O60779  S19A2_HUMAN

Gene name: SLC19A2   Description: Thiamine transporter 1

Length: 497    GTS: 2.207e-06   GTS percentile: 0.724     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 5      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 266      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDVPGPVSRRAAAAAATVLLRTARVRRECWFLPTALLCAYGFFASLRPSEPFLTPYLLGPDKNLTEREVFNEIYPVWTYSYLVLLFPVFLATDYLRYKPV 100
PathogenicSAV:                                                   L                                         H       
gnomAD_SAV:     #LS#R  #W#E   TALF   VP L    L L V P  CCV    K      PR   RR ES   KV  SD      H  V     ML     FCC  I
Conservation:  1111111111111111111111111100000133222212443211221223221332210223311341214595669745237475853983458665
STMI:                                      MMMMMMMMMMMMMMMMMM                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMM        M
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH        HH          HHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHH
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHH         HH         HHH    EEE   HHHHHHHHHHHHHHH    HHH
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH                    HHHH   EEE   EEEEEHHHHHHHHHHHH    H
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                              
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                            
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                    N                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VLLQGLSLIVTWFMLLYAQGLLAIQFLEFFYGIATATEIAYYSYIYSVVDLGMYQKVTSYCRSATLVGFTVGSVLGQILVSVAGWSLFSLNVISLTCVSV 200
PathogenicSAV:                                           F                            D                            
gnomAD_SAV:    I R   G    # VP CT  Q T       #  T G   T# FN#C   E VL      C QC SS     #CG E  F  M VCL  T D TCF    A
Conservation:  5334422322322432221440233234525542564657865457445221195567553544172524254224944362103131141334622223
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMM          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEE     EEHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHE       EEEEEHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AFAVAWFLPMPQKSLFFHHIPSTCQRVNGIKVQNGGIVTDTPASNHLPGWEDIESKIPLNMEEPPVEEPEPKPDRLLVLKVLWNDFLMCYSSRPLLCWSV 300
gnomAD_SAV:    G  M    ##S     V#YLLF W     F   SS T I   T     S# NVD   SI T  SSM  L HQ  HF  F      L T CA HA    F 
Conservation:  4321421694813445321111100000200000100000000000000001000000000000000000000010012014204421572411542573
STMI:          MMMMMMMM                                                                             MMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHH    HHHH                                                         HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH        EEE           EE                                         HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH                                                                  HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              
DO_SPOTD:                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              
DO_IUPRED2A:                                                               DDDDDD                                  
MODRES_P:                           S                                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WWALSTCGYFQVVNYTQGLWEKVMPSRYAAIYNGGVEAVSTLLGAVAVFAVGYIKISWSTWGEMTLSLFSLLIAAAVYIMDTVGNIWVCYASYVVFRIIY 400
PathogenicSAV:                                  D                                                                  
BenignSAV:                                                                     S                                   
gnomAD_SAV:      VP   D#S G   I    K M ##H   #  DC# TI  VRCT     AV  Q C      ISFPF F   VG  CVT I  Y  M  T F   *  C
Conservation:  8553435662843564923830215411105496467434251452453244332326212774282244231423442511203442472252346227
STMI:          MMMMMMMMMM                           MMMMMMMMMMMMMMMMM         MMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EE          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH E HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH   EHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                   N                                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MLLITIATFQIAANLSMERYALVFGVNTFIALALQTLLTLIVVDASGLGLEITTQFLIYASYFALIAVVFLASGAVSVMKKCRKLEDPQSSSQVTTS 497
BenignSAV:                              I              T                                                        
gnomAD_SAV:    V   A  #  N #  I# HCS    IS SVT   RM FSVTGI   S    V   YF        MT   Q  D   #TR   *   A  N    A 
Conservation:  3354744353542253223767377244513324633342334512362514026414442441233135212322110000000011110011100
STMI:          MMMMMMMMM          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                  
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH   HHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              
DO_DISOPRED3:                                                                                     DDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                        DDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                  DD