O43490  PROM1_HUMAN

Gene name: PROM1   Description: Prominin-1

Length: 865    GTS: 1.949e-06   GTS percentile: 0.635     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 4      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 483      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MALVLGSLLLLGLCGNSFSGGQPSSTDAPKAWNYELPATNYETQDSHKAGPIGILFELVHIFLYVVQPRDFPEDTLRKFLQKAYESKIDYDKPETVILGL 100
BenignSAV:        A              A           #                                                                     
gnomAD_SAV:    V  I  FV      R Y AV R#  A DSR *D QF  K  K  G   #ELTDM  K AYL  C  ESLV       #    T    F N  L   S   
Conservation:  5111111123322110202111112000211325246111736011223424316613322661356731461423223332123010322187465838
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                                 
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHH                                 HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH            HHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHH H              E                   HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH              HHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHH                                     HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH            HHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                       
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KIVYYEAGIILCCVLGLLFIILMPLVGYFFCMCRCCNKCGGEMHQRQKENGPFLRKCFAISLLVICIIISIGIFYGFVANHQVRTRIKRSRKLADSNFKD 200
gnomAD_SAV:      F CV EVT YYL    C F LA MWC SY  H       Q Q QL KK SL    YVV#     V V #   SR L       WV   Q      L V
Conservation:  6342983955433249447336393672474388765489776776663532538436422943354445386345436643343334143162257348
STMI:                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                      
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LRTLLNETPEQIKYILAQYNTTKDKAFTDLNSINSVLGGGILDRLRPNIIPVLDEIKSMATAIKETKEALENMNSTLKSLHQQSTQLSSSLTSVKTSLRS 300
PathogenicSAV:                                             P                                                       
gnomAD_SAV:    FG      A   R*M #*DDP RGRV I     S L   RLVA* K S TA   A  T  IPM A  GV  STD  W   Y R# R I R  RM  GQW 
Conservation:  6436331441652653255223513432464453147822721362324064541422552453254247313212411422321152037203402411
SS_PSIPRED:    HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH HHHHHHHHHH  H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                           DDDDDDDDDDD       D         
CARBOHYD:                         N                                                     N                          
MODRES_A:                              K                               K      K                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SLNDPLCLVHPSSETCNSIRLSLSQLNSNPELRQLPPVDAELDNVNNVLRTDLDGLVQQGYQSLNDIPDRVQRQTTTVVAGIKRVLNSIGSDIDNVTQRL 400
PathogenicSAV:                                                                         C                           
gnomAD_SAV:    FVKNL     LLG#   N#TF  G  SGK        M  GV     I K        H D  F YV NG  H  MII#VDVES   YT   T S   HP
Conservation:  4934319101121029117204713701323311631520351342143245621342453035425501512651143113413541451260122203
SS_PSIPRED:    HH          HHHHHHHHHHHHH      HHH     HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HH          HHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH H HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHH         HHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                      DD           DDDDDD                                                              
CARBOHYD:                                                                                                    N     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PIQDILSAFSVYVNNTESYIHRNLPTLEEYDSYWWLGGLVICSLLTLIVIFYYLGLLCGVCGYDRHATPTTRGCVSNTGGVFLMVGVGLSFLFCWILMII 500
PathogenicSAV:             D                                                                                       
gnomAD_SAV:     S NT      HDS I   # K FS  V C  CR     IS     V M   HV  P #M S*    ILA *SW F  RS V V     C     VF NV
Conservation:  5531151142025211411411043135317586743443355343543384278545923954323695399557869946855665537454643722
STMI:                                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                MMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                     HHHHHHHHHH     HHHHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                      EEEEHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                   N                                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VVLTFVFGANVEKLICEPYTSKELFRVLDTPYLLNEDWEYYLSGKLFNKSKMKLTFEQVYSDCKKNRGTYGTLHLQNSFNISEHLNINEHTGSISSELES 600
gnomAD_SAV:           DTS##  N   *M  DF WI #A##F S G V S       # ET VP   I # YR #  A*SSFYR*ST H C YVK H    #L     I
Conservation:  5332833756456649665044257554858454312444666724424334269232476373243838266555315543115421133125000631
STMI:          MMMMMMM                                                                                             
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH       HHHHH           HHHHH             HHHHHHHHH    HHHHH       HHHH  HHHH   HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH    HHHH           H           HHHHH             HHHHHHHH     HHHHH         HH  HHH    HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH HHHHHHHH     HHH      HHH  HHHHHHHHHHH         HHHHHHHH   HHHHHHHH            HHHH   HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                     N                               N                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LKVNLNIFLLGAAGRKNLQDFAACGIDRMNYDSYLAQTGKSPAGVNLLSFAYDLEAKANSLPPGNLRNSLKRDAQTIKTIHQQRVLPIEQSLSTLYQSVK 700
BenignSAV:                       R                                                                                 
gnomAD_SAV:    M        FDT  T H RG   Y REG Y GGC   A   LS   # P  C VQ R   S S     F  S T A     *HQ   V #  NIVH RFR
Conservation:  3252524267412552491272136521546216616325233135633761163225316526063135112422540640135245423512423352
SS_PSIPRED:        EEEEE  HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        EEEEE  HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H    EEEE  HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                   DD                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ILQRTGNGLLERVTRILASLDFAQNFITNNTSSVIIEETKKYGRTIIGYFEHYLQWIEFSISEKVASCKPVATALDTAVDVFLCSYIIDPLNLFWFGIGK 800
PathogenicSAV:                                                                                           F         
gnomAD_SAV:    M  CARDRFF TG         P  V   S T#  T A     T LV    RC  C K  VG  AVP  H V # V  LV        N     #Y M  
Conservation:  0752241261145015503553580651233515513731161126347622931951055203442968356448645333383433375746867381
STMI:                                                                                                      MMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH H  HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                  NN                                                                      

                       10        20        30        40        50        60     
AA:            ATVFLLPALIFAVKLAKYYRRMDSEDVYDDVETIPMKNMENGNNGYHKDHVYGIHNPVMTSPSQH 865
gnomAD_SAV:        S L    V E PR*CGQV L    N    TS   R D   S   V#IC   S  TA   * 
Conservation:  43366575564676756466553575565424222323221112222221101202212111110
STMI:          MMMMMMMMMMMMM                                                    
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                             
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                            
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                            
DO_DISOPRED3:                                      DDDDDDBDBBBBBDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                     DD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                   D
MODRES_P:                                                                    S