O14678  ABCD4_HUMAN

Gene name: ABCD4   Description: Lysosomal cobalamin transporter ABCD4

Length: 606    GTS: 2.995e-06   GTS percentile: 0.901     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 13      gnomAD_SAV: 360      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAVAGPAPGAGARPRLDLQFLQRFLQILKVLFPSWSSQNALMFLTLLCLTLLEQFVIYQVGLIPSQYYGVLGNKDLEGFKTLTFLAVMLIVLNSTLKSFD 100
BenignSAV:        P                                                      R                                         
gnomAD_SAV:    TVGVWST *S VSL    R   WL  V R #   *L K S ICPI#F  PRP    T R  V     C   * E VQW   V   P  R   S M   I 
Conservation:  2222221100112444521433651133142551314243335243424352365376586457735514851441126304312621553337254733
STMI:                                                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM    
SS_PSIPRED:                     HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                     HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H  HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                     HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDD                            DDDDDDDDDDDD                                               
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDD                                                                                       
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QFTCNLLYVSWRKDLTEHLHRLYFRGRAYYTLNVLRDDIDNPDQRISQDVERFCRQLSSMASKLIISPFTLVYYTYQCFQSTGWLGPVSIFGYFILGTVV 200
BenignSAV:                                V                                           IC                           
gnomAD_SAV:      I H  CL   R   ALF HF  #DHV HA TMPQ EVNK#  H  *GM#* YW    I    LTYLL  I*CA*     AV   LGG L CCV  IM 
Conservation:  5555524563864169219610861334894645543456689997799676795458456544546985629973694156784953565588339733
STMI:                                                                                                   MMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE          HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH HH   HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE        HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NKTLMGPIVMKLVHQEKLEGDFRFKHMQIRVNAEPAAFYRAGHVEHMRTDRRLQRLLQTQRELMSKELWLYIGINTFDYLGSILSYVVIAIPIFSGVYGD 300
BenignSAV:                                                               S                                         
gnomAD_SAV:     Q SVA  L   LQR   D  L LN L MW  V S    G RY   #  NCG R  V*S MK  P  FR  VS   V C       A VGV     FC N
Conservation:  9738749671495599999978978978685688475958570853366426681861284165145547349696969696589834665899381532
STMI:          MMMMMMMMMM                                                                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM 
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH  HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:    HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:    HHHHH  HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LSPAELSTLVSKNAFVCIYLISCFTQLIDLSTTLSDVAGYTHRIGQLRETLLDMSLKSQDCEILGESEWGLDTPPGWPAAEPADTAFLLERVSISAPSSD 400
PathogenicSAV:                   C                                                                                 
BenignSAV:        T                                           # R                 K                                
gnomAD_SAV:       GDR     N G G  C#      VVN  SM L  S  M S V  Q M   V   L   K  CKNK   NI #  LV Q   I LR  Q     #P G
Conservation:  7383586387969798769865697378686443585869668668828351131120010202111013421100010001142562541434138262
STMI:                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                  
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                               EEEEE EEE     
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                               EEEEE EEEE     
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                        E    EEEEE EEEE     
DO_DISOPRED3:                                                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                       
DO_SPOTD:                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                    
DO_IUPRED2A:                                                                             DD                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KPLIKDLSLKISEGQSLLITGNTGTGKTSLLRVLGGLWTSTRGSVQMLTDFGPHGVLFLPQKPFFTDGTLREQVIYPLKEVYPDSGSADDERILRFLELA 500
gnomAD_SAV:     T #EN N    K  I I      I   AFPQ  V   MNAQS MR #MG  SRE       L#C V# VWK  T S    CAH    EN STSS    T
Conservation:  2377568463534726576596896986767849549932119143524268956334485455454647647667875454714643685983449455
SS_PSIPRED:      EEEE  EEE    EEEEE      HHHHHHHH        EEEEE        EEEEE         HHHHHH              HHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:     EEEEE EEEE    EEEEE      HHHHHHHH         EEEE       EEEEE          HHHH                HHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:             E      EEEE      HHHHHHHHH        EEEE        EEEE          HHHHHH              HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                           GNTGTGKT                                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GLSNLVARTEGLDQQVDWNWYDVLSPGEMQRLSFARLFYLQPKYAVLDEATSALTEEVESELYRIGQQLGMTFISVGHRQSLEKFHSLVLKLCGGGRWEL 600
BenignSAV:                                                                                   Q                     
gnomAD_SAV:      Y   TS QA   H#      IR#L   LQ    *F    LR TG         GK   K#CHM     TM VG ERQ RVD  DC I Q     #C  
Conservation:  9523841744869118585836286888678956565473565456766566854744612473152347573586997245345521032514271454
SS_PSIPRED:      HHHHHH           HHH   HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE       HHHHHHHHHHHHHH  EEEEE   HHHHHH  EEEEE     EEE
SS_SPIDER3:      HHHH              HH    HHHHHHHHHHHHHH   EEEEE       HHHHHHHHHHHHH   EEEEEE  HHHHHH EEEEEE     EEE
SS_PSSPRED:        HHHH                 HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE       HHHHHHHHHHHHHH  EEEEE  HHHHHHHHHHHEEEE    EEE
DO_DISOPRED3:                                                      DD                                              
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                     
AA:            MRIKVE 606
gnomAD_SAV:    RK EA 
Conservation:  112200
SS_PSIPRED:    EE    
SS_SPIDER3:    EE    
SS_PSSPRED:    EEE   
DO_DISOPRED3:       D
DO_SPOTD:            
DO_IUPRED2A: