O95447  LCA5L_HUMAN

Gene name: LCA5L   Description: Lebercilin-like protein

Length: 670    GTS: 6.741e-07   GTS percentile: 0.094     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 312      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSLADLTKTNIDEHFFGVALENNRRSAACKRSPGTGDFSRNSNASNKSVDYSRSQCSCGSLSSQYDYSEDFLCDCSEKAINRNYLKQPVVKEKEKKKYNV 100
BenignSAV:                     S                                                                                   
gnomAD_SAV:    VF   Q   DTGA LSS T  K SKA      LD  Y  W     S       A      S FR           P  T S  *     I GMG  EC  
Conservation:  4023324311233121121111111311011002112011010010011211111010211110121332211103212011101211011212112020
SS_PSIPRED:                      EE                                                                   HHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:                  EE HE                                                 H                       H       
SS_PSSPRED:                     EEE                                                                     HHHHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                             D   DDDDDDDDDDDDDDD                                        DD        DDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SKISQSKGQKEISVEKKHTWNASLFNSQIHMIAQRRDAMAHRILSARLHKIKGLKNELADMHHKLEAILTENQFLKQLQLRHLKAIGKYENSQNNLPQIM 200
gnomAD_SAV:     Q PH  S  KVPFGE       VC  L  IT   GH  VLQ   VSR       T  S TN   QT  AQ   FQ FHP R E   N  Y   S L  T
Conservation:  1201112524114122110111202101202114232222234143211256593654134334422312783497254156245522432332263242
SS_PSIPRED:     HHH         HHHHHH  HHHH HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                 H H  H   H    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH
SS_PSSPRED:                 HHHH      HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDD     D DDDD                                                                               DDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AKHQNEVKNLRQLLRKSQEKERTLSRKLRETDSQLLKTKDILQALQKLSEDKNLAEREELTHKLSIITTKMDANDKKIQSLEKQLRLNCRAFSRQLAIET 300
gnomAD_SAV:     #R #   K*TP    YRG     P   GGN  K PT  #VF V   PFK E    KD R D  C F I   S E  TK   E*        GQH TVK 
Conservation:  1360275428615831542243235339423713943434273182263431283465481248314323541533484299535165123626654251
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                         DDDDD                                                                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDD   D  DDDDDDDDDD DDDDDDDDDD                      D            DD          D                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RKTLAAQTATKTLQVEVKHLQQKLKEKDRELEIKNIYSHRILKNLHDTEDYPKVSSTKSVQADRKILPFTSMRHQGTQKSDVPPLTTKGKKATGNIDHKE 400
gnomAD_SAV:    Q  S SE#     RMKIEYP    M  GG P   DTC R*     R    *        F     T  L T G *E H  Y  R  A DN # #  Y#  
Conservation:  3630452123018415411534344553665233665533423111221322411134346553112221112223122210201013121012201032
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHH                                 HHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHH                                      
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHH                                  H
DO_DISOPRED3:                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:           D      DDDDD D  D                     DDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KSTEINHEIPHCVNKLPKQEDSKRKYEDLSGEEKHLEVQILLENTGRQKDKKEDQEKKNIFVKEEQELPPKIIEVIHPERESNQEDVLVREKFKRSMQRN 500
gnomAD_SAV:    RL  V Y V          K     H     KG Y Q     K  V * E  G    #    QA  QI   TT  VRT   T  D  PLS  L S    I
Conservation:  1101011111100121111312211015122422123111014111111321312222001111301101302200143142124222213201010111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH  HHH     HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:      HHH             HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH H                HH  HHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:     HHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GVDDTLGKGTAPYTKGPLRQRRHYSFTEATENLHHGLPASGGPANAGNMRYSHSTGKHLSNREEMELEHSDSGYEPSFGKSSRIKVKDTTFRDKKSSLME 600
BenignSAV:                                                   S                                                     
gnomAD_SAV:    VMNNPF   SVL*R  HF    #       K  Y     LW# TS S IKCR##SDRR  D #    K#    *   L TP#   GR A C   RR  T 
Conservation:  1022111101020031212232121532431357163342320012122322101141221122111112111548433212124113022022321222
SS_PSIPRED:                                                                  HHH                          HHHH  HHH
SS_SPIDER3:                                                                  H                             HH   HHH
SS_PSSPRED:                                                                                                HHH  HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDD   

                       10        20        30        40        50        60        70
AA:            ELFGSGYVLKTDQSSPGVAKGSEEPLQSKESHPLPPSQASTSHAFGDSKVTVVNSIKPSSPTEGKRKIII 670
gnomAD_SAV:       AT      G LT S T  *     #  LY    R    N   R P  SAI Y   L  I  *G  S 
Conservation:  2222213202110101011111111110121221152212443354553000000001222112212110
SS_PSIPRED:    HHH   EE                                                              
SS_SPIDER3:    HH                                        H       EE                  
SS_PSSPRED:    HHH                                                               EEE 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:     D  DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD