O75845  SC5D_HUMAN

Gene name: SC5D   Description: Lathosterol oxidase

Length: 299    GTS: 1.871e-06   GTS percentile: 0.607     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 5      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 140      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDLVLRVADYYFFTPYVYPATWPEDDIFRQAISLLIVTNVGAYILYFFCATLSYYFVFDHALMKHPQFLKNQVRREIKFTVQALPWISILTVALFLLEIR 100
PathogenicSAV:                             Q                S                                                      
gnomAD_SAV:        FC G  #  I  # LVSR K#   *  VNPR   H SVC #S L  A  CC L N   #E       E HL     A T  CL  I  T  W  M 
Conservation:  9535512361235674367225452222873247434454941255424524573456761434883854797248902341547266367536851866
STMI:                                         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM 
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHH   HHH HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHEEHHHH    HH   HH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:      EHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  D                                                                                                   
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GYSKLHDDLGEFPYGLFELVVSIISFLFFTDMFIYWIHRGLHHRLVYKRLHKPHHIWKIPTPFASHAFHPIDGFLQSLPYHIYPFIFPLHKVVYLSLYIL 200
PathogenicSAV:                                                            R                                        
BenignSAV:                                                                                      V                  
gnomAD_SAV:    S     NG    SC      I #M       # T RV  S PRI IHNH Y       MS A TG       A   N S*RMH    LS RM   T   S
Conservation:  9595855242324085223216222764888628957772788423671377599256757795577669475956536996868389858335528753
STMI:                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                MMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:     HH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH HHHHH     HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     H      H      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH            HHHH   HHHHHHH     HHHHH    HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH           HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                              HRGLHH       HKPHH                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VNIWTISIHDGDFRVPQILQPFINGSAHHTDHHMFFDYNYGQYFTLWDRIGGSFKNPSSFEGKGPLSYVKEMTEGKRSSHSGNGCKNEKLFNGEFTKTE 299
PathogenicSAV:          ED                                                                                        
BenignSAV:                                                                                 H                      
gnomAD_SAV:      S IV   ES  CI HV  S     P R  # I  EC            D L    L  G   L      V   EC             LS D  E  
Conservation:  884645579963635800320268856865668436546799889796465476528545262852213414122201100120001000013000312
STMI:          MMMMMM                                                                                             
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH       HHH      HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH                HHHHHHHH                         
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH         H       HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH       HH          HHHHH                         
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH                                E   HHHHHH                HHHHHHHHHHH                      
DO_DISOPRED3:                                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                DDD  DD               
MOTIF:                                    HHTDHH                                                                  
MODRES_P:                                                          S