O14777  NDC80_HUMAN

Gene name: NDC80   Description: Kinetochore protein NDC80 homolog

Length: 642    GTS: 7.832e-07   GTS percentile: 0.133     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 228      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKRSSVSSGGAGRLSMQELRSQDVNKQGLYTPQTKEKPTFGKLSINKPTSERKVSLFGKRTSGHGSRNSQLGIFSSSEKIKDPRPLNDKAFIQQCIRQLC 100
BenignSAV:                                                                      A                                  
gnomAD_SAV:      #     S   L ##  I   E  N*DP#S R#R RTA *T N  RL   K  P L  GNN*   W   P   P C N   L RV N            
Conservation:  4241113232224231322531421512216642134123454422511564324355251431628451231643398587398857947766656393
SS_PSIPRED:                    HH                                                                      HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                    HHH H                                                                   HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                                                                            HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                 
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDD     DDDDDD        DDDDDDDD      DD    DD                         
MODRES_P:                                                 S                        S                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EFLTENGYAHNVSMKSLQAPSVKDFLKIFTFLYGFLCPSYELPDTKFEEEVPRIFKDLGYPFALSKSSMYTVGAPHTWPHIVAALVWLIDCIKIHTAMKE 200
gnomAD_SAV:     L     C   A I   *T  L     FC       #A     E    D        PA LY  P   K        C  V         SFE R     
Conservation:  6692314521244264995894879465649430363546335239499658526624664634565654476696676434346288453454002122
SS_PSIPRED:    HHHHH                HHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHH         HHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH          H     HHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHH     EE  HHEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                                                                      S                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSPLFDDGQPWGEETEDGIMHNKLFLDYTIKCYESFMSGADSFDEMNAELQSKLKDLFNVDAFKLESLEAKNRALNEQIARLEQEREKEPNRLESLRKLK 300
gnomAD_SAV:    G    V  KRR   I NA  RSE      K         SN     D        #     VS   *S T D     HM    #         AL    T
Conservation:  1121424120111325332033545345214582187160827451522311355235255311312412423161254437838662535752145334
SS_PSIPRED:                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                  HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:    DDDDDDDDDDDDDDD                                                                                   
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:       DDDDD                                                                     DDDDDDDDDD DDDDDDD    
MODRES_P:                                               S                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ASLQGDVQKYQAYMSNLESHSAILDQKLNGLNEEIARVELECETIKQENTRLQNIIDNQKYSVADIERINHERNELQQTINKLTKDLEAEQQKLWNEELK 400
BenignSAV:                                                    D                                                    
gnomAD_SAV:     F R       T V   G    V  R  S      TGLQ  Y I   D  Q     EDK  L S SK*  Y K   H      NEA  VQ    *#    
Conservation:  1345393565338322455612151371134136133122324233373138413313735433745654174247374423643365235333939953
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                               DD DDDD                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YARGKEAIETQLAEYHKLARKLKLIPKGAENSKGYDFEIKFNPEAGANCLVKYRAQVYVPLKELLNETEEEINKALNKKMGLEDTLEQLNAMITESKRSV 500
gnomAD_SAV:       S  VV AK  K       I     DGD   D      L  K   S   R   K    F  F      AS       I   Y     K V     *  
Conservation:  4351461361152586446967686903446615266572212314112112231562128223413356321121316325444178411230620414
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                EEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             EEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                            DDDDDDDDDDDD         DD                                                       
DO_IUPRED2A:                                      D                                      DDDD                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RTLKEEVQKLDDLYQQKIKEAEEEDEKCASELESLEKHKHLLESTVNQGLSEAMNELDAVQREYQLVVQTTTEERRKVGNNLQRLLEMVATHVGSVEKHL 600
gnomAD_SAV:    IA   D  #                    #                  E    I       QK  V    M   KQ GES   C      I  V AK   
Conservation:  6153643566642231213412154232216343341522273235217223422443235334344242538435230046013322332650235524
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                 DD    D  DDDDDDDDDDDD   D   DDDDDDD  DDDD        DD     D      DDDDD                 D

                       10        20        30        40  
AA:            EEQIAKVDREYEECMSEDLSENIKEIRDKYEKKATLIKSSEE 642
BenignSAV:         P                                     
gnomAD_SAV:    G   PN  KVH D#V*  P#Q M   T    TT N N F   
Conservation:  153014223131412264130031232236224420211111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                 D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                        D  DD DDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:         DD  DD  D  DD  D  D           DD  DD