O60343  TBCD4_HUMAN

Gene name: TBC1D4   Description: TBC1 domain family member 4

Length: 1298    GTS: 1.282e-06   GTS percentile: 0.347     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 13      gnomAD_SAV: 663      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEPPSCIQDEPFPHPLEPEPGVSAQPGPGKPSDKRFRLWYVGGSCLDHRTTLPMLPWLMAEIRRRSQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAG 100
gnomAD_SAV:    T   #  H    SYLRDR#TV TP  R#WN  EE  P *D AV*F     AV VVS* #   H     L  DC  T   G* #  P     LG  E#   
Conservation:  6111111111111111111111111111101011040302352213423222213234213321111111111100110103040202103241111111
SS_PSIPRED:                                       EEEEEEE           HHHHHHHHHHHH              EEEEEEE    EEEEE     
SS_SPIDER3:                                     EEEEEEEEEEEE        HHHHHHHHHHHH              EEEEEEEE   EEEE      
SS_PSSPRED:                                      EEEEEEE           HHHHHHHHHHHHH               EEEEEEE   EEEE      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                    DDDDDDDDDD                      DD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                    DDDDDDDDD                      DD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                D    DDDDDDD                      DDD 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ASGGTSPSATQPNPAVFIFEHKAQHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQVPDVISSIRQLSKAAMKEDAKPSKDNEDAFYNSQ 200
BenignSAV:     V                                                                                                   
gnomAD_SAV:    V RAARLLP#H T# ELVL# M  #N*C  RD  G  S  C     HGH  W T  QI     RG              VTV D     EE  VT    R
Conservation:  1111111011111011245333341324333543432244453112211110112212231000029657543685478344335211001123361146
SS_PSIPRED:                   EEEEE  HHHHHEE        EEEEEEE     HHH EEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHH   
SS_SPIDER3:                   EEEEEE  HHHHHEEE      EEEEEEE         EEEEEEE   HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH          H    
SS_PSSPRED:                   EEEEE HHHHHHHHHH       EEEEE            EEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHH                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDD                                                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDD                                                                       DDDDDDDDDDDDDD      
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD DDDDDD                                     DDDDDDDD         D       D  DDDDDDDDDDDDDD      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCMEKFSLHEQQRLKIQGEQRGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQPALTSSRVCFPERI 300
BenignSAV:                                          T                                                              
gnomAD_SAV:     LK  C  #  #    STPC     V N   QKR*H T   G GCL S     G      RFLRN*VLKGG   H   C  P T  R     W    KQ 
Conservation:  6789786965261465644587979533622211111001111201111110000220010021000011111111111111100011002120101113
SS_PSIPRED:     EEEEEEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHH                                          HHH
SS_SPIDER3:    EEEEEEE  EEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHH                                          HHH
SS_PSSPRED:     EEEEEE EEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                                         HH
DO_DISOPRED3:                                D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D           
MODRES_P:                                                                   S                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LEDSGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQPSDSEKNRTMLFQVGRFEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGF 400
gnomAD_SAV:    W*EFAL  H K P W   A SAK#G YQC     T*Q L  T  PI  LNL  K     #A Q  F   G        GNS   TF SALVR  #     
Conservation:  2131122141214031321112211103201110111111122205985422396567746425464545965843435729644548588533299896
SS_PSIPRED:    HH     HHHHHHHHH      HH HH                       HH   EEEEEE   EEEEE      EEEEEE    EEE      HH  EE
SS_SPIDER3:    H      HHHHHHHH                   HHH E                EEEEEE   EEEEE      EEEEEE   EE          HEEE
SS_PSSPRED:    H       HHHH                      HHHHH                EEEEEE  EEEEE       EEEEE                    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                    
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                 
DO_IUPRED2A:                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                               
MODRES_P:                   S   S                      S  S                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ICRESPEPGLSQYICYVFQCASESLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKLVIQRHLSSLTDNEQADIFERVQ 500
gnomAD_SAV:    M#W FLGA   RC  NI HS  K VF     S I   GMVV   R NM        L    # V     R  S   E M   Y      D RVGM GG *
Conservation:  7785112141134385688953659766567676889537614431412224741894306658844677325445762564445161314741486143
SS_PSIPRED:    EE          EEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEE       E EEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEE      HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:               EEEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH     HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                               D DDD                                                  
DO_SPOTD:                                                                                               DD         
DO_IUPRED2A:                                                                                                    DDD
MODRES_A:                                                                                  K                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTISNSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSFERSNSLAS 600
gnomAD_SAV:          G         YVKK YDGR    # SR     VA         GR TL  E    E *GY  IFM  VL        VW #T     Q SGF# 
Conservation:  5236136547765442197146525841816113111002111112111133425451564555456546674545351462524323032122212211
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                          HHHHHHH      HHHHHHHH                        
SS_SPIDER3:           HHHHHHHHHHHHHH HHHHH           E              H  HH          H HHHH                          
SS_PSSPRED:    H     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                               HHHHH   HHHHHHHHH                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:        DDDDDDDDDDD              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DD                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDD             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                       S T S                 S  S         
MODRES_M:                                                                                  R                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKDYSPGDSPPGTPPASPPSSAWQTFPEEDSDSPQFRRRAHTFSHPPSSTKRKLNLQDGRAQGVRSPLLRQSSSEQCSNLSSVRRMYKESNSSSSLPSLH 700
BenignSAV:                       L                                                                G                
gnomAD_SAV:       C*  N  S IL#V SLP  #*M  K  FNFL  * WVYA   LA NA T    R   S*AMH RVRG   R  G  #A LGHT        R     
Conservation:  1351321213101231443111011112111011248586585563621121111211110211324625533251231011013112121111332345
SS_PSIPRED:                                     HHHHHH                                                             
SS_SPIDER3:                                     HHHHHH                                                             
SS_PSSPRED:                                     HHHHHH                                                             
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:              S   T   S                        T                       S                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TSFSAPSFTAPSFLKSFYQNSGRLSPQYENEIRQDTASESSDGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQRIFLRVASPMNKSPSAMQQQDGLDRN 800
BenignSAV:                                                        A                                                
gnomAD_SAV:    NA  T#   S#P  QN  R      A *       AT * N     E N  IY S  Q   E  G  HQ     P   #IT  TKR   #VPRR     K
Conservation:  6336357456758781154111113531632112322111111111341121112011010123221654886556754665742223221311211310
SS_PSIPRED:                HHHHHH           HHH                                       HHHHHHHH          HHH      HH
SS_SPIDER3:                HHHHH             H                                        HHHHHHHH                     
SS_PSSPRED:                HHH                                                        HHHHHHHH                     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DD                  D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD                 DDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                        S  S  S     T                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ELLPLSPLSPTMEEEPLVVFLSGEDDPEKIEERKKSKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLEASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKLLNC 900
BenignSAV:                       I                                                                                 
gnomAD_SAV:    K    PR#F #V   L  I  PR VE  ETD    LEG  N   E VY   F I*I   K    T GG    I    GC  AD YE    V   E#*  Y
Conservation:  3423242112001141110111111111111123221346159335648656856664642561454436335426837384216357321297438233
SS_PSIPRED:    H                HH       HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH HHHH   HHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:                   HHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH      H       HHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:                                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH      HHH    HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                   
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDD      DDDDDDDDD   DDDDDDDD                            DDDDD                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPDISYKELLKQLTAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSL 1000
gnomAD_SAV:       VS  V  #P F E* I   #QE  *R    R *P Q S  Q  S  VP R    P A **R#  E  E M  S SH  LH# T RR#   F      
Conservation:  7353325172440342377862388768355425325231331412113336248544554687579666844463434443348388769584855665
SS_PSIPRED:    HHHHH  HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHH     HHHHHHHH       HHH      HHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHH   HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH HHH            HHHHHHH    HHHHHHHHHH       HHH      HHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHHH  HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                        DBD DDD                                                       
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LDKEVGYCQGISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGF 1100
PathogenicSAV:                                         H                                                           
gnomAD_SAV:     N   R R        F    I    T      F CE S C    S VIP HM  FE    F  C#SEI# YP GK V     VP C F F V H  *  
Conservation:  6926886558466578456564264556156555664255845659563388656776699979654364266613463758665799793767766768
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH  HHHHHHHHHH   HHH
SS_SPIDER3:        H HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH   HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH      HEHHHHHHHHHHH    HH
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH  HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIMECESFENIVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETLE 1200
BenignSAV:                       A                           M                                                     
gnomAD_SAV:       L V      A I   A  #  N * I V  S     V  S   A   IY   IG   S G Q     P   C    N  R K RG   PR   D S 
Conservation:  7675642252584555886654674433225433445637754573257274114695552762466547777589867476465415211214414323
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH HHHHH    HHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH    HHHHHHHHH          HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                      DD DDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQKTVEQLRKLLPADALVNCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP 1298
BenignSAV:          S                                               D                    AS       I              
gnomAD_SAV:     MGS S  V  E TG              F A     SM   *  #  # PV D V D  SM#  W   LT V AS  V   #  *S K  T LR   
Conservation:  46564512844863466647524324431551144043127125311312671650052133214100010111110110100111111000001111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH               
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH               
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               
DO_DISOPRED3:  DD     DD  DDDBD DDD DDD        D                                       DDDDDDDDBBBBDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:      DD                                                                                    DDDDDDDDD