O60427  FADS1_HUMAN

Gene name: FADS1   Description: Acyl-CoA (8-3)-desaturase

Length: 444    GTS: 4.163e-07   GTS percentile: 0.026     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 83      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAPDPVAAETAAQGPTPRYFTWDEVAQRSGCEERWLVIDRKVYNISEFTRRHPGGSRVISHYAGQDATDPFVAFHINKGLVKKYMNSLLIGELSPEQPSF 100
gnomAD_SAV:       N A SDS #R L A *   V      A        N M              C     #      G                  I     Y   L  
Conservation:  1111110000001001110111121101010111002100111011000000211011210010100175807571310141446137358363235431
SS_PSIPRED:        HHHHH            HHHHHHH     EEEEE  EEEE  HHHHH     HHHH          HHHH   HHHHHHHHH              
SS_SPIDER3:        HHHHHH           HHHHHHH     EEEEE  EEEE HHHHHH   H HHHEE        HHHHH     HHHHH     EE         
SS_PSSPRED:                         HHHHHHH     EEEEEE EEEE           HHHHHHH         HHH    HHHHHHHHH             
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDD                                                                                     
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDD DD    DD  D                                                                            D

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EPTKNKELTDEFRELRATVERMGLMKANHVFFLLYLLHILLLDGAAWLTLWVFGTSFLPFLLCAVLLSAVQAQAGWLQHDFGHLSVFSTSKWNHLLHHFV 200
gnomAD_SAV:         T VI   #Q Q    W   R   Y                       C    F   F G   IV  T         E      A  C    Q   
Conservation:  4104311541783193114522456232018823162744356224623421472631242322233334425124689726916631350555326143
STMI:                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                              
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DD DD                                                                                               
MOTIF:                                                                                       HDFGH                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IGHLKGAPASWWNHMHFQHHAKPNCFRKDPDINMHPFFFALGKILSVELGKQKKKYMPYNHQHKYFFLIGPPALLPLYFQWYIFYFVIQRKKWVDLAWMI 300
BenignSAV:                                                                            S                            
gnomAD_SAV:         EG T              S     Q   TR           M I        L        S     #       *  S     *   M  V   
Conservation:  3314483522584217246847684208966423222143381037151512523233432542451222313323323210230122032071742412
STMI:                                                                             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            
SS_PSIPRED:    HHHH    HHHHHHH                     EEEEHHHHHHHHH           HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH      HHHH                        EEEEHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH  HHHH HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH      HHHH                       EEEE  HHHHHHHHHHHH     HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                        HFQHH                                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TFYVRFFLTYVPLLGLKAFLGLFFIVRFLESNWFVWVTQMNHIPMHIDHDRNMDWVSTQLQATCNVHKSAFNDWFSGHLNFQIEHHLFPTMPRHNYHKVA 400
gnomAD_SAV:       I #              C          S               N  Q        P           S          TK   S M  *   Y  P
Conservation:  4432422124033343132423202242224034344442364441420413145322760344332351535534534443343554435826531242
STMI:               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                                          
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHH     HH  HHH                   HHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHH H  HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH                HHHHHHHHH          HH      E             HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHH          HHH                    HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                                                                          QIEHH              

                       10        20        30        40    
AA:            PLVQSLCAKHGIEYQSKPLLSAFADIIHSLKESGQLWLDAYLHQ 444
gnomAD_SAV:               M           T                   E
Conservation:  42443471562415216341164184213340221151243011
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH    EE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH   EEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH   EE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                              
DO_SPOTD:                                                DD
DO_IUPRED2A: