ASN VM TT  HCW V  M  LF 
Conservation:  7111111110110111122531422342345556263455433321124243244252453343854385854662333484164221140334385354
STMI:                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     MMMMMMMMM
SS_PSIPRED:     HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        HH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEHHHHE     EHEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH   EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEE    EEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDD                                                                                           
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDD                                                                                         
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LIVYIFECASCITSYTHRDYMVSNPSLITKQMLTFYSADTDQGQELTRLWDRVMIEQECCGTSGPMDWVNFTSAFRAATPEVVFPWPPLCCRRTGNFIPL 200
gnomAD_SAV:       #F  #   TACDP SG*V    C F  *    CR  A RD K  HF*YHLTT *##  I  LTN#   MT LQV AAGE#LL  S  SHWMR V  V
Conservation:  3447396386465623334343113233435770160130022024702642471411689305805730526166003252235892099232011032
STMI:          MMMMMMMMMMMM                                                                                        
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH         HHH    HHHHH                       
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     H HHHHHHHHHHHHH        H HHH   HHHHH       E   H           
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH               HHHHH                       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                           N                              

                       10        20        30        40        50        
AA:            NEEGCRLGHMDYLFTKGCFEHIGHAIDSYTWGISWFGFAILMWTLPVMLIAMYFYTML 258
BenignSAV:                                                             T 
gnomAD_SAV:    HKKS L#ER#V  L  D LK VS T #  MS VL L      RK LFTPT R L ITP
Conservation:  4225823810343302654114223212233555548354433111111112121000
STMI:                                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      
SS_PSIPRED:                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:                     HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                            
DO_SPOTD:                                                             DDD
DO_IUPRED2A: