O14802  RPC1_HUMAN

Gene name: POLR3A   Description: DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1

Length: 1390    GTS: 1.651e-06   GTS percentile: 0.516     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 29      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 581      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MVKEQFRETDVAKKISHICFGMKSPEEMRQQAHIQVVSKNLYSQDNQHAPLLYGVLDHRMGTSEKDRPCETCGKNLADCLGHYGYIDLELPCFHVGYFRA 100
PathogenicSAV: I                                                       E                                 L         
gnomAD_SAV:    I  K#   M M     RVY E E RD  C ##    #   P#R    YD#  F   N    M  EHCA  S  EI SVSVV H F N    S  IE   G
Conservation:  2222222222222224022223352221042425232443344431131422163435333323632252655744336463353445329465777224
SS_PSIPRED:                 EEEEEEEE   HHHHHHH EEEEE                                      HH                   HHHH
SS_SPIDER3:       EE       EEEEEEEEE   HHHHHHH EEEE  HHHE                     E           HHH      EEEE    H   HHHH
SS_PSSPRED:              HHHHHHHEE     HHHHHHHHHEEEE                                             EEEEEE        HHHH
DO_DISOPRED3:  BDD                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                   
DO_SPOTD:      DDD                                                                                                 
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                                                                             C  C      C  H                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VIGILQMICKTCCHIMLSQEEKKQFLDYLKRPGLTYLQKRGLKKKISDKCRKKNICHHCGAFNGTVKKCGLLKIIHEKYKTNKKVVDPIVSNFLQSFETA 200
gnomAD_SAV:     R VS     I  Y T  *VV Q   NHQR  SV F   Q    Q  Y  Q  H   YY T##C I         N     S         # F    I 
Conservation:  4535647583363255630655267130365525327696656875554866531610534246346544264624664443562442152154356335
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH     HH   HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHH                       HH            HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH    H     HHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHH    E          E        E             HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH HE   HHHHHHHHHHHH H   HHHHHHHHHHHHHHH                                     HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                 C  C                                           C                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IEHNKEVEPLLGRAQENLNPLVVLNLFKRIPAEDVPLLLMNPEAGKPSDLILTRLLVPPLCIRPSVVSDLKSGTNEDDLTMKLTEIIFLNDVIKKHRISG 300
gnomAD_SAV:    VD    AK  R T R      ELM    * A KNA      R  R LP     *  A     T  IA E         V           N     Q   
Conservation:  3534332522224634463632542353551034313836453344823451434457974577776452447345976746757754576454453347
SS_PSIPRED:    HHH   HHHHHHHHH    HHHHHHHHH   HHHHHHH        HHHEEEEEE                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHH HHHHHHH        HHHHHHHH    HHHHHH         HHH EEEEE                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHH   HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH   HHHHHHH         HHHEEEE                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                      DDD DDDDDDDDDDDDDDDDD                           
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AKTQMIMEDWDFLQLQCALYINSELSGIPLNMAPKKWTRGFVQRLKGKQGRFRGNLSGKRVDFSGRTVISPDPNLRIDEVAVPVHVAKILTFPEKVNKAN 400
PathogenicSAV:          C                                                             N              G             
gnomAD_SAV:         M       H      V R  LS   S T    I   IHC Q    #                 V   AT W     M A M R    S  L  G 
Conservation:  6654463665579977665455746746534333345345337777775775577757797977365995746532554744834344354554164126
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHH                     EE        HHH    HHHHHH        HHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHHH H                H HHHHH    EE EE            EEE       HHH     HHHHH     E  HHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHH                                 EE   HHHHHHH       HHH
DO_DISOPRED3:                            D  D  DDDDD  D D    BBBDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD                             
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            INFLRKLVQNGPEVHPGANFIQQRHTQMKRFLKYGNREKMAQELKYGDIVERHLIDGDVVLFNRQPSLHKLSIMAHLARVKPHRTFRFNECVCTPYNADF 500
gnomAD_SAV:    FSC    I  S  G   V  T   DK   K     T*  #  D     TIDKDVMNR M P  W*         S     E  W    K SA I     L
Conservation:  3045436734644247675644440223465745444333444953772779973557555779997995775547454445347995544754577757
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH         EEEE     EEE EE  HHHHHHH     EEEEEE    EEEEE    HHHHHHH    EE    EEEE            
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH        E EEEE     EEEEEE   HHHHHH     EEEEE     EEEE     H HHHHH  EEEE    EEEE            
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH         EEE      EEEHHH  HHHHHHHH    EEEE      EEEE     HHHHHHHHHHHEE                    
DO_DISOPRED3:                                                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                 DDDDDDD          DD                                                                   
METAL:                                                                                                           D 
MODRES_A:                                                  K                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DGDEMNLHLPQTEEAKAEALVLMGTKANLVTPRNGEPLIAAIQDFLTGAYLLTLKDTFFDRAKACQIIASILVGKDEKIKVRLPPPTILKPVTLWTGKQI 600
PathogenicSAV:                                                          L  G                                       
BenignSAV:                                                                               M      #                  
gnomAD_SAV:         HV V       T        E#    L S D#          ST I         QV S    G VV  MVKNN  HV L  #   I  *MRE T
Conservation:  5774577777543545753328334533364734447744336659653655736947459323646344322222343340562834277327777665
SS_PSIPRED:                HHHHHHHHHHH               EEHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHH               EE        HHH
SS_SPIDER3:                HHHHHHHHHH       E       EEEEEHHHHHHHHHHH    EE HHHHHHHHHHHH               E   EE    HHH
SS_PSSPRED:                HHHHHHHHHHH              EEEHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH                E        HHHH
DO_DISOPRED3:       DDDDDDDD                                                                                       
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:      D                                                                                                
METAL:         D D                                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FSVILRPSDDNPVRANLRTKGKQYCGKGEDLCANDSYVTIQNSELMSGSMDKGTLGSGSKNNIFYILLRDWGQNEAADAMSRLARLAPVYLSNRGFSIGI 700
PathogenicSAV:  R                                 Y       K                           E                            
gnomAD_SAV:    YR   T NNA    #T # RDR C CEE    PS  H  V   KFT  GVY  A      S  Y LVPQ  EE        Q PS GS C PSH   V F
Conservation:  6524536303312222266454463432242302643823354372263544434725543466663333353125224445422222232366834585
SS_PSIPRED:    HH           EEEEE                  EEEEE  EEEEEEE            HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:    EEEE         EEEEE E  E             EEEEE  EEEEEEE HHH        HHHHHEHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEE 
SS_PSSPRED:    EEEEE        EE                     EEEEE   EEE E            HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                  DD                                 DD                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GDVTPGQGLLKAKYELLNAGYKKCDEYIEALNTGKLQQQPGCTAEETLEALILKELSVIRDHAGSACLRELDKSNSPLTMALCGSKGSFINISQMIACVG 800
PathogenicSAV:                        Y                                                  #                         
BenignSAV:                 N                                                                                       
gnomAD_SAV:    S     *    V    P  S RQ    VK   MS   * R   TD S     V               Q  E      NT  WS  C      P    L 
Conservation:  5643431254124124412330342446436134454336544345655345445764566357345434744374543744575774375759567599
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHH         HHHHHHHH 
SS_SPIDER3:       E  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHH         HHHHHHHH 
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH       HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                         D                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QQAISGSRVPDGFENRSLPHFEKHSKLPAAKGFVANSFYSGLTPTEFFFHTMAGREGLVDTAVKTAETGYMQRRLVKSLEDLCSQYDLTVRSSTGDIIQF 900
PathogenicSAV:    T                   P                           V                                            N   
gnomAD_SAV:        NS *LL S         GN#P       I       S I A LL  ATG W                 * P   F G   R  M  Q #  VV   
Conservation:  9977595977599477777772654436365777347433463559634454466246364533363555347774745755434663766443455775
SS_PSIPRED:     EE                        HHH             HHHHHHHHHH       HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH      EE     EEEE
SS_SPIDER3:           E        E          HH   EH         HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHEEEEE   EE     EEEE
SS_PSSPRED:    HH                               HHH          HHHH        HHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH    EE     EEEE
DO_DISOPRED3:                            D      D                                                                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:            D    DD                                                                                    
REGION:                                                   PTEFFFHTMAGRE                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IYGGDGLDPAAMEGKDEPLEFKRVLDNIKAVFPCPSEPALSKNELILTTESIMKKSEFLCCQDSFLQEIKKFIKGVSEKIKKTRDKYGINDNGTTEPRVL 1000
PathogenicSAV:   R          E                                                                                      
gnomAD_SAV:      RR        AE   # A       TRV LL  T S  R  #   AR   #N*N    F G  R    RL#*R   NVR NT        D    C  
Conservation:  4673557554256445433384345373462212005224413241021504124014034442422443244103434324332454555334262352
SS_PSIPRED:    EE      HHHH        HHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHH
SS_SPIDER3:    EE      HHH         HHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHH  HHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHH
SS_PSSPRED:    E                  HHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                 DDDD 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:               D                                                                        DDDD          D

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YQLDRITPTQVEKFLETCRDKYMRAQMEPGSAVGALCAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNITLGVPRIKEIINASKAISTPIITAQLDKDDDADYARL 1100
PathogenicSAV:     #                                                               Q                               
gnomAD_SAV:        H  S #A N   # W  H#     A      R  *G    A             S       M Q    T V      AVTK   G   NV  TH 
Conservation:  2222324355432532222254233432694557554775773577544749977799755755977995754554341536635242530223234433
SS_PSIPRED:    H      HHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHEE    HHH  HHHHHH  HH         HHHHHHHH       EEEEE      HHHHHH
SS_SPIDER3:    H      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH     EEEEEE     HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH       HHHHHHHHH            HHHHHHHHHH     EEEEE      HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                            DDDDDDDDDD                                                
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VKGRIEKTLLGEISEYIEEVFLPDDCFILVKLSLERIRLLRLEVNAETVRYSICTSKLRVKPGDVAVHGEAVVCVTPRENSKSSMYYVLQFLKEDLPKVV 1200
PathogenicSAV:                               R                                                                     
gnomAD_SAV:      E L  I  R V K T    P GN  N IR   #W         T I       Y FCA LSV VLP   A Y IL      CVHHM      G # M 
Conservation:  4333423424233344335443323214442333533446534524433243643645655534446354332743324444443436432341494323
SS_PSIPRED:    HHHHH EEEHHHHHHHEEEEE     EEEEEE HHHHHHH     HHHHHHHHHH      HHHEEEE   EEEEE        HHHHHHHHHHH    E
SS_SPIDER3:    HHH H  E HHHHH EEEEEE     EEEEEE HHHHHH      HHHHHHHHH    EE HHHEEEE  EEEEEE       HHHHHHHHHHHH   EE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH   E     EEEE  EEEEEE       HHHHHHHHHHHH   EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VQGIPEVSRAVIHIDEQSGKEKYKLLVEGDNLRAVMATHGVKGTRTTSNNTYEVEKTLGIEAARTTIINEIQYTMVNHGMSIDRRHVMLLSDLMTYKGEV 1300
PathogenicSAV:                                                             K                              N        
gnomAD_SAV:     R  # L    M  VKKN*MKR*     DN  QG   I S  #PQ   S  C    I  VK##Q M  S  R     YST MN KQM    N  I Q#  
Conservation:  4545333454323333222525346435643532455548824235455332264344865336256336525432447454447953442646634775
SS_PSIPRED:    EE      EEEEEE      EEEEEEEE   HHHHH       EEEEE  HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHEE    EE
SS_SPIDER3:    EEE     EEEEEEE     EEEEEEEE   HHHHH         E    HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH     EE
SS_PSSPRED:    EEE    EEEEEEE       EEEEEE    HHHHHH      EEEE   HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH     EE
DO_DISOPRED3:                                                      D                                               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                          DD    DDDD                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90
AA:            LGITRFGLAKMKESVLMLASFEKTADHLFDAAYFGQKDSVCGVSECIIMGIPMNIGTGLFKLLHKADRDPNPPKRPLIFDTNEFHIPLVT 1390
PathogenicSAV:                               T   R                                                       
BenignSAV:                                                                                T              
gnomAD_SAV:         S   R    M V V        #S T   R  YCMY    S  #   T VR R L     TN# L   # LV  NAKD ##SP  
Conservation:  779997957554475977566743344545543565284446455453483445253543357432221212422311221021213101
SS_PSIPRED:    EEE HH          HH  HHHHHHHHHHHHHH           HHH          HHHHHH                          
SS_SPIDER3:    EEEEEEHHHH    HHHHH HHHHHHHHHHHHH       E HHHHHH         EEEEEEEE                       EE
SS_PSSPRED:    EEEHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EEEEE         HHHHHHHH                         
DO_DISOPRED3:            DDDD DD    DDD                                             DDDDDDDDDDDDDDDD DD D
DO_SPOTD:                                                                                                
DO_IUPRED2A:                                                                           D