O95398  RPGF3_HUMAN

Gene name: RAPGEF3   Description: Rap guanine nucleotide exchange factor 3

Length: 923    GTS: 2.35e-06   GTS percentile: 0.767     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 8      gnomAD_SAV: 507      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKVGWPGESCWQVGLAVEDSPALGAPRVGALPDVVPEGTLLNMVLRRMHRPRSCSYQLLLEHQRPSCIQGLRWTPLTNSEESLDFSESLEQASTERVLRA 100
BenignSAV:                    P                                                                                    
gnomAD_SAV:        C       GV PL  R VP  AW  T  NL  GRI    M   I L *      P    LL R H  C   H   K*F    KI K   K W    
Conservation:  1101211210112110111010011210112122112101201000211111100001101100211011100230101221111111115312334135
SS_PSIPRED:              EEEE                        HHHHHHHH         HHHH                    HHH       HHH HHHHHHH
SS_SPIDER3:     EE       EEEE                          HHHHE E         HHHH                            HHH  HHHHHHH
SS_PSSPRED:              EEEE                         HHHHHHHHH       HHHHH                            HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  BDDDDDDD    DDD   DDDDDDDDDDDDD                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        
DO_SPOTD:                                                                   DDDDDD          DDDDD                  
DO_IUPRED2A:                              DD                                                                       
MODRES_P:                                                                                    S                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GRQLHRHLLATCPNLIRDRKYHLRLYRQCCSGRELVDGILALGLGVHSRSQVVGICQVLLDEGALCHVKHDWAFQDRDAQFYRFPGPEPEPVRTHEMEEE 200
BenignSAV:                                     Q                                                           G       
gnomAD_SAV:    #G*  Q     S    # #       WR FC W   YRT   * E P WN F  M  G  E DT  YLNR CD   QE * CQV R KAG MG Q   AK
Conservation:  5504101422116144666645632375834836788542112022227154474475654543516553301649714586881201112000110035
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH            HHHH     HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH   EEEE            EE              HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH  HHHH  H   HHHHH   HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH   H EE   EEE    E EEEE            HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH                                    HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                           DDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                       DDDDDD DDDDDD   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LAEAVALLSQRGPDALLTVALRKPPGQRTDEELDLIFEELLHIKAVAHLSNSVKRELAAVLLFEPHSKAGTVLFSQGDKGTSWYIIWKGSVNVVTHGKGL 300
BenignSAV:                      A                                                                                 P
gnomAD_SAV:      G E#   *LATE   I   G LS *CMNQ       DV        P # E * IVTIP    #    SM     E #AL H  * A  KLM     P
Conservation:  5263434926365474533363615148305535453685455354348625645374445365340336576424453336777544555364444564
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH   HHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHEEEE     EEEE        EEEE  EEEEEE     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH   HHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHEEE     EEE        EEEEE    EEEE    E
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH   HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHEEEE    EEEEE       EEEEEE    EEE     
DO_DISOPRED3:                                                                          DDD DDDDDDDDDDDDD           
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                      DDD                                                                              
NP_BIND:                                                   AVAHLSNSVKRELAAVLLFEPHSKAGTVLFSQGDKGTSWYIIWKGSVNVVTHGKGL
REGION:                         TVALRKPPGQRTDEELDLIFEELLH                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VTTLHEGDDFGQLALVNDAPRAATIILREDNCHFLRVDKQDFNRIIKDVEAKTMRLEEHGKVVLVLERASQGAGPSRPPTPGRNRYTVMSGTPEKILELL 400
BenignSAV:                                                                              S                          
gnomAD_SAV:    G   L        D    VL#  AV  * NS  I CA     SC T   K  I W    D  A    I    PS  *#LA R  QC      A E     
Conservation:  5355468665656646543564556563532444445554355355566685958949523386555421110110121211215926539366959765
SS_PSIPRED:    EEEEE                  EEEE     EEEE  HHHHHHHHHHHHHHEEEEHH  EEEEEEE                  EEE    HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEE     HE           EEEEEE    EEEE   HHHHHHHHHHHH   EEEEE  EEEEEEEEE                E      HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    EEEE                  EEEEE     EEE   HHH      HHHHHHHHHHH  EEEEEEEEE                       HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                       DDDDDDDDDDDDDD                 
DO_SPOTD:                                                                              DDDDDDDDDDD                 
DO_IUPRED2A:                                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           
NP_BIND:       VTTLHEGDDFGQLALVNDAPRAATIILREDNCHFLRVDKQDFNRIIKDVEAKTMRLEEHGKVV                                     
REGION:                                                                                                         ELL

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LEAMGPDSSAHDPTETFLSDFLLTHRVFMPSAQLCAALLHHFHVEPAGGSEQERSTYVCNKRQQILRLVSQWVALYGSMLHTDPVATSFLQKLSDLVGRD 500
gnomAD_SAV:      S R   GT E   IVF N      F V  TH  T V R  L  #V S K*DH  CI  EK*RF QQ RH*  VC  IFY  R DI  F       AS 
Conservation:  9635537211132141131474535147462246522821564323325353731273422655441541374232401731510300745241004207
SS_PSIPRED:    HHHH            HHHHHHHH EEE  HHHHHHHHHHHH          HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHH  HHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHH             HHHHHEH EEE   HHHHHHHHHHHH E          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HH   HHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHH           HHHHHHHHHEEE   HHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                   DD                                                 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                D      DDD                                             
REGION:        LEAMGPDSSAHDPTETFLSDFL                                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TRLSNLLREQWPERRRCHRLENGCGNASPQMKARNLPVWLPNQDEPLPGSSCAIQVGDKVPYDICRPDHSVLTLQLPVTASVREVMAALAQEDGWTKGQV 600
BenignSAV:                     Y                                                                                   
gnomAD_SAV:     Q    Q    TK WQY      Y D   R   W FL G  DK     S   D        C VF#T YPA #MK    D #K#   T  *K SR  A M
Conservation:  1221114463225443130252211111111102202035300551112011444208443336531533133224360446255304430112112423
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                EE      EEEE     EEEEE     HHHHHHHHHHHHH     EE
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       H H       E             EEEE     EEEE    EEEEEEEE    HHHHHHHHHHH      EE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HH H                              E      EEEEEE    HHHHHHHHHHHHH     EE
DO_DISOPRED3:                          DDDDDDDDDDDDDDDDBBDDDDDDDD                                                  
DO_SPOTD:                           DDDDDDD D                                                                      
DO_IUPRED2A:                     D  DD D         DD DDDD         D                                                 
MODRES_P:                                 S                                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LVKVNSAGDAIGLQPDARGVATSLGLNERLFVVNPQEVHELIPHPDQLGPTVGSAEGLDLVSAKDLAGQLTDHDWSLFNSIHQVELIHYVLGPQHLRDVT 700
BenignSAV:                                                                Q                                        
gnomAD_SAV:     AE S V   TD R   S  SA   FS C     LR AP  V Q      IL    R HPL      DH MVY * F    YR  PN *G    RPWNI 
Conservation:  4312463653114322315643464495667351123410515415836621441214524548757154703883891245537556453623131214
SS_PSIPRED:    EEEE          HHH HHHHHHHHHHHHEE  HHHHH                HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH  HHH    
SS_SPIDER3:    EEEE     EE   HHHHHHHHH       E   HHHHH      HH       HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH          
SS_PSSPRED:    EEEE            HHHHHHHH          HHHHH                       HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:             D DD       DDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                                               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                             DDDDD D                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TANLERFMRRFNELQYWVATELCLCPVPGPRAQLLRKFIKLAAHLKEQKNLNSFFAVMFGLSNSAISRLAHTWERLPHKVRKLYSALERLLDPSWNHRVY 800
gnomAD_SAV:     S P HL #S H   C  V K   YLM   G# RFM     V  F  K   SF  TI#    T# L H      W T R W  CYVFK  P   # QWA 
Conservation:  4576673346774583983684778113136415768557372245545989496764676473763981399655627366352238436564558525
SS_PSIPRED:       HHHHHHHH      HHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH     HHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHH HH  HHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH     HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH     HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RLALAKLSPPVIPFMPLLLKDMTFIHEGNHTLVENLINFEKMRMMARAARMLHHCRSHNPVPLSPLRSRVSHLHEDSQVARISTCSEQSLSTRSPASTWA 900
gnomAD_SAV:    #   T   S A    #V I  KI LYK  Y  LD  T    TTL  T #WV  R QN   A    FK #DY  #KN RMGGV IYLG    IQCL G   
Conservation:  7433443158347446654543553346513023255553543343443223214442101313211111111111111111111311211153211210
SS_PSIPRED:    HHHHHH          HHH            HH     HHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHH        HHHHHHH          HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH         HHHH   EEEHE            HHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHH    HHHHH             HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH       HHHHHHHHHHHH     HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHH      HHHHHHHHHH       HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  
DO_SPOTD:                                                                                DDDDDDDDDDDDDDDDDDD       
DO_IUPRED2A:                                                                    DDD               DDD D            
MODRES_P:                                                                     S                                    

                       10        20   
AA:            YVQQLKVIDNQRELSRLSRELEP 923
gnomAD_SAV:      LK   TNK*WG CC  QD  A
Conservation:  33433132634414223620442
SS_PSIPRED:    HHH       HHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHH       HHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHH  HHH HHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                         
DO_SPOTD:                           D 
DO_IUPRED2A:                    DDDDD