O60890  OPHN1_HUMAN

Gene name: OPHN1   Description: Oligophrenin-1

Length: 802    GTS: 5.356e-07   GTS percentile: 0.055     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 4      BenignSAV: 8      gnomAD_SAV: 178      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGHPPLEFSDCYLDSPDFRERLKCYEQELERTNKFIKDVIKDGNALISAMRNYSSAVQKFSQTLQSFQFDFIGDTLTDDEINIAESFKEFAELLNEVENE 100
BenignSAV:                                           I     T                                                       
gnomAD_SAV:             E      Y               S     I  H  T   TVK                  Y T                            
Conservation:  1000110000100012010102000000010200020000110001001000341531445336115433237534676734543541444132113312
SS_PSIPRED:           HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:           HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    E        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  BD                                                                                                  
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RMMMVHNASDLLIKPLENFRKEQIGFTKERKKKFEKDGERFYSLLDRHLHLSSKKKESQLQEADLQVDKERHNFFESSLDYVYQIQEVQESKKFNIVEPV 200
gnomAD_SAV:    K    Y             Q  H A              K  Y                 R        K     #T    I     I  Y   S   A 
Conservation:  5123333213354344525634346344535958586597575266767357355542273567124234411835475578546637674778336886
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                           DD                                         
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                DD                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LAFLHSLFISNSLTVELTQDFLPYKQQLQLSLQNTRNHFSSTREEMEELKKRMKEAPQTCKLPGQPTIEGYLYTQEKWALGISWVKYYCQYEKETKTLTM 300
PathogenicSAV:                                                 P                                                   
gnomAD_SAV:                    F         E                            P  I  I            K         M H  R     T    
Conservation:  9687546743565668652792889449857797476452673364338525341311122124124346575256555692593445636163151615
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH            EEEEEEE   HHH EEEEEEEEEEE    EEEE
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH   HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH             EEEEEEE         EEEEEEEEE    EEEE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH            EEEEEEEE  HHH   EEEEEEEEE    EEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                          DDDDDD                                          
DO_IUPRED2A:                                           DDDDDDDDDDDDDDDDD  D                                      DD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TPMEQKPGAKQGPLDLTLKYCVRRKTESIDKRFCFDIETNERPGTITLQALSEANRRLWMEAMDGKEPIYHSPITKQQEMELNEVGFKFVRKCINIIETK 400
BenignSAV:     M                                                                                                   
gnomAD_SAV:    M                 R      A   N     N                 T  SQ     G    M  R   R   T    M     W   S    E
Conservation:  1216143335323114164265644354655446643330671122454315314642544555955913134124223324432552634354126613
SS_PSIPRED:    EE            EEEEE  EE                      EEE    HHHHHHHHHH            HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    EE EE         EEEE EEEE         E EE E       EEE    HHHHHHHHHH             HHHHHH     HHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:                  EEEE          HHH               EEE   HHHHHHHHHH            HHHHHHHH      HHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:              DD                                                          DDDDDDD                    D
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDD                                    DDD                      D  D                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GIKTEGLYRTVGSNIQVQKLLNAFFDPKCPGDVDFHNSDWDIKTITSSLKFYLRNLSEPVMTYRLHKELVSAAKSDNLDYRLGAIHSLVYKLPEKNREML 500
PathogenicSAV:         C                                            K                                              
gnomAD_SAV:            H              V  T  S  I    G                      T CTF  Q        S        Y          Q   
Conservation:  6421276654595643543462126422352433521224725664645526573725844772653575044535442283235426434472242244
SS_PSIPRED:                HHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH
SS_SPIDER3:                HHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH
SS_PSSPRED:                 HHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDD DDDDDD                                                                                       
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ELLIRHLVNVCEHSKENLMTPSNMGVIFGPTLMRAQEDTVAAMMNIKFQNIVVEILIEHFGKIYLGPPEESAAPPVPPPRVTARRHKPITISKRLLRERT 600
BenignSAV:                                                                                                        M
gnomAD_SAV:     F      S  G        S KV I           G  SS            M V   D     T    T L   L Q      R  M   C  Q  M
Conservation:  2443177226413510746434856575685857435667765546889666675555330653012613112331523422345343455546226132
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH HH      HHHEEHE HH     HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH                                     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                     
DO_DISOPRED3:                                                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VFYTSSLDESEDEIQHQTPNGTITSSIEPPKPPQHPKLPIQRSGETDPGRKSPSRPILDGKLEPCPEVDVGKLVSRLQDGGTKITPKATNGPMPGSGPTK 700
PathogenicSAV:                                                                               N                     
BenignSAV:                                                                                          S      I       
gnomAD_SAV:          M  GQ  M L  #T   S    TT S HD    F K   #  R  F    V  D     A A M NFEF M        S T S HIRV     
Conservation:  1311111241211011022121111002132402201100010020011112122114212011012231111103103111111100212011000101
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:    E                                                                                                   
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    DD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TPSFHIKRPAPRPLAHHKEGDADSFSKVRPPGEKPTIIRPPVRPPDPPCRAATPQKPEPKPDIVAGNAGEITSSVVASRTRFFETASRKTGSSQGRLPGD 800
BenignSAV:                                                                        V                   W            
gnomAD_SAV:    I       R LQ  V Q   N GG NE QL R     TC AL #    GQVG          T    V   # F   F         WQI    D     
Conservation:  1010210222231100011500200231222110211121101522522100121413111111111210111326423523642221011111111112
SS_PSIPRED:                                                                              HHHHHH                    
SS_SPIDER3:                                                                              HHHHHHHH                  
SS_PSSPRED:                                                                              HHHH                      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                 
AA:            ES 802
gnomAD_SAV:    * 
Conservation:  10
SS_PSIPRED:      
SS_SPIDER3:      
SS_PSSPRED:      
DO_DISOPRED3:  DD
DO_SPOTD:      DD
DO_IUPRED2A:   DD