O00635  TRI38_HUMAN

Gene name: TRIM38   Description: E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38

Length: 465    GTS: 1.604e-06   GTS percentile: 0.494     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 234      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MASTTSTKKMMEEATCSICLSLMTNPVSINCGHSYCHLCITDFFKNPSQKQLRQETFCCPQCRAPFHMDSLRPNKQLGSLIEALKETDQEMSCEEHGEQF 100
gnomAD_SAV:    V    G   #T    R #F G  MSS   S     *D  VI    D RENR S     * #YQ#  RV I *  *  E  T#    MG GLL#DK R#HL
Conservation:  7432113134334539349316511643627784681085102211000011012020873821231114332443643433233232130283364626
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHH      HHH               HHHHHH     HH                  HH    HHHHHHHHHHHHH     HHH     
SS_SPIDER3:         H  H    E    HHHH           HHHHHHHHHH              E      E    H    HHHHHHHHHHH        HHH  EE
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHH                               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDD                                                                                       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDD                                                                                           
DO_IUPRED2A:   DDDDD                                                                            D                  
ZN_FING:                      CSICLSLMTNPVSINCGHSYCHLCITDFFKNPSQKQLRQETFCCPQCR                        DQEMSCEEHGEQF
MODRES_P:                                                                           S                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HLFCEDEGQLICWRCERAPQHKGHTTALVEDVCQGYKEKLQKAVTKLKQLEDRCTEQKLSTAMRITKWKEKVQIQRQKIRSDFKNLQCFLHEEEKSYLWR 200
gnomAD_SAV:    Y S KN R     H  W        I  AG I R C  N E  A IR      FM  N  RVV*TA   K   F*KR  Q  C             CI S
Conservation:  2567456256586374512253362423435533254435433332621221241122013214521542141024224312831451592286323534
SS_PSIPRED:    EEEE     EEEHH    HHH   EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEE    EEEEEE    HHH   EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    EHEH H  HHHHHHHHH HH     EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
ZN_FING:       HLFCEDEGQLICWRCERAPQHKGHTTALV                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LEKEEQQTLSRLRDYEAGLGLKSNELKSHILELEEKCQGSAQKLLQNVNDTLSRSWAVKLETSEAVSLELHTMCNVSKLYFDVKKMLRSHQVSVTLDPDT 300
gnomAD_SAV:    P   Q*#  T   ##   MR  N#   R S    GR*    E            N    M #  DI  GR      F    #G     RRHII NPA H 
Conservation:  7425553371373313317225123322353284266437352573553255172234233153222333122433323334332144222315445524
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH HHHHHHHHHH          HHHHH    HHHHHHHHHHHHH     EE    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH               HHHHH     HHHHHHHHHHHH  EEEE  HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH EEEE     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                D      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AHHELILSEDRRQVTRGYTQENQDTSSRRFTAFPCVLGCEGFTSGRRYFEVDVGEGTGWDLGVCMENVQRGTGMKQEPQSGFWTLRLCKKKGYVALTSPP 400
gnomAD_SAV:     Y K  V  VQ    C      PEI#Y   #  S     K L  # S    NI KE R*  EI     R    VT D     C F#    RD    # S 
Conservation:  6612815223222521300211100431561143457723262484336352212431533846133525201212142275746422111221343131
SS_PSIPRED:        EEE     EEEE                  EEEE       EEEEEEE      EEEEEEE            HH  EEEEEEE   EEEE     
SS_SPIDER3:        EEE     EEEE            H     EEEE        EEEEEEEE    EEEEEEE  EE            EEEEEEEE  EEEE     
SS_PSSPRED:       EEEE      EE           HHH     EE           EEEEE      EEEEEE                 EEEEEE    EEEE     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:         D        DDDDDDD                                                                              

                       10        20        30        40        50        60     
AA:            TSLHLHEQPLLVGIFLDYEAGVVSFYNGNTGCHIFTFPKASFSDTLRPYFQVYQYSPLFLPPPGD 465
BenignSAV:                         R                                            
gnomAD_SAV:    I IQVY# LR          #      R S       LRV   HA QT   ACR  L* Q SQ  
Conservation:  32404011212454343353725545421323534456244433134743132213152311011
SS_PSIPRED:              EEEEEEE    EEEEEE     EEEEE                            
SS_SPIDER3:              EEEEEEE    EEEEEE     EEEEE        EEEEEE       E      
SS_PSSPRED:              EEEEEEE    EEEEEE                                      
DO_DISOPRED3:                                                                  D
DO_SPOTD:                                                                     DD
DO_IUPRED2A: