O60635  TSN1_HUMAN

Gene name: TSPAN1   Description: Tetraspanin-1

Length: 241    GTS: 2.078e-06   GTS percentile: 0.682     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 115      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MQCFSFIKTMMILFNLLIFLCGAALLAVGIWVSIDGASFLKIFGPLSSSAMQFVNVGYFLIAAGVVVFALGFLGCYGAKTESKCALVTFFFILLLIFIAE 100
BenignSAV:     V                                    F                                                M             
gnomAD_SAV:    V*F      TV    S      VT  GAD    SN  F     RS L N V S  M H   T SIA V  S M W     DCR S MM LSL   SIT  
Conservation:  5131023301212211122238232333946423321442234101310202323434456437224324735855681236564642662445565436
STMI:                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM               MMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE    HHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEHEHEE    EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEE    EEE          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VAAAVVALVYTTMAEHFLTLLVVPAIKKDYGSQEDFTQVWNTTMKGLKCCGFTNYTDFEDSPYFKENSAFPPFCCNDNVTNTANETCTKQKAHDQKVEGC 200
gnomAD_SAV:          VFA I T  RL M    S  #  C PP H A  RTN       Y  # NM      #LR  GG S    S  I    SA   M E  NK L  S
Conservation:  4544333435221420351013211631277011036126514712329974255468127042000105900991111110000091000400003088
STMI:          MMMMMMMMM                                                                                           
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH                 HH        HH                        H
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH  E     H HH   H                      HH              
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH                                              HHH    H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                    DDDDDDDDDDDDDDD       
DO_IUPRED2A:                                                                                        D              
CARBOHYD:                                              N            N                       N     N                

                       10        20        30        40 
AA:            FNQLLYDIRTNAVTVGGVAAGIGGLELAAMIVSMYLYCNLQ 241
gnomAD_SAV:         CY Q     M CA V TEC K TTI LFIH   D  
Conservation:  40142014214202435543543357424324432551122
STMI:                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                           
DO_SPOTD:                                               
DO_IUPRED2A: