O94822  LTN1_HUMAN

Gene name: LTN1   Description: E3 ubiquitin-protein ligase listerin

Length: 1766    GTS: 1.114e-06   GTS percentile: 0.274     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 699      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGGKNKQRTKGNLRPSNSGRAAELLAKEQGTVPGFIGFGTSQSDLGYVPAIQGAEEIDSLVDSDFRMVLRKLSKKDVTTKLKAMQEFGTMCTERDTETVK 100
gnomAD_SAV:       RK   A R     D  #    F    ERM     S   L N  C    R    #E H     * A #       A     VE L    AK N  A  
Conservation:  6444445555542588676668769577392565869852323126767967757577446967996699856868268786959797379236425266
SS_PSIPRED:                    HHHHHHHHHHH        EE                HHHHHH   HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH
SS_SPIDER3:                      HHHHHHHH        EEEE               HHH H    HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH
SS_PSSPRED:                     HHHHHHHHHH                                   HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH
DO_DISOPRED3:  BDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GVLPYWPRIFCKISLDHDRRVREATQQAFEKLILKVKKQLAPYLKSLMGYWLMAQCDTYTPAAFAAKDAFEAAFPPSKQPEAIAFCKDEITSVLQDHLIK 200
gnomAD_SAV:    RAI C   V  R    R HHI* T     K F        S C      CGP   Y A I      E    V    G  L       G        RVL 
Conservation:  6689897657976849498979995857954975676638864653568585456663628662451189458863299589539976964355462645
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ETPDTLSDPQTVPEEEREAKFYRVVTCSLLALKRLLCLLPDNELDSLEEKFKSLLSQNKFWKYGKHSVPQIRSAYFELVSALCQRIPQLMKEEASKVSPS 300
gnomAD_SAV:       NIF             Q  #  I F   S *VF   AN    F  D     #  SE     EQR    H   L   C S  C    V D        
Conservation:  8855656956365268844872936879696574572264217101532551174352899996573266775979643345932381442065445754
SS_PSIPRED:    H            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH  HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:       DDDDDDDDDDDDD                                                                                  
DO_SPOTD:            DD                                                                                            
DO_IUPRED2A:      DDDDDDDDDD                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VLLSIDDSDPIVCPALWEAVLYTLTTIEDCWLHVNAKKSVFPKLSTVIREGGRGLATVIYPYLLPFISKLPQSITNPKLDFFKNFLTSLVAGLSTERTKT 400
gnomAD_SAV:      F V E ERTA S       SI RNT H    L  RN M  R     #   QVP # M  C  SL  E  H     N NL  S RM  IS  L#K  TI
Conservation:  6965688386384556977596444262599188754956699943464596495844459557775946810431524573326543321964378323
SS_PSIPRED:    HHHH       HHHHHHHHHHHHHHH     EE       HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHH    HHHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:    HHH          HHHHHHHHHHH H  HHEEH       HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH  HHH    HHHHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHH       HHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSLESSAVISAFFECLRFIMQQNLGEEEIEQMLVNDQLIPFIDAVLKDPGLQHGQLFNHLAETLSSWEAKADTEKDEKTAHNLENVLIHFWERLSEICVA 500
BenignSAV:       S                                                          D                                     V
gnomAD_SAV:      SKYL  TP L K  H  VK      A   LVI     #  NS VR     RW  CSR TDA         M       # VKS# KY  Q     S E
Conservation:  7158556532535996572434322222432565137958544135243164134560233548149825441121200102512471289226213520
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH HHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH  HHHHHHHHH  H H H HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                        D                            D
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                      D  DDDDDD                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KISEPEADVESVLGVSNLLQVLQKPKSSLKSSKKKNGKVRFADEILESNKENEKCVSSEGEKIEGWELTTEPSLTHNSSGLLSPLRKKPLEDLVCKLADI 600
BenignSAV:                                                                     C                                   
gnomAD_SAV:      # L PVIG FF I      FR # G     E  K#  T  E      ###  Y   G D   CRG R    VIY   D  F          A * # T
Conservation:  3530133212152556168436425222131335601354623110201110220222121110002222222202221111314622485247727524
SS_PSIPRED:    H       HHHHHHHHHHHHHHH  HH           EEE HHHHH  HHH                                    HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH      HHHHHHHHHHHHHH    H           EEE HHH                 H  H       H          HH HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HH      HHHHHHHHHHHHHHH               EEEE                                             HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDD      D     DDDDDDDDD     DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          
DO_SPOTD:                                   DDDDDDD        DDDDDDDDDDDDDDDDDD                                      
DO_IUPRED2A:                                   DD                 D    D         DDDD        D                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SINYVNERKSEQHLRFLSTLLDSFSSSRVFKMLLGDEKQSIVQAKPLEIAKLVQKNPAVQFLYQKLIGWLNEDQRKDFGFLVDILYSALRCCDNDMERKK 700
gnomAD_SAV:    N  F  KQ #  N  L  A      L QL  I  AN  LN  *T        L    V L  # NR     K R   L     TF G  Q    E# IRT
Conservation:  5425533226328727651852295503692284201211000021021122102546539741353186232032422386555694717923018440
SS_PSIPRED:    HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH           HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHH   HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH           HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH H       HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                       DDDDDDDDDDDDDDDD                                               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VLDDLTKVDLKWNSLLKIIEKACPSSDKHALVTPWLKGDILGEKLVNLADCLCNEDLESRVSSESHFSERWTLLSLVLSQHVKNDYLIGDVYVERIIVRL 800
BenignSAV:                                                                 I                                       
gnomAD_SAV:      N  I L   R    Q    G LG N Y    #    NV   T  S   GF        IP  YRCL  R  V  LS H IQ      NI     #FKF
Conservation:  5944542145261436458557613312313311977923784383054228711131101212111223926666578522255369442745466249
SS_PSIPRED:    HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH         HHHHH   HHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH    HHHHHHHHHHHH       H HHHHHH    HHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHH        E  HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH    HHHHHHHHHHHH     HHHHHH H    HHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                         DDDDDDDDDDD                                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HETLFKTKKLSEAESSDSSVSFICDVAYNYFSSAKGCLLMPSSEDLLLTLFQLCAQSKEKTHLPDFLICKLKNTWLSGVNLLVHQTDSSYKESTFLHLSA 900
gnomAD_SAV:    R    NAE    T  N  A # F   SC     T R        E     S  #V       WL   V     SCP A  #MI      CR#     F  
Conservation:  6249234523434331443553667432368283324454366566547495648414203355426207731542373158422111102343773255
SS_PSIPRED:    HHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH      HHH  HHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:          D  D                                                                                        
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LWLKNQVQASSLDINSLQVLLSAVDDLLNTLLESEDSYLMGVYIGSVMPNDSEWEKMRQSLPMQWLHRPLLEGRLSLNYECFKTDFKEQDIKTLPSHLCT 1000
gnomAD_SAV:        T   G A GV    I   V      I V  G  CIL  CL GI ASGNV  #    F VE  R  V       D    EIH#R R#L         
Conservation:  3964265432274226752732562353125223121154104321538411491245238416832166834444351203112121111115937674
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH  HHHH HHHH   EEE             HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH   HHHHHHHH    HHHHHHHHH     E             H  HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                     HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                    DD DDDDD          
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SALLSKMVLIALRKETVLENNELEKIIAELLYSLQWCEELDNPPIFLIGFCEILQKMNITYDNLRVLGNTSGLLQLLFNRSREHGTLWSLIIAKLILSRS 1100
gnomAD_SAV:           F #V KT      K     V       P YQ  ND        FG  K RSMMC D PAPD RL      L   GGR  P  V        Q 
Conservation:  4656433121111010021011200424846655595394312502423610371231532323212111125322561672217187674323240102
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    HHHHHH   HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                   DDDDD                                                                              
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ISSDEVKPHYKRKESFFPLTEGNLHTIQSLCPFLSKEEKKEFSAQCIPALLGWTKKDLCSTNGGFGHLAIFNSCLQTKSIDDGELLHGILKIIISWKKEH 1200
gnomAD_SAV:            Y     R L         M    S         C     T FW                  V       ENV#VA V REV   V      L
Conservation:  0111134144221445464443365848364426214543173224542632512124123434243645545882223122234413552454386311
SS_PSIPRED:       HHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH   HH       HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH    H HH   HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EDIFLFSCNLSEASPEVLGVNIEIIRFLSLFLKYCSSPLAESEWDFIMCSMLAWLETTSENQALYSIPLVQLFACVSCDLACDLSAFFDSTTLDTIGNLP 1300
gnomAD_SAV:      TCFL  H  K IA   C  T VT        * L#A   G  N  #        #    K    VLFL    YGIYE V V N S        V D L
Conservation:  7529773435232321163445734555343422132261214886569768798753264212312755636554452633253058222322101149
SS_PSIPRED:    HHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
SS_SPIDER3:       EEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             
SS_PSSPRED:    HHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
DO_DISOPRED3:      DDDDDDDDDD                                               DD                           DDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VNLISEWKEFFSQGIHSLLLPILVTVTGENKDVSETSFQNAMLKPMCETLTYISKEQLLSHKLPARLVADQKTNLPEYLQTLLNTLAPLLLFRARPVQIA 1400
gnomAD_SAV:       F#*RR L  R       LV   IA  K        R TI      A MCV E     QR  #   T      #    A  KI  S      WA    
Conservation:  1381479148722854346965533343212423412432247264716724473247223294266334834455316865674638796336856844
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH     HHH   HH    HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH
SS_SPIDER3:    H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHH     HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH     HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                DDDDDDDDD                    D  DDDDDDDDDDDD                          
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VYHMLYKLMPELPQYDQDNLKSYGDEEEEPALSPPAALMSLLSIQEDLLENVLGCIPVGQIVTIKPLSEDFCYVLGYLLTWKLILTFFKAASSQLRALYS 1500
gnomAD_SAV:    L  #  E  S   E         R      GV S V     RNV   F G I R   I  R  V   G A Y    C  I*  M  L        W    
Conservation:  5644828494289238233374547436742868732874551339364434522449943527365646564697996576948388767485887496
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH          HH              HHHHHHHHH HHHHHHHH    HHHHEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH      H H                  HHHHHHHH  HHHHHHH       HEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                               
DO_SPOTD:                     DDDDDDDDDDDDDDDD                                                                     
DO_IUPRED2A:                     DDD DDDDD                                                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MYLRKTKSLNKLLYHLFRLMPENPTYAETAVEVPNKDPKTFFTEELQLSIRETTMLPYHIPHLACSVYHMTLKDLPAMVRLWWNSSEKRVFNIVDRFTSK 1600
gnomAD_SAV:    T  W   G     HY           V I #D SS       N     T G I#V TCN    #  FF VI Q    V  W   G      STMN   R 
Conservation:  4687443494599368978886392233222612266177585815081523211422665699938942675969855667886378655236657636
SS_PSIPRED:    HHHHH   HHHHHHHHHHH                      EEHHH   HHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH   HHHHHHHHHHH         H              EHH  HH        HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH HHHHHHHHHHHH                                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                    
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                DD                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YVSSVLSFQEISSVQTSTQLFNGMTVKARATTREVMATYTIEDIVIELIIQLPSNYPLGSIIVESGKRVGVAVQQWRNWMLQLSTYLTHQNGSIMEGLAL 1700
gnomAD_SAV:       ILFF    P      H     M   #  NG  I#ACA DN  TK        *    VVA  ERS  I AP        FNS  IP  E  V     
Conservation:  6663398389945652866363675957946777456975455637996999736799767295775757665667999799977797697997779969
SS_PSIPRED:    H  HHHHHHHHHH          EEEEEE    EEEEEEEE  EEEEEEEE         EEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHH            EEEEE    EEEEEEEE  EEEEEEEE         EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH          EEEEEE    EEEEEEEEE EEEEEEEE         EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60      
AA:            WKNNVDKRFEGVEDCMICFSVIHGFNYSLPKKACRTCKKKFHSACLYKWFTSSNKSTCPLCRETFF 1766
gnomAD_SAV:      S INRC  D            S        T   RR     S      IF SRF  S    M  
Conservation:  996999969796979799797696797759746979766675657977666656565776764465
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH       EEEEEEE         EE      EE HHHHHHHHHH              
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH     EEEEEEEEEE    EE  EE      EE HHHHHHHHH            E  
SS_PSSPRED:    HHHHHHH        EEEEEEE                HHHHHHHHHHHHH               
DO_DISOPRED3:                                                                    
DO_SPOTD:                                                                        
DO_IUPRED2A:                                                                     
ZN_FING:                     CMICFSVIHGFNYSLPKKACRTCKKKFHSACLYKWFTSSNKSTCPLCR