O60563  CCNT1_HUMAN

Gene name: CCNT1   Description: Cyclin-T1

Length: 726    GTS: 8.485e-07   GTS percentile: 0.158     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 336      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEGERKNNNKRWYFTREQLENSPSRRFGVDPDKELSYRQQAANLLQDMGQRLNVSQLTINTAIVYMHRFYMIQSFTQFPGNSVAPAALFLAAKVEEQPKK 100
gnomAD_SAV:      E    D#R  * IL    SC#FGGCD    E  P    V   H             N  S  F     T E  K* LR P# S#            R 
Conservation:  0000011000102301111100312113022213100211131322124211036476669565543455412461252212424334546455635769
SS_PSIPRED:                   HHHHH  HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:                   HHHHH    H     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HH        HHHHHHHH H      
SS_PSSPRED:                   HHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHH          
DO_DISOPRED3:  BBBBBBBDD                                                                                           
DO_SPOTD:      DDDDDDDD                                                                                            
DO_IUPRED2A:   DDD    D  DDDDDD       DDDDDDDDDD                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LEHVIKVAHTCLHPQESLPDTRSEAYLQQVQDLVILESIILQTLGFELTIDHPHTHVVKCTQLVRASKDLAQTSYFMATNSLHLTTFSLQYTPPVVACVC 200
gnomAD_SAV:            R        V    R T    #        L    V     F          S   *EI                        PSAL  G  
Conservation:  9759655435532526224534434655746685356544533557646666665376674667754356575666454777656676966395667777
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EE  HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH       HHH   HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE  HHHHHHHHHH H  HHHHHHHHHHH        EEEE   HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEE    HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH      EEEEE    EEEEHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                      S                                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IHLACKWSNWEIPVSTDGKHWWEYVDATVTLELLDELTHEFLQILEKTPNRLKRIWNWRACEAAKKTKADDRGTDEKTSEQTILNMISQSSSDTTIAGLM 300
gnomAD_SAV:     R            A NR   R         Q   K    L         G         GKS RERR   PER       AV SV  P     I    V
Conservation:  7996977767779697669599597713956377649767799997799667655547351312283512110031131324311113222121232411
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH            HHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHH               
SS_SPIDER3:    HHHHHHH            EHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH HHHHHHHH H                H                
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH            EEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH                HHH                 
DO_DISOPRED3:                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           DD 
MOTIF:                                                             KRIWNWRACEAAKKTKAD                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SMSTSTTSAVPSLPVSEESSSNLTSVEMLPGKRWLSSQPSFKLEPTQGHRTSENLALTGVDHSLPQDGSNAFISQKQNSKSVPSAKVSLKEYRAKHAEEL 400
BenignSAV:                                                                  R                                      
gnomAD_SAV:     V AA IG#ASP   FK      S   L AVEC    K     A S  RQ G   T#  A R V  E P     K R  ER   T M   VHCV Y  G 
Conservation:  2222432222130211111211011000121107211201101100111112101101102011001000111222012111212456844864111111
SS_PSIPRED:                                                                                            HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                                          H                                 HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                                                                            HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DD D  DDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDD      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDD DDDDDDDD
MODRES_P:                                             S                                               S            
MODRES_A:                                                                                               K          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AAQKRQLENMEANVKSQYAYAAQNLLSHHDSHSSVILKMPIEGSENPERPFLEKADKTALKMRIPVAGGDKAASSKPEEIKMRIKVHAAADKHNSVEDSV 500
gnomAD_SAV:             V     L #         D GC    V  I V V GD##QR PG  GQ      V     N  E    Q    CVE   V  E#D #* GF
Conservation:  1119324510301132120012121113120153333626111111212001450352227331413121111111135365667442212111213121
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                 HHHH              HHHHHHHH   HHHH         
SS_SPIDER3:    HH HHHHHHH HHHHHHHHHHH                            HHHH   HHH                HHHHHHH                 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                           HHHHH                    HHHHHH      HHH         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDD DDDDD  DDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                                    S   S 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TKSREHKEKHKTHPSNHHHHHNHHSHKHSHSQLPVGTGNKRPGDPKHSSQTSNLAHKTYSLSSSFSSSSSTRKRGPSEETGGAVFDHPAKIAKSTKSSSL 600
BenignSAV:                                             C                                                           
gnomAD_SAV:    IR # YE RLRIY F   RYYH        TH L# A  RHT# S  NIPANS  NEAC##  Y  FF C C KET#V  RRS S N GEVTE       
Conservation:  1124407753612111224013141302011212111221111211011111211202121111122232434411111111213242261362342210
SS_PSIPRED:       HHHHHHH                                                                             HHH          
SS_SPIDER3:          H                                                                                   H         
SS_PSSPRED:         HHHH                                                                              HHHH         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDD
MODRES_P:                                                                     S            S                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NFSFPSLPTMGQMPGHSSDTSGLSFSQPSCKTRVPHSKLDKGPTGANGHNTTQTIDYQDTVNMLHSLLSAQGVQPTQPTAFEFVRPYSDYLNPRSGGISS 700
gnomAD_SAV:      FY   L KC IL R L RN FA T   Y  H LY*  GERL R SD SM   R CEG #S  P   RV R R  L # S  AC #G C   QC    #
Conservation:  1111212210111022022231132322212012342635222131265402322242233335244333321111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:                                                            HHHHHHHHHHHHHH          HH    HHHH          
SS_SPIDER3:                                                            HHHHHHHHHHHHHH                 HHH          
SS_PSSPRED:                                                               HHHHHHHHHHH                HHH           
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                      DDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                       DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDD

                       10        20      
AA:            RSGNTDKPRPPPLPSEPPPPLPPLPK 726
gnomAD_SAV:    G SK  R Q  R    L#   T    
Conservation:  11111111111111111111111111
SS_PSIPRED:                              
SS_SPIDER3:                              
SS_PSSPRED:                              
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDBBBB
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD