O43196  MSH5_HUMAN

Gene name: MSH5   Description: MutS protein homolog 5

Length: 834    GTS: 1.566e-06   GTS percentile: 0.476     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 8      gnomAD_SAV: 374      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MASLGANPRRTPQGPRPGAASSGFPSPAPVPGPREAEEEEVEEEEELAEIHLCVLWNSGYLGIAYYDTSDSTIHFMPDAPDHESLKLLQRVLDEINPQSV 100
BenignSAV:                                 S                                                       F               
gnomAD_SAV:        R        E I    AYRL I  S #                 D RQ M       RV CC    T V         K F# FR        *YI
Conservation:  7120010010121020222202222221111112220111222222012323534312403433465416334434263351226136145428519225
SS_PSIPRED:                                         HHHHHHHHHH  EEEEEEE   EEEEEEEE    EEEEE        HHHHHHHHHHH   EE
SS_SPIDER3:                                         HHHHHHHH    EEEEEEEE  EEEEEEEE    EEEEE        HHHHHHHHHH    EE
SS_PSSPRED:                                         HHHHHHHHHH  EEEEEEE    EEEEEEE     EEE         HHHHHHHHHH    EE
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                      
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                            D DD                     DD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VTSAKQDENMTRFLGKLASQEHREPKRPEIIFLPSVDFGLEISKQRLLSGNYSFIPDAMTATEKILFLSSIIPFDCLLTVRALGGLLKFLGRRRIGVELE 200
gnomAD_SAV:     M    VK # Q       #KD  R  R VV    A        KC   R    LS TV    E     # F  G##   QG R   Q   Q   # Q  
Conservation:  6687665214428511421011211244954369336944344757444333544712242245325678555645254555676767653567555689
SS_PSIPRED:    EEE    HHHHHHHHHH           EEEE       HHHHHHHHH         HHHHH  EEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:    EEE   HHHHHHHHHHH           EEEE       HHHHHHHHH        HHHHH H EHEHH       HHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:    EE    HHHHHHHHHHHHHHH       EEEE       HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDD  D        DDDDD                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DYNVSVPILGFKKFMLTHLVNIDQDTYSVLQIFKSESHPSVYKVASGLKEGLSLFGILNRCHCKWGEKLLRLWFTRPTHDLGELSSRLDVIQFFLLPQNL 300
BenignSAV:      C   F                                                                                              
gnomAD_SAV:    EC  NI   D   #TF    SV      I  V     YT     S ER  RR VC  F     T*    #  L  HL R P K # C  IVH  V  P  
Conservation:  7125259563633636233825838684678798332466445323735665684846748355294347749738981631591597685169325452
SS_PSIPRED:             EEEEEEHH EEEEEHHHHHHHH       HHH            HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH    H
SS_SPIDER3:             EEEEEEH HEEEE HHHHHHHH H       HH      E   EHHHHHHH    HHHHHHHHH H     HHHHHHHHHHHHHH     H
SS_PSSPRED:             EEEEEE   EEEE  HHHHHHHEEEE                  HHHHHH    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH    H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DMAQMLHRLLGHIKNVPLILKRMKLSHTKVSDWQVLYKTVYSALGLRDACRSLPQSIQLFRDIAQEFSDDLHHIASLIGKVVDFEGSLAENRFTVLPNID 400
BenignSAV:                                                       G                         F                       
gnomAD_SAV:    YT    RQ  SQ   MS V  HV#F #NTITNL   CE A GS S #   H   RF    WNV P        VT F#  A   G   P  H R    T 
Conservation:  4221455257565365534956913446752595176755466456683474872361693284117556914543574787686272245595766577
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH     HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH    HHHHH   EE     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH     HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH     HHH   EEE     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH    HHHH    EE     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PEIDEKKRRLMGLPSFLTEVARKELENLDSRIPSCSVIYIPLIGFLLSIPRLPSMVEASDFEINGLDFMFLSEEKLHYRSARTKELDALLGDLHCEIRDQ 500
PathogenicSAV:                                                                                       Y             
gnomAD_SAV:     K  D  # P R LGLF K  #        H       C       VFTSC L    #      E   I  L K    #  QI KV   M     K Q# 
Conservation:  4269489545299649964794498408612655845796986688855569439233148352586649552466599614878982469889676564
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH        EEEE    EEEEEEE  HHH          EEEEEHH   EEEE HHHHHHHHHH  HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH        EEEEEE   EEEEEEE  HH       EE  EEEEEE   EEE   HHHHHHHHHH  HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH        EEEEE   EEEEEE                 E E   HHHHHH  HHHHHHHHHH  HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ETLLMYQLQCQVLARAAVLTRVLDLASRLDVLLALASAARDYGYSRPRYSPQVLGVRIQNGRHPLMELCARTFVPNSTECGGDKGRVKVITGPNSSGKSI 600
BenignSAV:                                                                                    G                    
gnomAD_SAV:     MP I      M  * PI  ##    A# G      TV   CR   LL  LK  RIQ  S  Y  TKF  *ICM    AGV Y E D   P RSL  N  
Conservation:  8435834894269355235127434264995967651476664934914311211425125898756695248959421524103677668889856887
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EE      EEE       EE          EEE     EEEEEE      HHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EE     EEEEE     EEEEE   E    EEEE    EEEEEE      HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EE     EEEEE                  EE      EEEEEE       HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                       D               
NP_BIND:                                                                                                  GPNSSGKS 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YLKQVGLITFMALVGSFVPAEEAEIGAVDAIFTRIHSCESISLGLSTFMIDLNQVAKAVNNATAQSLVLIDEFGKGTNTVDGLALLAAVLRHWLARGPTC 700
gnomAD_SAV:      R I    Y  M     A  DTKM V  TM  QVR *K         V N #  V   #Y   RL   TG#   R  ML   T   T  *Q   H    
Conservation:  6897657848968789588934757836748655444456465686695586886515564553189786999999997489879966453494133206
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH     HHH EEE             HHH    HHHHHHHHHHHHHHH     EEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH      HHH EE  E EEEE E      H     HHHHHHHHHHHHHH     EEEEE        H HHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH        EEE    EEEE             HHHHHHHHHHHHHHH     EEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                            DDDD  DDD                                                 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PHIFVATNFLSLVQLQLLPQGPLVQYLTMETCEDGNDLVFFYQVCEGVAKASHASHTAAQAGLPDKLVARGKEVSDLIRSGKPIKPVKDLLKKNQMENCQ 800
BenignSAV:                                                                                          S              
gnomAD_SAV:      V               SRRL      #  SK  SY F #CR  K AV   RV    DH EP#G#P  H    L   G A    S  N VQ K L S  
Conservation:  9367569886784682686031362474455226535657565561634136474356234445104428525565423163252222011122311261
SS_PSIPRED:     EEEEE  HHHHHH         EEEEEEEEEEE  EEEEEEEEE       HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     EEEEEE  HHHHH         EEEEEEEEEEE  EEEEEEEEEE      HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH        HHH HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     EEEEE   HHHH          EEEEEEEEEEE  EEEEEEEEE      HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                    DDDDDDBBBBDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30    
AA:            TLVDKFMKLDLEDPNLDLNVFMSQEVLPAATSIL 834
gnomAD_SAV:         L    MD       I   E       #  
Conservation:  1471384154745314551055115565222213
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH         HHHH HHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHH           HH  HHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH         HHH  HHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDD  DDDDD D                 
DO_SPOTD:                                        
DO_IUPRED2A: