O60931  CTNS_HUMAN

Gene name: CTNS   Description: Cystinosin

Length: 367    GTS: 3.055e-06   GTS percentile: 0.910     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 32      BenignSAV: 8      gnomAD_SAV: 251      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MIRNWLTIFILFPLKLVEKCESSVSLTVPPVVKLENGSSTNVSLTLRPPLNATLVITFEITFRSKNITILELPDEVVVPPGVTNSSFQVTSQNVGQLTVY 100
BenignSAV:                                              I                               N                          
gnomAD_SAV:     K    PV T#    #I      IG NL  II   DS LNTI P VQ   K   M       H#RH     F GKILG SRMIST  K   RYF R  G 
Conservation:  6100010112311101100443020413512615311121341312104231422515354408220275269237134221103171414125884743
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHH            EEEEE   EEEEEEEE       EEEEEEEEEE   EEEEE   EEE        EEEEEE    EEEEE
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHH   EEEEEE E   EEEEE   EEEEEEEE       EEEEEEEEEE   E EEE   EEEE    EEEEEEEEE    EEEEE
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE    EEEEE    EEEEEE      EEEEEEEEEEE    EEE     EE       EEEEEEE    EEEEE
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                         N    N         N              N                 N                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LHGNHSNQTGPRIRFLVIRSSAISIINQVIGWIYFVAWSISFYPQVIMNWRRKSVIGLSFDFVALNLTGFVAYSVFNIGLLWVPYIKEQFLLKYPNGVNP 200
PathogenicSAV:          V                      F     F F         G     DP          D   C   #    R              R  L
BenignSAV:                  H    H  TS                                                             C               
gnomAD_SAV:     R    H  SLT C P  C  TV    E#    CSG SF FSFS  V#   Q R   P LN M #  M  M  GI  #SP R S LQ#HL  R S R DS
Conservation:  8103142112365382656814413335469959935986999994329749699798679764686487379569965868631455685104829659
STMI:                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                  
SS_PSIPRED:    EE         EEEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:    EE         EEEEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH     E   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    E          EEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:         N  N                                                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VNSNDVFFSLHAVVLTLIIIVQCCLYERGGQRVSWPAIGFLVLAWLFAFVTMIVAAVGVTTWLQFLFCFSYIKLAVTLVKYFPQAYMNFYYKSTEGWSIG 300
PathogenicSAV:     N                R                                                         R      IK         N  
BenignSAV:                                                                I                                        
gnomAD_SAV:    M   NI     V   M   MLRY PNDHS #HMFS   S VM#VSI P  AT M #MALI    L  F  SL  T AP   LLHV V   # GI S #  
Conservation:  9227969996974344353317723854528158224226833452654334245442235893665589858845683784887367515455156659
STMI:               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM               MMM
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH        HH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH         HH
SS_PSSPRED:          EEHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH        HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60       
AA:            NVLLDFTGGSFSLLQMFLQSYNNDQWTLIFGDPTKFGLGVFSIVFDVVFFIQHFCLYRKRPGYDQLN 367
PathogenicSAV:     #  #D     R       K             R#R      N                     
gnomAD_SAV:    SM     RV  RHP#K F Y SKN RM T #E I L  R   MILNIIVL  D  # TR Q  #   
Conservation:  4777864992687488445655843516458667548694444255446326744754001032020
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMM                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE        H  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH HHHHHHHHHHHH     EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE          
DO_DISOPRED3:                                                              BBBBBBB
DO_SPOTD:                                                                 DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                      
MOTIF:                                                                      GYDQL