O43719  HTSF1_HUMAN

Gene name: HTATSF1   Description: HIV Tat-specific factor 1

Length: 755    GTS: 5.19e-07   GTS percentile: 0.050     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 179      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSGTNLDGNDEFDEQLRMQELYGDGKDGDTQTDAGGEPDSLGQQPTDTPYEWDLDKKAWFPKITEDFIATYQANYGFSNDGASSSTANVEDVHARTAEEP 100
gnomAD_SAV:        S VR H              C    AHAV    L A   #                  V D  L       D   #   I  TK    LG      
Conservation:  6210011001120111111121111111101101002202211102320324303243244245576383867567511320223212110010011121
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHHHHHH                          EEEEE           HHHHHHHHHHH               HHHHH     
SS_SPIDER3:              HHHHHHHHHHH                   E E     EEEEE    EEEE   HHHHHHHHHH              HHHHHH      
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHHHHHH                                          HHHHHHHHHH                 HHH      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDD DD BBBBDD        DD   D                                               DDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PQEKAPEPTDARKKGEKRKAESGWFHVEEDRNTNVYVSGLPPDITVDEFIQLMSKFGIIMRDPQTEEFKVKLYKDNQGNLKGDGLCCYLKRESVELALKL 200
gnomAD_SAV:         L   N G   K                                       C VV           R  R                          
Conservation:  1111011012141747978162455234225556645576958341577323546456653841555365578682578779868888686885366234
SS_PSIPRED:              HHHHHHHHHHH            EEEE        HHHHHHHHHH  EEEE      EEEEEEE        EEEEEEE  HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:               HHHHHHHH              EEEEE       HHHHHHHHHH  EEEE      EEEEEEE     EEEEEEEEEEE HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:              HHHHH                  EEEEE       HHHHHHHHHHH  EE       EEEEEE          EEEEE  HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                         
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                                                                        
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD            D                                DDD                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LDEDEIRGYKLHVEVAKFQLKGEYDASKKKKKCKDYKKKLSMQQKQLDWRPERRAGPSRMRHERVVIIKNMFHPMDFEDDPLVLNEIREDLRVECSKFGQ 300
gnomAD_SAV:             R  IV                   Q F    CV        L   S        QAA        V     L           G  LT   
Conservation:  6862348945566818387677577547976636665953228665896468722311644285656658786817574666598866596646848884
SS_PSIPRED:    HH      EEEEEEE              HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH           EEEEE    HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    H    E   EEEEEEE             H HHHHHHHHHHHHHH                  EEEEE     HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    H HHH     EEEEEE           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                EEEEEEE          HHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                          
DO_SPOTD:                            DDDDDDDDDDDDDD   D DD       DDDDDDDD                                          
DO_IUPRED2A:                                                 DDDDDDDDD    D                                        
MODRES_A:                                                                                                      K   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IRKLLLFDRHPDGVASVSFRDPEEADYCIQTLDGRWFGGRQITAQAWDGTTDYQVEETSREREERLRGWEAFLNAPEANRGLRRSDSVSASERAGPSRAR 400
gnomAD_SAV:         I             #Y    G     FN           R         M                  S         H         V     G
Conservation:  5665458869988699766643435708413745999696762742999289666565366886666482266222111010001111111111111111
SS_PSIPRED:    EEEEEEE      EEEEEE  HHHHHHHHHHH   EE   EEEEEEE           HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH        HHHH        
SS_SPIDER3:      EEEEEE    EEEEEEE  HHHHHHHHHHH   EE  EEEEEEEE       H  HHHHHHHHHHHHHHHH                           
SS_PSSPRED:    EEEEEEE      EEEEEE  HHHHHHHHHHH       EEEEEEEE           HHHHHHHHHHHHHHH                           
DO_DISOPRED3:                                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                            DDDDDDDDDDDDDD  D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                 DDDDDDDDDDDDDDD  D DDDDDD     D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                            S             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HFSEHPSTSKMNAQETATGMAFEEPIDEKKFEKTEDGGEFEEGASENNAKESSPEKEAEEGCPEKESEEGCPKRGFEGSCSQKESEEGNPVRGSEEDSPK 500
BenignSAV:                                                                                  A                      
gnomAD_SAV:    R     C YQV         # K   G          E    R    S      K   KK     Q    F R    A         SSSI V    G  
Conservation:  1111111120111121101111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111123011
SS_PSIPRED:             HH HHHHHHH        HHHHHH          HHH        HHHHH                      HHH                
SS_SPIDER3:              H HHHHH           H H                        H                                            
SS_PSSPRED:               HHHHHHH         HHH                       HHHHHH                                        H
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:        S   S S                                   S      SS                           S   S        S   S  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KESKKKTLKNDCEENGLAKESEDDLNKESEEEVGPTKESEEDDSEKESDEDCSEKQSEDGSEREFEENGLEKDLDEEGSEKELHENVLDKELEENDSENS 600
BenignSAV:                              T                                                                          
gnomAD_SAV:      F N S    Y    F R     F  D       #EGFK    K    K     HY   FK            EK DF      H  N     K     
Conservation:  1111111111111111111111111111011111221211111101101111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:     HHHHHHHH HHHHHH HHH HHHHHH               HHHH  HHHHHHHH    HHHHHHHHH HHH   HH HHHHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:            H   HH            H                                  HHHHHH            HHHHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:    HHHHHH HHHHHHHH HH HHH                    HHHH    HHHHHH    HHHHHHHH           HHHHH  HHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                          S       S                           S   S                 S                 S  S

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EFEDDGSEKVLDEEGSEREFDEDSDEKEEEEDTYEKVFDDESDEKEDEEYADEKGLEAADKKAEEGDADEKLFEESDDKEDEDADGKEVEDADEKLFEDD 700
BenignSAV:                                                                                  G                      
gnomAD_SAV:    K K  S K         KQL K L           N    K         T  #     Y    G           N R    TV  KI   E#   KE 
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:           HHHHHHH  HH      HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:            H                          HH      HH HHHH HHH  HHHHHHHHH  HHHHHH               H  HHHHH    
SS_PSSPRED:                           HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH  HHHHHHH     HHHHHHH     HHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:            S        S       S        T        S                                 S                        

                       10        20        30        40        50     
AA:            DSNEKLFDEEEDSSEKLFDDSDERGTLGGFGSVEEGPLSTGSSFILSSDDDDDDI 755
gnomAD_SAV:      S       K C   F #YF    ASD L# I  ER    GR   C N   # V
Conservation:  1111111111111111111111111111111102221164375222511641131
SS_PSIPRED:     HHHHH  HHHHHH                             EEE         
SS_SPIDER3:                                               EEE         
SS_PSSPRED:           HHHHH                              EEEE         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:       S          SS      S