O43511  S26A4_HUMAN

Gene name: SLC26A4   Description: Pendrin

Length: 780    GTS: 3.521e-06   GTS percentile: 0.956     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 107      BenignSAV: 21      gnomAD_SAV: 539      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAAPGGRSEPPQLPEYSCSYMVSRPVYSELAFQQQHERRLQERKTLRESLAKCCSCSRKRAFGVLKTLVPILEWLPKYRVKEWLLSDVISGVSTGLVATL 100
PathogenicSAV: #                          #Q                                              # C        Y  L   I    RP
BenignSAV:          V              V  G                        R                                                 M 
gnomAD_SAV:    R    VK QT#H R  G   VL G#   *VS H   QL P  LNK  KR   S   *  I#SAEP SH TV  * LNH#I K   NEA LVFNI  ATK 
Conservation:  1222222222222200001212131123101311011100101111102222222442243202222247432744042242343343468444635435
STMI:                                                                                                 MMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:                       EEEE     HHHHHHHHHH       HHHHHHHH    HHHHHHHHHHH HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                       EEEE     HHHHHHHH HH      HHHHHHHH    HHHHHHHHHH   HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                      EEEEE     HHHHHHHHHH    H HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDD                                                                                      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDD                                                                                     
DO_IUPRED2A:   DDDDDDD                                                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QGMAYALLAAVPVGYGLYSAFFPILTYFIFGTSRHISVGPFPVVSLMVGSVVLSMAPDEHFLVSSSNGTVLNTTMIDTAARDTARVLIASALTLLVGIIQ 200
PathogenicSAV:  R  C#          F     S        IT   P#A       #                                        T    I   R   
BenignSAV:        V                                                                                    S           
gnomAD_SAV:    PR#   VP SF# R  FH    SV #HS#L   G V FV   L#  V R LI  VPSNQ I A  G    SS IVTAPT #V  TF TSCV I PAR T 
Conservation:  3545558652534156865598725383456665957476977544847136123432100000103121021222222213114515535453538548
STMI:          MMMMMMMM MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                   MMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHH HHHHH                          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH     HHHHHH HHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHH H                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH     HHEHHHHHHHHHHHHH            EEEEEEHHHHHHH                       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                     DDDD                             
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LIFGGLQIGFIVRYLADPLVGGFTTAAAFQVLVSQLKIVLNVSTKNYNGVLSIIYTLVEIFQNIGDTNLADFTAGLLTIVVCMAVKELNDRFRHKIPVPI 300
PathogenicSAV:         V    C            P        #  D            P                  H         IY                  
BenignSAV:                                                                                       I                L
gnomAD_SAV:    F#Y   # V TE FS  LSA V         QL*RV  D SI IE# KR PPVVCM   S  IF#Y S    I  #  MIIYVT   F  Q  R VSI S
Conservation:  5258235398553775345656875688535566946346451414323355333341244146114823744455454335245854623542464365
STMI:          MMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHH   HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:    HHHHH   HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PIEVIVTIIATAISYGANLEKNYNAGIVKSIPRGFLPPELPPVSLFSEMLAASFSIAVVAYAIAVSVGKVYATKYDYTIDGNQEFIAFGISNIFSGFFSC 400
PathogenicSAV:                                  VL                        V D      E  V           G  V   #Y        
BenignSAV:     L                      Y                                T                                           
gnomAD_SAV:    STQ TLM TV VV C D   *D Y ST      #L   K LS NFSL I GTASP#TAE   VV  A  L  ARHY #VN KHG VD  M Y#     P 
Conservation:  8683445644444664346113525256314215512711621024112423564465767566588665753854816677987474944844462845
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMM                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                   MMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHH   HHH   EE               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHH    HH   EEEEE            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH     HH  
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHH         EEE              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH HH   H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FVATTALSRTAVQESTGGKTQVAGIISAAIVMIAILALGKLLEPLQKSVLAAVVIANLKGMFMQLCDIPRLWRQNKIDAVIWVFTCIVSIILGLDLGLLA 500
PathogenicSAV:  M      ##P R  P    P                       WR #        K                      D         L      S   
BenignSAV:                                                           F                                             
gnomAD_SAV:    S   N  PPMPIRQGP    E    N# V    T  D R    SW* L     LF  P EI # P V SC RK     TA S  MY E LTR   FS I 
Conservation:  7446957886558565777584764465245664433462573567568966656499898547315521654465183256426532434877639743
STMI:          MMMMM                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                 MMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHH HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH H   HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GLIFGLLTVVLRVQFPSWNGLGSIPSTDIYKSTKNYKNIEEPQGVKILRFSSPIFYGNVDGFKKCIKSTVGFDAIRVYNKRLKALRKIQKLIKSGQLRAT 600
PathogenicSAV:        #     #            P S# I                   I   # K      #    I                              
gnomAD_SAV:    #   #      T R #P    A  RN  VHE  N    TK #  GET    NHV CVH NV   GVQ  AE  VV #C     V K  P*Q E   S V 
Conservation:  5533553465384947233155451356687313160231421754756325767778524562361234773423653882554324334232512114
STMI:          MMMMMMM                                                                                             
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH    EEEE                       EEEEE    EEE HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH     EEEEE      E  HH          EEEEEE     EE HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHEE     EEE       EE  HHH          EEEEE        HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                     DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                DDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KNGIISDAVSTNNAFEPDEDIEDLEELDIPTKEIEIQVDWNSELPVKVNVPKVPIHSLVLDCGAISFLDVVGVRSLRVIVKEFQRIDVNVYFASLQDYVI 700
PathogenicSAV:                                                  D  A V   L      FC E  E   Q               L P      
BenignSAV:             G              P                                                              Y            M
gnomAD_SAV:            I R  G    DVVAGMK     I  T #K #CSP       I R  V  FL E   VP PNI EMG  WMT   S   YAY  V   *A MT
Conservation:  1262201110020011242113202102111242331458222571230591424785647652538483463325413444514526247552121122
SS_PSIPRED:                        HHHHHH                             EEEEEE     EE HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE   HHHH
SS_SPIDER3:       E                 HHH        H             E       EEEEEEE     E  HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE   HHHH
SS_PSSPRED:                                                           EEEEEE     EE HHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE   HHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                     
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80
AA:            EKLEQCGFFDDNIRKDTFFLTVHDAILYLQNQVKSQEGQGSILETITLIQDCKDTLELIETELTEEELDVQDEAMRTLAS 780
PathogenicSAV:   P              S  M ##    P                                             T     
BenignSAV:                 M                          S                                        
gnomAD_SAV:     N Q *R   YS# NNRS  MGRGTV C HS AEY*KC#V VV M IV   G    GSTK   M GG    AK V#IF#F
Conservation:  14610317643132133454646645523102110000222100000222222222222000001010000122121112
SS_PSIPRED:    HHHHH            EEE HHHHHHHHHHHH          HHHHHHHH     HHHHHH   HHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHH         H   E  HHHHHHHHHHH             E EH         HHH    HHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHH          EEE  HHHHHHHHHHH             HHH                     HHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: