O75150  BRE1B_HUMAN

Gene name: RNF40   Description: E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B

Length: 1001    GTS: 1.519e-06   GTS percentile: 0.456     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 441      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSGPGNKRAAGDGGSGPPEKKLSREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDLKVLQFKNKKLAERLEQRQACEDELRERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQ 100
gnomAD_SAV:     F   S    C  DL TQ  E NCD      V  LV F        I            GQW     V     Q                 F   #  T 
Conservation:  7472326612333242427851122423334447454566434298594765538969835467586536546765695995998777658445665535
SS_PSIPRED:                      HHH         EEEE EE       HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEHHHHHH
SS_SPIDER3:                                EEEEEEEEEE      HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEHHHHHH
SS_PSSPRED:                           HHH    HHH  EE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEHHHHHH
DO_DISOPRED3:  BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB                                                                         
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                       
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D        D         DD DDDDDDDDDDDDDDDDDD                  
MODRES_P:                                               S                                                          
MODRES_A:                         K                                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LDETVEALLRCHESQGELSSAPEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRDPLLMQLRPPLSEPALAFVVALGASSSEEVELELQGRMEFSKAAVSRVVEASD 200
gnomAD_SAV:      VI  S #Q  DN  GVC VT V  I V SI Y  # T LR  #  #S  IH WLL G LT    MT              DL     V   H   V  
Conservation:  5852520434336121211111402121132123111112131232220020222224151322453252253267434445354335215422461233
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH                                             HHHHHHHHHH     HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH                                                HHHHHHHH       EEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH                                                HHHHHHHHH      HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                  BBDBBDBBDBDDDDDDDDDDDDDDDDBB                                                        
DO_SPOTD:                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                     
DO_IUPRED2A:              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           D             DD                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RLQRRVEELCQRVYSRGDSEPLSEAAQAHTRELGRENRRLQDLATQLQEKHHRISLEYSELQDKVTSAETKVLEMETTVEDLQWDIEKLRKREQKLNKHL 300
gnomAD_SAV:    C #HWL     PA GQE G #H  VT    QK  CD #G EN V     N  L       F  E I         D  M G  *  K  QN  E      
Conservation:  1550132072013112220101111200220182154038444320633652134363114225421543642353334568787548466884666365
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH HHH   HHHH HHH      EEEEE EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                               DDD                                                    
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                     DDDDDDD                          D

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AEALEQLNSGYYVSGSSSGFQGGQITLSMQKFEMLNAELEENQELANSRMAELEKLQAELQGAVRTNERLKVALRSLPEEVVRETGEYRMLQAQFSLLYN 400
gnomAD_SAV:    S         HCLF GC   RW     N     T  V#SG      SRC VD           #Q S#HF    Q IS    W M #SC       V   
Conservation:  3554866467542362335227756855347763654855353677256317645832653341224215322422354334634165547978984686
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH  EEEE         EEEEEHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH  HHHHHHHH HHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH   EE E     E  EEEEEEEHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH   HHHHHHH HHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH   EEE         EEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH  HHHHHHH HHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                        D    DDDDDDDD                                                  
MODRES_A:                                                            K                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ESLQVKTQLDEARGLLLATKNSHLRHIEHMESDELGLQKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQNLAANEQAGPINREMRHLISSLQNHNHQLKGD 500
BenignSAV:                                                                   H                                     
gnomAD_SAV:       R     G# P    TA   RP  V LR TNK     Q #     V  M   IH            YVV S  V    C                   
Conservation:  6562683668644448344533545436446346536545575555465654636666584655555433565663334345363443366445374545
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH  HHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH        HHHHHHHHHHH    H   H
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH     HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                            DDDDDDDDDD                                D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AQRYKRKLREVQAEIGKLRAQASGSAHSTPNLGHPEDSGVSAPAPGKEEGGPGPVSTPDNRKEMAPVPGTTTTTTSVKKEELVPSEEDFQGITPGAQGPS 600
gnomAD_SAV:    T Q R   Q L V   M LV V  F Y  #      NC I   V     S  D I NSN      A R   IAA L# E #  LP DN HV I  TR LP
Conservation:  4345532434331511424231221112112222222222243422351111221111012312221111110011121131121332121002213122
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                                   EE EE       HHH            
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                                E E E E        HH             
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                                    EEE        HHH            
DO_DISOPRED3:                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                 S                                                        S               
MODRES_A:                      K                                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SRGREPEARPKRELREREGPSLGPPPVASALSRADREKAKVEETKRKESELLKGLRAELKKAQESQKEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEV 700
BenignSAV:                   Q                                                                                     
gnomAD_SAV:    YQ Q  Q  #TQ PWVW D   R R#IT T  # EW# V    A Q    PFR  Q A  N   N N       T R V#R  Q E *  TVG#  TTK 
Conservation:  2314424133725274664112322212122211451114154135442413324332435545535648677676369766669777657653614562
SS_PSIPRED:               HHHHH          HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:               HHHHH          HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:              HHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     DD                                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DELRSRIRELEERDRRESKKIADEDALRRIRQAEEQIEHLQRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLREKDDANFKLMSERIKANQIH 800
gnomAD_SAV:    G  # CVW      Q  G   V    PQH Q  V  T    H   V                      E    Q I        G       W       
Conservation:  4334153658775565545646785676662154436319465522355646365566456456676467672653577697576999769977667697
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:      DD    BBBBBBBBBBBB                                                                              
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDD     DD     DDDDDD   DD DDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDD                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KLLREEKDELGEQVLGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQGSLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQPCLAESRAAREK 900
gnomAD_SAV:    R          K    F  HA    M A EQ    PG     RDM  D M C     F       TT   K  RM  A L IW # #   QG G#TGH #
Conservation:  9674575655458553646662546556445444423544232226554233244942374752443335545537451341462136124144424465
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                          BBBBBBBB                                                   D
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKARLTCPCCNTRKKDAVLTKCFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRIYI 1000
gnomAD_SAV:     I    T      Q    R   K     V  NK     M   RV  S L   NH   V F     I   K M VC#  C    #  SV S  R       
Conservation:  4246355454544544355632442422225556636664464535455473233344862332445565442324424322442323245545543543
SS_PSIPRED:    H   HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEE  HHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHH EEEHHHHHH   HHHHH               EEE  
SS_SPIDER3:    H   HHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEE  HHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH        HH  E EEEEEE
SS_PSSPRED:    HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    H H       EEEEE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
ZN_FING:                                                      CPCCNTRKKDAVLTKCFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCN             

                
AA:            S 1001
Conservation:  2
SS_PSIPRED:     
SS_SPIDER3:    E
SS_PSSPRED:     
DO_DISOPRED3:   
DO_SPOTD:       
DO_IUPRED2A: