O15118  NPC1_HUMAN

Gene name: NPC1   Description: NPC intracellular cholesterol transporter 1

Length: 1278    GTS: 2.669e-06   GTS percentile: 0.845     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 168      BenignSAV: 24      gnomAD_SAV: 646      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MTARGLALGLLLLLLCPAQVFSQSCVWYGECGIAYGDKRYNCEYSGPPKPLPKDGYDLVQELCPGFFFGNVSLCCDVRQLQTLKDNLQLPLQFLSRCPSC 100
PathogenicSAV: #                                                             R          Y                 R        
gnomAD_SAV:      TC   FSFV  PMY   L         # RT H G     K      L    ECN  H       V S    W IQ   I            P G P 
Conservation:  5000001101010333333612218697878314114755893728472592145415426787461554334986319826842445596857799879
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                              
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHH    EE                            HHHHHHHH   HH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHH    EE    EEEEE           E           HHHHHHHHHH   H          HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHH       EEEE                         HHHHHHHHH          E   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDD                                                                                         
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                               N                                     Q                     
DISULFID:                              C     C          C                    C          CC                     C  C
CARBOHYD:                                                                           N                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FYNLLNLFCELTCSPRQSQFLNVTATEDYVDPVTNQTKTNVKELQYYVGQSFANAMYNACRDVEAPSSNDKALGLLCGKDADACNATNWIEYMFNKDNGQ 200
PathogenicSAV:             R                       M                            S          #                       
BenignSAV:                                                     R G                                                 
gnomAD_SAV:    C            NL*             I  G   M     K H  IRR     T    W  #  L  E V  F    YTNS D  D*   V# EG   
Conservation:  8497566899879862942946472312513302111116714548666229564767793785586582588655786442285656884767443957
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH     HHHEEEEEEEEE           EEEEEEEEE HHHHHHHHHHH            HHHH         HHHHHHHH       
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH        EEEEEEEEEEE E          EEEEEEEE HHHHHHHHHH           HHHHHH         HHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH   HHH     EEEEEE          HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH        HHHHHH          HHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
SITE:                 F                                                                                            
DISULFID:              C   C                                              C                C      C                
CARBOHYD:                           N            N                      N                          N               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            APFTITPVFSDFPVHGMEPMNNATKGCDESVDEVTAPCSCQDCSIVCGPKPQPPPPPAPWTILGLDAMYVIMWITYMAFLLVFFGAFFAVWCYRKRYFVS 300
PathogenicSAV:                      S        G          #    YV                       R                            
BenignSAV:                   R                     S                                                               
gnomAD_SAV:    T  AV#   AY   RAL S  D   S  K AG  ITS N    TTI VLT   RSS# L M  V  #T IV     VE  F     L  AC#   WF   
Conservation:  4983528385725312517939195494644562436989899414998392884332693557379534886348339644823233326848531426
STMI:                                                                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                  
SS_PSIPRED:       EEE EE                                                   EEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:       EEEEE                                   H                EE  E HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:        EE                                                      EEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                           D
DO_SPOTD:                                                                                                    DDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                C          C C  C   C                                                     
CARBOHYD:                           N                                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EYTPIDSNIAFSVNASDKGEASCCDPVSAAFEGCLRRLFTRWGSFCVRNPGCVIFFSLVFITACSSGLVFVRVTTNPVDLWSAPSSQARLEKEYFDQHFG 400
PathogenicSAV:                                                                        W     A F       PC           
BenignSAV:                                     D                             V                 C                   
gnomAD_SAV:    KC   # H DV#  TG    V     IGT    S  QPC C   C I    F       VVNV L     FQI AD F F A AGG  HR     ER   
Conservation:  8746635414233410213133544135415620850194199468542911753254345224628614344696985899571867738827972587
STMI:                                                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                             
SS_PSIPRED:                             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HH       HHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:                             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH E     HHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:                              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEHHHHHHHHHHHHH   EEEEE            HHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                             
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PFFRTEQLIIRAPLTDKHIYQPYPSGADVPFGPPLDIQILHQVLDLQIAIENITASYDNETVTLQDICLAPLSPYNTNCTILSVLNYFQNSHSVLDHKKG 500
PathogenicSAV: T  #                            LL                K                     PL    Y                     
BenignSAV:               Q                      S                                     P                            
gnomAD_SAV:    S#SQM *   Q    G  V   CSL        L   #  Y     * VMK    F V   L  E   V L  L  K  #   #      N  M  YE #
Conservation:  7968448698655110021626643833549454623249287958932642626133433636496965996959278785959887997532963012
SS_PSIPRED:         EEEEEE                         HHHHHHHHHHHHHHHH  EE       HHHH                HHHHH   HHHH     
SS_SPIDER3:         EEEEEE       EEE               HHHHHHHHHHHHHHH  EEEE      HHHHH           EE  HHHHHH    HH     
SS_PSSPRED:         EEEEEEE                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHE      EEHHHH            EE  HHHHH            
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                                                         C          C                     
CARBOHYD:                                                         N      N                  N                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DDFFVYADYHTHFLYCVRAPASLNDTSLLHDPCLGTFGGPVFPWLVLGGYDDQNYNNATALVITFPVNNYYNDTEKLQRAQAWEKEFINFVKNYKNPNLT 600
PathogenicSAV: V       SP R   Y #  S               L     L                              K R                        
BenignSAV:               M                                                                                         
gnomAD_SAV:     N  GH N QMY   FIWSSST  #AR  RE *  M   S  L  M  DC   K   T   L   S H CC   QRF  T     K  K   TCT  S  
Conservation:  7265545878687668344946579651495697676989759997799963258588658646765184275314315527992376175336245595
SS_PSIPRED:             HHHHHHHH                         HHHH        HHH EEEEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      E
SS_SPIDER3:             HHHHHHHH                      E   EEEEEE     HHH  EEEEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      E
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHH                          EEE           EEEEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                     C                C                                                                   
CARBOHYD:                             N                                N              N                         N  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ISFTAERSIEDELNRESDSDVFTVVISYAIMFLYISLALGHMKSCRRLLVDSKVSLGIAGILIVLSSVACSLGVFSYIGLPLTLIVIEVIPFLVLAVGVD 700
PathogenicSAV:     V     GD  #            S  R        R           W       S   M N   W  V          FT     L   V    N
BenignSAV:                                              I                                                          
gnomAD_SAV:       I   N K   ##  H    NA   H T   CVAV    #   HSPR AL     TT L#N#PN L       G V VSW    MA M          
Conservation:  6663698968996488927940672599349948645488472321447799975776597479947936959579725276999769999999997999
STMI:                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM          MMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    EEEEEEE HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    EEEEEEE HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    EEEEE   HHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHEEEEE  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NIFILVQAYQRDERLQGETLDQQLGRVLGEVAPSMFLSSFSETVAFFLGALSVMPAVHTFSLFAGLAVFIDFLLQITCFVSLLGLDIKRQEKNRLDIFCC 800
PathogenicSAV: K S                    P TF      I       K  E        K        L   V       P             #           
BenignSAV:                                                             A                             V             
gnomAD_SAV:     #IF AR F G# HF ED  N  P  I      I LV*    ILE  I  S M   M A T SV  G  V CI P NYCMGIFA  V  RQEYG N    
Conservation:  9679599556774633395753757977967996569974697369779346179675977597759766996996769696775944777355397489
STMI:          MMMMMM                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                 
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEE
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH   EEEHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH       EE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH    EE  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VRGAEDGTSVQASESCLFRFFKNSYSPLLLKDWMRPIVIAIFVGVLSFSIAVLNKVDIGLDQSLSMPDDSYMVDYFKSISQYLHAGPPVYFVLEEGHDYT 900
PathogenicSAV:                         C                       I            L  L     C  V            LSMC        D 
BenignSAV:              I                                               V              A                           
gnomAD_SAV:      S K    F V D#   L  R  CYL P# E T  T   VLL FV   MTF   A V     #LV V   V V  T V R# RV  S *  M   YN  
Conservation:  3231121111134452861797316583684575984767498838898487347756995926879398853287124236485969899955496682
STMI:                                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                               
SS_PSIPRED:    EE             HHHHHHHH  HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH      HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE      
SS_SPIDER3:    EE             HHHHHHHH HHHHH  H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HH      HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE     
SS_PSSPRED:                 HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE      
DO_DISOPRED3:       D DDDDD                                                                                        
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSKGQNMVCGGMGCNNDSLVQQIFNAAQLDNYTRIGFAPSSWIDDYFDWVKPQSSCCRVDNITDQFCNASVVDPACVRCRPLTPEGKQRPQGGDFMRFLP 1000
PathogenicSAV:          S      Y        TVPP    Q     L CMNN  # M   L Y #E S      S       R C       S     #   R    
BenignSAV:               S                                                           G                             
gnomAD_SAV:     C R  V# SST   S        KTV   SS Q D TAL   NN SN ME #L   *  DV     S L   S GIH  L  LDSQ   #RE  L    
Conservation:  6118952799949967797796571874633874753377996999999649586999335173199996936139248844523872792417973799
SS_PSIPRED:     HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHH   HHH                                   HH HHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHH         HHHHHHHHH      E        HHHHHHHH       EE      E       H HH              HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHH                                          HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                     DD                
DISULFID:              C    C                                         CC         C        C  C                     
CARBOHYD:                     N              N                             N      N                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MFLSDNPNPKCGKGGHAAYSSAVNILLGHGTRVGATYFMTYHTVLQTSADFIDALKKARLIASNVTETMGINGSAYRVFPYSVFYVFYEQYLTIIDDTIF 1100
PathogenicSAV:    L  A    D  VR  C   G          RV#      A          T    Q TV   N                    LCK    T  N   
BenignSAV:                                                     V                                                   
gnomAD_SAV:       L  L   SC  VR TCN        R   I VM       M #       TM Q Q #    AKS  LSS   QI  *R      K    TT #AV 
Conservation:  8894869624999999969467823321324179868967698784283856364448416616561443113212269799699999999686419756
STMI:                                                                                                           MMM
SS_PSIPRED:    HHHH                  EEEEE    EEEEEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EEEE HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH                  EEEEE     EEEEEEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEE  H  HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH                   EEEE     EEEEEEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                C                                                                                         
CARBOHYD:                                                                     N       N                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NLGVSLGAIFLVTMVLLGCELWSAVIMCATIAMVLVNMFGVMWLWGISLNAVSLVNLVMSCGISVEFCSHITRAFTVSMKGSRVERAEEALAHMGSSVFS 1200
PathogenicSAV:                                     I  V T       KT    #        M LYR    V           HG G       F   
BenignSAV:                                                                                   V                    G
gnomAD_SAV:     F     T L   IFV SR IR  F V    T F   L  G#  *S R KTI  ID        #   I V  V M  VRSNHMK#VKG# TYV  Y  G
Conservation:  6844894678396344895736653454298587646969469664969997999998646997999989669896461424643984587626996768
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                       MMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH  HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        
AA:            GITLTKFGGIVVLAFAKSQIFQIFYFRMYLAMVLLGATHGLIFLPVLLSYIGPSVNKAKSCATEERYKGTERERLLNF 1278
PathogenicSAV:     #      L#  V       #           E   R        G                             
BenignSAV:                        T                                             Q            
gnomAD_SAV:       VK S  M LV   I   Y T D    S     ET  R V       C   TI E#T     KQDQ#K#HGQ  SS
Conservation:  986698869937967779599669885995778599859995899859894673254452143223124543424313
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                  
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHH    HHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HH   HHH HHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHH   HHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDB
DO_SPOTD:                                                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                 
MOTIF:                                                                                   LLNF
REGION:                                                                                  LLNF