O60721  NCKX1_HUMAN

Gene name: SLC24A1   Description: Sodium/potassium/calcium exchanger 1

Length: 1099    GTS: 1.35e-06   GTS percentile: 0.378     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 8      gnomAD_SAV: 479      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGKLIRMGPQERWLLRTKRLHWSRLLFLLGMLIIGSTYQHLRRPRGLSSLWAAVSSHQPIKLASRDLSSEEMMMMSSSPSKPSSEMGGKMLVPQASVGSD 100
BenignSAV:                                         S                                                               
gnomAD_SAV:    L Q     S  KS FW  QV RNCFF  V     DCS     # #   L *  A   *AM    L   N QL IR   A     KI D  VA  G #VTG
Conservation:  7100010100100100245321253335322323122221111111111111111111111211210111111111111110111001111111111111
SS_PSIPRED:            HHHHH HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHH      EEEEE      EEEE              EE    EE   
SS_SPIDER3:       EEE   HHH H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HH        EEEEE     EEEEEE             EE     E   
SS_PSSPRED:        E    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHH       HHH               E          
DO_DISOPRED3:  BBB  BBDB            D                                DDDDD  DD D  DDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    D                                              D            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EATLSMTVENIPSMPKRTAKMIPTTTKNNYSPTAAGTERRKEDTPTSSRTLTYYTSTSSRQIVKKYTPTPRGEMKSYSPTQVREKVKYTPSPRGRRVGTY 200
gnomAD_SAV:     V   R MG    VS GI   T #  E     K     K   GI   #     C      *   ECA  SK        N*  GE     F GAG     
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:          EEE                                                                                           
SS_SPIDER3:          EEE                                            E       E                   H    E             
SS_PSSPRED:         EEE                                                                                            
DO_DISOPRED3:     DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VPSTFMTMETSHAITPRTTVKDSDITATYKILETNSLKRIMEETTPTTLKGMFDSTPTFLTHEVEANVLTSPRSVMEKNNLFPPRRVESNSSAHPWGLVG 300
gnomAD_SAV:    G    LKV IN V  HK    NGNV E CIVFKSS F   I K   A  N V   I AS     AG I      IVGEK   S  ###       RRSER
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:                                EEEE      HHH       HHHHH          HHH        HHH                       
SS_SPIDER3:       EEEEE E        E        EEEEE      HHH         H           HEH        H                          
SS_PSSPRED:         E                      EEEE     HHHHH                    HHEH                                  
DO_DISOPRED3:                DD                                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDD        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
CARBOHYD:                                                                                               N          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KSNPKTPQGTVLLHTPATSEGQVTISTMTGSSPAETKAFTAAWSLRNPSPRTSVSAIKTAPAIVWRLAKKPSTAPSTSTTPTVRAKLTMQVHHCVVVKPT 400
BenignSAV:               L V                                                                                       
gnomAD_SAV:     GIL  #   L VRNA I  E   VGIV  C       LI      HS    R    T     L*  T        # I  M  S   K          I
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111000010000011011213210010
SS_PSIPRED:              EE          EEEEE     HHH                           HHHHH               HHH     EEEEEEE   
SS_SPIDER3:                          EEEE          E  HHH                   HHHHHHH                       EEEEEEE  
SS_PSSPRED:                          EEEE      HHH                           HHHHHH                      EEEEEEE   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD              
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D DDDDDDDDDDD   DDDDD D           DDDDDDDDDDDDDDDDDD               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PAMLTTPSPSLTTALLPEELSPSPSVLPPSLPDLHPKGEYPPDLFSVEERRQGWVVLHVFGMMYVFVALAIVCDEYFVPALGVITDKLQISEDVAGATFM 500
gnomAD_SAV:    SGT I L T  #I V       NH AV  R Q FQS AQ  L       QQ DC   QI  ##CAL    T      I#GVVI I#     K    TA  
Conservation:  1000021110020100201111111110010120102536818385434643855268438638594796689887998593495245198598888678
STMI:                                                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                        MMM
SS_PSIPRED:                                                  HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH    HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                                  HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                                  HHHHH   EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:               DDD     DDDDDDDD                                                                       
DO_SPOTD:       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                
DO_IUPRED2A:          DD    DDD         DDDD DDD        D                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AAGGSAPELFTSLIGVFISHSNVGIGTIVGSAVFNILFVIGTCSLFSREILNLTWWPLFRDVSFYILDLIMLILFFLDSLIAWWESLLLLLAYAFYVFTM 600
gnomAD_SAV:      R P     IFF      #N M   #       S# L   S  #L *K FS    R  H   CC  #  IP    PY   V   R     PC  CM  R
Conservation:  8996669668556795977758799669998887968996758755954563998998798459953483699299786170338822853482187258
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMM    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM MMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHH  HHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH   HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE HHH HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HH    HHHHHHHHHHHH         E  HHHHHHHHHHHHHHHH    EEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KWNKHIEVWVKEQLSRRPVAKVMALEDLSKPGDGAIAVDELQDNKKLKLPSLLTRGSSSTSLHNSTIRSTIYQLMLHSLDPLREVRLAKEKEEESLNQGA 700
BenignSAV:            I           V                                                                                
gnomAD_SAV:     RSER KI  N   T   EV# I  #   TLDN  VV    R       L    Q T W   P  S H     I F    TVK IP   KE     H ES
Conservation:  8391138013711413111113111210131101111111012111212141633432133523212323343444355444321102221321131102
STMI:          MMMMMM                                                                                              
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH       EEE                                    HH   HHH  HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHH      H   HH                                            HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HH HHHHHHHHHHH                         HHH                         HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                               S                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RAQPQAKAESKPEEEEPAKLPAVTVTPAPVPDIKGDQKENPGGQEDVAEAESTGEMPGEEGETAGEGETEEKSGGETQPEGEGETETQGKGEECEDENEA 800
BenignSAV:                            M                                                   Q                        
gnomAD_SAV:     T        ISK      VLV M I V L  F      K  SE      K     A Q  KS        TN  Q#      G  I  E          
Conservation:  1110101110101111010010112221121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:    H    HH                                       HHHHH                                                 
SS_SPIDER3:    H  HHH     HHH        EEE                                                                           
SS_PSSPRED:         HHH               E                                                                            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                             T                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EGKGDNEGEDEGEIHAEDGEMKGNEGETESQELSAENHGEAKNDEKGVEDGGGSDGGDSEEEEEEEEEQEEEEEEEEQEEEEEEEEEEEEKGNEEPLSLD 900
BenignSAV:                                                                     G                                   
gnomAD_SAV:    *R   S    D    T    IE#    N R        S    GK        N  EYRK DKGGK      Q GA #       G #  R    S FP 
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111111122123211012111142111111111111111111111113213387371
SS_PSIPRED:                                HHHHHHHHH                      HHHHHHHHHHH     HHH HHHHHHHHHHH          
SS_SPIDER3:              HHHHHH            HHHHHHHH    H                   HHHHHHH    HHHHHHH HH HHHHHHHH          
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WPETRQKQAIYLFLLPIVFPLWLTVPDVRRQESRKFFVFTFLGSIMWIAMFSYLMVWWAHQVGETIGISEEIMGLTILAAGTSIPDLITSVIVARKGLGD 1000
PathogenicSAV:                                                                                          R          
gnomAD_SAV:         EQ    RL  SVM A R    NI#  * K   G A    VIRT   P   M R N A K TR    FV        AL R F IN T D*   RN
Conservation:  5613014322643446534565264664531022266325737561864275744555645364625554445685465454644454658453446466
STMI:                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHH HHHHE E         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DD                                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAVSSSVGSNIFDITVGLPVPWLLFSLINGLQPVPVSSNGLFCAIVLLFLMLLFVISSIASCKWRMNKILGFTMFLLYFVFLIISVMLEDRIISCPVSV 1099
gnomAD_SAV:    #      S           IS    # T          K      A    L  V    TV  Q#  K N S  I F           S  *   S   A
Conservation:  655665565555454444839844432221205519675444444537443544442554153635441452245255327533534641333174321
STMI:                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM          
SS_PSIPRED:    HHHH HH HHHHHHHHH  HHHHHHHHH    EEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          
SS_SPIDER3:     EEHHH    HHHHHHH HHHHHHHHHH     EEE HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EE     
SS_PSSPRED:    EEEEEE    HHHEEEE  HHHHHHHHHH    EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EE     
DO_DISOPRED3:                                                                                                     
DO_SPOTD:                                                                                                         
DO_IUPRED2A: