O14791  APOL1_HUMAN

Gene name: APOL1   Description: Apolipoprotein L1

Length: 398    GTS: 1.282e-06   GTS percentile: 0.347     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 8      gnomAD_SAV: 264      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEGAALLRVSVLCIWMSALFLGVGVRAEEAGARVQQNVPSGTDTGDPQSKPLGDWAAGTMDPESSIFIEDAIKYFKEKVSTQNLLLLLTDNEAWNGFVAA 100
gnomAD_SAV:    #  D  R#I LP   IRVH P M M    GR#GM#* I I IGA GL     S  T D T L G  S  #G  H    L I SM    I#IGV KRL   
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111110101221211121110112131123111112212111
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                         
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHH HH       HHHHH                                   HHHHHHHHHHH   HHHHHHHH   HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHH HH   E HHHHH                                   HHHHHHHH H    HHHHHHHH   HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHEEEHHHHHHHHHHH    EEE                                      HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH   HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDD    D D           DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                                     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                      
DO_IUPRED2A:                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AELPRNEADELRKALDNLARQMIMKDKNWHDKGQQYRNWFLKEFPRLKSELEDNIRRLRALADGVQKVHKGTTIANVVSGSLSISSGILTLVGMGLAPFT 200
BenignSAV:                                                      K       F                 S                        
gnomAD_SAV:     K SS#GE D C S  K      #      G    *   CM    Q   KF GY#STFCT V    N RN  IVTS M   V     #R#FISTV #  P
Conservation:  2132223211412160210111111211001111112305311531241242315127313941442365354543455133443744534373283725
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEHE    HHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    H   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EGGSLVLLEPGMELGITAALTGITSSTMDYGKKWWTQAQAHDLVIKSLDKLKEVREFLGENISNFLSLAGNTYQLTRGIGKDIRALRRARANLQSVPHAS 300
BenignSAV:                                I                          KG             D                              
gnomAD_SAV:     E#R #   S I W T    SR    ST  RR  *  T*V N  V  PH     KG   K TPK IP SA   PF *A#   TCVV # K DF   LYP 
Conservation:  3614425323524453452432334232503111123123213111112002030212010102200110120111204110313342221120120020
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HH 
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         
SS_PSSPRED:                HHHHHHHHH  HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                   DDDD
CARBOHYD:                                                                  N                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ASRPRVTEPISAESGEQVERVNEPSILEMSRGVKLTDVAPVSFFLVLDVVYLVYESKHLHEGAKSETAEELKKVAQELEEKLNILNNNYKILQADQEL 398
PathogenicSAV:                                          G                                         M              
BenignSAV:                                         N                                                             
gnomAD_SAV:     LSAQ PK #LD  S       Q R      E RVRN T AT# VLM I HFMC*  Y # ET LD T # R   E  A Q YV#  K ES  GY* P
Conservation:  01112211121111101311222213123331124032322432431531153234135126444115214522511641131141111205110110
SS_PSIPRED:               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:        E      HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:                HHHHHHHHHHH          EEEEEE  EHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                          D DD  DD                                                                DD
DO_SPOTD:                                                                                                   DDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD                                        DDDDD  DD                           
MODRES_P:                S  S