O95347  SMC2_HUMAN

Gene name: SMC2   Description: Structural maintenance of chromosomes protein 2

Length: 1197    GTS: 1.605e-06   GTS percentile: 0.495     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 523      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MHIKSIILEGFKSYAQRTEVNGFDPLFNAITGLNGSGKSNILDSICFLLGISNLSQVRASNLQDLVYKNGQAGITKASVSITFDNSDKKQSPLGFEVHDE 100
gnomAD_SAV:       R V IG   F # K   #  NS     #        K   CV V   LFK C  Q#  F      S   D  N Y  V#    #E#LG     IR  
Conservation:  6665654567777663687624774699979967799777777767956774657677736356767767659637739773999279319969672368
SS_PSIPRED:     EEEEEEEE         EE       EEEE      HHHHHHHHHHHH HH HHHH                  EEEEEEEEE               E
SS_SPIDER3:       EEEEEE      EE EEE      EEEE      HHHHHHHHHHH     HHH     HH HHE        EEEEEEEEE               E
SS_PSSPRED:     EEEEEEEE       EEEE       EEEE      HHHHHHHHHHHH  HHHHHHH   HHHHHHH       EEEEEEEEE               E
DO_DISOPRED3:                                                              DDD                                     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                      GLNGSGKS                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ITVTRQVVIGGRNKYLINGVNANNTRVQDLFCSVGLNVNNPHFLIMQGRITKVLNMKPPEILSMIEEAAGTRMYEYKKIAAQKTIEKKEAKLKEIKTILE 200
BenignSAV:                            T                                                                            
gnomAD_SAV:    L I    IM   S  S      ST      VYF       S    I  * #     E       M A           VS   N#K   T    MRM   
Conservation:  6577996539776697577355332774767697976586967663565466565686266967799979767893981275768469619833923762
SS_PSIPRED:    EEEEEEEE     EEEE      HHHHHHHHH                  HHHH   HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEEEEEEEE    EEEE  EEE HHHHHHHHHH          HH   HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    EEEEEEEE     EE         HHHHHHH                  HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                               DD DD  D DDDDDD     DD  D      DDDD    D               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_A:                   K                                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EEITPTIQKLKEERSSYLEYQKVMREIEHLSRLYIAYQFLLAEDTKVRSAEELKEMQDKVIKLQEELSENDKKIKALNHEIEELEKRKDKETGGILRSLE 300
BenignSAV:                                                                                 F                       
gnomAD_SAV:    KK  LAV   R G L F K    T  V   RH C VSR  VVKYI  H   K   IR      R         MNVFHR L     # #     TI#F  
Conservation:  7784954378474753778797435246564644585471299444126431643332221423212132413233611561357425434223172374
SS_PSIPRED:    HH HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    H HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:        D                                               DDDDD  DD  D  DD                     DDDDDDDD 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                DDDDDDDD  D   D        
MODRES_A:                           K                                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DALAEAQRVNTKSQSAFDLKKKNLACEESKRKELEKNMVEDSKTLAAKEKEVKKITDGLHALQEASNKDAEALAAAQQHFNAVSAGLSSNEDGAEATLAG 400
BenignSAV:                             T                                                                           
gnomAD_SAV:    V#FG S Q  A #ENT HR  E  T K NRC KQ   V D   I   R  *F  V G Q S    N   V V V V  N S   S M#N    G T VGD
Conservation:  2363415824474583444454741183273246342425624442376243131132913455331352048338545746656747453584536564
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH   HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D  DDD DDD D                                                    D          
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                              D DDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QMMACKNDISKAQTEAKQAQMKLKHAQQELKNKQAEVKKMDSGYRKDQEALEAVKRLKEKLEAEMKKLNYEENKEESLLEKRRQLSRDIGRLKETYEALL 500
gnomAD_SAV:     T      T  GE     T    R  P#   S R A  R NG C    D V TI   NG FK AI #PSH      N V  CK P C     E  C TV 
Conservation:  9944994537542655456576926553886485444545834846544373352304227724522726362455153425415212611845227142
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                              DDDDDDDDD DDDDDD                                                        
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                     DDDD   DDD   D  D                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ARFPNLRFAYKDPEKNWNRNCVKGLVASLISVKDTSATTALELVAGERLYNVVVDTEVTGKKLLERGELKRRYTIIPLNKISARCIAPETLRVAQNLVGP 600
gnomAD_SAV:        D # T  NAGE  K S    H    M    NY P      V  Q #S I  I I       S Q  CQ AV L S    S# V  SRGI R   # 
Conservation:  4557384828348833851328694642444534153446894689469755587874686666549396463858976574434411236228527450
SS_PSIPRED:    HH                   EEEEEEE EEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHEEE  HHHHHHHHHH      EEEE           HHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HH   H       HHH      EEEEE EEE   HHHHHHHHHHHH    EEE   HHHHHHHHHH HH    EEE HHH    E  HHHHHHHH    H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH    HHH      EEEEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHH EEE   HHHHHHHHHH H   EEE    E       HHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DNVHVALSLVEYKPELQKAMEFVFGTTFVCDNMDNAKKVAFDKRIMTRTVTLGGDVFDPHGTLSGGARSQAASILTKFQELKDVQDELRIKENELRALEE 700
BenignSAV:                       S                                                                                 
gnomAD_SAV:     KIQ S  F D  L  E T  S   R     S#HYV   SL R V       R  AC  R       #  E A   NCE RR IE     E S  PG  K
Conservation:  1442365256274346366886899356775366488566964274366894597496959773787334245593344547243127215314811452
SS_PSIPRED:      EEEHHHH    HHHHHHHHHHH  EEEE  HHHHHHHHH      EEEE    EE                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH  EEEE  HHHHHHHH     E EEEEE  EEE     EE            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     EEEEEHH H H HHHHHHHHHHH EEEEE  HHHHHHHHHH   EEEEEEE  EEE                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                 DD D D                               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                 D                                     
MODRES_A:                                                                                  K                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ELAGLKNTAEKYRQLKQQWEMKTEEADLLQTKLQQSSYHKQQEELDALKKTIEESEETLKNTKEIQRKAEEKYEVLENKMKNAEAERERELKDAQKKLDC 800
gnomAD_SAV:     STSP  AD N C  QH R*      H      R  PC#           NV Q    F       #Q K      KS     DG GAQ V       H#
Conservation:  6721741357564267874744265344832663576685678653293449435635822456264586455339739577533743555727633620
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:     DD  D     DDD                                                                         D          
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   D              DD        DD  DDDDDDDD DDD DDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDD  D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AKTKADASSKKMKEKQQEVEAITLELEELKREHTSYKQQLEAVNEAIKSYESQIEVMAAEVAKNKESVNKAQEEVTKQKEVITAQDTVIKAKYAEVAKHK 900
gnomAD_SAV:     E  SG  N RT    H  Q         R D    RK  DVL  #V FC #    #         L      VM  R #L   RN  V T        E
Conservation:  5725653634338457973464299564855842444563254246433432642144255232442632553464448436225422541621320233
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDD       DDDDDDDDDD               D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D          DDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EQNNDSQLKIKELDHNISKHKREAEDGAAKVSKMLKDYDWINAERHLFGQPNSAYDFKTNNPKEAGQRLQKLQEMKEKLGRNVNMRAMNVLTEAEERYND 1000
gnomAD_SAV:     # HNYL   R  E   # # W      T    L NVCG LY   Y #RRS   DH  # SA   RRG R SK  RD      S   L        Q H 
Conservation:  3335328744554673725434641665256357723639814671487444728895234745514474384314128454682465336455977655
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:           D                                                                                          
DO_SPOTD:                                                         DD                                               
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD  D  DD  D          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LMKKKRIVENDKSKILTTIEDLDQKKNQALNIAWQKVNKDFGSIFSTLLPGANAMLAPPEGQTVLDGLEFKVALGNTWKENLTELSGGQRSLVALSLILS 1100
BenignSAV:             K                                                             R                             
gnomAD_SAV:     K    T     C   K V    R        T  Q S##   V  A  LS # VFPTSD     G    R       T   P      KT         
Conservation:  8357556853861487258246827932662488689638747997499986383934242132529676777992498769399999999657767767
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEE          EEEEE         HHHH HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE       H   EEEE      HH HHH   HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH      E            EEEEEE    HHHHHH     HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                DDDDDDDDDDDDD         
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:    DDD              D                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MLLFKPAPIYILDEVDAALDLSHTQNIGQMLRTHFTHSQFIVVSLKEGMFNNANVLFKTKFVDGVSTVARFTQCQNGKISKEAKSKAKPPKGAHVEV 1197
gnomAD_SAV:    I      SVC        F P #        H        #     G   S   I            AV  I* E   M     Y  E HQA     
Conservation:  4676697666777777977779776769597237733979579779697937766665555356464635313021100012000112000333333
SS_PSIPRED:    HHHH    EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE HHHHHH  EEE   EE  EEEEEEEE     HH HHHHHH           
SS_SPIDER3:    HH      EEEEEHH H   HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE    HHH  EEE E     EEEEEEEEEE      H                
SS_PSSPRED:    HH      EEEEHHHHHHH    HHHHHHHHHHH    EEEEEE  HHHHHHHHHE  EEE   EEEEEEEEE HH HHHHHHHHH           
DO_DISOPRED3:                DDDDD                                                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                  DDDDDDDDD DDDDDDDD
MODRES_A:                                                               K K