O94906  PRP6_HUMAN

Gene name: PRPF6   Description: Pre-mRNA-processing factor 6

Length: 941    GTS: 1.022e-06   GTS percentile: 0.233     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 242      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MNKKKKPFLGMPAPLGYVPGLGRGATGFTTRSDIGPARDANDPVDDRHAPPGKRTVGDQMKKNQAADDDDEDLNDTNYDEFNGYAGSLFSSGPYEKDDEE 100
gnomAD_SAV:                S     S                                    # N*     T                  *      G         
Conservation:  4021012111100211011201216777779776747777779799979779677777677766664666779777799676767777766766666667
SS_PSIPRED:                                  HHH                        HHHHH                                 HHHHH
SS_SPIDER3:                             E                                HHHH                                 HHHHH
SS_PSSPRED:                                                                                                     HHH
DO_DISOPRED3:  BBB                                     D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD            
DO_IUPRED2A:    DDDDD  DD DDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D DDDDDDDDD DD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ADAIYAALDKRMDERRKERREQREKEEIEKYRMERPKIQQQFSDLKRKLAEVTEEEWLSIPEVGDARNKRQRNPRYEKLTPVPDSFFAKHLQTGENHTSV 200
PathogenicSAV:                                                                                    H                
gnomAD_SAV:      VTC  R   K       W  K                        R     *A *          I C*   #C R  A   R   TR  SRKY   L
Conservation:  6676766799999997656996697799979977797977766677977577657999977679947669673774679997779777779669756679
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH   HH                   HHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH HH   HHHHH                     E    HHHHHHHH        
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH   HHH                   HHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:  DD D  D  DDD DBBBBBBBBBBBBBBBBDB D                              DDDDDDD                      DDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                         DDDDD                            
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                S                                    T                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DPRQTQFGGLNTPYPGGLNTPYPGGMTPGLMTPGTGELDMRKIGQARNTLMDMRLSQVSDSVSGQTVVDPKGYLTDLNSMIPTHGGDINDIKKARLLLKS 300
gnomAD_SAV:    G GL     F     A P  #     M  M   SA            S   N          N R  A S         V L      K VR  *   E 
Conservation:  6954356565455666575776975767967794597777777777777777977799777999667957777766756656556776677776467999
SS_PSIPRED:     HHH                                   HHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHH                                  HHHHHHHHHHHHHHHHHH             H HHHHHHH        HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHH        HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDD  D  DD  DDD D DD    D             DD
MODRES_P:                                                                       T        T   S                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VRETNPHHPPAWIASARLEEVTGKLQVARNLIMKGTEMCPKSEDVWLEAARLQPGDTAKAVVAQAVRHLPQSVRIYIRAAELETDIRAKKRVLRKALEHV 400
gnomAD_SAV:     #    YPL #R    C      R          RA I      I    T    R    V      C F E       #T   M  H   Q      D  
Conservation:  9999747779676666676677776675766667766765777667967777976777766677766666566656655776677466667575566666
SS_PSIPRED:    HHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHH     HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DD    D DDDDDD                                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PNSVRLWKAAVELEEPEDARIMLSRAVECCPTSVELWLALARLETYENARKVLNKARENIPTDRHIWITAAKLEEANGNTQMVEKIIDRAITSLRANGVE 500
BenignSAV:                                                                                 S                       
gnomAD_SAV:              I    L  G VV           M           C                H#R   M      V   #       N      Q  D  
Conservation:  6466566545667999799777966667779767765666757666666556575667657767655469656465335456756654446568344454
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            INREQWIQDAEECDRAGSVATCQAVMRAVIGIGIEEEDRKHTWMEDADSCVAHNALECARAIYAYALQVFPSKKSVWLRAAYFEKNHGTRESLEALLQRA 600
gnomAD_SAV:        L   N K      N V  R #TC M    M  Q Q  I  D SGG  T S     *T  T T      N     HTT  K  Q       V     
Conservation:  4584355677997657666679676676767997977769767677656744546566977697667437445564664445777657666696469669
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                               D                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VAHCPKAEVLWLMGAKSKWLAGDVPAARSILALAFQANPNSEEIWLAAVKLESENDEYERARRLLAKARSSAPTARVFMKSVKLEWVQDNIRAAQDLCEE 700
gnomAD_SAV:                             E           S                    #  W            SQ        D # G   V       
Conservation:  9667967799799799679766667579579657766677797777797779499696777747967696664966768685568746644138468526
SS_PSIPRED:    HHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH   HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH   HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ALRHYEDFPKLWMMKGQIEEQKEMMEKAREAYNQGLKKCPHSTPLWLLLSRLEEKIGQLTRARAILEKSRLKNPKNPGLWLESVRLEYRAGLKNIANTLM 800
PathogenicSAV:                             W                                                                       
gnomAD_SAV:    T W  A      V    MK     I  VW    HW       I P   FFL Q       Q  T     H    N L    D  Q    V        V 
Conservation:  5964663958986639846550321638845834966564253377554326654566764696577766556434335664576694746674543355
SS_PSIPRED:    HHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                          DD    DD  D                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AKALQECPNSGILWSEAIFLEARPQRRTKSVDALKKCEHDPHVLLAVAKLFWSQRKITKAREWFHRTVKIDSDLGDAWAFFYKFELQHGTEEQQEEVRKR 900
gnomAD_SAV:      S  K  D  M       F   R S   NM       Y           LC  Q TA T     H     LN   V  #L        S   EQD   L
Conservation:  5557457646736563534742445334455574438463545554544668555874868486483555456599498365599567768555245336
SS_PSIPRED:    HHHHHH    HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH    HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH    HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                 DDD                                                             DDDDDD

                       10        20        30        40 
AA:            CESAEPRHGELWCAVSKDIANWQKKIGDILRLVAGRIKNTF 941
BenignSAV:                   M                          
gnomAD_SAV:     K T  W  D   TM  HVTT  N FR M     SH T S 
Conservation:  84345846943543156351553253444612542164546
SS_PSIPRED:    HHHH   HHHHHHHHHH HHH    HHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHH  H HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHH    HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                          D
DO_SPOTD:                                             DD
DO_IUPRED2A:   D