O60741  HCN1_HUMAN

Gene name: HCN1   Description: Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 1

Length: 890    GTS: 5.201e-07   GTS percentile: 0.050     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 18      BenignSAV: 25      gnomAD_SAV: 263      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEGGGKPNSSSNSRDDGNSVFPAKASATGAGPAAAEKRLGTPPGGGGAGAKEHGNSVCFKVDGGGGGGGGGGGGEEPAGGFEDAEGPRRQYGFMQRQFTS 100
PathogenicSAV:                                                                                                    F
BenignSAV:             P             V                  S    V     Q                                R              
gnomAD_SAV:          R               V        R  V  L   SL  CVV    QR      LNSS  S  D#D DK T# S   SD#SG K   V    #A
Conservation:  1111000010110100011111111111111111111111111111111111111111111111111111001110000011111111111110010110
SS_PSIPRED:                         HHHH      HHHHHH                     EEE                                 HHHH H
SS_SPIDER3:                                    HHHH                       EE                               HH H   H
SS_PSSPRED:                                     HHH                        E                             HHHHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEKEQERVKTAGFWIIHPYSDFRFYWDLIMLIMMVGNLVIIPVGITFFTEQTTTPWIIFNVASDTVFLLDLIMNFRTGTVN 200
PathogenicSAV:                                                     I   V                                           
gnomAD_SAV:             A              K A         T                                   P                          S
Conservation:  0102011010100001002100111110100001101000035464334424433554447346354245232343366335443452553444637231
STMI:                                                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      
SS_PSIPRED:    H      HHHHHHH  HHHHHHHHHHHH    EEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:    H      HHHHHHH   HHHHH HHH     EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE         EEEEHHHHHHHHHHHHHHHH  EE  
SS_PSSPRED:           HHHHHH    HHHHHHHHHH     EEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEE         EEHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDD DDDDDDDD                                                                                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                             
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EDSSEIILDPKVIKMNYLKSWFVVDFISSIPVDYIFLIVEKGMDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFN 300
PathogenicSAV:                                  F        R                            P      Y                 T   
gnomAD_SAV:         V    E   I          LV       V         A                  G  H             #   Y     F    GK   
Conservation:  4233242544214302333455246455645454453343133335234344334224222343544324433332322332214443454356333425
STMI:                         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              MMMMM
SS_PSIPRED:        EEE  HHHHHHHHH   HHHHHHHH    EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        EEE  HHHHHHHHHH  HHHHHHH   HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:         EE  HHHHHHHHHH HHHHHHHHH HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LIGMMLLLCHWDGCLQFLVPLLQDFPPDCWVSLNEMVNDSWGKQYSYALFKAMSHMLCIGYGAQAPVSMSDLWITMLSMIVGATCYAMFVGHATALIQSL 400
PathogenicSAV:     L                       S                                                             #     L P 
BenignSAV:                                                                     V              T               I    
gnomAD_SAV:                     F                       V                 W                               YD       
Conservation:  6654465665858643536525444503333233132523321354353544354548453622472523455654354446547444443343455455
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMM                          IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            H     HHHHHHHHHHHHHHHHH HH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                                                  CIGYG                                      
CARBOHYD:                                           N                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADMRQKIHDYYEHRYQGKIFDEENILNELNDPLREEIVNFNCRKLVATMPLFANADPNFVTAMLSKLRFEVFQPGD 500
PathogenicSAV: H            M                                                                                      
gnomAD_SAV:       G# *          L   T         RGH    FH     K S FD  Y    Q     D QE          VY      V             
Conservation:  5534555434442322223322352212433634443424633443332323442522368554456385345756444663896447458456575714
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH   EE     
SS_SPIDER3:     H HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHH HHHHHHH       HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   HH    HHHHHHHHHH   EE     
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH H       HHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YIIREGAVGKKMYFIQHGVAGVITKSSKEMKLTDGSYFGEICLLTKGRRTASVRADTYCRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIGKKNSI 600
PathogenicSAV:                                                                                          Q          
BenignSAV:                                                    H                                                    
gnomAD_SAV:    H      M N V       T   I P N  RV                     Q           MGK T          T   R       Q    SP 
Conservation:  2555674264565856883415443221332737958674464544624543534455565468664254565654623644553333344232212013
SS_PSIPRED:    EEE        EEEEEEEEEEEEE    EEEE    EEEEEEE        EE     EEEEEEEHH HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH     H
SS_SPIDER3:    EEEEE       EEEEE EEEEEE   EEEEE    EEEEEEEEE     EEEEEE EEEEEEEE   HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH     H
SS_PSSPRED:    EEEE      EEEEEE  EEEEEE    EEE     EEEEEEE       EEEEEEE EEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     H
DO_DISOPRED3:                                                                                                 DDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                      DDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                             GEIC      RT                                       RLDR       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLQKFQKDLNTGVFNNQENEILKQIVKHDREMVQAIAPINYPQMTTLNSTSSTTTPTSRMRTQSPPVYTATSLSHSNLHSPSPSTQTPQPSAILSPCSYT 700
BenignSAV:                                                       W                             S     N       A     
gnomAD_SAV:        L E    D  KSR D  F R       I  T V MD   T    FIWFSM  A CIK       AVPRR  RD R R# #P NSP  TV A  F N
Conservation:  3232122242362231133254444434733440202112112111221133221221111111111111111111110121301112111111221211
SS_PSIPRED:    HHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                                                
SS_SPIDER3:    HHHHH           HHHHHHHHHHH  HHHHH                                                                  
SS_PSSPRED:    HHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                                                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                           D                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TAVCSPPVQSPLAARTFHYASPTASQLSLMQQQPQQQVQQSQPPQTQPQQPSPQPQTPGSSTPKNEVHKSTQALHNTNLTREVRPLSASQPSLPHEVSTL 800
BenignSAV:                        D   T  M               AL      A     I                           S               
gnomAD_SAV:     V     I  L  ##     T  T    F R  LR   P   AL I T EL L   AS    Q  K DRN E    A   G   S     SL    G I 
Conservation:  0101010101111012100201101111111111111111111111221111011111111111011112112121112110112120001112121111
SS_PSIPRED:               HHH           HHHHHH                                                 HHHHHHH             
SS_SPIDER3:                 HHH          HHH H  HH                                    H                            
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:       DD D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90
AA:            ISRPHPTVGESLASIPQPVTAVPGTGLQAGGRSTVPQRVTLFRQMSSGAIPPNRGVPPAPPPPAAALPRESSSVLNTDPDAEKPRFASNL 890
BenignSAV:                                        L               Q P                                    
gnomAD_SAV:           A  F #  RP GRV    #   RS#R DL CF # Q T L S SQKQVIL  TTL T    K  FPL   ES T   LVT   
Conservation:  111110111101011111111111111121111120131121111011111111111011111221011120111011101110202110
SS_PSIPRED:                                           HHH                                                
SS_SPIDER3:                                              H                                               
SS_PSSPRED:                                                                                              
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD