O00337  S28A1_HUMAN

Gene name: SLC28A1   Description: Sodium/nucleoside cotransporter 1

Length: 649    GTS: 2.755e-06   GTS percentile: 0.862     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 3      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 403      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MENDPSRRRESISLTPVAKGLENMGADFLESLEEGQLPRSDLSPAEIRSSWSEAAPKPFSRWRNLQPALRARSFCREHMQLFRWIGTGLLCTGLSAFLLV 100
BenignSAV:                                      G                                                                  
gnomAD_SAV:    K KG L * # VCVIL  T    L V  # GP    V# NY NTT  S  # KVT  S     #REA R V N  # YV* LQRTS D   IE       
Conservation:  4111111111001000010301201100111101001110000001011110111111111010211101100222141012203101332143322332
STMI:                                                                                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:                    HHH      HHHHHHH           HHHH               HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                        E     H  H             HHH                    HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                 HHHH           HHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                         
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                    
DO_IUPRED2A:   DDDDDDD DD                                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ACLLDFQRALALFVLTCVVLTFLGHRLLKRLLGPKLRRFLKPQGHPRLLLWFKRGLALAAFLGLVLWLSLDTSQRPEQLVSFAGICVFVALLFACSKHHC 200
BenignSAV:                                                                                             IS          
gnomAD_SAV:       #    S   SFPI      V  C   WF V     LV L D SC  I*I GV  P T V   P*  QG#  W DE #P S TRL ISFV VF #YY*
Conservation:  4412442454374535232322123213111131130012021010110163551312222313225334632323146464383224323343294351
STMI:          MMMM     MMMMMMMMMMMMMMMMMMM                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMMMMMMMMMMMMMMMM     
SS_PSIPRED:    HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    HHH   HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    H 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AVSWRAVSWGLGLQFVLGLLVIRTEPGFIAFEWLGEQIRIFLSYTKAGSSFVFGEALVKDVFAFQVLPIIVFFSCVISVLYHVGLMQWVILKIAWLMQVT 300
BenignSAV:                                         K                                                               
gnomAD_SAV:    TLPCSGM        APRP I K  TR TE #   KK L L   M#P P  MS  S   ED   H        NGFV I   M#   L T RM   #  I
Conservation:  2614324238334782474544661291034254614341631441175174671122121546425643664345464666264544450645325323
STMI:           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMMMMM
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHE    H H EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEE        EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGTTATETLSVAGNIFVSQTEAPLLIRPYLADMTLSEVHVVMTGGYATIAGSLLGAYISFGIDATSLIAASVMAAPCALALSKLVYPEVEESKFRREEGV 400
gnomAD_SAV:     D IV #  NA #S    P QD  PTQ HF HTIF  AQIFTIRD T   D   #V VTS  N I   V   V     F     A SV   F  G     
Conservation:  4254338644554576562344534536441136066354455393554663345244247734335556656458458535853689331312100114
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMM                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              
SS_PSIPRED:    H   HHHHHHHH  EE          HHHH    HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HH  
SS_SPIDER3:    H    HHEEEEEEEEEE      EE H       HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                
SS_PSSPRED:    H     EEEEEEE EEE      HHH HHHHH     EEEEE   HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                
DO_DISOPRED3:                                                                                             DD   DDD 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KLTYGDAQNLIEAASTGAAISVKVVANIAANLIAFLAVLDFINAALSWLGDMVDIQGLSFQLICSYILRPVAFLMGVAWEDCPVVAELLGIKLFLNEFVA 500
BenignSAV:             S                                                                                           
gnomAD_SAV:     PNCE  RSV# #   VVT  MN  T V#D M V  V QH  S       #   N*    H  SF V WL GL  SEV  E T     V    L  DSAT
Conservation:  1400522264456431973155054436454555554343837236193725542225583254563637345558424255325535563725345645
STMI:                                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                     
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHH
SS_SPIDER3:    E        HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH
SS_PSSPRED:            HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YQDLSKYKQRRLAGAEEWVGDRKQWISVRAEVLTTFALCGFANFSSIGIMLGGLTSMVPQRKSDFSQIVLRALFTGACVSLVNACMAGILYMPRGAEVDC 600
PathogenicSAV:          C                                   P              Q                                       
BenignSAV:                         N                                                                               
gnomAD_SAV:     R   RN  CC    K  ISN  R#LY     HM        S  PT V     I I#S QN #  *T  WV  M  #EY  KGYTS #F V S#   HR
Conservation:  5326513312611312121221333432444244565565845324474344253232406414441132544346123543246346372131100126
STMI:                                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         H
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH    HE     EEE HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH           EEE HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEE        H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        5
AA:            MSLLNTTLSSSSFEIYQCCREAFQSVNPEFSPEALDNCCRFYNHTICAQ 649
gnomAD_SAV:         MI   NI  M E  C GL* DS#    D # KGYW    M    
Conservation:  0034101211121120087014410010101111301440111011311
SS_PSIPRED:    HHHHH         HHHHHHHHHH       HHHHH   HH        
SS_SPIDER3:    HHHH        HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:    HHHHHH      HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                   
DO_SPOTD:                                                      D
DO_IUPRED2A:                                                    
CARBOHYD:          N                                     N