O95470  SGPL1_HUMAN

Gene name: SGPL1   Description: Sphingosine-1-phosphate lyase 1

Length: 568    GTS: 1.608e-06   GTS percentile: 0.495     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 4      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 229      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MPSTDLLMLKAFEPYLEILEVYSTKAKNYVNGHCTKYEPWQLIAWSVVWTLLIVWGYEFVFQPESLWSRFKKKCFKLTRKMPIIGRKIQDKLNKTKDDIS 100
BenignSAV:                         L                                                                               
gnomAD_SAV:     #N    TS V   CS    L   ED TC         L H  T* IM      L* A  C S     G Q N   F K   F  H  H R      #V 
Conservation:  3333333332441292542315222341268305102855345314221552245232456625561672543265337648346018513326542551
STMI:                                                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                       
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDD DD                                                                                            
DO_SPOTD:      DDD                                                                                                 
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KNMSFLKVDKEYVKALPSQGLSSSAVLEKLKEYSSMDAFWQEGRASGTVYSGEEKLTELLVKAYGDFAWSNPLHPDIFPGLRKIEAEIVRIACSLFNGGP 200
PathogenicSAV:                                                                                    T                
gnomAD_SAV:    E     QGN DH      #   L        G   # TL    I#  I   A K#  KP   V      TDA         C L    L M     D   
Conservation:  1241364142273418922863223674564562333209336468948936542652868666429587989856698856859897956353863685
SS_PSIPRED:    HHH       HHHH        HHHHHHHHHHHH     HHH EEEEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HH          E E       HHHHHHHHHHHHH        EEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHH      H HHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHH    HHHHHH       HHHHHHHHHHHHH         EEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DSCGCVTSGGTESILMACKAYRDLAFEKGIKTPEIVAPQSAHAAFNKAASYFGMKIVRVPLTKMMEVDVRAMRRAISRNTAMLVCSTPQFPHGVIDPVPE 300
PathogenicSAV:                      #                                                                              
gnomAD_SAV:    E  E     R      G    #  VL TR  I  T T      TY    G     #EQ   M #R L  # T   M     V IF        I E IS 
Conservation:  2489348899999976678669466255874199656928595885998499567544644332647664895648469958868959676894499726
SS_PSIPRED:       EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEE      HHHHHHHHH   EEEEE      EE HHHHHHH    EEEEEEE           HHH
SS_SPIDER3:    H   E E  HHHHHHHHHHHHHHHHHH       EE E    HHHHHHHHH   EEEEE      EE HHHHHH     EEEEEE            HHH
SS_PSSPRED:       EEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEE   HHHHHHHHHHHH  EEEEE     EE  HHHHHHH    EEEEEE            HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VAKLAVKYKIPLHVDACLGGFLIVFMEKAGYPLEHPFDFRVKGVTSISADTHKYGYAPKGSSLVLYSDKKYRNYQFFVDTDWQGGIYASPTIAGSRPGGI 400
gnomAD_SAV:          RH  LF   S   A  VI V  T #S  Q    W              SC   V        R   KC   I  Y     CG S V        
Conservation:  8666944526859798999998549626667362226884638888686666799688898955584424682697853469699686884489996967
SS_PSIPRED:    HHHHHHH    EEEE   HHHHHHHHHHH              EEEEEE            EEEEE  HHHH   EEEE                  HHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH    EEEE    HHHHHHHHH        EE EE  E EEEE      E     EEEEE  H HH   EEEE      E            HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH   EEEE     HHHHHHHHH          E   EEEEEE            EEEEE  HHH    EEEE                  HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_A:                                                          K                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SAACWAALMHFGENGYVEATKQIIKTARFLKSELENIKGIFVFGNPQLSVIALGSRDFDIYRLSNLMTAKGWNLNQLQFPPSIHFCITLLHARKRVAIQF 500
BenignSAV:                                                                                                T        
gnomAD_SAV:    RTG  VT R LS K C  V EH     H F      V  F   EDA  *      H     * P  V #    W HM# #        S  T# *  V  
Conservation:  6968996756396259655954662565362365336335373959557656489218985584627245894671885938686859448633555226
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE    EEEEEE     HHHHHHHHHH             EEEEEEHHHH HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE     EEEEE     HHHHHHHHHH   E         EEEEEEE    HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE     EEEEE     HHHHHHHHHHH            EEEEEEHHH  HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        
AA:            LKDIRESVTQIMKNPKAKTTGMGAIYGMAQTTVDRNMVAELSSVFLDSLYSTDTVTQGSQMNGSPKPH 568
BenignSAV:                                                                     S   
gnomAD_SAV:      E G#C I  V  R V  I     C  V  AFG S I    LIL  N C INP     E  S S LY
Conservation:  62555336137556324558946879956843599457465312785477295110111449844312
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH         HHHHH HH    HHHHHHHHHHHHHHH                   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHH        HHHHH H      HHHHHHHHHHHHHHH                   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH         EEE         HHHHHHHHHHHHHHH                   
DO_DISOPRED3:                                                         DDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                            DDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                           DDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                     S