O15457  MSH4_HUMAN

Gene name: MSH4   Description: MutS protein homolog 4

Length: 936    GTS: 1.983e-06   GTS percentile: 0.647     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 7      gnomAD_SAV: 420      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MLRPEISSTSPSAPAVSPSSGETRSPQGPRYNFGLQETPQSRPSVQVVSASTCPGTSGAAGDRSSSSSSLPCPAPNSRPAQGSYFGNKRAYAENTVASNF 100
BenignSAV:                                                                V                             T      T   
gnomAD_SAV:    I   Q   AAL TLVI  ##  I##S RRL DLRI  ISHN# W   F   A#S M   G HQ    G FTY VTD    R#     R T   DILT   
Conservation:  2222210100101101101001000200000001000011111100001012012121112012002100000000000222100031121121111112
SS_PSIPRED:                                                EEEEE                                       HHHHH       
SS_SPIDER3:                                  E              EEE                                   H    HHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:                                                  EEE                                      HHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD  D DDD  DD    
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TFGASSSSARDTNYPQTLKTPLSTGNPQRSGYKSWTPQVGYSASSSSAISAHSPSVIVAVVEGRGLARGEIGMASIDLKNPQIILSQFADNTTYAKVITK 200
BenignSAV:                                                                  K                                      
gnomAD_SAV:             *    T      *PAR L   R R R       V    VF  YT * T    K   V    T#I N  F KT    #     K  S  T  
Conservation:  2221221311011131114331322222211121244224333446833322124556556895658686564684436296549688584546466466
SS_PSIPRED:            HH                     EEEE          HHH      EEEEEEEE       EEEEEEEE    EEEEEEE     HHHHHHH
SS_SPIDER3:           EE     H H          E  EEEE            H        EEEEEEEEE      EEEEEEE     EEEEEE     HHHHHHH
SS_PSSPRED:                                   EEE                     EEEEEEE        EEEEEEE     EEEEE    HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:          DDDDDDDDDDDDDD                  D                                                           
DO_SPOTD:             DD D  DD  D                                                                                  
DO_IUPRED2A:    DD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDD                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LKILSPLEIIMSNTACAVGNSTKLFTLITENFKNVNFTTIQRKYFNETKGLEYIEQLCIAEFSTVLMEVQSKYYCLAAVAALLKYVEFIQNSVYAPKSLK 300
gnomAD_SAV:        L  #  KL    GM      LA VA  L D    PT  I LSAI   GCVA  R          L  N  #   I V  Q        I       
Conservation:  5355294554855555426336497264364432535556687976635846545486446445645565379868855765589397595448756996
SS_PSIPRED:    HHH    EEEEE  HHH    HHHHHHHHHH    EEEEE HHH  HHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHH          
SS_SPIDER3:    HHHH   EEEEEHHHHH    HHHHHHHHHH    EEEEE       H HHHHHHHH      HHHHEH   HHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEE
SS_PSSPRED:    HHH    EEEE          HHHHHHHHHH    EEEE       HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ICFQGSEQTAMIDSSSAQNLELLINNQDYRNNHTLFGVLNYTKTPGGSRRLRSNILEPLVDIETINMRLDCVQELLQDEELFFGLQSVISRFLDTEQLLS 400
gnomAD_SAV:    MYL   KRAVV N    R I    TD      #I  D    I  #    * C DV    D  D L     Y    F*G GVCIV * I#    GI H   
Conservation:  7283998495969436814899549456175256948799596868828699566889835336944959566959438459777644543968664989
SS_PSIPRED:    EEEE    EEEEEHHHHHHHHHEEE         HHHHHH      HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH    HHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEE    EEEE HHHHHH EEEE          HHHHHH      HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH     HHHHHH
SS_PSSPRED:    EEEE    EEEEHHHHHHHHHHHHH         HHHHHH       HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VLVQIPKQDTVNAAESKITNLIYLKHTLELVDPLKIAMKNCNTPLLRAYYGSLEDKRFGIILEKIKTVINDDARYMKGCLNMRTQKCYAVRSNINEFLDI 500
BenignSAV:                                                                                                  V      
gnomAD_SAV:     I R  ERYM    V Q   VTH  RAW* L      V     S    CC      M   T  N  I   G T  T E  D     G  L   V  C   
Conservation:  4879599767423775993469499886686358513641428398489423859178227934845669264462665645888888967447657895
SS_PSIPRED:    HHH              HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH    HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH               EE EEE    HHHHH
SS_SPIDER3:    HH        H  H   HHHHHHHHHHHH  HHHHHHH     HHHHHHHH   H  HHHHHHHHHHHHH    HH      EEEEEEEE     HHHHH
SS_PSSPRED:    HHH       HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH                EEEEEEE    HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ARRTYTEIVDDIAGMISQLGEKYSLPLRTSFSSARGFFIQMTTDCIALPSDQLPSEFIKISKVKNSYSFTSADLIKMNERCQESLREIYHMTYMIVCKLL 600
BenignSAV:                                                                                             C           
gnomAD_SAV:     K I I   G  G IVP  ED  R S K     V*     T  N #  LG   #L  #* A     CI IPS V    K R  C  KVCD  F##A    
Conservation:  5976979779875467254454635656658634789969532642143242893684664517636498636658695763878679686794656686
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE    EEEEEEEHHH         HHHEEEEE    EEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE   EEEEEEEHHHH        HHHEE EEE  EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE   EEEEEEEE            HHHHHHH     EEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SEIYEHIHCLYKLSDTVSMLDMLLSFAHACTLSDYVRPEFTDTLAIKQGWHPILEKISAEKPIANNTYVTEGSNFLIITGPNMSGKSTYLKQIALCQIMA 700
gnomAD_SAV:      V  Y      V  A P  NL   S RVYAF ECAQ      S VE  #  SV T CVG    K N       VF # AS   *      #V F  V T
Conservation:  2364337799899794899899957795595483558869996764656798598752344654853654654663458896666866557878849779
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          EEEEE       EE          EEE     EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   E  E    EEE       EEE          EEE     EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          EEEEE     HHHH                  EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                                                                      GPNMSGKS             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QIGSYVPAEYSSFRIAKQIFTRISTDDDIETNSSTFMKEMKEIAYILHNANDKSLILIDELGRGTNTEEGIGICYAVCEYLLSLKAFTLFATHFLELCHI 800
PathogenicSAV:                                                      L                                              
gnomAD_SAV:     T TH           E V A  TS      #* I T     V C   S D NLF  TA  DGD DM      FH A      S       P        
Conservation:  9696657636664665399999675676496757779399775588477463489578999998965989696766468466327589686997897936
SS_PSIPRED:    HH     HHH  EE   EEEE             HHHHHHHHHHHHHHH     EEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE  HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH     HH     EE EEEEEEE          HHHHHHHHHHHHH       EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE   HHHHHH
SS_PSSPRED:    HH          EEHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                              DDDDDDDDDDDD                                                            
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DALYPNVENMHFEVQHVKNTSRNKEAILYTYKLSKGLTEEKNYGLKAAEVSSLPPSIVLDAKEITTQITRQILQNQRSTPEMERQRAVYHLATRLVQTAR 900
gnomAD_SAV:    N    KA    SV RN NS  K T  N #ACRI      D K    V   A* L L#    R VA  VM K  K EK  L #      FR   S  LSS*
Conservation:  4248685692774858242111214152886282592658548875696374574264257424212543434123223443123583748736848468
SS_PSIPRED:    HHH   EEEEEEEEEEE        EEEEEEEEEE       HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH   EEEEEEEEEEE        EEEEEEEEEE       HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH HHH     HHHHHHHHH HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH    EEEEEEEEE          EEEEEEE         HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                          DDDDDDDDDDDDD               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                 D                                                      DDDDDDDDDDD  DDD              D

                       10        20        30      
AA:            NSQLDPDSLRIYLSNLKKKYKEDFPRTEQVPEKTEE 936
BenignSAV:                  N                      
gnomAD_SAV:      E   GR Q H N    R NQVV    K SQ    
Conservation:  694964449628722974362132111000010012
SS_PSIPRED:    H    HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH        
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHHHHHHHH             
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                         DDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                               DDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                         DDDDDDDDDDDDDD