O14983  AT2A1_HUMAN

Gene name: ATP2A1   Description: Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1

Length: 1001    GTS: 2.702e-06   GTS percentile: 0.852     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 499      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEAAHAKTTEECLAYFGVSETTGLTPDQVKRNLEKYGLNELPAEEGKTLWELVIEQFEDLLVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILIA 100
gnomAD_SAV:    VQ  Y    D#Y DC  M K M  ILE  Q  Q*  S  K  V   N  *#P #QH   HR WL    VR     TR Q DG I         V    TT
Conservation:  6212211111223012131201443222210112142122685446654538728994698989966994596496565444353756769477566644
STMI:                                                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                    MMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:       HHH  HHHHHHHH         HHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       HH   HHHHHHHH         HHHHHHHHHHH            HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHH  HHHHHHHH         HHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  D                                                                                                   
DO_SPOTD:      DDD                                                                                                 
DO_IUPRED2A:   D                                                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NAIVGVWQERNAENAIEALKEYEPEMGKVYRADRKSVQRIKARDIVPGDIVEVAVGDKVPADIRILAIKSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTEPVPDPRAV 200
gnomAD_SAV:    S NM I   L    SVKD  # Q GT   C           SW VI   #M     NE  G  #  T    M L VH   P K A  VNNM  I V QG 
Conservation:  6545647833345555458545554475525134124436443333755445433523133534531537748868886958574754443444433656
STMI:          MMMMMMMMMM                                                                                          
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH    EEEEE    EEEEE HHH     EEEE         EEEEEEEE  EEEEEHHHH     EE            
SS_SPIDER3:    HHHHHH  H  HHHHHHHHHH     EEEEE  EEEEEEE HHH     EEEE    E    EEEEEEE   EEEEE       EEEE E E        
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEE    HHHEE          EEEE    EE   EEEEEEE   EEEEEE     EEEEEE           
DO_DISOPRED3:                                                                             DDDDDDDDDDDDDDD          
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                             DDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NQDKKNMLFSGTNIAAGKALGIVATTGVGTEIGKIRDQMAATEQDKTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICVAVWLINIGHFNDPVHGGSWFRGAIYYFKIAV 300
BenignSAV:                                                 N                                  S                    
gnomAD_SAV:    H     T  L  SV  S S   M   S  #K    *GR  P Q N  A  R  AK      R  F       H  M   SNSIR DF  CR   H  TDM
Conservation:  5567583665645745965384545552178687863544333334579626555663558355444844563464588348468767348846454655
STMI:                                                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                      MMMMM
SS_PSIPRED:          EEE   EEEE EEEEEEE    HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:          EEEE E  EE EEEEEEE   H HHHHHHHHHHH   H   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH E           HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:          EEE   EE    EEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                              DD                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDD                                  D      D      D                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCKMFIIDKVDGDICLLNEFSITGSTYAPEGEVLKNDK 400
gnomAD_SAV:      S G   K  RS T    T   HQ SN  T # #  F#  PS   F#  N           # NI  T   VE VFF  K   I    T          
Conservation:  8658665844656666676584546764636756347457779655467565696676576663666443132110506136354753548263511110
STMI:          MMMMMMMMMMMMM                                                                                       
SS_PSIPRED:    HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EE     HH      EEEE          EEEEEEEEEEEE    EEEEEEEEEE        EEE  E
SS_SPIDER3:    HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EE     H H   EEEEEE         EEEEEEEEEE      EEEEEEEEE  EEE     EEE  E
SS_PSSPRED:    HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE            EEE            EEEEEEEE         EEEEEEE EE      EE    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                 DD    
BINDING:                                                           T                                               
METAL:            VA I E                                         D T                                               
ACT_SITE:                                                        D                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PVRPGQYDGLVELATICALCNDSSLDFNEAKGVYEKVGEATETALTTLVEKMNVFNTDVRSLSKVERANACNSVIRQLMKKEFTLEFSRDRKSMSVYCSP 500
BenignSAV:                                                                           G                             
gnomAD_SAV:      QT *H R  *   V    H      KK  SAH  FSK  KIPIS    NI   SME   #  L K  TG L MHH TE K  Q   QG  YK I* F 
Conservation:  1414312546365334445755847544435245684866875764676867554243311541376523742353364363368588797666864833
SS_PSIPRED:    E  HHH HHHHHHHHHHHHH   EEEE      EEEE  HHHHHHHHHHHH    HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE       EEEEE  
SS_SPIDER3:    EE H   HHHHHHHHHHHH    EEEEE    EEEEEE HHHHHHHHHHHH    HHH     HHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE      EEEEEE  
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHHH           EEEEEE HHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHH HHHE          EEEE  
DO_DISOPRED3:                                                                                                D     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                E                                              R           
MODRES_P:                                              T                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AKSSRAAVGNKMFVKGAPEGVIDRCNYVRVGTTRVPLTGPVKEKIMAVIKEWGTGRDTLRCLALATRDTPPKREEMVLDDSARFLEYETDLTFVGVVGML 600
BenignSAV:                                            L                                                M           
gnomAD_SAV:     IF W  #   L L   R SI NH    *  S QM  MELL *ELTV    L S QE PH  T   Q I L#Q               A  R#M IM   
Conservation:  1221112133468686798655668034937204324201263354226645539156656655763726112315062533192177125775668877
SS_PSIPRED:              EEEE   HHHHHHH  EEEE  EEEE  HHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEEEE     HHH     HHHHHHHH   EEEEEEE  
SS_SPIDER3:              EEEEE   HHHHH   EEEE  EEEE  HHHHHHHHHHHHHH       EEEEEEEEE     H      HHHHHHHH   EEEEEEEE 
SS_PSSPRED:              EEEE   HHHHHHH  EEEE  EEEE  HHHHHHHHHHHHHH     HHHHEEEE               HHHHHHHHH  EEEEEE   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                           D  D                        
BINDING:                     K                                            R                                        
MODRES_P:                                                                          T           S                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DPPRKEVTGSIQLCRDAGIRVIMITGDNKGTAIAICRRIGIFGENEEVADRAYTGREFDDLPLAEQREACRRACCFARVEPSHKSKIVEYLQSYDEITAM 700
BenignSAV:                                                      N                                                  
gnomAD_SAV:      RHEV M      C  R W  I A NST R     QQM      Q  VNCTCM *  NN L#T #Q  FQC  R TLAD L   QT    RACN M  #
Conservation:  7777177215513811696466685636736535564445851215550034489789656310172165105396798594655476539642477897
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHH    EEEE    HHHHHHHHHHH            EEEHHHHHH  HHHHHHHHHH EEEE   HHHHHHHHHHHHH   EEEE
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHH   EEEEEE   HHHHHHHHHH             EE HHHHH   HHHHHHH  H EEE E  HHHHHHHHHHHHH   EEEE
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHH  EEEEEE   HHHHHHHHHHH               HHHHH   HHHHHHHHHHHHHEEE   HHHHHHHHHHHHH  EEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                               TGD                                                                         
BINDING:                                                                                    R     K                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TGDGVNDAPALKKAEIGIAMGSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAALGLPEALIPVQLLWVNLVTD 800
PathogenicSAV:                                                              C                          L           
gnomAD_SAV:     #  I#          #V       MVRI  #     N    V D M   #T *SKI   VH      M * I            V  #M V    F  N
Conservation:  7779766797979776755666846977596666755766664656676666764966777797997777797966446565454466766676549779
STMI:                                                                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM          MMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    E       HHHHH   EEEE    HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH    HH  HHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    E   H   HHHH    HHHH    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHEEE     HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:            N                                                                                              
REGION:                                                                                               IPVQLLWVNLVTD
METAL:           D                                                                N  E                        N  TD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GLPATALGFNPPDLDIMDRPPRSPKEPLISGWLFFRYMAIGGYVGAATVGAAAWWFLYAEDGPHVNYSQLTHFMQCTEDNTHFEGIDCEVFEAPEPMTMA 900
gnomAD_SAV:    V   I  D  TSEP    HTRQT  DT        C TTVAS M T  MR  VR   *#  RH      V  IT YIK SNY KST     KV K V # 
Conservation:  6597797966679677827288543669863695488537537773667588469832313881655375355457223331604326157443176676
STMI:          MMMMMMMM                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                              MMM
SS_PSIPRED:       HHH                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHH                       HHHH
SS_SPIDER3:        HH        HHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH                    HHHHH
SS_PSSPRED:                                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH                          HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                   DD DD                                                                               
REGION:        GLPATALG                                                                                            
DISULFID:                                                                                 C           C            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LSVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWVNIWLLGSICLSMSLHFLILYVDPLPMIFKLRALDLTQWLMVLKISLPVIGLDEILKFVARNYLEDPEDERR 1000
gnomAD_SAV:      MV PM#         KK*  QQ R   #    R VY       VN  AE  LTV N Q#  #S RFT  RM   #V  N    LL Q          K
Conservation:  6667765555858575654675447776252794466249439974775446674554323420026234343439432354144325513043100000
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMM             MMMMMMMMMMMMMMMMMMM               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM               
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH        E       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH   E   HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH         
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                              DDDBBBBB
DO_SPOTD:                                                                                                 DDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                     DD
REGION:                                       WLLGSICLSMSL                                                         
METAL:                E                                                                                            

                
AA:            K 1001
Conservation:  1
SS_PSIPRED:     
SS_SPIDER3:     
SS_PSSPRED:     
DO_DISOPRED3:  B
DO_SPOTD:      D
DO_IUPRED2A:   D