O75127  PTCD1_HUMAN

Gene name: PTCD1   Description: Pentatricopeptide repeat-containing protein 1, mitochondrial

Length: 700    GTS: 2.702e-06   GTS percentile: 0.852     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 445      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDFVRLARLFARARPMGLFILQHLDPCRARWAGGREGLMRPMWAPFSSSSSQLPLGQERQENTGSLGSDPSHSNSTATQEEDEEEEESFGTLSDKYSSRR 100
BenignSAV:                                                V                                                        
gnomAD_SAV:    L LM  T#P T T#AVEP   RY #RRST RS #M E  W L V     C *R  SRQHR  M I    L  P  MTM   EKD*G    I CE    WK
Conservation:  1114210221000211100010000001000123010100000111000110010000000001000000110001111111122011782351244351
SS_PSIPRED:      HHHHHHHH        HHHHH            HHH        EEE             HHHH   HHHHH         HHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHH      HHHHHH      H                EEE             H HHH                HHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHH       HHHHH                                              HHH H         HHHHH    HHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDBDDDDDDDDDD DDDDDDDD                            DDDDDDDDDDDDDDDDDD              
DO_SPOTD:                                                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  
DO_IUPRED2A:                                  D         D       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LFRKSAAQFHNLRFGERRDEQMEPEPKLWRGRRNTPYWYFLQCKHLIKEGKLVEALDLFERQMLKEERLQPMESNYTVLIGGCGRVGYLKKAFNLYNQMK 200
BenignSAV:       C                                                                                      R          
gnomAD_SAV:     SC  T##C SVLV KQ##  V#A R  ** W S A #CVW G   MQ    F SV        N  Q   RQ S MG TRD RW    R V DP #  R
Conservation:  1535224022342113122211101022322327644876647525654458349726941388545362529288668586678584455762875579
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHH           HHHH      HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH  HH   HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHHH         HHHH      HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH H   HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH      EEHHHHH        HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:               DDDDDD DDDDDDDDD                                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KRDLEPSDATYTALFNVCAESPWKDSALQSALKLRQQLQAKNFELNLKTYHALLKMAAKCADLRMCLDVFKEIIHKGHVVTEETFSFLLMGCIQDKKTGF 300
gnomAD_SAV:     W  #HLET  M PS I  K S*    P  T   WRKP   HLKISM  H V  *RV  FTYV      L A     PM  K   G  PTC   N     
Conservation:  9735272367996988596559463578518339446821552255235667689328345564374344455422741351466438655943642177
SS_PSIPRED:    H      HHH HHHHHH          HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH       H
SS_SPIDER3:    H      EE EEHHHHH          HHHHHHHHHHHHH      HHHH HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH     H
SS_PSSPRED:    HH     HHHEHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH     EEEHHHHHHHH       H
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RYALQVWRLMLSLGLQPSRDSYNLLLVAARDCGLGDPQVASELLLKPREEATVLQPPVSRQRPRRTAQAKAGNLMSAMLHVEALERQLFLEPSQALGPPE 400
BenignSAV:                                                            L      A                                     
gnomAD_SAV:    Q T   RW   N   *LIQNG        W F   YSHL  DVF    KK       LNS WAW  P*   D  TT     DV K   C     G R   
Conservation:  8244667348203641521238665813665945743136515872102001022212232221111001110001003445268335612121100100
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH              
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH       HH HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH              
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH         EHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH             
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDD                    DDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PPEARVPGKAQPEVDTKAEPSHTAALTAVALKPPPVELEVNLLTPGAVPPTVVSFGTVTTPADRLALIGGLEGFLSKMAEHRQQPDIRTLTLLAEVVESG 500
gnomAD_SAV:     L #   S S#SG  AR VL  K TF SMSV  SAMQMK  F #S  IH A    RM  IR Y#   T D   L   V Q K   H   FM   K L PR
Conservation:  0011001111011010001110001312101010010111869320111115666525123248748594338672482222417555858786634352
SS_PSIPRED:                       HHHHHHHHH      HHHHHHHHHH       EEHHHHHH HHHH   HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:                       HHHHHHHHH       HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:                       HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH      EEEEE    HH HHH HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         DDDD         DDD                       D                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SPAESLLLALLDEHQVEADLTFFNTLVRKKSKLGDLEGAKALLPVLAKRGLVPNLQTFCNLAIGCHRPKDGLQLLTDMKKSQVTPNTHIYSALINAAIRK 600
gnomAD_SAV:     TT F   V  N QR   H IL  M##  RR     KEP VV L  T  S IL#RPI #T  VR # # ED   FIYT   #   S Q  GSFVYVV  N
Conservation:  1233128722331125358238785456535523553386335235233251462477645735913215755981564136318634577696228355
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                              DDD                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LNYTYLISILKDMKQNRVPVNEVVIRQLEFAAQYPPTFDRYQGKNTYLEKIDGFRAYYKQWLTVMPAEETPHPWQKFRTKPQGDQDTGKEADDGCALGGR 700
BenignSAV:                        G                                                                                
gnomAD_SAV:     K  C      NVRL SIL I*   CH     R   IL #C#R S   K T SC*P#H * PI R#SK  LQ    LQ    EER AS Q N RRT   G
Conservation:  9692793169429211262685666359968538963676542441662456668457127920435222225322221301111100011001110201
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH    HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHH           HHH          
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH     HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH          HH             HH          
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                    
DO_DISOPRED3:                                                                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD