O15121  DEGS1_HUMAN

Gene name: DEGS1   Description: Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1

Length: 323    GTS: 1.709e-06   GTS percentile: 0.541     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 4      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 141      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGSRVSREDFEWVYTDQPHADRRREILAKYPEIKSLMKPDPNLIWIIIMMVLTQLGAFYIVKDLDWKWVIFGAYAFGSCINHSMTLAIHEIAHNAAFGNC 100
BenignSAV:                                                                     N                                   
gnomAD_SAV:     R G    E G      S          E   MR   ETESS     L  F I   T SV R FN  SI LEVCV     D LV      ST S   C  
Conservation:  2100022201111110011002111215878288398368325582522663273243344335395754655537753467744587876697258832
STMI:                                                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            
SS_PSIPRED:          HHH EE       HHHHHHHHHH HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:          HHH EE       HHHHHHHHHH HHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:              EEE     HHHHHHHHHHH HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                                                                                              
DO_SPOTD:      DDDDD                                                                                               
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                                                                                 HEIAH       
LIPID:          G                                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KAMWNRWFGMFANLPIGIPYSISFKRYHMDHHRYLGADGVDVDIPTDFEGWFFCTAFRKFIWVILQPLFYAFRPLFINPKPITYLEVINTVAQVTFDILI 200
PathogenicSAV:             D                   W                                                                   
BenignSAV:                                                                               Q                         
gnomAD_SAV:        TH*LRV  H  V  #H V      VER #   VH I A TT#N  CS   ITC  LM    RLF FT   Q V   QVM    TD M   AS   F
Conservation:  0313774534468554648554588499489977763415957595238556845425743943598446358842555533506731822393227225
STMI:           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH   HH HHHHHHHHHHH             HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                    HMDHH                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YYFLGIKSLVYMLAASLLGLGLHPISGHFIAEHYMFLKGHETYSYYGPLNLLTFNVGYHNEHHDFPNIPGKSLPLVRKIAAEYYDNLPHYNSWIKVLYDF 300
PathogenicSAV:                                                       S                        V                    
BenignSAV:                                                                       S                                 
gnomAD_SAV:        RTTA GCV G        R         QCILS    A     SP     Y V #   N  TS  A  ILV     S  C SFL  YT   LP   
Conservation:  3024826442854353364485564686655685362453694999958924458596659999995675238534434443443165230551155233
STMI:          MMMM    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                       
SS_PSIPRED:    HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH    EEEEEE HHHHHHHH      HHHH       HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH  HHHHHHHHHHHHH  H           EEE    EEE   HHHHHHH       HH          HHHHHHHHHHH         HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHH      EEEE   HHHHHHH                   HHHHHHHHHHH        HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                                                   HNEHH                                     

                       10        20   
AA:            VMDDTISPYSRMKRHQKGEMVLE 323
gnomAD_SAV:        #V    #R    TED   Q
Conservation:  52221343344245112112222
SS_PSIPRED:    HH                     
SS_SPIDER3:    H          EEE     EE  
SS_PSSPRED:    H      HHH             
DO_DISOPRED3:                  DBBBBBB
DO_SPOTD:                     DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                          
MODRES_P:            S