O75762  TRPA1_HUMAN

Gene name: TRPA1   Description: Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1

Length: 1119    GTS: 2.294e-06   GTS percentile: 0.750     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 8      gnomAD_SAV: 603      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKRSLRKMWRPGEKKEPQGVVYEDVPDDTEDFKESLKVVFEGSAYGLQNFNKQKKLKRCDDMDTFFLHYAAAEGQIELMEKITRDSSLEVLHEMDDYGNT 100
BenignSAV:       C                                                      T                                          
gnomAD_SAV:    R CNQ #  #   * K  RI CK  L  R* C *    # D  V     S   NE RTYNNT #    CT     T  T  MI  F  AM #G  NFE  
Conservation:  6111012222211222201101001000021110113530253211421232111410132123345748531622125226211210334421711634
SS_PSIPRED:      HHHHHHH                         HHHHHH   HHHHHHHH              HHHHHHH   HHHHHHHHH   HHHH         
SS_SPIDER3:       HHHH              E           HHHHHHH    HHHHHH               HHHHHHH   HHHHHHHHH   HHH H        
SS_PSSPRED:      HHHHHH                          HHHHHHH  HHHHHHHHHH            HHHHHHHH  HHHHHHHHHH  HHHHHHH      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDBBBBDBDDDDDDD   DDD                                                                      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                 
DO_IUPRED2A:         DDDD     DDDDDDDDDD                                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PLHCAVEKNQIESVKFLLSRGANPNLRNFNMMAPLHIAVQGMNNEVMKVLLEHRTIDVNLEGENGNTAVIIACTTNNSEALQILLKKGAKPCKSNKWGCF 200
BenignSAV:             K                                                                     K      N              
gnomAD_SAV:    TM Y    K TKGIR  V KRV    *KVI V   YTS  DVD   I*F F  GI#N         IVA FV   H  KT   # N AT #R  #* R  
Conservation:  5565753435124312871377587536112258684753102414432732411552662643467534277215924650393234622622733725
SS_PSIPRED:    HHHHHHH   HHHHHHHHH              HHHHHHH   HHHHHHHHH               HHHHHHH   HHHHHHHHH              
SS_SPIDER3:    HHHHHHH   HHHHHHHHH              HHHHHHH   HHHHHHHH                HHHHHHH   HHHHHHHHH              
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH HHHHHHHHHHH             HHHHHHHH  HHHHHHHHHH             HHHHHHHH  HHHHHHHHHHH             
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                                                                                 C        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PIHQAAFSGSKECMEIILRFGEEHGYSRQLHINFMNNGKATPLHLAVQNGDLEMIKMCLDNGAQIDPVEKGRCTAIHFAATQGATEIVKLMISSYSGSVD 300
BenignSAV:                                                                                                       M 
gnomAD_SAV:       *PVVLD   Y       D   R    SR I T K  VSR    M  #   VVR  P  SV  H#   R   D  Y   R* I     V LYFC  MA
Conservation:  5592558596414653582175408212006694464313789968756853638338422783554172445667868558973646736434312303
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH  HHHHHHHHHH HH                  HHHHHHH   HHHHHHHHH              HHHHHHH   HHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:    HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHH   HHHHHHHHH      H       HHHHHHH   HHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH  HHHHHHHHHH                     HHHHHHHH  HHHHHHHHHH            HHHHHHHHH  HHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IVNTTDGCHETMLHRASLFDHHELADYLISVGADINKIDSEGRSPLILATASASWNIVNLLLSKGAQVDIKDNFGRNFLHLTVQQPYGLKNLRPEFMQMQ 400
gnomAD_SAV:    V  KIV RYAP    V F    *   C M L T  TQ NF  H   MS  T  F YTI    F DT* Y  YI RC      I  #      * A  R  
Conservation:  5662286315868864338672354548542764351381542768449645457436348632662314550156596954556737745611235612
SS_PSIPRED:               HHHHHHH   HHHHHHHHH              HHHHHHH   HHHHHHHHH              HHHHHHH     HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     EE        HHHHHHH   HHHHHHHHH              HHHHHHH   HHHHHHHHH              HHHHHHH       HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    EEE        HHHHHHHH  HHHHHHHHHH             HHHHHHHH HHHHHHHHHHH             HHHHHHH      HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QIKELVMDEDNDGCTPLHYACRQGGPGSVNNLLGFNVSIHSKSKDKKSPLHFAASYGRINTCQRLLQDISDTRLLNEGDLHGMTPLHLAAKNGHDKVVQL 500
gnomAD_SAV:     F D   NDEKN #P  Q#E  EWD VFAK # SI#M#FP  N       R E NC CV SFH   *VVNEMW    VEI * IRH PTG    G I   
Conservation:  1632752279049989789796593429934672543441195656665776663588358926865241546689768328587977863498258735
SS_PSIPRED:    HHHHHHH        HHHHHHH   HHHHHHHHH              HHHHHHHH  HHHHHHHHH                 HHHHHHH   HHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH        HHHHHHH   HHHHHHHHH              HHHHHHH   HHHHHHHHH    H            HHHHHHH   HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHH          HHHHHHHH  HHHHHHHHHH             HHHHHHHH  HHHHHHHHHH                HHHHHHHH  HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                    D                                                                   D              
BINDING:                    C      C                                                                               
DISULFID:                                                                   C                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLKKGALFLSDHNGWTALHHASMGGYTQTMKVILDTNLKCTDRLDEDGNTALHFAAREGHAKAVALLLSHNADIVLNKQQASFLHLALHNKRKEVVLTII 600
gnomAD_SAV:    I        N Q   #  Y#T   E #  L I          G   N# S FY  #S S#TR#IV H IRSGAV  K HRS     T Y   ED # M V
Conservation:  9845867535842656388785249874861457146334462264545756836543974375266601582525632158859385433556652448
SS_PSIPRED:    HHH             HHHHHHH   HHHHHHHHH               HHHHHHHH  HHHHHHHHH             HHHHHHH   HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH             HHHHHHH   HHHHHHHHH               HHHHHHH   HHHHHHHHH             HHHHHHH   HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH            HHHHHHH   HHHHHHHHHH              HHHHHHHH  HHHHHHHHHH            HHHHHHHH  HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RSKRWDECLKIFSHNSPGNKCPITEMIEYLPECMKVLLDFCMLHSTEDKSCRDYYIEYNFKYLQCPLEFTKKTPTQDVIYEPLTALNAMVQNNRIELLNH 700
BenignSAV:                              I                                                                          
gnomAD_SAV:    S  T*#K*  TC   YR SR  V  IL   H Y#TII   *T QCR G TF*N  #KF L  HH SS* S*EK#   IT  L  S Y V    CL R SP
Conservation:  2436315431261014322354535665379743517881752481361351473637382686284112310012110338813573842456349939
SS_PSIPRED:    H   HHHHHHH          HHHHHHH  HHHHHHHHHHHH           HHHHHHH      EE                HHHHHHH   HHHHH 
SS_SPIDER3:    H    HHHHHHE         HHHHHHH  HHHHHHHHHHH             EHEE   H E  EEE               HHHHHHH   HHHHH 
SS_PSSPRED:    HH   HHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHH   EE                HHHHHHHH HHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                           C                   C                       C                                   
SITE:                                           M           T                                                      
DISULFID:             C            C           C                               C                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PVCKEYLLMKWLAYGFRAHMMNLGSYCLGLIPMTILVVNIKPGMAFNSTGIINETSDHSEILDTTNSYLIKTCMILVFLSSIFGYCKEAGQIFQQKRNYF 800
gnomAD_SAV:    TMY  *VF    PNR#   V SF     SFM VI  I ST S ID      NSV #N   M NIM   #  AF  F#    T      V H L * TI  
Conservation:  9673588167818883378358523734773976266323392111212221212111111211332122226413442453333376425413541285
STMI:                             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM               
SS_PSIPRED:    HHHH  HH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     H          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            E       H       HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH HHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEE                           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                K                                                                                          
CARBOHYD:                                                    N     N                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDISNVLEWIIYTTGIIFVLPLFVEIPAHLQWQCGAIAVYFYWMNFLLYLQRFENCGIFIVMLEVILKTLLRSTVVFIFLLLAFGLSFYILLNLQDPFSS 900
PathogenicSAV:                                                       S                                             
gnomAD_SAV:    LE  SI Q*F# MM    M S LA       # R #   CLC  S      IY    #   # D        C      H    #    FF   RHLL  
Conservation:  1502911781334255396364212222134954843644149447958778741388668871572485344224536834665639647511612513
STMI:             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                                             C                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PLLSIIQTFSMMLGDINYRESFLEPYLRNELAHPVLSFAQLVSFTIFVPIVLMNLLIGLAVGDIAEVQKHASLKRIAMQVELHTSLEKKLPLWFLRKVDQ 1000
gnomAD_SAV:    LF       N#TV   S *    *T PI    Y   C  EI F     R   #T        N  #G     #    V      #      F L C MH 
Conservation:  4076446484975964884445623431226266146622641935359869698688887987868844828986699737784884767244534774
STMI:           IIIIIIIIIIIIIIIIIIIII            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                            
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH     HHH  HHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH            H       HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:               F                                  F                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KSTIVYPNKPRSGGMLFHIFCFLFCTGEIRQEIPNADKSLEMEILKQKYRLKDLTFLLEKQHELIKLIIQKMEIISETEDDDSHCSFQDRFKKEQMEQRN 1100
BenignSAV:                      R                                                                                  
gnomAD_SAV:     AS MCL     DRTF RV Y    PE      T       R   E * QM    L M NRR     F R #  V  R  EG Q  L G   R    #K 
Conservation:  1234468852322211202111221001110111222215716516781557443125579527548546776826756618210123111021111021
SS_PSIPRED:      EEE         HHHHHHHHHH    HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:      EEE         HHHHHHHHHH    HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    E          HHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:       EE         HHHHHHHHHH    HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                    D                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                  DDDDDDDDDD              
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
REGION:                                                     KQKYRLK                                                

                       10        2
AA:            SRWNTVLRAVKAKTHHLEP 1119
gnomAD_SAV:     T     T#   Q  R  A
Conservation:  5471463353222121322
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:       D DDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: