O15164  TIF1A_HUMAN

Gene name: TRIM24   Description: Transcription intermediary factor 1-alpha

Length: 1050    GTS: 5.118e-07   GTS percentile: 0.048     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 326      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEVAVEKAVAAAAAASAAASGGPSAAPSGENEAESRQGPDSERGGEAARLNLLDTCAVCHQNIQSRAPKLLPCLHSFCQRCLPAPQRYLMLPAPMLGSAE 100
gnomAD_SAV:                  V        L            H      #  TD# S   A    #      T            C     R  I  A  LVAP  
Conservation:  2011111111111111111111111111111111111111010011111100111001201000000001201011110010101020100011111111
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHH                            HHHHHHH  HHH  HH            HHHHHH    HHHH           
SS_SPIDER3:         HHHHH                                              HHH              H H    H    HH             
SS_PSSPRED:      EHHHHHHHHHHHHH                               HHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHH           
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                         DDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                           DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                             DDDD DDD
ZN_FING:                                                              CAVCHQNIQSRAPKLLPCLHSFCQRCL                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TPPPVPAPGSPVSGSSPFATQVGVIRCPVCSQECAERHIIDNFFVKDTTEVPSSTVEKSNQVCTSCEDNAEANGFCVECVEWLCKTCIRAHQRVKFTKDH 200
gnomAD_SAV:    S    SV  LLI V   #    R  H  A       TDVTG      AA                    T  D           EM V      R     
Conservation:  1111111111111111111114425783591775351555694965654524444375216485784845362679346476683697466468856548
SS_PSIPRED:                           EEE      EEEHHHHHH EEEE                          EEE    HHH  HHHHHHHH        
SS_SPIDER3:                          EEEE      EEE  H  HEEEHE               E         EEEEE   H    HHHHHHH   E     
SS_PSSPRED:                           EEE      HHHHHHHH  EE                           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                    
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                   
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDD D                                                                                    
ZN_FING:                                                                KSNQVCTSCEDNAEANGFCVECVEWLCKTCIRAHQRVKFTKDH
MODRES_P:      T        S                                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TVRQKEEVSPEAVGVTSQRPVFCPFHKKEQLKLYCETCDKLTCRDCQLLEHKEHRYQFIEEAFQNQKVIIDTLITKLMEKTKYIKFTGNQIQNRIIEVNQ 300
gnomAD_SAV:                  IIT     RH   R          E    #               G              A  IG            RS  T  Y 
Conservation:  2553434443422312243357843866838676556664568886874598565778656963567215622315926733252232226338425424
SS_PSIPRED:    EEEEHHH                        EEE      EE              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EE  HHH  H           E       EEEEEE     EEE  HEH       EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    EE  HHH                    HHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:     D   DDDDDDDDDD                                                                                   
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   D     DDDD                                                                                          
ZN_FING:       TVRQKEEVSPE      QRPVFCPFHKKEQLKLYCETCDKLTCRDCQLLEHKEHRYQFI                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NQKQVEQDIKVAIFTLMVEINKKGKALLHQLESLAKDHRMKLMQQQQEVAGLSKQLEHVMHFSKWAVSSGSSTALLYSKRLITYRLRHLLRARCDASPVT 400
gnomAD_SAV:               VM          A    Y   NF   YH   R    K           V        G RN T FH  #    W #   C K      A
Conservation:  4433523666355539447676786283346535477512391376265217347628752943774234556778779886557622545523433324
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NNTIQFHCDPSFWAQNIINLGSLVIEDKESQPQMPKQNPVVEQNSQPPSGLSSNQLSKFPTQISLAQLRLQHMQQQVMAQRQQVQRRPAPVGLPNPRMQG 500
gnomAD_SAV:    KTI R                   #KN  N         IM    R S    L    R L   T  P W PY    IVS KKEA Q     S    GI  
Conservation:  4425483654459546434664736841322221225212111113232213212134132334776764754454436545532332343133248153
SS_PSIPRED:       EEEE  HHHHHHHHHH   EEE                                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 
SS_SPIDER3:       EEEE  HHHHHHHHHH   EEE                                       HHHHHHHHHHHHHHHHHH                  
SS_PSSPRED:      EEEEE  HHHHHHHHHHH  EEE                                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 
DO_DISOPRED3:                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD            D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_M:                                                                          R                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PIQQPSISHQQPPPRLINFQNHSPKPNGPVLPPHPQQLRYPPNQNIPRQAIKPNPLQMAFLAQQAIKQWQISSGQGTPSTTNSTSSTPSSPTITSAAGYD 600
gnomAD_SAV:    #V    N   HL  H    EK            Y L   H #K   LQ T  QY  H         QR  MC   ES  A  G FA    AMT       
Conservation:  2122111112243632433532312433421121353473211632422223433234324452465613324553223252321243278434332312
SS_PSIPRED:                    EE                                         HHHHHHHH                                 
SS_SPIDER3:                                                           HHHHHHHHHHHHH                                
SS_PSSPRED:                                                             HHHHHHHHHHH                                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GKAFGSPMIDLSSPVGGSYNLPSLPDIDCSSTIMLDNIVRKDTNIDHGQPRPPSNRTVQSPNSSVPSPGLAGPVTMTSVHPPIRSPSASSVGSRGSSGSS 700
gnomAD_SAV:    A S   LV N   L          LE  S G  T H V   H  VNR  L   P  M  LA  LML   F  L AVP  Y #MC    C A     PD C
Conservation:  3424333245423323152246557633134421111214011221111112231133255324324531211121223223242233152432221522
SS_PSIPRED:                                    HHHHHHHH                                                            
SS_SPIDER3:            EE                        HH                                                                
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDD  D    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                           S     S      S                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SKPAGADSTHKVPVVMLEPIRIKQENSGPPENYDFPVVIVKQESDEESRPQNANYPRSILTSLLLNSSQSSTSEETVLRSDAPDSTGDQPGLHQDNSSNG 800
BenignSAV:                                                                  N                                 S    
gnomAD_SAV:       VR G  Y F        G    S R L       IT   DL  DC  P VH  SN  N    SGGHN A  D#MPK        VRA #Q  KY  A
Conservation:  2511144221011120133344643232323133453235625123312323121442255431232213112231122122131112121111011113
SS_PSIPRED:                                         EEE                  HHHHHH           EE                       
SS_SPIDER3:                                                              HHHHHH           H                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
REGION:                                                             NYPRSILTSLLLNSSQSSTSEETVLR                     
MODRES_P:                                                 S                       S                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KSEWLDPSQKSPLHVGETRKEDDPNEDWCAVCQNGGELLCCEKCPKVFHLSCHVPTLTNFPSGEWICTFCRDLSKPEVEYDCDAPSHNSEKKKTEGLVKL 900
BenignSAV:                                                                            E                            
gnomAD_SAV:    # QC  L  N  P   G                                         D  I         E  R   Q NGG  R SA        IT 
Conservation:  2111021021111111112235454644846844794845853845557329979361148374739789754117642422210011111120010015
SS_PSIPRED:                                 HHH     EEE                                                            
SS_SPIDER3:                               EEEEEE   EEEE      EEE        HH      EE EEE                             
SS_PSSPRED:                               H HHH     EE       EE                EEEE                                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                         DDDDDDDDDDDDDDD    
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                              DDD      DDD     
SITE:                                    D                                                                         
ZN_FING:                                EDWCAVCQNGGELLCCEKCPKVFHLSCHVPTLTNFPSGEWICTFCRDL                           
MOTIF:                                                                                                   KKKTEGLVKL
REGION:                                         NGGELLC                                                            
MODRES_P:             S  S      T                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TPIDKRKCERLLLFLYCHEMSLAFQDPVPLTVPDYYKIIKNPMDLSTIKKRLQEDYSMYSKPEDFVADFRLIFQNCAEFNEPDSEVANAGIKLENYFEEL 1000
gnomAD_SAV:      #G     H                           L     A   V     V   V    QE           G D         #        L K 
Conservation:  1427664786699256845362364244423243322334175362167366311101802324571645554165315472234331451252137642
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHH     HHH        HHHHHH      HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHH     HH         HHHHHH      HHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHH    HHH         HHHH       HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:         TPIDKRK                                                                                             
REGION:                                                                                      FN                    

                       10        20        30        40        50
AA:            LKNLYPEKRFPKPEFRNESEDNKFSDDSDDDFVQPRKKRLKSIEERQLLK 1050
BenignSAV:             S                                         
gnomAD_SAV:    V K  S IG     C       R         I  Q  C  NT  C*  R
Conservation:  61135333164112111112201024317675224422211101311112
SS_PSIPRED:    HHHH                               HHHH   HHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHH                                  H    HHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHH                               HHHH   HHHHHHH 
DO_DISOPRED3:              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDB
DO_SPOTD:                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:              DD  DDDDDDDDDDDDDDD    DDD             
MODRES_P:                        S     S  S             S