O43292  GPAA1_HUMAN

Gene name: GPAA1   Description: Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein

Length: 621    GTS: 2.8e-06   GTS percentile: 0.870     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 6      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 331      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGLLSDPVRRRALARLVLRLNAPLCVLSYVAGIAWFLALVFPPLTQRTYMSENAMGSTMVEEQFAGGDRARAFARDFAAHRKKSGALPVAWLERTMRSVG 100
PathogenicSAV:                                                   L                                                 
gnomAD_SAV:    K     S  P    # L    S   M  CAE# S    M VQ    HP # Q  TD  V V    DE C  T VL # VYCR W P #    AW  P LE
Conservation:  4333135014124111222112424124323531553553216423322356544656663638018385221442524424315336336434241206
STMI:                                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                       
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   EE     HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EEE          EEE  HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH                    EEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                     
DO_SPOTD:      DDDDD                                                                                               
DO_IUPRED2A:                                                      D                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LEVYTQSFSRKLPFPDETHERYMVSGTNVYGILRAPRAASTESLVLTVPCGSDSTNSQAVGLLLALAAHFRGQIYWAKDIVFLVTEHDLLGTEAWLEAYH 200
PathogenicSAV:                                                                            S                        
BenignSAV:                            A                                                                            
gnomAD_SAV:     D# M  VCW    SH  # P*VA D  M*S  #TRC  RIQL  V  #      S#* M   M M   LQR T S  YTI       I   G    V Y
Conservation:  5554282624258574311563261626557655454445444335334431420314636434464244834555454669744447637467797477
SS_PSIPRED:     EEEEEEEEE            EEE EEEEEEEE        EEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHH  HH  EEEEEE     HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     EEEEEEEEEE               EEEEEEEE        EEEEEEE       HHHHHHHHHHHHH H    HH EEEEEE     HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     EEEEEEEEE                 EEEEEE         EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHH HHH  EEEEEE     HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DVNVTGMQSSPLQGRAGAIQAAVALELSSDVVTSLDVAVEGLNGQLPNLDLLNLFQTFCQKGGLLCTLQGKLQPEDWTSLDGPLQGLQTLLLMVLRQASG 300
PathogenicSAV:                                        G                                                 PP         
BenignSAV:              F                                                                Q                         
gnomAD_SAV:    N SGI  HLFAV  *    KT E  Q T     I   GM VP R  L     S   I F* RS   MI S  HTQN*I   EL *D  PP   I W   S
Conservation:  4372562033220544745666445543455476363246975756656654575246956034385246665226425224425446676663727758
SS_PSIPRED:                     EEEEEEEEE       EEEEEEE        HHHHHHHHHHHHH     EE              HHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:                     EEEEEEEEE E   E EEEEEEE        HHHHHHHHHHHHH      EE             HHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:                  HHHHHHHHHHHE       EEEEEEE         HHHHHHHHHHHHH   EEE              HHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:             D                                                                                            
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:        N                                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RPHGSHGLFLRYRVEALTLRGINSFRQYKYDLVAVGKALEGMFRKLNHLLERLHQSFFLYLLPGLSRFVSIGLYMPAVGFLLLVLGLKALELWMQLHEAG 400
PathogenicSAV:                                                                                         P           
gnomAD_SAV:    C #S Q #  CCC  V  PCS S LC HQ# P     S DD  CT S  R H  L  L C   S   LG SSV VRTLS  F F D  T K         
Conservation:  2529477977764679374566777755936314372449845676777676677566666562654756662847615743246254451595161011
STMI:                                                                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           
SS_PSIPRED:          HHHHH  EEEEEEEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:        HHHHHHH    EEEEEE          HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH   EEE      E EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:                  EEEEEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                         D
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGLEEPGGAPGPSVPLPPSQGVGLASLVAPLLISQAMGLALYVLPVLGQHVATQHFPVAEAEAVVLTLLAIYAAGLALPHNTHRVVSTQAPDRGWMALKL 500
BenignSAV:                                 T                                                               G       
gnomAD_SAV:      FGK R#TR LR H S * V E  L LTS   LRT    FC  L V   I IH  SM    V M       G   S L    #AI   VL G  L    
Conservation:  0112210001101110210124424243363454332842540484125226334666253884563243553554437857442312112214432454
STMI:                                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                MMMMM
SS_PSIPRED:                           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                          HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                          EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDD                                                                                     
DO_IUPRED2A:       D DDDDDDDD                                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VALIYLALQLGCIALTNFSLGFLLATTMVPTAALAKPHGPRTLYAALLVLTSPAATLLGSLFLWRELQEAPLSLAEGWQLFLAALAQGVLEHHTYGALLF 600
BenignSAV:                  T                                                                                      
gnomAD_SAV:          TV   F TP S A     T I L S V     RSQ  S   M    L  M   R  P W PR VS  VSK       V     VG   *#TV  
Conservation:  2442565248483352675775443233383551217013214051263214732356335332336151833216451468145445483812475143
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMM                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                   M
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                      N                                                                                   

                       10        20 
AA:            PLLSLGLYPCWLLFWNVLFWK 621
gnomAD_SAV:    QQ F SH   RMV *    *N
Conservation:  523232236655358547482
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM 
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHH HHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                       
DO_SPOTD:                           
DO_IUPRED2A: