O75400  PR40A_HUMAN

Gene name: PRPF40A   Description: Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A

Length: 957    GTS: 5.463e-07   GTS percentile: 0.057     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 272      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MRPGTGAERGGLMVSEMESHPPSQGPGDGERRLSGSSLCSGSWVSADGFLRRRPSMGHPGMHYAPMGMHPMGQRANMPPVPHGMMPQMMPPMGGPPMGQM 100
gnomAD_SAV:    VK AM# D  VVIL ALA YL  *#S  R*  #F  #V  DF  F     G Q#PL     R   V    T   VSTS   Q    P# A I*  SV R 
Conservation:  1131232212322222321222012321222222222222222222222222222446643464436334325532336263333533546444745675
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDD     DDDDD  DDD DDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                       S                                                                  
MODRES_M:              R                                                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PGMMSSVMPGMMMSHMSQASMQPALPPGVNSMDVAAGTASGAKSMWTEHKSPDGRTYYYNTETKQSTWEKPDDLKTPAEQLLSKCPWKEYKSDSGKPYYY 200
gnomAD_SAV:           VS  V#  # R YL   SL   S  EIV    C    V              Y           V                K       A   
Conservation:  5334444355453422335433232354532122223222237329677454656576793547795976953777547575767496976974975979
SS_PSIPRED:                                                  EEEE     EEEEE                HHHHHHH    EEEE     EEEE
SS_SPIDER3:                                                  EEEE     EEEE            H    HHHHHH     EEEE     EEEE
SS_PSSPRED:                                                                                HHHHHH       E          
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  DDDDDDDDDDDDDDD                     
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      DDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDD DDD          D  
MODRES_P:                                                        S                                                 
MODRES_A:                                                                                                     K    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NSQTKESRWAKPKELEDLEGYQNTIVAGSLITKSNLHAMIKAEESSKQEECTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANANAST 300
gnomAD_SAV:       K   H T                                  T  #     S   S      A  V    S K    I G   V TT   T I    S
Conservation:  6446597575695776667222222222222222222364335322121111211111121111101132122222222222222222222222222222
SS_PSIPRED:    E    EEE    HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:    E    EE     HHHH                   HHHHHHH                            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H       
SS_PSSPRED:                HHHHHHHHHHH           H HHHHHHHH                         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:           DDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    DDD  D DDDDDDDD   D                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                   DDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SASNTVSGTVPVVPEPEVTSIVATVVDNENTVTISTEEQAQLTSTPAIQDQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAF 400
gnomAD_SAV:     S    T A   D  R II V  A A      N P G  P      V  YR A I N #     N D IV   L N            S S   D     
Conservation:  2222222222222222222222331151411101115620411111012211141101014111013111100115134213223333395565698449
SS_PSIPRED:                           EE      EE  HHHHHHH   HHHH                           HHHH            HHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                        HHHHHH    HH                           HHHHHH H         HHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                        HHHHHH                                                  HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD             
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       
MODRES_P:                                                  T                           T                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KELLKEKRVPSNASWEQAMKMIINDPRYSALAKLSEKKQAFNAYKVQTEKEEKEEARSKYKEAKESFQRFLENHEKMTSTTRYKKAEQMFGEMEVWNAIS 500
gnomAD_SAV:           #I P VL  *  Q             I   R     C   I         L H  S   V H    P     AI  R   H# E     K VT
Conservation:  8669668364645686566757439677799496799797797995776979979766779977726959996756959499767999693737994375
SS_PSIPRED:    HHHHHH        HHHHHHHHH  HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHH   HHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHH        HHHHHHHH   HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHH     H    
SS_PSSPRED:    HHHHHHH       HHHHHHHHHH HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:                                                   DDDDDDDDDD                                         
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDD      D   DDD  D                        DDDDD  DDDDDDDD           DD     D   DDD                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ERDRLEIYEDVLFFLSKKEKEQAKQLRKRNWEALKNILDNMANVTYSTTWSEAQQYLMDNPTFAEDEELQNMDKEDALICFEEHIRALEKEEEEEKQKSL 600
gnomAD_SAV:     CV    C  I       G     H *        D   S      C              A  #     S            Q Q    K     E   
Conservation:  7777597969969777799797676947994697749775965764377775796676779377796597779999997999977679977767676546
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH HHHH  HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHH   HH   HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH       HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                               DDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                     DDDDD
DO_IUPRED2A:                            D                                  DDDDDDDDD                          DDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LRERRRQRKNRESFQIFLDELHEHGQLHSMSSWMELYPTISSDIRFTNMLGQPGSTALDLFKFYVEDLKARYHDEKKIIKDILKDKGFVVEVNTTFEDFV 700
gnomAD_SAV:     T M Q * #     V  V          #        AVR  V    TF           R            K                # S   Y  
Conservation:  5777766577675792466677737597556564555845846186343954494575797979774976566797677776649756197637396795
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHH  HHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEE    HHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHH  HHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH    EE    HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH HHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE   HHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDD                                                                                            
DO_SPOTD:      DDDDD                                                                                               
DO_IUPRED2A:   DDDDD                                                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AIISSTKRSTTLDAGNIKLAFNSLLEKAEAREREREKEEARKMKRKESAFKSMLKQAAPPIELDAVWEDIRERFVKEPAFEDITLESERKRIFKDFMHVL 800
gnomAD_SAV:    V    #         D R T         G  #       G   QT*     T    P L          C                    V        
Conservation:  4679679976599979999699956654435445676353462465634543854664634623318634535443425745686966756464543233
SS_PSIPRED:    HHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH    H    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHH   HHHH    HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHH  HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                               DDDDDDDDDDDDD                                                          
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                                         DDDDD
MODRES_P:                            S                                                               S             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EHECQHHHSKNKKHSKKSKKHHRKRSRSRSGSDSDDDDSHSKKKRQRSESRSASEHSSSAESERSYKKSKKHKKKSKKRRHKSDSPESDAEREKDKKEKD 900
gnomAD_SAV:                   Q      K H C Q#A     A G  R   PQ   H   Q#   #GT        R        S       C   Q  #     
Conservation:  7499894937478947667999786736466666546426237675372846386266826965726647768883887968926634414334301423
SS_PSIPRED:    HHHHHH                                                    HHHHHHHHHHHH        HHH       HHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHH                                                                          H                     
SS_PSSPRED:    HHHHH        HHHHHHHHHHHHH                    HHHHH HHH     HHHHHHHHHHHH  HHHHHH          HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                        S S  S            

                       10        20        30        40        50       
AA:            RESEKDRTRQRSESKHKSPKKKTGKDSGNWDTSGSELSEGELEKRRRTLLEQLDDDQ 957
gnomAD_SAV:    Q  G E I    # R  L                        V    N  K      
Conservation:  342272212133412255433312644433333243433644212332242335311
SS_PSIPRED:     HHHHHHHH HHH                         HHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:                                             HHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HH                                      HHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                     TS S  S